Os12g0179800
| Gene Name |
Os12g0179800 |
|---|---|
| Description |
Silent information regulator protein Sir2 family protein |
| Version |
NM_001072842.1 GI:115487645 GeneID:4351669 |
| Length |
4749 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0179800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:4031268..4036016 |
| Sequence Coding Region |
4031703..4031756,4031847..4031946,4032060..4032187,4032595..4032759,4033080..4033209 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:4031268..4036016 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:4031268..4036016 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggcgggggcgcacgcgtcgcgcgcttcggctccgatcattgcaggtctcacaggtgctcttcgagcagcatataaaggattttctcctcagttatgcaacttccatgcgtcagtaaataatggacttctccacagaaggaaaatacaactccattttatatgctcttttcgctccatacaagcaagatataaccattcgtcagctgttgcacctaaggactattgcgaaacttacatccagtttctaagagataaacagatagttcctgattcagatcctccaagtgctaaggatgtggacctactttaccggtttattgatcagagtaaaaaactcatggtgttaactggagcaggaatgagcactgaatcaggaattcctgattataggagccctaatggtgcttacagttctggttttaaaccacttactcatcaggagtttgttcgttctattcgagcccgaaggcggtactgggctaggagctatgctggatggagaaggttcaggagagcacaaccaaactcagcccattatgctcttgcatcactggagagaattggccgggtacactcaatggttactcaaaacgtggataggttgcatcatcgtgctgggagtaagccagttgaattgcatggaagtgtgtatgaggtagcatgtttagactgtggtacatccattgaccgagaatcattccaggagcaggtcaaggacctcaacccaaagtgggctctagctattgacagtttggaagtaggacaaccgggctcagacaaaagtttcggaatgcagcagcgacctgatggtgatattgagattgatgagaagttctgggagcaagattttgatattcctagttgcaaccaatgtggtggagtgctgaaacctgatgttgtgatgtttggtgataatgttcctgaagagagagctgaaagcactaaggaggctgcaagaaattgtgatgctcttctagtggttggttcagcactaatgacaatgtctgcttttaggctcgcaaggcttgcacatgaagcgaatgctccaattgcggcgatcaccattggtgagaccagggctgatagtattttatccttgaaaattaatgcaagatgtggggagatactgcccagaatacttcagatgggaagtctagctgtaccaaacgtaagttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAGAHASRASAPIIAGLTGALRAAYKGFSPQLCNFHASVNNGL LHRRKIQLHFICSFRSIQARYNHSSAVAPKDYCETYIQFLRDKQIVPDSDPPSAKDVD LLYRFIDQSKKLMVLTGAGMSTESGIPDYRSPNGAYSSGFKPLTHQEFVRSIRARRRY WARSYAGWRRFRRAQPNSAHYALASLERIGRVHSMVTQNVDRLHHRAGSKPVELHGSV YEVACLDCGTSIDRESFQEQVKDLNPKWALAIDSLEVGQPGSDKSFGMQQRPDGDIEI DEKFWEQDFDIPSCNQCGGVLKPDVVMFGDNVPEERAESTKEAARNCDALLVVGSALM TMSAFRLARLAHEANAPIAAITIGETRADSILSLKINARCGEILPRILQMGSLAVPNV S</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4261..4314#4071..4170#3830..3957#3258..3422#2808..2937#2558..2718#1619..1664#1476..1541#1143..1391#1012..1055#121..159#atttcccaccaaacaaaaaaaccaaatcgccgagcagcttcgcggcgacgcaccacgtcggccggccgccaccgccggagagggagggcctccccgaccctccccgccaagaaggatcctatggcggcgggggcgcacgcgtcgcgcgcttcggctccggtaacaatttctcgccatttttttttctcgttctccctcgatcgaaactggccttttttttttctcaacgtcattatgtggtttagtggatcgggatttgatgggccttgactcaatcgacggcgcccaagattttctgggcacgattttggaaggcggttcatgccgtggcagtttggaatttggtggttcaggaattaggactcaactgagaacctggagtaggcatttccaatagctgttgctttgttcctttgtgaaattagttacgtaaatgtttcgttcagctgaggtgcaatcactgaatcactgaagttcatagttcagtgaatgttctatatggcattgttatggaaaaggaatttagtccttcctaatggctaatgatggagctactgaactagcatgctagcttcattataacatgtaggagtacaatttgtatgcctgttccaaagctccgtaatttttctatgataatcctgtctaactgtgaaccaacctagacagtttcttgtggtacttgcgatattggctcacacaggctacacagcagatttttaggacctctacaacaccatgctactcgcggtattatgatttataccagaatttctgttccatctaaacagtttgcataacatttaaacaggccatgagttagtttggaaatataaattatgggtaattcttttactgtcgtaattcaagtttcttggaataatttccaaattatgatcgctttcttggtcattgactgtgcaattaagtttattctatttatatgcatctttcttattggcactattgaggcttatggaacaaccaacttacctgtgtaatggaattcagatcattgcaggtctcacaggtgctcttcgagcagcatataaaggcaagttgtctgagaagaactgtttttctggcatgatttaacaattcctaattttccactaactagttgaaaccagtcacttatcaggattttctcctcagttatgcaacttccatgcgtcagtaaataatggacttctccacagaaggaaaatacaactccattttatatgctcttttcgctccatacaagcaagatataaccattcgtcagctgttgcacctaaggactattgcgaaacttacatccagtttctaagagataaacagatagttcctgattcagatcctccaagtgctaaggatgtggacctactttaccggtttattgatcagaggtaggaatctgcccttgaacatttttcaacatttttagctatgtttcaagtgagattaacttcgctatcttctacttgcttcagtaaaaaactcatggtgttaactggagcaggaatgagcactgaatcaggaattcctgattataggaggtacacttaacccagttgccagacttgccatgtttctatgtactattctaacatgcagaatttttgtttggtggcagccctaatggtgcttacagttctggttttaaaccacttactcatcaggtgtgaccctacttctgcttgtcaaatgacaactattatcatgcttttttacttctttgtgtcaaatgataactattatcatgcttttttacttctctgacagaggtgcatggagatttttctctcattatggagctattttaaactcatatgtcctaagtcagtgttttttctaaaaaaatttcattcctaagactaacaaagttgtgcactctctgtttcttgacatatattatccatgtgaaaagctcataaaaaatgctacttacattagtcgttttttctttacatcaagagcttttttaaaataagttcagactgttatatttgtattcattttttctgagcagaacttatctggatactttactgaaatgctgatttaaaaatgattttggcaggcgattttaaaataattcacatggagaaaccattgaaaacaaaaaaaaaatctatcattaaggaacattgatggacctactagaacttttaatcctctggcatgctttaatctttaatgtaattatttttttgacaattgttttgtggtttttgcaattttatgttgtatttcgttcatgaatgcttgcatcaacttctccagagcttgacaaaattcggttcagattatgattcacctaaagaacagtaaagaaaccttttactgttaaggaacacttatcagatctatataggtctcaattttttctggcatgaaccttaatttgagatgtcattgaatcatactatatgattttctgatagtaaacttagtttctgcaacatatgtaccaatgttcagtaggaaatcatgctagtagcccctaatgctctcctcatttgtccaaatcagcttaccagtgattacacccttccaactttactatttgtaggagtttgttcgttctattcgagcccgaaggcggtactgggctaggagctatgctggatggagaaggttcaggagagcacaaccaaactcagcccattatgctcttgcatcactggagagaattggccgggtacactcaatggttactcaaaacgtggataggtaatgggctggatctatgtcattgcggcgtagttgagaatgataatgttatttatttctcaccttcacttttcacgtatgtatttaaggttgcatcatcgtgctgggagtaagccagttgaattgcatggaagtgtgtatgaggtagcatgtttagactgtggtacatccattgaccgagaatcattccaggagcaggtcaaggacctcaacccaaaggtttgcctgtttgatagttgcttttttttttctttaagctatgttcattatatcagtagtatgtgctgtacatatgacagaaattcaaaaaaaaaatattaaataggtgttaatgttgacagaaattaaaatatttgataactgaactcttgcatttgatgctataattgttcaataaatcagacttacagtacatgagtatagggaaatgatgtcattttctgatcaaagtttcaagtgaatcaatggttcttactcccctaatatggactatatttcagttttgggacgaagcataatatatattgctttatctgcagtgggctctagctattgacagtttggaagtaggacaaccgggctcagacaaaagtttcggaatgcagcagcgacctgatggtgatattgagattgatgagaagttctgggagcaagattttgatattcctagttgcaaccaatgtggtggagtgctgaaacctgatgtgagaatactctcctaccttatgggagtacttttagttatttttttttaaaaaatctcacgtataagtattcggcattggtttattgcagtttgaatgaggagtatgacagcaggccatattagttaatatttttataacattgatttttcataatcaaacaaggccatcattccaatatataatccattttcaaacttgatttccatggtttgcatgcatgcagtctttcattggtgtgcatctctagcagttcttttttcggacaatgtttctcttacactgtacaaaattcccttttttttcctgatattttggcagcagctcatgttaccacttcggaaaacagcaaactttcttccttcactatttaaagtgattgttcacgtgtgttctgatatttgaaggttgtgatgtttggtgataatgttcctgaagagagagctgaaagcactaaggaggctgcaagaaattgtgatgctcttctagtggttggttcagcactaatgacaatgtctgcttttaggctcgcaaggtaccacccgaaatattattcagccacccccttgtataaatttagacctagttatcatctgttgagaacatttttttatgagaacaaaagattgatgataaatccaatcctaggcttgcacatgaagcgaatgctccaattgcggcgatcaccattggtgagaccagggctgatagtattttatccttgaaaattaatgcaagatgtggggaggttagtactttcatctcatacttattttttgtaatgcaccatatgactcactgcatttctcccttgctgtaatgccaccatcttcttcagatactgcccagaatacttcagatgggaagtctagctgtaccaaacgtaagttaagctggtgctgcgcagtcatctttgtcggaaaccatgtttccatgtaagaacaattctttggagaacaaacaagtcacaagggaagacgaaacaatgaaagaaacttttagcaactaattaagttcagttcaactgggcagaatatcatctccatcctgtttgcatgagatgagggagttaaccttgttaaccctgttgttgtaagtgtgtaaaccttaaccttgttaaccctgttgttgtaagtgtgtaaacctttttcagtgacaattcattcaaatgtttccaaagatatggatatcccgaactgatcagcacattgaagaagtacaatatgctttgatagttccttgtaatgtgtcattaagcagaagttgaaaaacgttctagctggtccggatatttggattcatgtagtctattgtgctcttcacctgt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |