BGIOSGA035778
| Gene Name |
BGIOSGA035778 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:001-039-F06, full insert sequencecDNA |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA035778, complete gene. |
| LocusTag |
OS12G0632700 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA035778-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA035778-PA |
| Length |
4292 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:22662292..22666583 |
| Sequence Coding Region |
22666512..22666583,22665359..22665574,22664485..22664799,22664298..22664387,22664061..22664144 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:22662292..22666583 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:22662292..22666583 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGGACGCAGCAGCAGCAGCAAGGCGGATGGAGAGGCTTGCCTCCCACCTCCGCCCGCCCGCTTCTCAGATGGAGGAATCACCCCTCCTGAGGGGCTCCAATTGCCGGGCAAAAGGTGCCGCTCCGGGTTTCAAGGTCGCCATCTTGGGAGCGTCTGGTGGGATTGGCCAGCCTCTTGCATTGCTCATGAAGATGAACCCTCTTGTTTCTGTGCTCCATCTGTACGATGTTGTCAACACTCCCGGTGTCACAGCTGACATTAGCCACATGAACACTGGTGCTGTGGTGCGTGGTTTCTTGGGCCAGCCACAGTTGGAAAATGCCCTTACTGGAATGGATCTTGTGATCATTCCTGCTGGTGTTCCTCGTAAGCCTGGGATGACAAGGGATGATTTGTTCAACATCAATGCCGGAATCGTCCGGACTCTTTGTGAAGGAATCGCAAAATGCTGCCCCAATGCAATTGTGAATGTGATCAGCAACCCTGTCAATTCTACTGTTCCGATTGCTGCTGAGGTTTTTAAGAAAGCTGGGACATATGACCCTAAGCGCCTTTTGGGGGTGACGACACTTGATGTAGTGAGAGCCAATACTTTTGTGGCAGAAGTTCTTGGGCTTGACCCCAGAGATGTAAATGTCCCTGTCATTGGTGGGCATGCAGGAGTAACAATATTACCACTCCTTTCACAGGTGAATCCTCCCTGCTCATTCACCTCAGAAGAAATTAGTTATCTTACCACTCGCATACAGAATGGTGGGACAGAAGTAGTCGAGGCTAAAGCTGGAGCGGGGTCTGCAACCCTTTCAATGGCATATGCAGCTTCTAAATTTGCAGATGCTTGCTTGAGAGGATTGCGTGGCGACGCTGGGATAGTGGAGTGCTCTTTTGTAGCTTCTCAGGTGACAGAGCTGCCTTTCTTTGCATCCAAAGTGCGGTTAGGTCGCTGTGGCATCGAGGAGATCTTATCACTTGGTCCATTGAATGAATTCGAAAGAGCTGGACTGGAGAAGGCTAAGAAGGAGCTGGCCGAGAGTATCCAAAAGGGGGTCGCTTTCATCAACAAGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEDAAAAARRMERLASHLRPPASQMEESPLLRGSNCRAKGAAPGFKVAILGASGGIGQPLALLMKMNPLVSVLHLYDVVNTPGVTADISHMNTGAVVRGFLGQPQLENALTGMDLVIIPAGVPRKPGMTRDDLFNINAGIVRTLCEGIAKCCPNAIVNVISNPVNSTVPIAAEVFKKAGTYDPKRLLGVTTLDVVRANTFVAEVLGLDPRDVNVPVIGGHAGVTILPLLSQVNPPCSFTSEEISYLTTRIQNGGTEVVEAKAGAGSATLSMAYAASKFADACLRGLRGDAGIVECSFVASQVTELPFFASKVRLGRCGIEEILSLGPLNEFERAGLEKAKKELAESIQKGVAFINK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..72#1010..1225#1785..2099#2197..2286#2440..2523#3162..3197#3287..3376#3469..3563#4220..4292#ATGGAGGACGCAGCAGCAGCAGCAAGGCGGATGGAGAGGCTTGCCTCCCACCTCCGCCCGCCCGCTTCTCAGGTCAGCACCCCACACGCCGCCCAGATCCCCATCTCTCTCTCTCCCCCACCCTCTTTTTCTTTTCCACCCGATTTAATTCAGGTTTAGTTTAGTTTGGTTTGCTGCGCGTTTGCTTTTCGGGAAGCTGCAAGATGATCTTGCTCATCTAGTATCCGAGGTTACCTTCTTCTTGCAAGCTTGGGGATTACGGGGAGTTGAGATTGGGGAGGTGGCGAGTCAACCATGGGGATGGCTGGACCTAGGTTACTACTACTACTATTCAGTTACTTTTAGTTTGGATCTCCTTCTTGAATTACCTACGCCGCGGGGTACCGATTTCACAGTGCTTCTGATCGAATTATGTTTTAGTTTATCACTTGCAATGTACTACTAGTGTAAAGCTACCAACTTTACTGGACTTGGAGGAGGTCCCGTTAGCTAGCTTTGGGGGAACCAAATCTCTGGTTTTGCTACTTCCCACAGATTCTCAAGTGAACTGAAAATTGACTTACATTTTTTTCTGATGATATGCTCTCTGGACGACTTGTTAGTTTCTGATTGAAACTTTGAACCCTGATACTAGGATCTTACCCTTATAGCTATTTGCTTTCTACTAGTGATAGTGAGTAGGGAATGTGATCGACAATTATGCTACTTTGCACCTTCTCTGCTTAGCCGTAAGTTTTCAGGGGAGAACATTTTGACCAGAAACCTTGTTAGAACAGCATTTGTTCAATAAACAGCAATTGACTCTGCCACTTTTGTAGCGACTACAACCATGCTCTTCCTTTATTATGTATACTTTAAAACGATAGTTAGCCATTGATCTAGGAAGTTTACAAGCATACACGGTATGCAAATATGGCCGGAAGATAAAAGCTTACCCTTCCATGTTCTCTGCTCTCTGTTTATAATCTGTTTTATCCTGCTTAATTTTCTCTGTTTGGTGTATGTGAAGATGGAGGAATCACCCCTCCTGAGGGGCTCCAATTGCCGGGCAAAAGGTGCCGCTCCGGGTTTCAAGGTCGCCATCTTGGGAGCGTCTGGTGGGATTGGCCAGCCTCTTGCATTGCTCATGAAGATGAACCCTCTTGTTTCTGTGCTCCATCTGTACGATGTTGTCAACACTCCCGGTGTCACAGCTGACATTAGCCACATGAACACTGGTGCTGTGGTATGTTCCTTGACATTATGTTTAGTATCCCCCTATTCATAATTGAAATACCACATTCTGTAACCGTTGCATTTTGCTACTACTTTTATGGTCAGTTGCAATTTCTATAATTTTCAGTTGTATGTCTTGAGGGAGGGTACATATGCTTCATCTATATTTTCCTTACATAACATGTGAATCATCCAGAAGACAATCTAGTTCTGACAAATTTAATTTTTCAAACCATTGATTATCCAGAATGAAAGAAACAAGTAATTCCAATGAAACTTGTCTATCTGATAGTCATATCTTAATAACTTAAAAGGTACTAAGTTGGTGTCTGATCATTGAGCGGCTACTGTTGATCAAAATACAGATATTATATAATACTGCTAGCAATACGTCATAGCCTTCATGCATATTTAAAGTATTTTAACTATTATTAGATTTCAGCTTTGTAGTTTCCAGATATCCTTTTTTTATCACCATGTGGTATTCCTATAGTTATTCATCTGTTTATTGAACCGTAAAAGGTATTTCGATCATTGTATTTAATTATGCTAAGGTCTCAAATCTACAGGTGCGTGGTTTCTTGGGCCAGCCACAGTTGGAAAATGCCCTTACTGGAATGGATCTTGTGATCATTCCTGCTGGTGTTCCTCGTAAGCCTGGGATGACAAGGGATGATTTGTTCAACATCAATGCCGGAATCGTCCGGACTCTTTGTGAAGGAATCGCAAAATGCTGCCCCAATGCAATTGTGAATGTGATCAGCAACCCTGTCAATTCTACTGTTCCGATTGCTGCTGAGGTTTTTAAGAAAGCTGGGACATATGACCCTAAGCGCCTTTTGGGGGTGACGACACTTGATGTAGTGAGAGCCAATACTTTTGTGGTATGAACTTCAACAGAGTTTGCTTTGTAGTATATCATTGTACTAACTTTACATGGACAGTTTCTCATTTTTTTTTTTGTCTTTGTTTTGTTTACAGGCAGAAGTTCTTGGGCTTGACCCCAGAGATGTAAATGTCCCTGTCATTGGTGGGCATGCAGGAGTAACAATATTACCACTCCTTTCACAGGTTAGGAATACCTTCCATTGTTGCAAATCTGAAATCTGAGCCACATATGTAGGACAAATTAGTTTTTCTGGATATAGACAATTAGTATTGGATCAATGTTACCCTGTTTATTTTTTCAAAAGATTGATGGAATTTTACTACTATTCCCCCTAGGTGAATCCTCCCTGCTCATTCACCTCAGAAGAAATTAGTTATCTTACCACTCGCATACAGAATGGTGGGACAGAAGTAGTCGAGGTATGATTTTTTCTTTATCATCTAATGATGCATGTTTAGAATTGTATTCATAAAGAAGAAAGGGAAGTTGGTTTCACAGTCCCTGATATGTATCATGCATAATGGTTGTAGTTGTTTGACTTGAAAGTTAATAAATCTGGAAAAGAATCAACATGCTAATTTTGTTTGAATATAAGTGACCACTTATAGCATGAATACTTTCAATCCTTGTACATATGCATATTAGTTAAATGAATTTCATGGTGTTAACAACAAAGTCAAGTATTAAGTGCATGTCGAACTTTAACTAAATATGCCTTGAATGTCTGTTTGCCCATATTGCATACATTTCATGTTGTTGGCAGAAAACTACTAGTTCAATGCATGTTTAAGTGTCGAAATCCCCCTTTCTTCATTTATCAATATAAAGGCCTCCCATGTTCTAGATTTTTCTGCTTACGTTTGCTTTTGCTAGGTGAAAGTTTAACAGTAGTCTGTCTAACGGTAAATGTTTTTCTATGGAGGTTACAGAGTTGTTTGTTGGCTGAAGTTTAATGTGTTGTTCCCTATTGGCGATTCCTGTGTACTGTTGGTTTCTCAATGTTTATATGTTGCTAATACTGAGCATTTTAATTCCCCCCTTCCTATTATCCATGTAGGCTAAAGCTGGAGCGGGGTCTGCAACCCTTTCAATGGTTGGTTTCTGTCACATGCGTATTAGCGTATGAAGGTTAGTTCTTTTATCAGAACAATTAAGATTTAACATGGACAATTTTTCTTGTAGGCATATGCAGCTTCTAAATTTGCAGATGCTTGCTTGAGAGGATTGCGTGGCGACGCTGGGATAGTGGAGTGCTCTTTTGTAGCTTCTCAGGTTTCTTTTCTCCCTTTTATGCTGGTTATATTTGTCATTTGTGTGAACATATATTTCTAATTTGCAAATTTTGCTTGCGGTGGGTATTGAAGGTGACAGAGCTGCCTTTCTTTGCATCCAAAGTGCGGTTAGGTCGCTGTGGCATCGAGGAGATCTTATCACTTGGTCCATTGAATGAATTCGAAAGGTTTGTATGCTTTTCCAGTATTTGGCATGCATAACATGCACTCATATTTAGTGCTACATGCTCTTATATGCTTTTCAATGATGTTGATCCTAAATCCCCACACTGTGTAATTATCAAGCTATCTTCTAGTAGCGCACAACGCTTATATCGCCAGCTCATAACAGTCTTTAAAACCTTCATGACTTGATTGCCAGATCAGTAGATACTGACTGGAAGTCTGCCTAATGGTTTCTATTGGACTGGGCTCAAGTACTATTACTTGCATTTAGTAGCTCATAGCAAATACTGACAAGTCCCCCTTTTGAAAGTGAAAAATACTGCTGAAAATATGAATGCATAATCATGGCAGACTGCGGCCGTATAACAGTGCTTAGAAAGAGTCCTGAAAGTAGAGATGCCCCACTACAGATTGTATGGCTTCACATTGCAATATAAATAATACTATTGCCAAGTTATCTCTTCATATCCATACTGTAGAACTGCAGGATATATGACCCCTCCGACAAGAACACGCTGCGTCTGAATTGAAAGCCTCTGCGGCATATATATGACAATATATGATGCTGCATTAGGTCCACAGCCAATTAAGATTTGATGTATCCTACTGCTGTATTGACCTGCATTACTGATTATCTTCATACATCGCTGTCATGCAGAGCTGGACTGGAGAAGGCTAAGAAGGAGCTGGCCGAGAGTATCCAAAAGGGGGTCGCTTTCATCAACAAGTGA</dnaseqindica> |
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