BGIOSGA035938
| Gene Name |
BGIOSGA035938 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA035938, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_38889 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA035938-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA035938-PA |
| Length |
6153 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:19647622..19653774 |
| Sequence Coding Region |
19653196..19653774,19652406..19652508,19652232..19652269,19650244..19650345,19650012..19650095 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:19647622..19653774 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCGGCATCCACCGCCGCCTCCGCCGCCAAGTCCCCGCGCCTCCGTCTCCACCACCTCCTCCTCTCCATCCTCTCCGCTCTCCCAACCTGCCCTCTCGATCACTCCACCCCCACCTCCGCCGCCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCGAGCCACCACCACGTCGTCACCACGCTCCCGGGCTACGACGGCGAGCTCCCGTTCCGCCTCGAGACGGGCTACGTCGCCGTCGACGAGGAGGAGCACGGCGCGGAGCTCTTCTACTACTTCGTCGAGTCCGAGTCCGGCGACCCGCGCCGCGACCCGCTCCTCCTCTGGCTCACCGGCGGCGCCCGCTGCAGCGTGCTCAGCGGCGTCTTCTTCGAGGTCGGCCCGGTGAGGCTGGCCTTGGAGCACCACCGCCCCTACGACGCCGGCGAGCTCCCGCGGCTGAGGTACCACCCCCACGGCTGGACCAAGGCGGCGAGCGTCCTCTTCGTCGACTCGCCGGTCGGCGCCGGCTGGAGCTTCTCCCGCCACCCCGACGGCTACCTCGTCGGCGACGTCTCCGCCTCGCTGCAGCTCAAGCACTTCCTCGCGAAGTGGATTAGTGATCATCCAGAGTATCTCGCAAATCCTTTCTACATTGGAGGTGACTCCTACGCAGGGAAGATCGTCCCATTTCTCGCGCAGAAGATCTCTGAAGATATCGAAGCTGGGGTGAGGCCAATTGTTGATCTCAAGGGCTATCTAGTAGGTAATCCGGTTACAGGTGAAAGCATTGACTTCGATTCGAGAGTGCCGTATGCTCATGGAGTTGGGATCATTTCAGATCAGTTGTACGAGACGATAATGGAGCACTGCCAAGGAGAGGATTATAGCAACCCCAAGAATGCTATTTGCCGTCAAGCTTTGGATAGGTTTAACGAACTGCTTGGCGAAAGTTCTGGCGGACATATCTTGTACAACTATTGTATTTACGATAGTGATATAGATGGATCGATCCAGGAAAAACCAAAGATTCCACCATTTCCTCCAAGAGAATGTATTGGAAGTGTCGATGAGTGGTTAAGGTGCCACAATGGAGATCTGCCTTACTCGATGGACATCAAAAGCAACATAAAGTTTCATCACAATGTTACAACAAAAGGTTACCGTGCCTTGGTATACAGTGGTGACCATGATGCAATGATACCATTTTTGGGCACACAAGCCTGGGTGAGATCACTCAACTTCTCTGTTGTAGATGACTGGAGGGCTTGGCACGTCGATGGCCAGTCAGCAGGGTTCACCATAACGTATATGAACAACATGACTTTCGCTACTGTAAAGGGTGGTAGCCACACAGTACCAGAGTTTGAACCAGAGAGAAGTCTCGCCATGTTCAAGCGTTGGATTTCTAATGAACCGCTTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPASTAASAAKSPRLRLHHLLLSILSALPTCPLDHSTPTSAASAAAATASHHHVVTTLPGYDGELPFRLETGYVAVDEEEHGAELFYYFVESESGDPRRDPLLLWLTGGARCSVLSGVFFEVGPVRLALEHHRPYDAGELPRLRYHPHGWTKAASVLFVDSPVGAGWSFSRHPDGYLVGDVSASLQLKHFLAKWISDHPEYLANPFYIGGDSYAGKIVPFLAQKISEDIEAGVRPIVDLKGYLVGNPVTGESIDFDSRVPYAHGVGIISDQLYETIMEHCQGEDYSNPKNAICRQALDRFNELLGESSGGHILYNYCIYDSDIDGSIQEKPKIPPFPPRECIGSVDEWLRCHNGDLPYSMDIKSNIKFHHNVTTKGYRALVYSGDHDAMIPFLGTQAWVRSLNFSVVDDWRAWHVDGQSAGFTITYMNNMTFATVKGGSHTVPEFEPERSLAMFKRWISNEPL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..579#1267..1369#1506..1543#3430..3531#3680..3763#3864..3983#4776..4897#5477..5590#5729..5774#6070..6153#ATGCCGGCATCCACCGCCGCCTCCGCCGCCAAGTCCCCGCGCCTCCGTCTCCACCACCTCCTCCTCTCCATCCTCTCCGCTCTCCCAACCTGCCCTCTCGATCACTCCACCCCCACCTCCGCCGCCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCGAGCCACCACCACGTCGTCACCACGCTCCCGGGCTACGACGGCGAGCTCCCGTTCCGCCTCGAGACGGGCTACGTCGCCGTCGACGAGGAGGAGCACGGCGCGGAGCTCTTCTACTACTTCGTCGAGTCCGAGTCCGGCGACCCGCGCCGCGACCCGCTCCTCCTCTGGCTCACCGGCGGCGCCCGCTGCAGCGTGCTCAGCGGCGTCTTCTTCGAGGTCGGCCCGGTGAGGCTGGCCTTGGAGCACCACCGCCCCTACGACGCCGGCGAGCTCCCGCGGCTGAGGTACCACCCCCACGGCTGGACCAAGGCGGCGAGCGTCCTCTTCGTCGACTCGCCGGTCGGCGCCGGCTGGAGCTTCTCCCGCCACCCCGACGGCTACCTCGTCGGCGACGTCTCCGCCTCGCTGCAGCTCAAGCACTTCCTCGCGAAGGTAATTAATTAATCTATACGTATACTATACACAACATGTGATATCATATATATCATATATATTAGTACTACTACATCTGTCACATAAAAATTATATTTCTACATTTGAATCTTTATTCAAAAATTATATTTCTACTAATGTGGAACCCAGCAAATTGATTACATCAAAATATATTTCCTTCTAATCTCTGATCCTTCCAATTACTTCTCTAACTTGTTGTCTCAACATTCCTTTTAATTAAATAAGGTTATTGTAGTCATTTGTTAATTCTACGAATTTGTCCTTAATTCCCTATAAATATAATGTAATTTTTATTAGATCGGAGGAAGTAGTAGTCTTCTGGTAGACGTCTCTTTCAAACTTATTTAATTTTTTTCAATTCAGACTTATTTAATTTTTTTAGGAAAAACTTATTTAAATTTAACTAAACTTATAAAGAGAATAGTAGTATTTTTAATAAAAACAAACATATTACAAAAATATTTATCCAGTGTTATATTTAATGAAACTAATTTGGTGTTCTATATGTTATTAATTTTTTTCTATAATTTAGTCAAATCTAAATAAGTTTGAAAAAAAGTTAAATTGACTTGGACTACGATGAAATGGTGGGAATAGTAATTAATTTTGATTTAGTCAATCGAGTTGAGATGATTAACCTGCTTAATTGGTGTGATTAATATATAGTGGATTAGTGATCATCCAGAGTATCTCGCAAATCCTTTCTACATTGGAGGTGACTCCTACGCAGGGAAGATCGTCCCATTTCTCGCGCAGAAGATCTCTGAAGGTTAATTATTTACTTAATTGCACCATTAATTACGTGCAACTAGGAGATTTTTGTTAGTTTAGTGTGCAAATTAAGCTTAATTAATCTGCGCGCTTACTTTTTTTCTGACACGATCATGTGGTGTGTACGTATTCAGATATCGAAGCTGGGGTGAGGCCAATTGTTGATCTCAAGGTACGTACACCAATACTATATGGTCACCACAATACTATTTATTTAGGTACATTATTATCCTTCTTATGTTCTAATATACTCCCTCCTTTCCTAAATGTTTGACGTCGTTGATTTTTTTAAACATGTTTGATCATTCATCTTATTCAAAAACTTTTGTGAAATATATAAAACTATATATATACATAAAAGTATATTTAACAATAAATCAAATGATAGGAAAATAATTAATTATTACTTAATTTTTTTAATAAGACGAACGGTCAAATATTTTTAAAAAAATCAACGGCGTCAAATATTTTGGGATGGAGGGAGTATATATGTGCCGTTGTTGTCGATAGTTAATTTGCTAGTGGCAATATGAGAAAGACCCGGAGTCTTACTTATACTATTATATCCTAAGTTAGAGGACTAGTTAGCCTAAGACCCTGTTTAGATGGGCTATCACATCGGATATTTGGATACTAATTATAAATATTAAACGTAGACTATTAATAAAACCCATCCATAATCTTGGACTAATTCGCGAGACGAATCTATTGAGCCTAATTAATACATGATTAGCCTATGTGATGCTACAGTAAACATTCTCTAATTATAGATTAATTAGGCTTAAAAAATTTGTCTCGCAAATTAGCTTTCATTTATGTAATTAGTTTTGTAAGTAGTCTATATTTAATACTCTAAATTAGTGTCTAAATACAGAGACTAAAGTTAAGTCCCTAGATCCAAACACCACCTAAGATTCAAGCATCACCACCTCCTAATAAACATCAATATATAGAAATCCCGCATATCATACGTAGGTTTTTTTTTCTATATATGCTAATGGCAATATAACTAAGGCTGTGTTCGGGAGAGCCTGTTCCCAACTTCCCCCTCTCGTTTTTCGCGCGCACGCTTTTCAAATTGCTAAATGGTGTGATTTTTTGCTAAAAGTTTCTATATAAAAGTTGTTTAAAAAATCATATTGATCTATTTTTCTTAAAAAAAAGCTAATACTTAATTAATCACGCGCTAATGGACCGTTCCGTTTTCCGTGTGCACTGTTCTGTACTGTATGCTGGCTTGCGACGCATCCTAAGTCATGTCATTTTTTTAATTACTACTCCCTTCATTTAAAGCATAAGATGTTATTTGTTATATGGACTTTTAGATGTATCATTTCACCATGGTCTTAATATAAAATTTAGTAAAAAAATACGCATTATGTTTTAAGTACTCTTAATGTCAACGTAAGTCACAACAAAATAAATAATACGTATCTTTTAATAAGATGAATAGGTCAAATACCATTTCTAAAGTTCAACAAGGCCATATACATTTAAAAAAAAACGAATTTATTCTCTTCTGTTTCCCGTCATATCTCTGTCTCCTTGTAAGTTTTATAAGACAATCCGATAACCAAAAGAACTTGGCCCAATTAACCCATATGAACTCATAAGCTCATACTCATCACAAACTAAACTACCGACCCACTAACCGATCCAACTCCACCATGTCAGAATAGAACACACACCCGTTCCATGTCTTCTATCTTCATACAACAAGCTAGAGCATGGCCATCTAATGACATCTCTTGACCGACTCTGATCTCGGAAACCGCATCCTAGTCTCCCGTTCCCTTGTAACTCATTATGATCGCTTATAATTCGCTTCCTAGCTTCACATGCACATCAAATAAAAAGAAACATCTTTCGGAAACAAGTTCTGATCACTATCTTGATCCACATTAGTCTAAACAATAACCCATTTTGCCTATTATTCATCACACATATCAAACATGATTTCATCATAAAGGTAGTATGTAGTTATATAGTGTGATCCTTCGTGATAAATTTTTTTTTTGTATATATGGTCATCAATTTGTATTTTGTGATAACAAGCAGGGCTATCTAGTAGGTAATCCGGTTACAGGTGAAAGCATTGACTTCGATTCGAGAGTGCCGTATGCTCATGGAGTTGGGATCATTTCAGATCAGTTGTACGAGGTAATCAAATAATTCTTTAACACGCTATTCCAATTAATCTCGCTAATAAGCCTCACACTAATTAATCAAAGATGACCTCACTAGAAATTAACTGAACCTATGCTGACTGCTGTCTCAATGTGCCTACATGTGATTGATCTTAATTAAGACGATAATGGAGCACTGCCAAGGAGAGGATTATAGCAACCCCAAGAATGCTATTTGCCGTCAAGCTTTGGATAGGTTTAACGAAGTATGTTCCAATATTTCTTTCTATATATAATGCATATGCCAAAAATATTTTGAAATATATATAGCCCTTAGTAAATTGATGTTACTTACTCCATCTGCAGCTGCTTGGCGAAAGTTCTGGCGGACATATCTTGTACAACTATTGTATTTACGATAGTGATATAGATGGATCGATCCAGGAAAAACCAAAGATTCCACCATTTCCTCCAAGAGAATGTATTGTAAGTCAGCCTTATGTATTGGCTTCATTCATATCACTACAAGTGGCTAGATAATTGTTATATAGAGTGCATTATTGTTAACTTATCAAACATCCCTTGTAATTTATGAATCATAATCTGAGGCTAAAAGGCCATGCATGGGGATATAAGGATAAAGAAAAGGGTATGTCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCATGATGTAGGTCTTTCACGAGAGCCAAGCTCGTTGGGTCGTGGATATAGAGTATAATTAAGCATTTTTGAAAAGAGGGCAAAAGCTTTGCCTCGTATGAACTAATAGAGTAGAGAATAGAGTCTAAGCATCAATTGAAAAGAAAGAGCTATTTGAAGAAGAAAAAAAAATGAGAGGATGAAATTACATTATTTGGACCATTTTAAACATTGTGCATTGGGTGAGCTAAGCCTAATATTAATACCAGTGACTAGGTGATGCAGTCTGGTATTGGGACTGCTCTAACATTGCATGCGCCCTTGTTCTCCGAACATACATAAACACTTGTATATCACTTCATTTCCATTTAGTATAGTTATGTGCCACTGCCACCAAAAGTTGTATATGAATATCCATTAATTCCTAATTTCTTCCAGCAACAGACATATGGCAATTATTTAATATATTTTTGGGCTAACAACAACATCACACGAGAAGCTCTTGGGATAAAGATGGTAAAATTTCATATACAACTTACTATTCGCCAGGATACATTTTGCATTAATGTTAATTCTACCTACTTATTTTATCTCTTTATGCTAACAAATAATTAGGGAAGTGTCGATGAGTGGTTAAGGTGCCACAATGGAGATCTGCCTTACTCGATGGACATCAAAAGCAACATAAAGTTTCATCACAATGTTACAACAAAAGGTTAC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