Os12g0199000
| Gene Name |
Os12g0199000 |
|---|---|
| Description |
Similar to Agglutinin alpha chain (MPA) |
| Version |
NM_001072900.1 GI:115487761 GeneID:4351733 |
| Length |
2433 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0199000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:5131870..5134302 |
| Sequence Coding Region |
5131870..5131998,5132375..5132460,5132609..5132690,5133403..5133585,5134006..5134302 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:5131870..5134302 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcggccagcaacaacaagctgcaattcaccccacgtagctcgctatttcagggcaacgagatcaacttcagcatgctctacctgcaccacacgccggctggtccaagaccagaccagtccgggcttacaggcaataacagagaaaccggcttgggccccttggtcgtcaacaactggccggtgtatgacggcatcggccgcgacgccaaggtcgttgcccgtgcacaaggcctgcacatttacgccggtaactggcataactcctttagccttgtgtttaaggatgaaaggagcggatccacacttgaggtgatggggatagtcgttgaacgaggtgagtgggctattgttgggggcacgggacagtttgctatggcaaatggtgttatcttcaaaaaattccacgaacagaaacaagaaggcaatattatggaactcactatccagggattttgtcctgtcttgaaagggtcacagcttaccttgcgcgactacatcgtgaacataatggtacttgatatcaatgtgctttgtcctctaatgaaacatctgatctttgattcgatatcgtttatttacttggaccaagctggacagaagcacagagcaggtccatggggtggtcctggtggggatccctacatgattgaatttggcagttcagagcttctcaaggaagtttctggaacgtatggcctatatgaaggatggaaagttataagatctattaaatttgtcaccaataagaaaccatatgggccatttggacggtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSASNNKLQFTPRSSLFQGNEINFSMLYLHHTPAGPRPDQSGLT GNNRETGLGPLVVNNWPVYDGIGRDAKVVARAQGLHIYAGNWHNSFSLVFKDERSGST LEVMGIVVERGEWAIVGGTGQFAMANGVIFKKFHEQKQEGNIMELTIQGFCPVLKGSQ LTLRDYIVNIMVLDINVLCPLMKHLIFDSISFIYLDQAGQKHRAGPWGGPGGDPYMIE FGSSELLKEVSGTYGLYEGWKVIRSIKFVTNKKPYGPFGR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2305..2433#1843..1928#1613..1694#718..900#1..297#atgtcggccagcaacaacaagctgcaattcaccccacgtagctcgctatttcagggcaacgagatcaacttcagcatgctctacctgcaccacacgccggctggtccaagaccagaccagtccgggcttacaggcaataacagagaaaccggcttgggccccttggtcgtcaacaactggccggtgtatgacggcatcggccgcgacgccaaggtcgttgcccgtgcacaaggcctgcacatttacgccggtaactggcataactcctttagccttgtgtttaaggatgaaaggagcgtaatgtataccgttaactttttttaaacatatttgaccgtttgtctattcaaaatatttaattaattattaattcttttcctatcatttgattcatggttgaatatagttgtatgtatacatatagtttttgatagaagtttttgaataagacaaacagtcaaacatgtttaaaaaagtcaacggcgtccaatatttagggacggagggagtatattgatctgtatgtatatatgtgtatgcgtatgtatgcatgcatgcacgaggatggatacactactctagctcttttaatcacactataatgaaagctaagttctacacttgtattttggccattagtttttttctcaatcaattataacgtggcagtaacctattggtcgatgtggtgttttatgtatgtgctacacgttcaagggatccacacttgaggtgatggggatagtcgttgaacgaggtgagtgggctattgttgggggcacgggacagtttgctatggcaaatggtgttatcttcaaaaaattccacgaacagaaacaagaaggcaatattatggaactcactatccagggattttgtcctgtcttgaaagggtcacaggtaattaaggacaaaataatctatttttagctttgttaaatgttatgaatcacttgacgtgcaatatcaatatatatggaatatgcaagatttacatatatgcagagccttgtcaccaagattgggccttgcggcggaattgatggagggagagctcaagacatcacagcaattccaaagcgtctagaatccattacaatacatagcagctggaatgttgattctgttaggaaacgataggcgaacaaacgataaagaataataaatcaatcacaaaagacacgagatttaacgtggaaaaccctcccaaaacaggagagaaaaaaccacgggcgccagccagcaaaatatcttcactatatctgaggtgaggttacatcgtcgcacggcggcttacaagaggtatatatatagtggaaccctaaaagggatgatgatccgtacggcagaagctggcctttattaagtgcaaatgaatttggatcacaactcaacaaactccaccttgagacaaattccttcttgtagcatgaatcaatcctttaccctgaacacaacaaagacaaaaaaaaacactttcggcgccaaatagcctctcgggctaaaccactataccaactaagcttgagcaaagctcaaacttagcaacaggaacaggttttgtcattatatcagcaggattatcatgagtacttatcttgcatacctttagcttaccttgcgcgactacatcgtgaacataatggtacttgatatcaatgtgctttgtcctctaatgaaacatctgatctttggtgaggcatatagcactttgactgtcacaaaacaagttaatgcaagaatcaactccacaaagctcagcaaacaatcctttcagccaaactgattatttacatgctggcctttattaagtacaaatgaatttggatcacaactcaacagattcgatatcgtttatttacttggaccaagctggacagaagcacagagcaggtccatggggtggtcctggtggggatccctacatggttagtgaacttccaatacgatctgtatttgatactccctccgtttcacaatgtaagtcattctagcatttcccatattcatattgatgctaatgaatctagacatatatatctatctaaattcattaacatcaatatgaatgtgaaaaatgctagaatgacttacattataaaacggagggagtactatattttggagtaacaatcatctatccctttgttcaaaaatatataaacctagtaatttactactatattttggatagacgctcgcccagctcacaccagacactcacaattaatgaaaagaaaatactaatatattgggtagtaaatttcttaccatacttttatatttttccttttctttgtgtagattgaatttggcagttcagagcttctcaaggaagtttctggaacgtatggcctatatgaaggatggaaagttataagatctattaaatttgtcaccaataagaaaccatatgggccatttggacggtag</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
