BGIOSGA037131

From RiceWiki
Revision as of 08:34, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA037131| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA037131, complete gene.| tag = OS12G01...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA037131

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA037131, complete gene.

LocusTag

OS12G0197900

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA037131-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA037131-PA

Length

7286

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 12

Location

Chromosome 12:5281120..5288405

Sequence Coding Region

5281120..5281290,5283226..5283330,5285033..5285119,5285241..5285294,5285378..5285523
,5285628..5285781,5285868..5286005,5286252..5286323,5286431..5286504
,5286592..5286733,5287376..5287454,5288308..5288405

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:5281120..5288405 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:5281120..5288405 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGTCGGCGCTGGCTCCCGCCCCGAAGCTGCAGCCGGACGAGCGGTCCAACCTCCTCTCGCTGCTCGCCGCCGCCTCCCGCCCGCTCGCCGACGTCGCCGCCGACTTCCTCGCGCGGTTCCCCCTCGAGCGCCGCCTCCGCGTCGGCGCCGCGCTCGGGTTCCTCCTCGAGGACAAGAAGATGCTTCATCCTACTGGTCGGTTGATTGCATTTGCTATTCTTCACCAGAGTTATTCCTCGGAGCCGGCAAACCCATATGTTCCACTTTTATTAAATGCAGCCTGTGATGAAACATCAGAAAAATCGGAACGGGCATTTGTCCAACTTTTGTTGACTTCAGCAAGTGGAAACAATAACATTGAGGTGCTGAAGCAGTCAGCTGTAGATTACATAAATGGGTCTGATTCTGCATCTCAGGCCTTACTTCCACGAGAACAGCTTGAGAAGCTATTCAGCAGTAATAGTGTACAGTCTCAGCCTCAGACCAGTAGTTTTAGTGCAGGAACTGTTAGATGTGCTATACCGGATCCAGATGTACCTCAAAGCTGTGTAAATTCGTCAGAGCCTAGCATATCATTACCTGGAACCAAACCAAAATCTGCTTCTGATGATAGAGATTTTGCTCTTGCTGGTTTACTCCAAGAAAAATCATGGGGAAGATTGGGTCCGCAATGGATACGACCCACACCCCCAAGACTTCACATACTTGATGGAGAGCTACAATGGTTGAACCCTGACAACAACCACGAGCTATTATGGGATTATAGCATGTGTGCTGACACAAGTCGAGGTGCTGCTATTCGAGATTTGATTGCAAGAGCCTTAAAAGGTCCACTTGCACCTTCCCAACAAGAGCAAGTCGTAATAGAACTGGCAAAGGACTCGAAGTTGGTGTATCATTGCGGGATGACTCCACAAAAGCTCCCTGACCTTGTTGAACACAATCCACTCATTGCTGTTGAAATTCTTTCGAAATTGATGAACTCTCCTGACATTGATGGTTACTTAGATGTTCTTGTGCATATGGAGATGAGCCTGCATTCTATGGAAGTTGTAAACAGGCTTACTACTGCTGTAGAACTCCCGACAGAGTTTGTCCATGAGTACATCTCGAATTGCATCCAATCATGTCAGAACGTTAAGGATAAATACATGCAGAACAGGTTGGTGAGACTAGTTTGTGTTTTCCTTCAGTCTCTCATCCGAAACAAGATCATAAATGTTCAAGACCTCTTCATCGAGGTACAAGCTTTCTGCATTGAGTTCTCACGGATAAGGGAAGCAGCTGGCTTATTCCGGCTGCTCAAATCTTTGGAGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSALAPAPKLQPDERSNLLSLLAAASRPLADVAADFLARFPLERRLRVGAALGFLLEDKKMLHPTGRLIAFAILHQSYSSEPANPYVPLLLNAACDETSEKSERAFVQLLLTSASGNNNIEVLKQSAVDYINGSDSASQALLPREQLEKLFSSNSVQSQPQTSSFSAGTVRCAIPDPDVPQSCVNSSEPSISLPGTKPKSASDDRDFALAGLLQEKSWGRLGPQWIRPTPPRLHILDGELQWLNPDNNHELLWDYSMCADTSRGAAIRDLIARALKGPLAPSQQEQVVIELAKDSKLVYHCGMTPQKLPDLVEHNPLIAVEILSKLMNSPDIDGYLDVLVHMEMSLHSMEVVNRLTTAVELPTEFVHEYISNCIQSCQNVKDKYMQNRLVRLVCVFLQSLIRNKIINVQDLFIEVQAFCIEFSRIREAAGLFRLLKSLE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..171#2107..2211#3914..4000#4122..4175#4259..4404#4509..4662#4749..4886#5133..5204#5312..5385#5473..5614#6257..6335#7189..7286#ATGTCGGCGCTGGCTCCCGCCCCGAAGCTGCAGCCGGACGAGCGGTCCAACCTCCTCTCGCTGCTCGCCGCCGCCTCCCGCCCGCTCGCCGACGTCGCCGCCGACTTCCTCGCGCGGTTCCCCCTCGAGCGCCGCCTCCGCGTCGGCGCCGCGCTCGGGTTCCTCCTCGAGGTAAAGGGGCCACGCCCCATCCCCATCCCCATCCCCCCCTGCCCCTCTCCCCACGCCCTTCTCGGCCCTCCCTCCTGCTGCCCTCCCACCGCTTTGCTTGCTTTCGTCAGATTGCGTCCAGGATCTTCGCGGGCGGAAACGGATCGGGGAGCGGTTTGGTTCCATCGGCTTAGGGTTCGTGGTGGGAAGTTAGATTTAGTGGTTATGGGCGTGTTACGATGTCTGGGAGGTTGCTCCAGTTGGTCCCGACGTGAAATTACGGTGGTGGCTTCGTTCGGGGTTTCACTTGCTGGGGGTTAGCCCCCTGGATTGGGCTAGAGAATGTTAGGTTAGGCACAGATTTGTGGGGTTTTGGAGGAACTTAGCTCACTATATTTGGGTACTATTGGTAATAACCTTTGGGGTTACGAATTGCTTGATCTCGGATGGGTTGCTCAACTTCTAGATTTAGTGGCATTGTTTTGCTTTAGCAGAGTGGAGATGCAGAATTTTTAAATTTCTTTATGGCCTTGTGTTGTTAGTTTGATCAGGTTTGGATGGATTCATGTTTGCAGATGATGAAAATTTTGACTCCATTGCCTTGCTGATTTTGTGTCTATGAGGATCTGGGTTGCAATACACAACGTAGGGATGGACTCATGCTACACTCCGTATGAGTGCGTATGGTCCATTGTCTTAGTTGGTCAATTTTGTGATGTCACCGAATCGCCAAATATTTGGGTTTCATTTGTTCTTGAGTAGGTTAGCACTTAATTAGGGTTCCATTTCAAGTGAACAATCAGTGTGATTAAAGAAACATTATTAACATTTTTAATCCATAAACCTGCTTCATTCTTGGTATAATTCGATCGATTTAATAAACATGCTCTTTGTGATCTATCAAACTTGTCAGCTGTTTCAGAAGTGAATACTAACAAGCAGTGGTGTGAGCATTGCTTACTTGATTGGTTTTAATTACTATTTATCAAGTGTCTGGTGTTGAGTAAAAACAAATAGAGGAGACCATGGATCTGTTCCTTATTCTCAACTTCCACTATTTCATGCAATAGTCTGATCCTGATAGTACCTTTACTTCTCGTTCCAAAAGCAATGCTGAACCACACATATCATGGAAGAACTCTTCCTCCCAACATAACAGGAGCTAGATAAATTCAGCGTTTTCGATTTATCCCTGCTGGCAACATGCATTTGAGCTGACTCTATTCTCGATTATCAATGAAACTGCACTGTTTAAACACATGTCAGAAAGAGATCTATTTATCTGCACGGATTCTAACAGAGATGACAAGTCATATTTTTGGTGTGAAAACAAAACAATGCAGATTATCAAAGAAAGATGTAGTTCCTTTTGTGCCATCGCCCATCGGATGATCCCTTATTTGTGGTTATGGTTTACCACACCAAAGTTGTTCTTTTCTTTACTACTGTAGATTTAAACCATTACTCTTGCGAAAGTAGAATGTGAGGGTAATGGTTTTGAATGTGCTCGCATTGTAGGAAAAAGAACAATTTAGAGTGAACAATTAGGGGACAGAGGAAACCTTCCATGCCATATAAGGAACTTTCTCTGGAGAAATCATTTAATGAGTTTGTTAATGCATTCCTATGTTCTGATGAAGATGGTCACTAAGCTTTTAACCATTAGACAAGAACTGCAACCCCTTCTCCTTTATAGTGTGTTATCCAGTTTCTCGACCAAAGACACATTGTTGTTTTTATTTGACCTTTGTAATGGGCAATAAAAGTGTATTTGTCTTTATTTCACCATGCATTTGCAATTCTTTTCTTGATTATGCTGTTTGTCTGTTTATTCTTGACCATGCTAAGAGATATTTGGAGGATGCATGTTTTTGTAAAGATTCTTTTAGTTCTGAAATTTATTTCACAGGAAAAATGAAGTTCAGACTTTGATATATTTTGTTTCGTTTTGACTAGGACAAGAAGATGCTTCATCCTACTGGTCGGTTGATTGCATTTGCTATTCTTCACCAGAGTTATTCCTCGGAGCCGGCAAACCCATATGTTCCACTTTTATTAAATGTAAGCAATAAACTTTTTTCTTCAATTTTTTGTATTTTGGATCATCATGAAATGGAAGGGTTCCCAATTCCCCCTTCACTCTATGTAATTCAGAATGGGTGAAATTACAAGGTCATTTGATATGTTTCAAGATTGCTTTAATTTTCAAGAAGTAAATACATGAGCATAGGCTGCGAGGAAGCTATATAAACTGGTAAAACACCACGCATGCTGGTAACTTTGAGTTGTGTTGAAATACTAGTAGACACATAGGTCAATTCAGACAAGCTTGTTCGTCTATCATTTGCTTTCCTTTGTGATGCTGGGTGCTTGCCTAACCTTCAGCCAGGTTGCCCATCCCTGTCCCTTAAGTTATACTGCATAATAGACTACTAGTATACATACATTACAAGAATATTATTGTTTTTGTTTTAGTTTTTGATCAGTAATAATGAAATTTAATTGTTAATGTTGTGAGGCTTTTACTGAGGTGATTCTGCAACTGCGAATTGTTGTAGTAATTTAGAATCGGAACTTGTAGCTTTGAAGACTGTCAGGCCCCATTTGGCCAGGATATATCATAGATCTTTATATTCCTGCGCCATGTGCAAGCTGGGCTCCTAATGAATTATTTATGCTGCCCCTGGTTTCTCTTTTGCTGGATTTTTTGGTTGTCATTTTAGACTCTAGAGATTGATGTCATAACAGTATCATTTTGTCCAAATCTTTTCTTCATTCGTGGTTCTACACATCTTGTTGACAGAAAAGGGTTATGAAAGACCTATAACTTTCTTTAACGTCTGGGTTCTTTTTCTGATCTCCTATTGATCGCTACATAAATTGACATCGCATCTGGCTTGCTAGTTCTAGCTCTACAAAAACAGTTGTACTTTGGAAACTGTCAATTAGGGTCTTACATTGCTCTGCTTTACCTGCATAGGATCTGACATTTGATTTTGATCCCATAACACCAAGTTCAATTGTGCATGCCAATGTTTGTATCATTGTATGTTTGGTAGTACTCCCTCCGTCCCAAAATATAACAGCTTTTAGCACTCAGGTTTGTCCCAAATTATAACAACTTCTTCACCAACATTCCCTTCCCAACCAATCACAACCCTCCACCACTCACTTTTCCCACCTACCTCCACTTCTCAACCAATCACAACCTCTTCCTATTTAATTCCACCCACTTTCTTAATAACCATGTCCAACTCTAACACTTTCTTATATTCTGGGACCGAGGGAGTAGTATTCCAAAATGTAACCCTAATAATTTTGTAGCATATTTGCCTTGGTGTCAAGATCATGGATTTGCTAGTCTATATAGTTTTGTATAGATTTCTTTCTGACCAGTGGGATATGCCTCCACGGCTGCTTATCGGACTAACACCATGTTGAATAAATGTCTATTGCAACTTGCAGCTGGGTTGGATAGTTTATGTAGCATCTACACCAGCTTGGTTCGATAATTTCTGTGGAAGTTGGATCTTTGCCTTTTATCAACTTGGATACTATTTCTTTGTTCGTAACATATGATGGCAATACATGAAGAACACAGAACTGAACACTTAAATATCTGTTTTTTTTTTTTCTGTACACTAGGGCATTTGAAGAATTATTTAATATATATGTTTTGCAGAATTATTTACTATGTTAGAGTCTTATGTTTCTATTGTTATTGTTTATCATGCTTGAAGTTATAGTTTTATTATATCAACAGGCAGCCTGTGATGAAACATCAGAAAAATCGGAACGGGCATTTGTCCAACTTTTGTTGACTTCAGCAAGTGGAAACAATAACATTGAGGTGTGGCCTATCTACAAACATTAGTAAATCATATTGGTTGTAGGACATTATGGCGATTTTATTGCTCCTTTCATGTGCTGACATATGTATGCTTATTTTGGCATTGGTTTGTATGTCTCAGGTGCTGAAGCAGTCAGCTGTAGATTACATAAATGGGTCTGATTCTGCATCTCAGGTAGAGTGTTAAATTCTGATTCCATAATATAAAATTGTTTCAAGATCAGTTTGATTTATTAAAAGGTTCATTTATTTGTTTAGGCCTTACTTCCACGAGAACAGCTTGAGAAGCTATTCAGCAGTAATAGTGTACAGTCTCAGCCTCAGACCAGTAGTTTTAGTGCAGGAACTGTTAGATGTGCTATACCGGATCCAGATGTACCTCAAAGCTGTGTAAATTCGTCAGAGTATGTAGGCTCAGCTAACTCCTCCTGAAATTGTTATGTGGTGCTAGAATTCGTCATATTTTTCTTCTTGGTCTTCTCTTACAAAATTGGTTTTTTTTTATTAGGCCTAGCATATCATTACCTGGAACCAAACCAAAATCTGCTTCTGATGATAGAGATTTTGCTCTTGCTGGTTTACTCCAAGAAAAATCATGGGGAAGATTGGGTCCGCAATGGATACGACCCACACCCCCAAGACTTCACATACTTGATGGAGAGGTAACAGAGTGTCTTAGCCAGCCAAGAGTTGCATCTGTGTACCCGTTCTGTTTCTAAGTGCAACTGTGCTTGTATCGAACATACAGCTACAATGGTTGAACCCTGACAACAACCACGAGCTATTATGGGATTATAGCATGTGTGCTGACACAAGTCGAGGTGCTGCTATTCGAGATTTGATTGCAAGAGCCTTAAAAGGTCCACTTGCACCTTCCCAACAAGAGGTTCTCTGCTACATTCTTGTATTTATGCTAGCTATCTTGCATCTATGGATCACTAATAAACATGAATGTATAAGCACTATTAATTGGTGTTTTGTCTTTTTTATAATATATATTTGTTTAGCATAGGTGCTGGTGCTTTTATGGTAACAAGTATTTTCATTACCCCCTTCCCCATGGACATGCATACATTTTGGTACTATATATTTTCATATGGTACAAGCCTAATTAATGCACAGCTTCTCACAGCAAGTCGTAATAGAACTGGCAAAGGACTCGAAGTTGGTGTATCATTGCGGGATGACTCCACAAAAGCTCCCTGTATGCACCCATGCCAAATGTTGTGTTTTTGGTTGCTAAAAATGTTGTTTACTTATTTTACCATATTTCATCATATCTTATATCTGAGAATTTATGCATGGTTTTAGGACCTTGTTGAACACAATCCACTCATTGCTGTTGAAATTCTTTCGAAATTGATGAACTCTCCTGACATTGATGGGTATGTCTGTTTCTTTTCTTTGCTAGTCAATATGATCACCAACACTTTTTTTTAATATATTTTAATTGTGACCCTTTTCTTTTTCAGTTACTTAGATGTTCTTGTGCATATGGAGATGAGCCTGCATTCTATGGAAGTTGTAAACAGGCTTACTACTGCTGTAGAACTCCCGACAGAGTTTGTCCATGAGTACATCTCGAATTGCATCCAATCATGTCAGAACGTTAAGGTCTGTTTGTTATTTTGCTCGTTCAAATTAAATTTGTTGGAGAATTTGTTAGCAGGGTACTGTAGTTTTGTGGCTTACTTCAAGCTGATGGTTAAACAAAGATTGTTTAATGCTTTATGTCAGTCTGTTTGATCCAGTTGGTGATTTAACCTGGGCTACGTTTTCCATGGAAATATGTGGCCTCTGCTTGTTTGTTTCTTTGATAAGTTCAGATTTAGCATTTCCTCGTAGAAATACTTGTTTTACTGACTTTTTTGGTGAACTGAAGCACTTGTGTAGTGATGGTGCCTGTAAGTAAATGTACGTGCAATTGGCAGATCTTATTGCATGCTTTAGATTGTTGCAAAATAATTTATGTGCTTTATATAATGGCATGCTCCAATCAACTGCCATCTCCTCTATTTGTTCGGTTAAGTCCTTTGATCCAGTAGCTTGCTTGCTAAGTTGGGAAGAGCATTGTTTGCCTACTGGTTTCTCTATTCTCTGATAAAAATCCTTATGTTACAATTTTATTACTGTATCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTGCTCATTGGGTGATGGGTAATTTGCATTTTGTGGCTGCCTCACTTGTTAAATGCGTTACTTTCTTGAAGTTCCTTCAGTATGATTATTTTATTATGTGCAGGATAAATACATGCAGAACAGGTTGGTGAGACTAGTTTGTGTTTTCCTTCAGTCTCTCATCCGAAACAAGATCATAAATGGTGAGTGCACTGTTGTGTGCGGACTATGGAACAGATACATTTTTTGTCTCATATATACAGTTTAGTCATTGATCTGTTATCATTTGATTATTATGTTGATTATAAACATTTACATATCTGCTTTCTTGATCCAAAATACTGATACTTTAAAGTTCATAATACAAACCTTTTGATTTCTTTACCTTCACTAATTACTATCCTTAATGTACAATAACGTCTCCAAAAACACTAAGATAAGATTAAGAGTGTACCAGATAGAGAAGACAAATTTTACATGAATATGATATGGGGGTTAACTTTTGCATTTTCTTAATGTGTGCATGTGTCTAAAACATCATTTTTTGAAAAAAAACAAGGAATTACTTTGCTTTGAAAACTCTTGTGTGTTACACTGTTACTAGCCATAGACGTGCCCCTTTTTCTTGAATGATCTTTTAATTTGCTCAAGTTGGTTTTCAGTATTCATCTTGATTGTGGATATGCTGTTTGGTCTGTGAACCGTAAATGATTAGGATTTTTTTTTTTTGGATTTGTGACAGTGGTCACAAAGAATCATTCAAGTATGTTAAATTGTTTGTGGATTGATAGTAACCAAGTTGCCAACTGTTCATATTGATCGTCATAAAGTAAATTCAGTTTTTGTTTGATTAAACTCTTTTCTATATTTAGTGAAAGAAGCAACATGTGTTAATATGGTATAATTGATTGCTGAAATTTGTAATTCATAGAGTTTTTAAGCCATCTAAAGCCATTTAACTCGTTTATTCCAGCCTCATTTATCTTTCTTTGGTTGCATGCTATATTTATTGAAATCTTTTACTTATTTATAAGTTTTGTGCATGATTCTTTGCAGTTCAAGACCTCTTCATCGAGGTACAAGCTTTCTGCATTGAGTTCTCACGGATAAGGGAAGCAGCTGGCTTATTCCGGCTGCTCAAATCTTTGGAGTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA037131