BGIOSGA025913
| Gene Name |
BGIOSGA025913 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J013120K21, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025913, complete gene. |
| LocusTag |
OS07G0549700 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA025913-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA025913-PA |
| Length |
5790 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:19885495..19891284 |
| Sequence Coding Region |
19885495..19885600,19886128..19886180,19887472..19887597,19887793..19887895,19887979..19888051 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:19885495..19891284 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGAACTCAAGTCCAGATCCTAGTCGAAAACGGAAGGGGAGAAAGAAAAAACCAACACCTCGCAGGAAACAGCAGAGACCTCCTCCATTATATCCCGCCGGAGGTGGGCTCTTTGGACACCCGGTGATGGATCACGCGGAGCTGACCACCGAGCAGGTTCTCAAGAGGGATATTCCATGGGAATCATACATGGCAAATAAGCTGATTTCCGGGACATGCCTTCAGCTTTTGCGACGTTATGACCACAAACCAGAAAGCCAACGAGGTCCTTTGCTTGATGAGGATGGGCCATCCTATGTTCGAGTGTTCCTGAATATCTTGCGGAACATCTCCAAGGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAGTAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTGAAGACATCTACGACCCTTTCCTAAGATTGCTCTTGAAAGGTAACTGGTTTGTGCAAGAAAAAAGTTGTAAGATATTGACCCAAATAATAAGTGCACGACCCAAGATGCAGAATGGCATAGTTCCAAATGGAGAGGCTTCAAATTCAAAGAGCAAGCTAACATCTACTCAAGATGTGTTAAGAGGTTTGGTTGATTGGCTCTGTTCTCAGCTGAGGAATCCTACCCACCCAAACTGTTCTGTTCCTACTGCTATGCATTGTCTTGCCACTTTGCTAAGAGAGCAGTATGTTAGAGCTTTATTTGTTCAGGCGGATGGTGTAAAACTGCTCATTCCTTTAATTTCTCCAGCTTCCACACAACAGTCGATCCAGCTTCTCTACGAAACTTGCCTCTGCATCTGGCTTTTATCCTTTTATGATGCAGCCGTTGATTATTTGTCCACTACAAGGGTTATGCCAAGACTTGTAGAGGTTGTGAAAGGTTCAACAAAAGAGAAGGTTGTCAGGGTCGTTATCATGTCTATCCGTAACTTGCTTGCAAAGGGTGCGTTTGCTGCCCAAATGATTGATCTTGGACTGCCACACATAGTACAGAATTTGAAAGCTCAAGCATGGACTGATGAGGATTTATTAGATGCGCTGAATCAGCTAGAAATAGGACTCAAAGACAACCTTAAGAAGTTGAGTTCATTTGAGAAGTACAAGCAACAAGTTCTTCTTGGCCATCTTGACTGGTCTCCAATGCACAAAGACCCAAGTTTCTGGCGCGAGAACATTAATAATTTTGAAGAAAATGATTTCCAGATTCTACGTGTGCTTATGACAATCATCGACACATCGGCCGACACGACTGCTCTTGCTGTCGCCTGCTATGACCTCTCACAGTTCCTTCAGTACCACCCTTCTGGGCGCATTGTGGTGGCAGATCTGAAGGCGAAGGACCGAGTGATGAAGCTCATGAACCACGAGAACGCCGAAGTGAGGAAGAATGCCCTGCTCTGCGTGCAGAGGCTTTTCCTTGGTGCGAAGTACGCGAGCTTCCTGCAGACCTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSNSSPDPSRKRKGRKKKPTPRRKQQRPPPLYPAGGGLFGHPVMDHAELTTEQVLKRDIPWESYMANKLISGTCLQLLRRYDHKPESQRGPLLDEDGPSYVRVFLNILRNISKEDTVEYVLALIDEMLAVNPKRAALFYDNSLSGEDIYDPFLRLLLKGNWFVQEKSCKILTQIISARPKMQNGIVPNGEASNSKSKLTSTQDVLRGLVDWLCSQLRNPTHPNCSVPTAMHCLATLLREQYVRALFVQADGVKLLIPLISPASTQQSIQLLYETCLCIWLLSFYDAAVDYLSTTRVMPRLVEVVKGSTKEKVVRVVIMSIRNLLAKGAFAAQMIDLGLPHIVQNLKAQAWTDEDLLDALNQLEIGLKDNLKKLSSFEKYKQQVLLGHLDWSPMHKDPSFWRENINNFEENDFQILRVLMTIIDTSADTTALAVACYDLSQFLQYHPSGRIVVADLKAKDRVMKLMNHENAEVRKNALLCVQRLFLGAKYASFLQT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..106#634..686#1978..2103#2299..2401#2485..2557#3152..3217#3286..3403#3505..3666#3954..4079#4169..4294#4857..5036#5542..5790#ATGTCGAACTCAAGTCCAGATCCTAGTCGAAAACGGAAGGGGAGAAAGAAAAAACCAACACCTCGCAGGAAACAGCAGAGACCTCCTCCATTATATCCCGCCGGAGGTACGCCGCCGCAACAGCCGAAGAGGCTTCTTCTCCGGCAACCGGCGGCGGCGGCGGCGACGAGGCGAAGAACAAAACGATCGGGGAAGAGACGCTTTGATATTCGGGCAAACAGGTGGCAGGCCACTACTCCTCCACGTGGCCGTGTGGCGTGGGACCCACACCCATCAGGACTCGGCCACTCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCTCTAATTTTTTTGCCCCCCGTCTCTCTCAGATCTTCTCCTCTCTCTCTTCTTCTCTTCTCTTCTCCTCTCTTCCCCGTCGCCGCGCACCTCCCGATCCCTCCCTCCGCTCGCTCGCCCATCGCGCCAGGTGAGCCAACGCCCGCGATCCCACCACTCCTCTCGAATCGCTCGCTTGCGAGCGCGCGCGCGGTGCGGCGCGGCGTCACCCCGATCGCTGTGGTTGGGGATTTTCCTGGGGTTCGATCGGATCCGTGGGCTGAGGAAACCGGGGGCCGTTTTGATCTCATCCGTGGCTTGATTTTTCGTCTGCTCTTGCAGGTGGGCTCTTTGGACACCCGGTGATGGATCACGCGGAGCTGACCACCGAGCAGGTTAGTTAGTGATTGGGATTTGCCTCCTCCCCCGCGGGGCGGATTTAGCTTTGGTGTGCTGATAAACCTGTTCTACTGTCGAATTGTTGATGCTTGCGAGCTTCCATGTGTTCAAAGTGTTTATGATTTAGTACCTGTCTACATTGTAGTAGATTATAAGTATGCTTACGCTCATAGATGGGATACCCTTTGCGATCGATCAGTGTTAACCAGCGTGGTTTTCGAGTGGAAGTAGATGCCGTTGTGATTGTGTTAGGAAGTGAGAAGATTTTTCATATAAGGTGTTTTTCAACTGAGTAGAGTGTCAGGAGAATTTTAACGGAGTAGATTATGGTGTAGTGGTATTTGGAAGCTGACCAGTTTTTTTTCCTCTCACTTCAATGCATGCTTTTATGTTGGGGGTTAGACTGGTAATCATGGGTTTGTCCGAATACTACTTTATCAAGTCATGTCCGAACTAAACTATAGTTGTGAACTTTTTCTTTAGCTAAAAAGCGGTCTGTTTCATTGATAGAATCAGCGATTGTCCTGTTAAGGATTTTTAGCTAAAATACCAGCTTGTAAAGTATAGTATGGGTCGATTCTAACATCTTACGTGACTCTGTCCTTCATTAGAGATTGCACAGAATTTTGTTCTGCTTCCACAGAGATATGCCTATGGTTTATGGACGCATTCAGTTCTTATGTATGTGCCACAGTAACATGCAAAATTTGCTTTTATTGAAGGGAACTGTAAACATCAAATTGGGAATGGCAAACTTTTCCGTACTGTAATATTGTTACTTTTCTGGTGGACAAAATCCTCCTTTTTTCTTGTACCACGGATAAATTCTGGCTCTAGGCAACAGTGAACCTGCTGATATGTGTTCTGTCATACTCCCTCCGTTTCATAATGTAAGACTTTCTAGCATTATCCACATTTATATAGATGTTAATGAATCTAGACACACATATATGTTTAGATTCATTAACATCTATATGAATGTGGGCAATGCTAGAATGACTTACATTATGAAATGGAGGAAGTATATATTATGCATTATAGGCTTTGTAGATTTTAGTTTTAGCCTGTTAGGCACTGAACTGCAGATGCTATCTAATTTGTGTCTATCAAGTTCATGCGAAAGTATAAATTTGTCACATTCCCCCGAATACTTGTCATGTTCCTTGATAGATAGGGCTCCTTTTTCCATGAGAACTTCTTGAGCGTAGAAAAATTTTCATTTGCATTACATTTTATGGGGAAAAAACTTGCTTTATGCTGATCTGGACTCTGTCTTTGCATTTCAAGGTTCTCAAGAGGGATATTCCATGGGAATCATACATGGCAAATAAGCTGATTTCCGGGACATGCCTTCAGCTTTTGCGACGTTATGACCACAAACCAGAAAGCCAACGAGGTCCTTTGCTTGATGAGGTGAGTGTCGTTCTCATCCTCAACAATTTCTGTGGGTAAATGAGTTTAAGCACCATCATGTGATCGCTTTTCCTTAAGAGATTTCATATTGACTTCTTAGTGCTGATTTTGCTGTTTTGTGCACTTCTGTTTGGCTATGGTAATTTGCATTTGCAACTGTTCTCTTGACATAATGTCCACTGGAAATTCTTTTAGGATGGGCCATCCTATGTTCGAGTGTTCCTGAATATCTTGCGGAACATCTCCAAGGAAGATACTGTTGAATATGTGCTTGCCCTGATTGATGAGATGCTTGCAGGTGGGAAACTAGTTATCTGCGATATGGTTAAACAAAACTCTTCTGATGAGTTACACCTGTTAAATAATTGCCTTTGTTTTCAGTAAATCCTAAACGAGCAGCACTGTTCTATGATAACTCTCTCTCTGGTGAAGACATCTACGACCCTTTCCTAAGTTAAGTATTCTAGAATTGTATATGTTCTATTATGAGTTTTTTCATAATACCATCTTACCTGTAATCTAATGTGTTGTAAAGATAGAAATAAACCAACATAGACTGTGACAGATTTCTTGTATATTTTGAAGAGGCATTGTCATGGGAAGGATACATCTTGTAATTGTTGAATTGGTCTACCTTACAGTAGGATAGGATCATTCTGTGGCGGCTATAAAAACCAAAGAGATGATCAGTTGATCATACAATGTGATGTCATTATCAACATTTGGCATAGTTCCAGATCAGTTACTTGGATAAATTTTTACCTGTGTGCTGTTATCCTCAATGGTATAATTTGAGAATGTCAGATATTTCTTCTCCTAATCTCAGTTATCTCACATTTATCCATGAACTTATGCCATCCAAGATTTCACCATCCAATCCTGGCAACTATACTATAGATACTAAACCATTACGTTGGTTAAACACGTGATTTTACACCATCTAAACTGGGATGAATCAACCAGTCTAACTGTTTACAATCTTTGCATTTTTATTGTTTAGGTTTGATCTCTGATTGTCATATTTAGCTAACAAAATTGTCGTTTTCAGATTGCTCTTGAAAGGTAACTGGTTTGTGCAAGAAAAAAGTTGTAAGATATTGACCCAAATAATAAGGTATGTTCTGTCCATATCTGCGTGTTTGTTGTCTTGTTCTGGAGAGTCTAATTTTTATGCGATTATAGTGCACGACCCAAGATGCAGAATGGCATAGTTCCAAATGGAGAGGCTTCAAATTCAAAGAGCAAGCTAACATCTACTCAAGATGTGTTAAGAGGTTTGGTTGATTGGCTCTGTTCTCAGGTATAACCTGCGAATGGCCTAATTTATTCTACCCTTTCATATACTATGTTACAAAACTAGTGTTCAAGGGTTCTGAACTTTGAGAATGTTGTGTTTTGCAGCTGAGGAATCCTACCCACCCAAACTGTTCTGTTCCTACTGCTATGCATTGTCTTGCCACTTTGCTAAGAGAGCAGTATGTTAGAGCTTTATTTGTTCAGGCGGATGGTGTAAAACTGCTCATTCCTTTAATTTCTCCAGCTTCCACACAACAGTCGATCCAGGTATTTGTTGAGTCCTGTAATAATAACCAAAGCTGAACTTTTCTTTCCCCAAATTGCTATATTCTTTTCCTTGATATAGGATACATATATCAATTTCCTTTTTTTGTTTTAAAAGGGAGCTTTTCAAAACTAACGAGCTAATTAACAAACGGGATATTCACCTTTGATGAGATGCCATATTTAACAAGATTGTGCACATACACGGACATCAAACATAACTGTTCTCTCATTTACTTTGTGAACTAATTTGCTCAACCTTCTGCTTACCCTTATTGTGTCATTTGCAGCTTCTCTACGAAACTTGCCTCTGCATCTGGCTTTTATCCTTTTATGATGCAGCCGTTGATTATTTGTCCACTACAAGGGTTATGCCAAGACTTGTAGAGGTTGTGAAAGGTTCAACAAAAGAGAAGGTGAGGTTTGAAGTATTGTTGTTTTGTCGTGTTGTCACATCTCCTTTGTATCAGAAATACCATTCATGTTTTTCCTAAAATAATTGCAGGTTGTCAGGGTCGTTATCATGTCTATCCGTAACTTGCTTGCAAAGGGTGCGTTTGCTGCCCAAATGATTGATCTTGGACTGCCACACATAGTACAGAATTTGAAAGCTCAAGCATGGACTGATGAGGTGAGGAGCTTACCAAGGCTTTTGATTTCAATTTTTGCATTGACAGGATATAATTCATACCATCTTTATATCTGAAGCATAGTTTGAAGCAAAATATTTCAAGGGAGTTAAAAGACAAGCATATCCTTTCTTATACTGTCCCATCTGAAATAAATAACCCTTTAGGAGTCCAGCACTCCAGCATAATAAAGTGTTGTCTTCGTTACTACTTTACTTCAAACTGTATGCTGCGTAGTGAACTTTGTGAGTTATTTACTCCAGCATAATAAATAATCCTTTAGGAGTCCAGAACAGTTCCGTTTTTGCTATGTCTCACAATATTATTAAGCACATGAATTTCTACGACTTTCTATGCCTTAAGAAACATGTATAGTTTTTTTTGCTGTGAACGTGTTTTAACATGATTTACATGTATATATACTTTCAGAATATTTAAAAATCATACAAGGGCAAAAGGGGTGTATCTACACTTGAACTGTCAAATATGTTTATTTATTCACATTTGAGCTTGTCTTTATCTCTTTTGAACTGACAACCTTCTTTTTACAACCTATGCACCCAGGATT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