Os12g0210800
| Gene Name |
Os12g0210800 |
|---|---|
| Description |
Similar to 3-deoxy-D-manno-2-octulosonic acid-8-phosphate (EC 4.1.2.16) (Fragment) |
| Version |
NM_001072933.1 GI:115487827 GeneID:4351779 |
| Length |
5574 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0210800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:5800542..5806115 |
| Sequence Coding Region |
5800793..5800831,5801742..5801839,5801921..5802017,5802504..5802569,5803097..5803156 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:5800542..5806115 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:5800542..5806115 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacgcttcgtcggtggcgctctacggccagctcaaggctgctcaaccattcttcttgttagctgggcctaatgtgattgaatcagaggagcatgtcctgaagatggcaaaacacatcaaaggcatcacaaccaagcttggtctgccacttgtgttcaagtccagctttgataaagcaaatcgtacatcatcaaaatccttccgtggtcctggtctggaggaaggcctgaagatacttgaaaaagtgaaagcaacatatgacattccagtggtcactgatgtgcatgaaagccaccagtgtgaagccgttggaagagtggccgacatcatacaaattccagctttcctctgtcgccagactgatcttctagtggctgctgccaagactggaaaaattatcaacatcaagaaaggacaattctgtgctccttctgttatggccaactctgcagagaaaatcagacttgctggaaatcaaaatgttatggtctgtgagcgtggcaccatgtttggctacaatgatctaattgttgatccaaggaattttgagtggctgagagaagctaattgtccagttgtagctgatgtaacgcatgctctacaacagcctgctggaaaaaagcttgatggtggaggtgttgcaagtgggggcttacgagaactaataccatgcatcgcaaggacttctgttgctgtcggagttgatggtattttcatggaggtacatgatgatcccttgaacgcaccttgtgatggcccaactcaatggccactgcgcaatttggaggagctattagaggagctgattgcaattgctcgagtcaccaagggaaagaagccactcaagatcgatctcacccccttcaaagaat</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDASSVALYGQLKAAQPFFLLAGPNVIESEEHVLKMAKHIKGIT TKLGLPLVFKSSFDKANRTSSKSFRGPGLEEGLKILEKVKATYDIPVVTDVHESHQCE AVGRVADIIQIPAFLCRQTDLLVAAAKTGKIINIKKGQFCAPSVMANSAEKIRLAGNQ NVMVCERGTMFGYNDLIVDPRNFEWLREANCPVVADVTHALQQPAGKKLDGGGVASGG LRELIPCIARTSVAVGVDGIFMEVHDDPLNAPCDGPTQWPLRNLEELLEELIAIARVT KGKKPLKIDLTPFKE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>252..290#1201..1298#1380..1476#1963..2028#2556..2615#2735..2809#3425..3509#4065..4123#4673..4717#5002..5100#5225..5272#5396..5443#5520..5574#ctgtcgcctctgctcctcctcctcctgctccatctcctcctccatatcccactcgccaatctcgattccctcctccgctctacctcgccggagttcaccctggtcagtggctccgccgccgcattcctcgtcttcttggtggggattttttttcctcttggagcgagtggtgagtgaggcggttctttggtgttcttctttttgttgcctcctgcagtgtgggactgggagcggcggcggcgtcggaggcaatggacgcttcgtcggtggcgctctacggccagctcaaggtgccaatccatcatcgccttcctaagttctccttccgtttctttggtctggtctgctgcggcatttcgtcgatcacccagcgtgcgcgtgcggcggtggtgtggggttttcagattttttttttggcccccctttcatcgccggtggtgcgtttcagggaatagtttttcgatcttgcgttgttggagtggtcgagtggactgtagttcggattggtggtaatcataggaactgaattttggtagcatatgctctgtgctgcacatgataaatttcagactttgagcagcattggttgtaatacattgagccattttagccgcatgataccccaattttgttcgcgggttccaatctccgagtttcatgaagtctccaagattgtgggggttaatacatatttctctgtgagaaattatgcacagatttctaccttagggctttccatttctgctgtatttacctttgtgatgagcagccgaaagggtgctcttatttgtgttatattggcaaaatgttcttcttgacgagttgctcgaaggaatggaaagaattcttcaggatatagtgctctctctctcttgcttgatatgtgttcagtacttgtttctgtttgtgtggctctattggtttactaattttcttttttaacctctatatatttttttacctcattttctgtagtatgctgagagcctgagatcgaggccttggtatttcgtgaatagaaagatcccaatggtgatcttgacagagaccatgcgcctgttatattttgcttggtttctcatcatttgactgatatttacaaatatactattggtgtgatcacattcaatgcctggttttatttagaggaaacacaggttatttttctgtgagaactgaaccctctgattcttacaacaggctgctcaaccattcttcttgttagctgggcctaatgtgattgaatcagaggagcatgtcctgaagatggcaaaacacatcaaaggcatcacaaccaagtgagcagcaaactattgtaattttagttatttctgggatatatatgaatctgttttcctgctattttccctccacaataggcttggtctgccacttgtgttcaagtccagctttgataaagcaaatcgtacatcatcaaaatccttccgtggtcctggtctggaggaaggcctgaaggtgggtcaattcgtttcaaactaggaaattcagaaattcctaatttagataaaattagttttcctttcaatgcacagacgattagtaccttgcaaattcatatacacttatgttatgcccacttctatttttgaatggaagatgatatctgctttctgtgctgttctgtctatgtgtgattatctgtactcataggttgcaggtgcacagttttcaaactctggttgtatacccagtgtgccatgttattttgtcctagatttaagtcctacaaaaagatctgtttcagagctgttgtcaattcataaataattttgttctgtaagggccatgtgtgtttaatgtgataatatacatgcaacaactaatctaatcaacgtggcagaagtgtattttgtattttattgtttattcttttgcctcttcatgtatataacattgttggtttccctactgcattaatgcattactaattttgctgatcagatacttgaaaaagtgaaagcaacatatgacattccagtggtcactgatgtgcatgaaagccaccaggtatcagttgtcaatcattttttagattgatttgcattaatcttgtatccaaggaaaattgtcctgttttgagaccaaattctgctgcattactttctttgtctgcagatcctatctactagttatatccttttctgttgatacaattgttttgtctgaaaatgttgttggaatgctacttgttctttcatttcaataaggcatgtcccagtcgtttttgccagtttgaatatcatcagaaaaacaaggtatatatttgttagcaaagtgaaatcgtccttttgctaatattgctagtactactacttcttgtaagttattctatgtagcaccattagagaaattatgtggagcttattattattgccattagccacttctactccatgagaataaatcaccttatgctgcatgtgtttgttgcgcttttcctgcactgttgtcttttaatatactatgtctataatcgcccagtacatatccttgctctaaggaggatatggtttctaactaacttaccaaattagtgtgaagccgttggaagagtggccgacatcatacaaattccagctttcctctgtcgccaggtacaaatgagacaaatggattttttttgtagcgaattattgtgctaccagcagtataagcacgactctgtagtttacttcacattctgcattcctaacacatactatggtgttaacagactgatcttctagtggctgctgccaagactggaaaaattatcaacatcaagaaaggacaattctgtgctccttctgtaagttgtactttcagcttagtcttgctaaaaatggattcctagtctcctatgttggtactgtaaaggttctgttcctctgatttaatatatacaaggttaactgttgagagaatatggaagctattttttccggatcctttccttaatttcaggatcctacactgcatagcagcttagcttagttaagcagaaaaaatataataaaacaggaaaagtggattgtgtgtttcctttcaacctgtcaccatccagataaaccagttacctttcaagaagaatttatatttctcttcagataacttgtgttataattattttttttccagacagaagacacgcatgctaattcataagctgataatttatttatttttatggataaatgttggtccaaacatctacaattttaataatacaagcctgtaagtcaaaaaaaaaataattgttactagaagtctagaactttgaaacatgaaatatctgcaatcatttgagtaaagtccttttaggaattacctgctttttcaggcaaatccctttatcacatccagttatgttaattttcggaggcatctctagcatgtctgtcataataaacttgtatctttccaggttatggccaactctgcagagaaaatcagacttgctggaaatcaaaatgttatggtctgtgagcgtggcaccatgtttggctacagttaaggaatatatattcttttggctatcttttctgtacattgctcaatttaagataacacaaagtgaaaagtcatagatgtaaatatatgatattggataattagaaacacatacttactgtggtacgcagtgcaatggtctggaactaatggttgccatggagtccatagatgaaagatcaatctagtactaccagaatggccaaatgtttcttaacatatgtgatgtatctgtgtgttccctaaccgttgatggatattttatttcactaatacaaggcattgaaagccatgtcagggtagctgtaggttaattgccatgcaaataagcaatagggccacttaatggataagcacaagcttcagacctccttatttaggttctgaaggaaaacaaacaactggatgtttagccagcaccaccagctccctttcatcgcatgcccagttttagcattgtctgtttattaatatttatttttgcaccctctccaaagaaaattatgtttttgattgcttcatgacggttgaattctgttttcattccgacacagatgatctaattgttgatccaaggaattttgagtggctgagagaagctaattgtccagttgtaagtgttagcactttattgttgtgcagaagcagaactgcgtaatctacctgatgacttctgtgttgatttgtcctgcttgcttctgattgatgaaattggctgatggaataatatttggaaaaatcaacctaggattttacaaggaacctatgtttagtagttttattattctcttttcagtattcaccagaattccttgaggaatgtatgtttggattctgtacattcctaacaccaacagaattcaaggaataatagaaaaaaaaaaggaaacatgggacataacaggcaatcgaagatgcagacttcttcaattgagtagatttttgttatctttttcatcagaaagtaactgcatttctatcttattatgctttgtgaaatatgtttaaatttgtcatacattcatgtgttattctcatactaaaccaattttgtcatgcatttattttttttaattctcttaacccaataatttcatagacctttgaattagctatcaactatggtatagtacgtggaccattgatggatattacatttcaggtagctgatgtaacgcatgctctacaacagcctgctggaaaaaaggtatatttaccaattgcaatgcacttctgctggtttaggcaagattcctagtttaatggccgactttggtgctactcaaatcctatattgaccaacaaaggaatcaacattatggggatgtccatattttaacaactatctatagcttatatctgatgtaaatttgcatgcaactcgtgttcatagttttttgaacaccatgttaccgtcccttcctcaaatatctatgtatttgtgcaagtagacggttgtcaaattgtgcatatttggttctcttttgtaagcttgatggtggaggtgttgcaagtgggggcttacgagaactaataccatgcatcgcaaggacttctgttgctgtcggagttgatggtattttcatggaggtaaaacctaagaggaagctataatgttgccttttgtttcttacattgctttcccagtgacactccacaaataatgatgatattgtactcttgggacttaatttgatatataatcctacaacaggtacatgatgatcccttgaacgcaccttgtgatggcccaactcaatgggtaaacttctacatgtttgtcaagaaagttcatccatgcaatattttctttagtatgttgcaacattcacgctgatcttggtacgctcacttgttataatattgtctattgtgtttttgttagccactgcgcaatttggaggagctattagaggagctgattgcaattgctgtaagttacaccgacattcaaattttttcgaacacaaatatttaggctaaaggtctttattgttctttctttgaagcgagtcaccaagggaaagaagccactcaagatcgatctcacccccttcaaagaat</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
