Os12g0176500
| Gene Name |
Os12g0176500 |
|---|---|
| Description |
Similar to Replication factor C subunit RFC4 |
| Version |
NM_001072828.1 GI:115487617 GeneID:4351654 |
| Length |
3861 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0176500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:3872402..3876262 |
| Sequence Coding Region |
3872529..3872572,3872697..3872775,3872869..3872948,3873922..3874041,3874124..3874193 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:3872402..3876262 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgccgctcgtgccgtcctcgcagccatgggtggagaaataccggccgaggcaggtgaaggatgtcgcgcaccaggaggaggtggtccgggtgctcaccaccaccctccagaccgccgaccttccgcacatgctgttctacggcccgcctggcaccgggaagaccaccaccgcgcttgccattgcttaccagctctacggtccagagctctacaagtcaagagttctagaacttaatgctagtgatgatcgtggaattaatgtggtgaggactaagatcaaggactttgctgctgttgctgttggttctgcacgaaaaggcggttatccctgcccaccatacaagattattatactagatgaagcagattcgatgacagaagatgcccagaatgctttaaggcgtactatggagacttactccaaagtgacaagattctttttcatatgcaattacatcagcaggataatagaaccacttgcatcaagatgtgcaaagtttagattcaagcctctttcagaagaagtaatgagcaatcgcattttgcatatatgcaatgaagaagggctcagtcttgatgctcaggcattggctacactaagcaccatctctaatggtgacctccgccgtgctataacctatcttcagagcgctgctcgcttatttggatcttctatttcttctactgacttgattagtgtttcaggggctatccctgaagacgttgtcaagtcattgcttgcatcttgcaaatctggtgaatttgatgtggcaaacaaggaagtcaataatattattgcagatggataccccgtttcacagttgatctcacagtttctagatgtgatagttaatgccgatgatattccagatgagcagaaggcaagaatatgtaaaaagcttggggaagcagataagtgcttggtcgatggagcggatgagtatttacagcttttggatgtggctagtgagactatccgtgctctttttgacatgccacaaacgctggtcttctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAPLVPSSQPWVEKYRPRQVKDVAHQEEVVRVLTTTLQTADLPH MLFYGPPGTGKTTTALAIAYQLYGPELYKSRVLELNASDDRGINVVRTKIKDFAAVAV GSARKGGYPCPPYKIIILDEADSMTEDAQNALRRTMETYSKVTRFFFICNYISRIIEP LASRCAKFRFKPLSEEVMSNRILHICNEEGLSLDAQALATLSTISNGDLRRAITYLQS AARLFGSSISSTDLISVSGAIPEDVVKSLLASCKSGEFDVANKEVNNIIADGYPVSQL ISQFLDVIVNADDIPDEQKARICKKLGEADKCLVDGADEYLQLLDVASETIRALFDMP QTLVF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>128..171#296..374#468..547#1521..1640#1723..1792#1871..1944#2026..2146#2233..2295#2381..2440#2789..2914#2991..3074#3545..3643#agaggcgggaagcgaagccgcagcccgccactcgcctccgccctccgcgcgcgcgaacccctccctcggcggcggcgacgaccaaggcggcggcggcggcagcggcgcaagaggacgcggtagcccgatggcgccgctcgtgccgtcctcgcagccatgggtggagaaatagtaagcgccgccctctcttcccctcccccacaccattttcctccctcaatttgtcgataagccctcatggattgccctagttgcgactgactgaccccgctgctcatcctcctcccgttcgcagccggccgaggcaggtgaaggatgtcgcgcaccaggaggaggtggtccgggtgctcaccaccaccctccagaccgccgacgtgagccgcgggctaaaccctagctctgtttcttttttttttctcttgtgaccccctgggaggtttctgatttgtgatctggtccctttgcagcttccgcacatgctgttctacggcccgcctggcaccgggaagaccaccaccgcgcttgccattgcttaccagctctacgggtaactcaattcttgttggcaactgtttacttgaatttttctctttatgagaatcttgttttggttcggttgaaattggcttatcttagtaatcttggaagaggtggtaattctcaatgcaatgggagcattagataggctgcgctgggggtgaatcacttaacttttgagacattagaattgataaccttcattatcttgggtattttgtttattttggcaaatattggtatacatctttgtaggcaggcgttccaaaagtgggtacaattagtttgatgacatggttgatcctagtcctgcatattacaatactaatcggaccactggatcaatgtgtttgaatgatgtatggtgaaatggtagttcaagtttaaaatttggattgttgaaatgttgagatctgttataattttgttcactcatcagccattttcattgtttctgggctaggtaatttattcttgcatctctcacaggccccttttttcttgttgagttgttaccacttcacttgcttgattagaatctcacttgcttgattagaatctattcgatgtgtgtaatggttcatgtcttaccaatgataattggaggcggtcagatgtatggagggaaatctagagaatcaaaattttcatgtggaatagcacatatgaattaagggaaaaaataatactgaaacagtttgttaggaggaaatttgattagattgagtagtagcgaagtttattctctttttttttcaactgataatgagcactatagtgattgagattatctgtctgccaattttgctcttctaatatggtggttacttcctaaattcatttgcaagaaaaaccccattctaatcatgactactaaataatgaaataacattaagaggatatgttttctgcaaatagtgcaaggttgttctcagtaagtttgggactcatgatagttttttcgtactatttggatgatgcagtccagagctctacaagtcaagagttctagaacttaatgctagtgatgatcgtggaattaatgtggtgaggactaagatcaaggactttgctgctgttgctgttggttctgcacgaaaagggtaatttaaccaaaactagggacctttcagtttccatctgtagttgcattcttgactagtttgtttttgcgatggccttcagcggttatccctgcccaccatacaagattattatactagatgaagcagattcgatgacagaagatgcccaggtatagacaacaggcagaacgctaaaagccttgttgctgcagaaccgtgcgttgatgatgtcttatatctgtctgtagaatgctttaaggcgtactatggagacttactccaaagtgacaagattctttttcatatgcaattacatcagcaggtattagtttgtttctccttttttccccctgtggatctttatttgagtttatgtaattcattatcctaatgtgtaatacaggataatagaaccacttgcatcaagatgtgcaaagtttagattcaagcctctttcagaagaagtaatgagcaatcgcattttgcatatatgcaatgaagaagggctcagtcttgatgctcaggtaactgtactgcattcacttcaaaatctaaatctacatttaaatatccgcatttttgctaacactctttttatttttcataataggcattggctacactaagcaccatctctaatggtgacctccgccgtgctataacctatcttcaggtatggtttatctagtttggcgtttgcattatgtggtttatttatattaatcttaatttaatataccttttgttttttgttgcagagcgctgctcgcttatttggatcttctatttcttctactgacttgattagtgtttcaggggtacattaccactcatttctgttcccttgcaaatgcctaaacttacatgtgtcatttattttgctattctatgtttgagtctgtacaaagtcacgcttacttgatgacattgttttcctgaaagtagcaaagtggattttgcaccattttgttaacaagatcctgtgcacgtggtgatcaaattgtttaattgagagaaattcggtgtacttgtaacctggaaaaacttctctcatgtcatgataaattttagtgtgcaagtagtttgtgattggtataagtagtccagggaaccttattttatgggaggttaaattattttgctcatcttgtttgtccatatgtcaggctatccctgaagacgttgtcaagtcattgcttgcatcttgcaaatctggtgaatttgatgtggcaaacaaggaagtcaataatattattgcagatggataccccgtttcacagttgatctcacaggtcatctctatttaatttaaatctagatatgtgctgttttcaccttgtcatttgctaacctaactactccgtgcagtttctagatgtgatagttaatgccgatgatattccagatgagcagaaggcaagaatatgtaaaaagcttggggaagcagataaggtttgtcctactgggtttctcttctgtttttgttattctttcctactcccttcgcctccttatgaaagtggtttatgtggacaattatatatgacaaacatagaaataaatcttgctttgggaccgagggagtagatgcttgttccactatatctatagatttactttaccgaacaagtctttgtaagatccttcttgtcatcatgaggtgaatgtttgtgactaaaaacttagaaggcaacattgtatacaatgtaccatagatgattgtaatgaaggattgaattttctgtttctatgtttgtcatatattccacatactgaagttcaaataaaactgctaacttatatgtggaacagttccagcaattttatgtgtacatcattaaaagcatacacttaatatgatagctctgaagtattgttgctccatcccaattttctcattccatttcttttggaatatgtagtgcttggtcgatggagcggatgagtatttacagcttttggatgtggctagtgagactatccgtgctctttttgacatgccacaaacgctggtcttctaagagaacatggattggaaagatgacgcaggtggccatttctgcgagggatatcttctgtctcctttccaagtttaggttctgggggaagctcattttctcgacagactgttgtgccttttttatgtttgtgatggggattaaatagtgtgaactccacccttgtaaccaactgaattgtgcaccagtgtgtccatggaaagaatggttttcggcctgtc</dnaseqindica> |
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