BGIOSGA036004
| Gene Name |
BGIOSGA036004 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036004, complete gene. |
| LocusTag |
OS12G0562100 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA036004-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA036004-PA |
| Length |
4778 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:18510451..18515228 |
| Sequence Coding Region |
18515080..18515228,18514255..18514459,18514109..18514172,18513697..18513821,18513528..18513617 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:18510451..18515228 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:18510451..18515228 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGATGGTCACCGCCACCGCCGCCGCCGCCCTCCTCGCCTCGCCGCCGCAGGGTCATCTTGGAAGGCGGTGTCACCTCGTGGTGCCCGGGCTACGGCTGAGGCCGCCGGCCAGCTCATCTCCTCCCCACGCCGCCCCGCCGCTCAGGTTAAGCAATTTTGTCCCAAGGTGTTACATCACAAATGTTGAGGTTGATGTTAGTCATACGAGTGAACAAGAGGCTCTAGATGATCACCCACCATTGTTGCCAGCCTGCGCCATTCCAGTTGTACACCTACGAGATGTTCCGGATGCTAGTCCTTTTCCCCTGCATGAGAGTGCTTCCCATTCTACTGATTTTGAAGAGCTACCCGTCTTGTCTGAGGGTGAGCTACATACTATAGCTTCCACCCCTGCCCACCCTGCTGGATTATATGCTCTATACGCTAGCTACTTATTTGGTAACTTGGTGGAACAACTTTGGAATTTTGCTTGGCCTGCTGCACTGGCAATTCTCCATCCAAGCCTATTGCCTGTGGCTATTGTCGGTTTCTTCACAAAGCTTTCAGTCTTTATTGGGGCACCAATAGTAGGGAAACTTATGGATCATTTCCCTCGAATACCTATGTACACAGGGTTGAATGCTGTCCAGGTAGCCACTCAGTTGATATCAGCTGCAATGGTCATCTATGCTATGAAGAATGTGACCCATGCATCTACGTCCGCCGTAGTTCTCAAACCTTGGTTTATCGCACTAGTGGCAGCTGGAGCTATTGAAAGGCTTGCAGGATTGGCACTAGGAGTTGCTATGGAGCGGGACTGGGTTGTGTTGTTAGCAGGAACTAACAGGCCAGTTGCATTAGCTCAAGCTAACGCTGTGCTTAATCGACTTGATCTTGTTTGTGAGACTGTTGGTGCTTCAGTTTTTGGCCTTCTGCTGTCCAAATATCATCCAGTAACCTGTTTGAAGATTGCTTGTGGTCTAATGATATGCAGTTTCCCTGTCCTGGTTGTGTTGGGTCAACTGATTAACAGATTCTCCTGCCATGCTCTTGATTCCTCTAGAACCCCGAGTGATGAATCTATCTGTGCCAATCTATTGGATGTTCGTAAGATTGTTCAAAATGGCTTGAGTGCTATCAGAAATGGCTGGAATGAGTATAAGCAGCAAACAGTTCTACCTGCAAGTGTAGCTACCGTGTTTCTAAATTTCAATGTAGCACTTGCTCCTGGTGCTATAATGACTGCGCTATTGATGCATCGTGGTATTAGTCCGTCGATTGTTGGTGCTTTTAGTGGATTGTGTTCTATCATGGGCCTTGTTGCGACATTCATCTCCTCAAGCTTGGTGGAAAGAGTTGGAATTCTAAAGGCAGGAGCAGCTGGATTGATAGTTCAAGCTTCACTCTTGTCGGTCGCTCTCGTAGTGTATTGGACTGGTTCTATTTCACAGAGGACACCTCTACTTATCTTCCTGGCTGCTATCGCATTATCTCGGTTGGGGCACATGTCATATGATGTTGTGGGTACACAGATTCTCCAAACAGGTGTTCCTGCATCAAAAGCAAATCTTATTGGTGGAATGGAGGTCTCAATATCAAGCCTTGCAGAACTAGTCATGCTTGGTATGGCCATCATCGCAAACGACGTTTCTCATTTCGGTTTCTTGGCAATCCTATCCGTGTCATCGGTTGCTGGTGCGGCATGGATGTTCTGCCAGTGGTTGGGAAATCCTACAGATGAGCAGAGGGAACTGTTCATGTTTGATCCCCATTTCCAAGTTGAACCAATGTTGGAATTACTTAACACCGGTTTAAACATCAAGATTTTTAAAGTTCAAGCAAACGGCCCTGAAAAAAACTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGMVTATAAAALLASPPQGHLGRRCHLVVPGLRLRPPASSSPPHAAPPLRLSNFVPRCYITNVEVDVSHTSEQEALDDHPPLLPACAIPVVHLRDVPDASPFPLHESASHSTDFEELPVLSEGELHTIASTPAHPAGLYALYASYLFGNLVEQLWNFAWPAALAILHPSLLPVAIVGFFTKLSVFIGAPIVGKLMDHFPRIPMYTGLNAVQVATQLISAAMVIYAMKNVTHASTSAVVLKPWFIALVAAGAIERLAGLALGVAMERDWVVLLAGTNRPVALAQANAVLNRLDLVCETVGASVFGLLLSKYHPVTCLKIACGLMICSFPVLVVLGQLINRFSCHALDSSRTPSDESICANLLDVRKIVQNGLSAIRNGWNEYKQQTVLPASVATVFLNFNVALAPGAIMTALLMHRGISPSIVGAFSGLCSIMGLVATFISSSLVERVGILKAGAAGLIVQASLLSVALVVYWTGSISQRTPLLIFLAAIALSRLGHMSYDVVGTQILQTGVPASKANLIGGMEVSISSLAELVMLGMAIIANDVSHFGFLAILSVSSVAGAAWMFCQWLGNPTDEQRELFMFDPHFQVEPMLELLNTGLNIKIFKVQANGPEKN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..149#770..974#1057..1120#1408..1532#1612..1701#1815..1994#2192..2266#2446..2547#2642..2750#2825..2971#3050..3156#3241..3354#3450..3754#4706..4778#ATGGGGATGGTCACCGCCACCGCCGCCGCCGCCCTCCTCGCCTCGCCGCCGCAGGGTCATCTTGGAAGGCGGTGTCACCTCGTGGTGCCCGGGCTACGGCTGAGGCCGCCGGCCAGCTCATCTCCTCCCCACGCCGCCCCGCCGCTCAGGTGAGTGGCTGCCTGCCTGCCTTGCTTGCTTGCTAGTTACTACTGTCTTAGCATTGCCTGGATGCGTCAGTTAAGTTTTATGCAACAGCACGCAATATGGTGGGGATTTTGCCTGAGAATTTTTGTTCCGGGGAAGATTGGTGGTTCGGAAAGTTCTTTCTTGAGATTCATGTGTTGTTGTTGGTGGTGGTGGTGAAGAAGAGATAGGAGTTGGGATAGGTTGCGCTTCTTTGGGAGCTATGAAGTGCAGTGGTGTTGGTATTTTGATTTTTTTTTCTTATCATTGGTTTGTTCAGACCTTTGTGATGGTGACCTTATGATATAGGGTAAAATTAGCTAATAACAAGTGTGGTTGGTATGTCTGTGATTGGTCACTCATGCTGCTTAACAGATTTAGTTTTAAGTGTTGATTGTGAATGTGAATCAGTTCAGCATTAAACCCTTTATTGGATTTTGATGTATGTTAGGTTAGTGGACTGAGCTTGTGACAATGTATGTTGCTTTTGTTCTGGTCTTGTGATGATTAAACCAGCGTGGAAATCGCAAAACAATGTTTACTTGGAGTGCCTCTTAATTTTAGGATTTGGCAAAATATCAATGACTGGTTACTATTTTGCCAGGTTAAGCAATTTTGTCCCAAGGTGTTACATCACAAATGTTGAGGTTGATGTTAGTCATACGAGTGAACAAGAGGCTCTAGATGATCACCCACCATTGTTGCCAGCCTGCGCCATTCCAGTTGTACACCTACGAGATGTTCCGGATGCTAGTCCTTTTCCCCTGCATGAGAGTGCTTCCCATTCTACTGATTTTGAAGAGCTACCCGTATGATCTTCTTTCTTTCCCGATGCTCTTGGTCAGATACCATTTTTATTTGTACTCTTGTTACAGTCTGTTTGTGATGTAGGTCTTGTCTGAGGGTGAGCTACATACTATAGCTTCCACCCCTGCCCACCCTGCTGGATTATATGGTGCGTGAGAATTTCTGGATCATGTCACTGGATTATCTTTCTGCACTATTTAGTGCCTTCACTTCACTGCACAGTTCTTTTTTGATGGAAATGGATTTGTGTAACCATAATATCTACTGTTTAGTCTATTTTAATATTTCATAATTGGCAGCTAGTTAATATTTTCAAAGCCTAGCTCTTGGCTGAAGCAGCAAAGCTGACCTCCAGTAATTTATTTTTACTATTATAATATAATATCTAGCATGGAGTTTTGAAGACCCTTTAAACATCGTGTATGATTGATGCAGCTCTATACGCTAGCTACTTATTTGGTAACTTGGTGGAACAACTTTGGAATTTTGCTTGGCCTGCTGCACTGGCAATTCTCCATCCAAGCCTATTGCCTGTGGCTATTGTCGGTTTCTTCACAAAGGTATTCGCCACAGTACTAAGTGACTAAATTCAAGAAATATTTTTTGTTTCAATAATCTAATTTGTTTTATGATATCCAGCTTTCAGTCTTTATTGGGGCACCAATAGTAGGGAAACTTATGGATCATTTCCCTCGAATACCTATGTACACAGGGTTGAATGCTGTCCAGGTACTCGTCCTTTTTTTCCTTATGTTCTGGATGATATAAAGCCAAATTAGATTATATCGGAGTTGCAAAAATCCTGTATTCATGCCTGTTCTGTGTGCAACCTGTTCTGTCAGGTAGCCACTCAGTTGATATCAGCTGCAATGGTCATCTATGCTATGAAGAATGTGACCCATGCATCTACGTCCGCCGTAGTTCTCAAACCTTGGTTTATCGCACTAGTGGCAGCTGGAGCTATTGAAAGGCTTGCAGGATTGGCACTAGGAGTTGCTATGGAGCGGGACTGGGTTGTGTTGGTAGGGTTACTTATCCAGATATATTTTATAGATTGTGTATTCCCATTGTACAAAATCCATATTATGAAATGGAACTAAGAAACAAAATTGAAATGGAAGGCTTGACATCATAAAAGACACTTCAGATTTTAGAATAGCTAGCTGTCTTTTGTTGGGTCTGATCAGCTTTCTTCCTTGTTTTTTTTTTCTCTATGAAGTTAGCAGGAACTAACAGGCCAGTTGCATTAGCTCAAGCTAACGCTGTGCTTAATCGACTTGATCTTGTTTGTGAGGTGAGATGTTTCTAACATTTTCAAGCTTCATATGAGCACATTCTTTAATTATGGGAGCAGGCCACAAGACTGTTTGCTTGATTTTGTTATCTTAATGGTTTATTTAGTAACCGCTTTATGGAATCTCTTATTTTGAGTTGACAAGTTATAGTTGCATAACCAGTTTAGTATGGTTACAGACTGTTGGTGCTTCAGTTTTTGGCCTTCTGCTGTCCAAATATCATCCAGTAACCTGTTTGAAGATTGCTTGTGGTCTAATGATATGCAGTTTCCCTGTCCTGGTATATTTCATGTTCCTTAGTAGTACTTCCTAATTAAGTTAAAACTTGAACAACCAGATGCAGTACACTAACTAGATTCTACATGGACTTTCAGGTTGTGTTGGGTCAACTGATTAACAGATTCTCCTGCCATGCTCTTGATTCCTCTAGAACCCCGAGTGATGAATCTATCTGTGCCAATCTATTGGATGTTCGTAAGATTGGTGAGGAGCTTGGATGATTGAGTTTCTTATTTCATTTCACTTCTGTAGAGTCTAATACTTTCTTTAACCTTCAGTTCAAAATGGCTTGAGTGCTATCAGAAATGGCTGGAATGAGTATAAGCAGCAAACAGTTCTACCTGCAAGTGTAGCTACCGTGTTTCTAAATTTCAATGTAGCACTTGCTCCTGGTGCTATAATGACTGCGCTATTGATGCATCGTGGTAGGTTTCACTACTCCTGCTCAAATTTGCAACTCTGGAAAAGTCTCTTAACAGCATAATTGTTTTGATAATTTATAGGTATTAGTCCGTCGATTGTTGGTGCTTTTAGTGGATTGTGTTCTATCATGGGCCTTGTTGCGACATTCATCTCCTCAAGCTTGGTGGAAAGAGTTGGAATTCTAAAGGTTGGAGTTATTCTTACTTATTTTCTTTTGTTTATATTATGTTACAAATTTATAATTTGACACAACTGTCTTATGTTATACCAGGCAGGAGCAGCTGGATTGATAGTTCAAGCTTCACTCTTGTCGGTCGCTCTCGTAGTGTATTGGACTGGTTCTATTTCACAGAGGACACCTCTACTTATCTTCCTGGCTGCTATCGTGAGGACGAAATCCCTGAAACTTGTTCCAATTCGATAGACTTTTAACAAAATTAGAGTACTAATCCATGTGCATGTTCCGTGTTGTTTTTGCAGGCATTATCTCGGTTGGGGCACATGTCATATGATGTTGTGGGTACACAGATTCTCCAAACAGGTGTTCCTGCATCAAAAGCAAATCTTATTGGTGGAATGGAGGTCTCAATATCAAGCCTTGCAGAACTAGTCATGCTTGGTATGGCCATCATCGCAAACGACGTTTCTCATTTCGGTTTCTTGGCAATCCTATCCGTGTCATCGGTTGCTGGTGCGGCATGGATGTTCTGCCAGTGGTTGGGAAATCCTACAGATGAGCAGAGGGAACTGTTCATGTTTGATCCCCATTTCCAAGTTGAACCAATGTAAGTAAAAAAAAAACACCATTCATGCCATCACCTTGTTAAGAAAGATACTAGAGTTCAGAGTATTTGACTTCCATACTGGACGTAGCAAGAACTTTGTGCCACTTCTTTTTCCCAATTTACCATATGATCTTGAATATTGAAATTACAAATATCAAACGTTACATCGCCATTCGCTCATTGCACAAAGAAATGTACCATATGACAATCATCTAAGATGGCACTTCAATAGTTCAATTGTTGGATAGAGCTTCTGTTACATAGAAGTGAAACTTACAGAAAACACCACTATCTCATCTTGCAGATAATGAACAAGGCATGTTCTAAAGTAGCTGGGAAAGTTACATCACATGCTGCGTGTGCTTGGCGTCAGAAGAGGGCTCTGCAATGCCCTGAAGATGCTGTGACATTTTGATTCAATACAATATACACTTAGGATACAGTCATTTGTTACTATTAGCCCAAGCCATGCGTAGAATTCAACTTGTACACCCTTTTTTTCACCTCACATGCTGTACAGTTCATCTACCATGGGCTTAGTTGTTTGTTGTAGGCTTGTAGCTGATGTAGAGCACCATAACAATCAGTTGCAATAACAAAATCAATAGCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACAGTACACACAGATATGCAACGGAAAAAGTCCACTTTACTTCAATTTTTTTTTTCTAATTTTACATCCCGGATTATTAAAAATATTTTACTTTCCTCCCCTGATAAACACTATTTCTCTCTTTATTTCTCTGCATTTAAGTCATATCTTGCACTGCAAATTTGGTAGGATGCTAGATGTGTTACAACTTACTGCTCCGTCCCAAGAAAACCAATTCCTACATGTGTACAGGTTCATAGCTAGTAATTGATTTTTTTTTGGACGGAGGGGTACATCCTAACATATTTTAAAGAAATTTCACTGTTTATGTAGGTTGGAATTACTTAACACCGGTTTAAACATCAAGATTTTTAAAGTTCAAGCAAACGGCCCTGAAAAAAACTGA</dnaseqindica> |
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