BGIOSGA036027
| Gene Name |
BGIOSGA036027 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036027, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_38682 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA036027-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA036027-PA |
| Length |
9747 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:18046507..18056253 |
| Sequence Coding Region |
18056189..18056253,18055873..18055915,18055119..18055300,18054688..18054871,18054470..18054560 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:18046507..18056253 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:18046507..18056253 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGAACTACCTCGCGCAGTTCCAGACCATCAAGTCCTCCTGCGACCAGCATCGTCGTCGCCGTGCATCACATCGGCATGAAACAACCCGTGTAGGATTCTCCCAAGATCTTGATGAGTTCAAGACCATTCTTAAGCCTCGCCTCAAATTGATTGTGCAAAATGATGAGAGGGAATGGTTCATTGTATTTGTGTCTAAGGCCCATCCTAGCAATGACCAAGCATCTAAGATGGCAAAGAGAGTATATGCTAGGCTTGAGAGCGATTTCAACACTAAAAAAAGAGAAAGATGCTGTAAATTTGATCTCCATGGACCTGATGCGGAATTCTGGGATGATTTTGACTCCAAAATGGTGGACTGCATTAGAAACACATTGGATAGGCGGGTTCAATTTTATGAAGAGGAAATTCGCAGGTTAAGTGAGCAGAGATTCACTCCGATATGGAACTTCTGCAACTTTTTTATTCTTAAGGAAAGCTTGGCTTTCATGTTTGAGATGACTAATCTTCATGAAGATTCACTCCGTGAATACGACGAGCTTGAACTATGCTACTCAGAATCAGTTAATTCTCCTGGAAAACATCGAGAATTTGGAGGATTGGATACTGGTGATGATCAAGCGGCGCTGCTAAATCGAGGATTTAAAGCATTGACCCAAATTGTTCAGGATGATGTGTTCAGAGAATTTGAGTTTAGACAATACATATTTGCTTGCCAGGCTAAGTTATTGTTTAAATTGCATCGCCCAATTGAGGTTGCTGCAAGAGGATATGCTTTTGTGGTTAGCTTTTCCAAGACGCTAGCCTTGCAGGAGAATGGTCTACCATTTTGTTTTCGTGAAGTATGGGTGATAACTGCATGTATGGATTTAATAAAAGCAACAACCTCACACTATGATGGTACAGCTGTTGCTATCGACTCAGAGAGGGAGTTCTGTCGTATTCAGGGTGACCTCTATTCTCTGTGCCGTATTAAGTTTCTGAGGCTTGCTTATTTGATTGGTTATGGAGTTGAGATAGAAAAAAGTCCAGTCAACAGTGCATCTTTAAGCATGCTACCATGGCCAAAGCCAGCTACATGGCCTTCTATTCCACCGGATTCATCAGCAGAAACAATGGCAAAGGAGAAGGCAAGCAGTTTTCAGCATTACTTTTTGACATTTAATCTTCTAGTGATGCTTCATATGATTCTCCAAGCAAAATCAAGAGAAAAGATCTTCAATATTCACAGGAAACCACTGCCATTAGAACCTTCTTTGCTTCTTCGTGAGGCTAATAGGCGTAGGGCTTTTCTTTCTGTTGGAAATATATCTGAATTATATGATTCAGGTGATGGTTCAGGTCTGGATGCAAATTCAAAACCTTCGCCCAACAAATCTGCTTCGAACTACATGGCCAGGACAATGTCAGGGCCGGCGACATCTGAGACTTCTCTGCCAGTTGATCGCCCCATGAGGTTGTCAGAAATTCATGTTGCAGCTGAGCATGCACTGAAGCAGACAGTATCTGACCCTAATTTTATGACATCACTTTCATCACTAGAAGAATTTGAGAAAAGATATATGGAGCTTACTAAAGGCGCAGCTGACAATTATCATCGCTCTTGGTGGAAAAGACATGGAGTTGTGCTAGATGGAGAAATTGCAGCTCTATTCTTTAAGCATGAAAATTATGATTTGGCTGCAAAGTCCTATGAGAAAGTTTGTGCTCTCTATTCTGCAGAAGGCTGGGAAGAGCTGTTGGCAGATGTTCTTCCTGATCTTGCAGAATGCCAGAAGATTCTCAATGATGAAGCTGGTTATTTGACTTCCTGTGTGAAGTTACTTTCTCTAGAGAGTGGCTTATTTTCATCTAAAGAGCGGCAAGCTTTCCAGTCAGAGGTTGTTCGGCTTGCTCACAGTGAAATGAAGCATCCTGTGCCCCTTGATGTCTCATCACTTATTACATTTGCTGGAAATCCTGCTCCACCACTAGAGTTGTGTGATGGAGATCCTGGTACACTATCTGTAGCTGTTTGGAGTGCCTTCCCGGATGACATCACACTTGAGTCTCTCAGCTTAAGATTGTCGGCTTCCTCTAGTGCAGATGAAGGTCTTAAGGCGATAAAGAGTTCAGATGCTCGAGTTCTTGTACCCGGTAGAAATATCATCACCTTCGACATTCCTCCTCAAAAGCCTGGATCCTATGTGTTGGGTGCTCTGACGGGCCAGATTGGCAAGCTATCATTCAGATCGCATGGATTTTCTCAAGATGGTCCAGTGGACACTGATGAATTCATGAGCTTTGAGAAGCCAACAAGGCCTGTTTTGAAGGTGAGAAAACCAAGGGCTTTAGTTGATATTACTCCTGCTGTGTCCTCTGCATTGCTTATGAATGAACTTCAGTGGATTGGGTTAATTGTCAAGCCAATAGACTATTCTTTGAAAGATGGCATATTGCATATAGATGCGGGTGCTGGACTGAAAATTGAGGAGTCCCAGATGATTGAGATAGAAACTTATGGAAGTGATGTGGAGCATGTTGGTGGTACTGATGCTTCCAAGACATCATCAAGCTCCACTGATACTCGTAAGGTTGAGAAGGTCCCTATTGAAGATGGGAAGATAAAAATACCAGACTGGGCTAGTGATGTGACTACTCTTGTATGGTTTCCTGTTCGTGCTATTGATGATACAATTGCAAGGGGTGCATCGCCAGCATCCCCTCAGAAACAGAGCATAGTAGATGGGATGAGAATGATTGCTCTCAAGCTTGAATTTGGAGTTTTTCTTAATCAAGTGTTTGAAAGGACTATCGCAGTACATTTCACTAACCCATTCCATGTGAGCACACGCGTAGTAGATAAGTGCTATGATGGAACTCTACTACTGCAGGTGATATTGCATTCTGAAGTGAAGGCCACTCTGCATGTAAAGGATATATGGTTGGATCTGCAATCTGGATTTGAACACACAGGAAAGGGAGATGGACGACCAACTTCGAACTTGTTCCCTCTGGTTATTGCTCCTTCTTCGAGAGCTGGAATCTTATTTGTAATACGTTTAAGTGCCTTAGGAGATATGGATGAGCTAGAAAAGGCAGATAGCATGTTGAATATTAAGTATGGAATATCCGGTGACAGAACAACTGGAGCACACTCTCCAGTTCCTGTTAAACCTGATGATTCTGAGGAGCTTGTATTCAAGATTGCGGTGAAGATGAAGCGCCCTGTCCTGGACCCATGTGTGGCAGTTGGGTTCCTTCCATTTTCTTCGGACTGCTTGAGGGTTGGCCAGCTGGTCAACATGAGATGGAGGGTTGAAAGGCTGAAGAACCCGGAGGATGCCTCTCTGTTAGCCGACGAAATACTTTATCAAGTCGACGCCAACCCACAGAACTGGATGGTTGCTGGGAGGAAATGCGGTCACGTATCGCTGTCAAACGAACAAGGTTCAAGGATAGAGATCACGGTGACGTGCGTGCCGCTGGTGTCCGGCTACGTCCATCCGCCGCAGCTGGGCCTGCCGCACGTCGGCGAGGCCAACATCAGCTGCAACCCGGCAGGCCCTCACCTGGTGTGCGTCCTTCCTCCGACACTGAGCACCTCATACTGCATACCGGCTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MANYLAQFQTIKSSCDQHRRRRASHRHETTRVGFSQDLDEFKTILKPRLKLIVQNDEREWFIVFVSKAHPSNDQASKMAKRVYARLESDFNTKKRERCCKFDLHGPDAEFWDDFDSKMVDCIRNTLDRRVQFYEEEIRRLSEQRFTPIWNFCNFFILKESLAFMFEMTNLHEDSLREYDELELCYSESVNSPGKHREFGGLDTGDDQAALLNRGFKALTQIVQDDVFREFEFRQYIFACQAKLLFKLHRPIEVAARGYAFVVSFSKTLALQENGLPFCFREVWVITACMDLIKATTSHYDGTAVAIDSEREFCRIQGDLYSLCRIKFLRLAYLIGYGVEIEKSPVNSASLSMLPWPKPATWPSIPPDSSAETMAKEKASSFQHYFLTFNLLVMLHMILQAKSREKIFNIHRKPLPLEPSLLLREANRRRAFLSVGNISELYDSGDGSGLDANSKPSPNKSASNYMARTMSGPATSETSLPVDRPMRLSEIHVAAEHALKQTVSDPNFMTSLSSLEEFEKRYMELTKGAADNYHRSWWKRHGVVLDGEIAALFFKHENYDLAAKSYEKVCALYSAEGWEELLADVLPDLAECQKILNDEAGYLTSCVKLLSLESGLFSSKERQAFQSEVVRLAHSEMKHPVPLDVSSLITFAGNPAPPLELCDGDPGTLSVAVWSAFPDDITLESLSLRLSASSSADEGLKAIKSSDARVLVPGRNIITFDIPPQKPGSYVLGALTGQIGKLSFRSHGFSQDGPVDTDEFMSFEKPTRPVLKVRKPRALVDITPAVSSALLMNELQWIGLIVKPIDYSLKDGILHIDAGAGLKIEESQMIEIETYGSDVEHVGGTDASKTSSSSTDTRKVEKVPIEDGKIKIPDWASDVTTLVWFPVRAIDDTIARGASPASPQKQSIVDGMRMIALKLEFGVFLNQVFERTIAVHFTNPFHVSTRVVDKCYDGTLLLQVILHSEVKATLHVKDIWLDLQSGFEHTGKGDGRPTSNLFPLVIAPSSRAGILFVIRLSALGDMDELEKADSMLNIKYGISGDRTTGAHSPVPVKPDDSEELVFKIAVKMKRPVLDPCVAVGFLPFSSDCLRVGQLVNMRWRVERLKNPEDASLLADEILYQVDANPQNWMVAGRKCGHVSLSNEQGSRIEITVTCVPLVSGYVHPPQLGLPHVGEANISCNPAGPHLVCVLPPTLSTSYCIPA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..65#339..381#954..1135#1383..1566#1694..1784#2476..2636#3211..3300#3402..3563#4755..4816#4999..5143#5604..5755#5874..6090#6244..6789#6993..7205#7369..7753#7880..7970#8079..8163#8268..8451#8910..9190#9354..9444#9572..9747#ATGGCGAACTACCTCGCGCAGTTCCAGACCATCAAGTCCTCCTGCGACCAGCATCGTCGTCGCCGGTACGGGTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCACTGAACCCTAGAAATGGCCCCGGGATCTGATCCGTCAAGCCGCGCGGCTGGCTCGGCCCGCGTGATCTCGGGGCCGCGGCGATTCGAGCTGGAATAGTGGGTCTAGTTTAGTTAGATTCGCAGTGCAGGTAGTTTGCATGTTTGCGTTTGTGTAAAATTTCATAGTGATTGAGCTCACGAGCAGCAATGGAAGATGCGGGGGGTTTGGTGGTTCCATGATCTGATTCTGGAAGCGTGATGCAGTGCATCACATCGGCATGAAACAACCCGTGTAGGATTCTCCCAAGTATAACTACCCTCATTCACTCACTGCAGCTCAACTTGCTAGCACATTTCTAGCTATGTTGGAAGATTTGCCTTTTAGGGCGTACAGTTTGGAGAATTACATTGAAAATGGGTTTGAACATTAATTGTTTTACTTCTTTGCTGCACATGCTGGTGGAAATGAATTTCAAGTTTGTTTATCTGTGTGGACTTCTTCTTATACATGGTAATTTGCGTTTTGTAACAGTTGAAGATGTGAGTGACTTGTGGCTCAATGTGAAAGAAAGTTTCGAGCACGCTTACCAGTGAAGAAGGCCTGCCTCAATAACAGGCGAGGAATCCTGTTTTTGTGGAAAACCTACCAGCTGAGTTTATACAGACCACTGATTCGAGGCTACGTAGTCGATTTCCACAAGATCAATACTTGTTTTGGTTCCGGGAACCATATGCAACTGTTGTTCTTGTCAGTTGCGAGGTACTTTCGTGTCCTCATGCATGCTGCTCTTTCTAATTCTTCTCAAGTAATAATATCACTTCTCAAACGGACCATGTGGATGACTTTTTGCATTCATTTCTCTCTATTGAAATCTCCAGGATCTTGATGAGTTCAAGACCATTCTTAAGCCTCGCCTCAAATTGATTGTGCAAAATGATGAGAGGGAATGGTTCATTGTATTTGTGTCTAAGGCCCATCCTAGCAATGACCAAGCATCTAAGATGGCAAAGAGAGTATATGCTAGGCTTGAGAGCGATTTCAACACTAAAAAAAGAGAAAGGTATTTGTTTGCCAATTCTGCATAACAGTATTGGTAATATTCATATCTTTGACTTTGAAAAATGTAAATGTTTTGGTTGATTCAGTTCAACATGCTATTTGCGGTCATCTTGCACTTATGTTGTTCCTATATGGATGCTCAACCTCCAAATTCCCAAGGAACTTTTTTTGGGACCTTAAGTTAAACTTCACTACAAATAGTATCGAGTTATTAACAGGTTTAAAAAGTATGGCCTTTTATGATGCAGATGCTGTAAATTTGATCTCCATGGACCTGATGCGGAATTCTGGGATGATTTTGACTCCAAAATGGTGGACTGCATTAGAAACACATTGGATAGGCGGGTTCAATTTTATGAAGAGGAAATTCGCAGGTTAAGTGAGCAGAGATTCACTCCGATATGGAACTTCTGCAACTTTTTTATTCTTAAGGTATAACAATGCAACCACGTTTGATGCTTGTCAGTTGAAATTATATTTTTAGTAGCACTGGTTTTATGAACAAACATACCTTTGTTTCATGTGGCTTTCTTGTAATTGATATCATTTATTTGTTTAGGAAAGCTTGGCTTTCATGTTTGAGATGACTAATCTTCATGAAGATTCACTCCGTGAATACGACGAGCTTGAACTATGCTACTCAGAATCAGGTTTTCTCTAACTTCGATGTAGCAGTTATGTTGCATTCATTTTTGAGCTTTGCATCTAGTACATTTGCATATATCCAAAAGCTTTTCTGCCCTAATCAATATAAAGGTCGCGGTATAAGATTTTTTTCAAGAGTGATGAAGTTTTTCATGAATTTGCAGTAACTCCGTACATCTATTCATGCTTATTTGGAGTCTTTGGACTAAGCTATGTTTTTATCGTTGCACAATATGTCATTCACTTCTCATAGAAAATATAGATTTTTATTGAAATCTTAGGTTAGAAATGTTTTTTTTCATGGATAGATTTTATAGTATTAGATAGAGGTTTTAAAAGCTGTGCTTCTGATACCAGATCAGTCAGATGACATTATAAAACATTAATATTGCTTCCAACCATAAACATGTAAAATTGTAAATCTAATTTCCAAGTTTTCCTTGTTCTTTCTGGAGAATAACTGTTTATTTACGAATTTTTTAGTACTTATCATGCTTCGAAACTACCATTTCATCATCATTGACTATATCTCATTCTTTTCTTCTGTCTTAAGGATCTAACTGTGGTGTAAAACTTATCACTTTGCTGCGTAAGTTAGTATATATTATAGAGATATCTAAAATAAAATGTAAGGAATATTGTCTTACAGCATGGTTTGTTATTAGTATTCATAACATTCTGTTCACATGAATGCAGTTAATTCTCCTGGAAAACATCGAGAATTTGGAGGATTGGATACTGGTGATGATCAAGCGGCGCTGCTAAATCGAGGATTTAAAGCATTGACCCAAATTGTTCAGGATGATGTGTTCAGAGAATTTGAGTTTAGACAATACATATTTGCTTGCCAGGCTAAGGTATAAGACATGTCGTAAAAAAATGAGTAACTGAATGCTATTTTTTCCTATGATTTTTTTTGTCAAGTCAGTAATATTTTTTTTCATTCTTACTTCATTGCAATCTGTTCTTCATTGCTGTACTGCTTGGTTCTTTTTTTATTACCAGTTACATGCCCGTACGTTGCAACGGGATCATTAGATTTTTTTTTAAGGGTGGTTTTTTTATAAAGAGAGGGAGCATTTTTTTTAGAGGAGGAAGGACAACGACTGCTCTTTTAAAGTAGTTAAGATGAGTTGGCAATGTCACAGTTAGAGAATACCATTGTATGTGTCATTGACATGTGTGTCCAGGCCCCACATGTCATTCTCACATACAATTGCAATTTGCAACTCACATATGCCTAGAGTGCTACTGTTTAATGGCGTAGCGGTGCTCTTTATTGCTCAATACAAACATGCACACTGTTTTACTCAAGTGGAACATGTTACATAAAACTAGACATCCAGTGCCAGAACTTTGTTCTGTTTTAGAGCTAGTTCAACTGAACCTTATATATTGCCTTTATACTTTTTCCATTTCACCATTTTGCAGTTATTGTTTAAATTGCATCGCCCAATTGAGGTTGCTGCAAGAGGATATGCTTTTGTGGTTAGCTTTTCCAAGACGCTAGCCTTGCAGGAGGTATGTACATTCTCTGTTTTATTCCTCTACAAGCAAAGTTTATGTTCTAGAAAGACTATATTGTGTGAAGTGTACTCAAGTAATTCTGAATGTGCTTTCAGAATGGTCTACCATTTTGTTTTCGTGAAGTATGGGTGATAACTGCATGTATGGATTTAATAAAAGCAACAACCTCACACTATGATGGTACAGCTGTTGCTATCGACTCAGAGAGGGAGTTCTGTCGTATTCAGGGTGACCTCTATTCTCTGTGCCGTATTAAGGTAAGTTCTGATACTTCTGGTAATTTAATATTGATTTCCCTGCTATATATCGTATTTTTATTCTATTTACGAATTTACATTTTCCCATGAGTTATTGAAGAAGTATGAATGTTGTCTAGAATTCTGTACTTAATGAGGCTTATTTGTTTTAGCATTGATGCATTGTGATTTGTAGAAGTATCTAGTAAGGTTGCGTTTTTTACCTCCCTTTCCCAACCTCCCTCCCTCGTTTTCTGCGCGCACGCTTTTCAAACTACTAAATGGTACGTTTTTTGCAAAAAAATTCTATACGAAATTTGCTTAAAAAAATCATATTAATCCATTTTTGAAAAAAAATTTAGCAAATACTTCATTAATCATGCAATAATAGGTGCTTCGTTTTACGTGCCGGGGAGGAGGGGTTCCCAACCCCTCCTCCCGAACACAGCCTAAGTTTAATTGCTTAAATCTAATGTTTCTACTTGTTCCTATTTAATATTATAAATTAAGTACAAAAAAAGTGGAACAGTAGTGGGAAATAGTATTATGCAAGAGTTAGTTTGTAAAAAATCTTTAAAAAAAGAACTTAATTTTGTACTTGGTCAAGACCAGTTTCTGTTGCTATATTTTTAATCATTTCACACTAGCCGTGCTTTCATTTTTAGTTGTAAATCATTTTGGAAGTTACCTGTCTTCACACAAGTTTCTATTGTTTGATGATTTATATACATTTGTCATAAACCATTTATATTTTCTGTTAATAAGTAATGTTGTTGTTTATTTGTAGTTTCAAATCATTTACTAGTTACATCCTTATCTTCACATTAGTTTCTATTACTGTATTAAGTAATTTAGTCCTGATGAATCATTTTCGGAGTTGCCTAGCCATGTTGTCATGAATTGATCCGGTGTATTCACGGAATCAAGTTGAGGGGTGTATCTCCAGGGAATGACCCACTTGAACCACCCAATTATGTTTAGTGACCTATAGTGCAATTTACTCAATATTTTTAATTCAAATGGAAACTGTGTCTGTTCTTTCTCTTCTTTCTTTTGTACTCTTAACAATATGTGTTACTTTTTTTATTACAATGAATTTCTTGTGTGCCATCAATCAAGCCCTTTTTCGTTGCTTTGTGAATTACATTTCTCTCAGTTTTGTACTGTACAGAAAACTGTTTGTTTATATGATACTCTTGATGGATATTGCAGTTTCTGAGG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| External Link(s) |
