BGIOSGA025380

From RiceWiki
Revision as of 06:27, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA025380| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025380, complete gene.| tag = OS07G02...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA025380

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025380, complete gene.

LocusTag

OS07G0209500

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA025380-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA025380-PA

Length

7808

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:6021532..6029339

Sequence Coding Region

6021532..6021673,6021807..6021856,6023687..6023742,6024980..6025048,6025268..6025362
,6025508..6025618,6028912..6029339

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:6021532..6029339 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:6021532..6029339 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCTGCCCCCTCGCCGGAGCGGAGCCCTCGTCGCCGGGGACCGACTCCCCGGTGCTCTGCGTGCGAATCGTATCCCTCGACTACCACATGGCGCCGCCCCTCCCCGGCCGGATTCGACTTCTCCTACAGCCACTTCCACGGTGAAGGAGGTGATCAGGCTCCACTCCTTACTTGCCTCCACATCCATCTGTGTCCTAATAGTTTATCAGTAAATATACTGACCATTTATTACTGGCTCAATGCTTGGATGGTGCTGTTCTTAATAGAGTATTCCAACCTTATGAGTCTCACATTCCCTATCTTCTTCACTTTTTGTTCTGTAAGGCTCGATGAGAGTAGTTCGCTGAGCAATAATATTCCTCAGCTTGATGGGTCATCTGATGAAAACCAGGAAGTTCCACAAGAAGATGACGGTGCGATGCCAACTGAGAAGGAACCAAGTGTTTCTTTCATGAGTAGAACTGGAAAGAACTCCCATGCTACCACAGATAAGACTGGCAGGGAATCTTTTAGTCGATCAGATATTATAGTTGGATGGGAGATTCAGTTGGGATCTTTAGGATTTTTTGCTGAAGGAGCTGGTATAGGCTTACTGAAAAGAATTTCAAGGACACCACCAAATCAGATGAAACATCCACCTATGAACCCAGTGGAGGAATCTTGTCAGGAGTTTCCTGGAGCATCTTCAGCTGATGATGTTATTGATGATGCTAGTGAGAGCAATTGGAGTCATACTCATGCTAGTGGTATACATGTTGATGGAAGAATCATTCTGAACTTATGGCGTCTCATGCGTGCAGAAATTAAGCTTAATAATTACTCCCTTGAGGCTGTAGCTGATGAAGTCTTGAGGAAGGTACCATTAGTACCAACCAAGATATTGAATCGATGGTTTGCAACAGGTCCTGGACGAGGAAGATACCGGTGCATAGAATATGTTAACAATTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAAPSPERSPRRRGPTPRCSACESYPSTTTWRRPSPAGFDFSYSHFHGEGGDQAPLLTCLHIHLCPNSLSVNILTIYYWLNAWMVLFLIEYSNLMSLTFPIFFTFCSVRLDESSSLSNNIPQLDGSSDENQEVPQEDDGAMPTEKEPSVSFMSRTGKNSHATTDKTGRESFSRSDIIVGWEIQLGSLGFFAEGAGIGLLKRISRTPPNQMKHPPMNPVEESCQEFPGASSADDVIDDASESNWSHTHASGIHVDGRIILNLWRLMRAEIKLNNYSLEAVADEVLRKVPLVPTKILNRWFATGPGRGRYRCIEYVNN</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..142#276..325#2156..2211#3449..3517#3737..3831#3977..4087#7381..7808#ATGGCTGCCCCCTCGCCGGAGCGGAGCCCTCGTCGCCGGGGACCGACTCCCCGGTGCTCTGCGTGCGAATCGTATCCCTCGACTACCACATGGCGCCGCCCCTCCCCGGCCGGATTCGACTTCTCCTACAGCCACTTCCACGGTGCGTTTCCCTCCCCGCCCCCTTTCTCCACCCGCCTCTCTCGAGCCCCCGTTTCGCCCCCCTTGTGCTATGCCTCTGCACCGCGCCCACGTCACGTCAAGCGGTTGATGAGTTTGATGTGTGGTGGATTTAGGTGAAGGAGGTGATCAGGCTCCACTCCTTACTTGCCTCCACATCCATCTGGTGCGTAGCAGCTTCTCTGATGAGTGCTTTTTTTTTTCTCTCTGTTGATATTACGGATGAGCTAGTTTTGGTCGTCATGTTTGGTTGCAGCTTCAAGCTTTCAACCGAGTGCGTCGCGTCCTTTCAAGTGTTTTGAGTGTGAGTTACGCTGTGAGGGTATAATACATTTGTGTTTGCTGTTAGGTAGCCATGCGCAGCAACTAATCCTCCTCATGTATTACACGGTATCTATGCCCAACAATTGATGCCCATGGAGGGAATGTGGCAATGTGCTCTTTGTTGATACTGTACGCGCACCAAATTCGAAGTTTGGAGATCCAACTTCACTTTCGAAGTTCACTAAATTTGAAGCCCTCTTATCCTGCATGGGCTTAACATTATTTTCTATACACTTGGTGTTTGCTTGTAATATATGCAATATTTACTTCTGTGTGCACTTGATTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTGGTTGAGTTTGGACATGCATATGATGATTAGCTCTATTATATTTTGAATTCATGTTTTTGAATGAATACAGATATACTTCAATTTTTTTTATATCGCTTCTCTATGGAAAGTTGCTCACACTATTCCATTCATCATTAGTTGTGCCAACTAGTTTGTAAACGTTTGCTGTTTTTTGTATCTCCTTCAATTTCTGTCTGTGCCTTGCACAGAGGACCTTCTTCATAACATTGAAAAAGGTAATTCATTATTTGTAGTTATGCAACCCTGATGTATCATGTATATGCTATTACTGTTACTTTTGCAATTTGTTACATGGATTGTTCTATTTTGAATTGTACTGCTGATTTTCTATCTACATTACCTGAAAACTTTTTGCTGATGATTTTCATATCTACATCACCTGAAACTTGAAATTGATTGTTATTTATTCATATTCTAACTGAGCCTTACTGCTATCTCACAAACTTTTTAGACACTAATTCCTCTTGTATATGGCAGTTGCACACCGCTGTTGCAATTTTATTGACTTAATTAATTAATTCGTGATTTGAAAGGTCACTTCTTCATCTGTCGAAAGCTTGCCTTGTATGCATCTGCAACACATTTAGATAACTTAAACAGTAGGCTGAACCCTTTGTATGTGCATGTGGCTCGGTAAGCATCTCTTAGATTTTGTACTGGTGAAAAGGGCACCTGTGTCTAGAAATAAGTGGCCGTTACTTTTTCTTAACCAAATAGCCTAAATGTGTTATTCTCTGCAAATGGTAGAACTGAATACTGATGCTCCCTGATTAACTGTTGCTTGTAATGTCAAGAACATCGCTTGATGACAAGGAGAAATTGATATGTCTCTTTCCTGCCCTTTCTCTAGGTAATTCATATATAATTGGGGTCTATCAAGTGACCTTGAGAAAGCTTTGCAGGTATTTGTGATGTCCAGTTATGTATCCATAACTTTATTGTTTTCTAAAAAGTATTTTGGCTGCTATGGATGTTTGAACCAGTTCTAGATTACCTGTTCTTTCCTTCACACCTAGTGTTTCCATGAACATATTCCATATGATTAATTATAAATCAAAACCAAACAAAGTATTTACTGAAATCTTCACAAAAGATATACTGAGTTGTGGAACACAGTAACTGCATCCTCGCTGTTTCCTTTGCTGTGCAATTTCTGCCTATCAGTGTTCATCCTGAAAGATTATATTAGGTTCTCCTTTAATTAATTAATTTTGATTTATTTCTGTATTTTTTTCCTTCAGAACTAATTCTTGATTTCTTAGCATTAACTCCTATTTTATATTTATTGTCTAGCTTCTCCTTGTCAATATTGAAACTGTTGTACTCACTATATGTTTCTGTTTCAGTGTCCTAATAGTTTATCAGTAAATATACTGACCATTTATTACTGGCTCAATGCTTGGTGTGAGTATCTAAGTTCTGATGTCTTATGATTGTTGCTTCCACCTAGAGTTTGCAACCATGATATATTATTCCAATTCTGGACTTCAAGGTAGTCTATGTAAAATGGTAAAAATGCAAAACTTCCTTCATTTGTTCTGTGTTGGAGTTATCATGAGAAAAATCTACTGATTTGTTTTGTAGCTAATTGGCTATACATAATTGCCTATGCATATATTCTTGACAAGCATTAAATAAGTCAGTGGGAATTTTATTGGTGTTCCGTGATATCCTTAATATTTGTTGATATTGAATCCAACTATTGAATACCATGTTGCTTGTTTAAACCACAATTTCATGAGAAATCATCTACTGCACAAGTGCACATTCTGCTGCAGCCCAGCTATTGGTCTGTTGACCCCTTCTGCTTAATTTATGACCTTGGTATTTTCCAAATTTCCAGTAGCTAAACATGTCTGACAGGAGGAATATAGCTGTTATACTTCTAGATTTTTTTTTCTTTCACTATTTTTTGGCAATGGTACTTTGTTTTATTATCCCCTCTATTTCTTCTTAATTGTTACTAGTATTGTTTATATTTCACTGTCTCGGAGTTACAATTTGGACCTTCTCTGCTATAGTTTAACATCAAGGTATATCAATAAAACTATAATATTACAGCAGTATGTTCAGCAAGGAATCTATTGATATAATATCTATATAGCCAATCTATCTAGTTGTTGACATATTAATGGTCAAACTTTGCAGAATTTTATGGCTAGTTCTGACACTGGAAGGAGTATTTATTGAAAGAGAGAGTTGTAATAGATATTTCAATATTATTATTTGCTTTTGTTCATTGCGTATGTTTCCTTTCAGCTTTACATTAATAATGACTACACTTGTCTGCTGTAGGAAACTAGTATTTTTACGTGAAAGATTTGATTTCAAACGCCTTCTGTTGCATGCCATTTCACTTGAAAAATGTGCATTGTGTCTCAGTGTTGCATGTGTATGTTGCTTTATTTTCATGATGTGAAGCTGTGGATTCATTCTCCTAGCAACATGAAACTTGGCCTCTAGACAGTTATGCCATCTAGGATCGAGTCTGTTCTCTGTACAGACTATCATATGTTATAGTAATTTGAAATTGTTCAGTTTATCTTGTGATCTTCCTTGTAAATACACTTTACTCTTCTCGAATGGGAGTATTTTAAACTATTTCCTGTGGTTCCTGATTTTGAGATGCTTGGTTTCAGGATGGTGCTGTTCTTAATAGAGTATTCCAACCTTATGAGTCTCACATTCCCTATCTTCTTCACTTTTTGGTAAGAGCAACACTTAGTTTCTTTTCATAGTTGTTGTGAACTGCAAGAACAGTATTTCATTTTGTCTCTTATGCAGTCTTAACATAATAAATACCACAGTCTAGCTTTTATGATATATAGTATATTGATATTTGAGCGGCTGGAGTGCCAGGATATTAATGATTGAATTGAACCTGTGAATGGAGAAGAACAACCAAATGATCAAATATCTTACCGCAGTTCTGTAAGGCTCGATGAGAGTAGTTCGCTGAGCAATAATATTCCTCAGCTTGATGGGTCATCTGATGAAAACCAGGAAGTTCCACAAGAAGATGGTAAGTATAAAATCAACAGGAAAAGTGCAGGATTGCCTAGTTACTCATCTCCTCAAAGTAGTTGAACTTCTCTGGTGCTCTTTGCCACCTCCCATTAAAAAGAGGTCAGATGTAAATGTTGATGGTCATGTTAAAACCTCTCCAGACGGTGCGATGCCAACTGAGAAGGAACCAAGTGTTTCTTTCATGAGTAGAACTGGAAAGAACTCCCATGCTACCACAGATAAGACTGGCAGGGAATCTTTTAGTCGATCAGGTGAACATGACCCATTGTGTGATTCTGTGAGGGTCTGAGAGACTTGATGATGAGGAGGAGGATATCTTTTCAGTCTGAACAATCAGAAGTTGGCAAGTCTGGAGATGCAATATACATCATTTGTAAAGAGAATGAAATTGTGAATTCCGAGGGACTAGAATGGCCTGATTCATCCAGTGGCCTTTCGAATTCATAAATGTGTTTTTCTGGCAGTGAATATTAGCAGATGACCTTTGCACAGAAGCCTCCAATGAAGAATGAAGTATTATGTTGTTTGGAGGGCTCTTCAGCAGGTAGTGAGCTGCCTCAGTTTAAGTTAAAGTGGTATTTATTTATCATGGTCAATGTAAGTTCCACAAGTGATCTTTATTTTATCATGGTGAATGCAATTCATTTGATGTATACTGTAGTTGTTGCTCATGTAAATTTTGTAGTAGTTTTGATGTTGTTGTTAACGATCTAATATATAAATAATTGTATTAGTGCCTACGTATGATTATGTAACAGATGTTCATTGTTTTCTTTCAGTTTTTCTAGCATTAGGCTTTTAGGTCCTTTGCCATTTACATAGCTTAGCATGTATGCAAAAATAGTACTCCCTCCGTTTCACAATGTAAGACTTTCTAGCATTGCCCACATATATATAGATGTTAATGAATCTAAACACATTCATTTAGATGCTAATGAATCTAGACATATGTATGTGGTTAGATTCATTAACATCTATATATATATATATATGGGCAATGCTAAAAAGTCTTACATTGTGAAACGGAGAAAGCATTATTTATTTGTTTGTTATCATTTGCCATTTACACAGCTTATCATTATTTATTATTGTTTTCCCTCTAGAACAGTTTGGACTATCAACCAAATGAAATAGTATACCACTATAACTTACTATAAGTACAGTGCTATTCTGTTAAAACTTAATCTTTCTTGAATTTTCCGGTATCATCATTCACTTCATATCATTTAAAACACATTATATTTTCTCTGTTAATCCACATTCGCTCTTCTGCTATTTTTCAACTTCTAAACTGGGATTTATCGATATCCCTCTGTTTTTCAATCAGAATGCTGAAGCGAATAAGCAGAATGAATCATTTCAACACATGGAAAGTAGCGAGTTTTCATTGGATACATGGGGTGTTCCAACTCATTTCCAAAATGATTGGTCAGCCCTATATTTGCTAACACATGCATTTTTGCCACCCCGTGGGCCAGTGGCTAACCTAACAATCTTGTTCCATTAGTGTCTCCGGTATAGATTATTTCCTGCACAGTCAATTTAATGACCATGTATCGATGTTGTCACACACTGTTATCTTAGGCCATTTCAACTGTAGTGAGAGAGTGTCTGTTGATCAGGAACGAGCAAACAATTCTACTCTTTCACCATACTAGCAAATTACCCATGCCATGCTATGCCATGGGATAAAAAATGAAACTGCTTTGCTGTGTTATTACTACGCAGCATTTGGGTGTTTTTCCCCCTTTTTTTTGTTTTTTCCTAATTGGCGGTTTTCTGGAGAAACTGTTTGGTTTTTTCTAGAGGGGGTGGAGCACAGAATTGGTTGGGTGGAGAGGAGGAGGACGATGACTCCCTTTTAGTGTAGTAGAGATATGGGAGGTCCTACTTTGATGGACGATTCTCTTGCATCCAAATTGGCTTTGGAGCATAGCCCTACAACCTTTCCTAATGGTACAGTTATGATGGAACCAGATCTTTCCAACCAAGTAATGAAAAATCTACTCCCTCCGTTTCAAATTATAAGTCGTTTTGACTTTGGTCAAAGTCAATCTACTTTAAGTTTGACCAAGTTTTAGAAAAAAGGTAGTAACATTTTCAATCCAAGATAAATATATTATGAAAATGTATTCAATTATCGATTAAATGAAACTAATTTTGTGCTGTAAATATTACTATATTTGTCTACAAACTTAATCAAACTTGAATTAGTTTGACTTTGATCAAAGTCAAAACGACTAATAATCTGAAACGGAAGGAGTAGCTGATTGGCATGAGTTTTCCCAGATCTTAGGAAGAGATGAGAAGGATAAACTAACACCTCTCAGTCAAATTGGATTCCGTGGTCCTACTAGCACTGGTAGTGGATTACAATTGACTATAAGTAGCATAGTGGTTGTACCACATTCTTTTTTCTTTTGTTCCTGACGTACATATGTTTCTTTTTGTTAATTCTTCATACAATGTAGGTGCTAATTTACTGTTCGTGGAAAAATCTATGTCTGCAACCAGCAGTTCTTTTTTGTTATTATTAATCATGTCAGTTTGACTTGCTCTATCCAGTGAAAAGAAAATGCAAAGTTGAATTACCAGTTTATCACATGACATTTATTTCATTAATACATGTATTAACAGAAAGCAGAGGAGAGCTGCATCCTGATCCACGATTTCGTGTCATCAACGCTGTATCGCTGGCTGTTGAGGATGATGCTGACAACACTACTGAAATCATGTGCTTTATACGTGGAAACAATGACAGTTCACACAGGAGGAGGTTGTGTGAAATCACTCAAATCTTGGAATTGTTTGTTGTTTTACTTTTCCGTTTCTTCTTGTTTTGGCACTAACCAGTCATCTTTTCCTTTTTAATCAAAATTCCATTCTGTTTAATTTTGTTTTTCTCAAGCAACATATATCTTAATGAGTCTACAGAATCTCAAGGAATTGAACTGTCCTAATCAGAAGAGTTGTGTGCTTGTGTTAAATGTGAAATTTAGTACATTAGTATGTGAGTCATAATCCTAGTTCAACAAGAGAAGTCTGCATGGACATCGAGTGACTATGGTGGTGACTGCTACAGTGCAGTAGCAACTGATGTCATTTGACGAGAGTACTTTGGATCATTACTTTTATTTATGGGTCTGTTAAGGATTTGATATGGTACCATCAAAAACACATTTGTTGCTTCCATGTGATGGGCCTTTCATATGTGCTGAACATATCCTATGCTTCTGGACTTGAAGAACACCATATAACTTCGGGTTCTTTTATTTAGAATTTGTTGGATCATAAACCACAGTTTTACTGTTTTAGAGTTACACTCTCATGTAGCCATAATTGTTTGTTTTCAGCTAAGGAACTTGTTTGATTCTTTTTTAAGGGCTGTAAGAGTTCAACCTGTTGTATTGAGATGTCTTTATTGTCCTTTTTCTTGTAACTGCAGAAACCTGGATAGAGTTGCCGGTTGCGACATAAACGTATTTCCTTGAGAGACAGAAACTTTTAAACCATCTTATTAATGAAATATGTTCAATCGATCCAGATATTATAGTTGGATGGGAGATTCAGTTGGGATCTTTAGGATTTTTTGCTGAAGGAGCTGGTATAGGCTTACTGAAAAGAATTTCAAGGACACCACCAAATCAGATGAAACATCCACCTATGAACCCAGTGGAGGAATCTTGTCAGGAGTTTCCTGGAGCATCTTCAGCTGATGATGTTATTGATGATGCTAGTGAGAGCAATTGGAGTCATACTCATGCTAGTGGTATACATGTTGATGGAAGAATCATTCTGAACTTATGGCGTCTCATGCGTGCAGAAATTAAGCTTAATAATTACTCCCTTGAGGCTGTAGCTGATGAAGTCTTGAGGAAGGTACCATTAGTACCAACCAAGATATTGAATCGATGGTTTGCAACAGGTCCTGGACGAGGAAGATACCGGTGCATAGAATATGTTAACAATTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA025380