BGIOSGA037817
| Gene Name |
BGIOSGA037817 |
|---|---|
| Description |
YABBY proteincDNA clone:001-047-F07, full insert |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA037817, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA037817-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA037817-PA |
| Length |
7776 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:22108397..22116172 |
| Sequence Coding Region |
22108397..22108468,22112974..22113111,22114346..22114508,22114864..22114912,22115014..22115089 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:22108397..22116172 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:22108397..22116172 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCTGCCCAGATCGCTCCGGCAGAGCAAGTGTGCTATGTGCACTGCAACTTCTGCAACACGATTCTCGCGGTGAGTGTCCCAGGAAACAGCATGCTGAACATCGTGACCGTCCGGTGTGGGCACTGCACGAATCTGCTGTCAGTGAACTTGAGAGGACTGATGCACTCAGCCCCAGCACTACAAGATCATCATCATCATCATCTCCAGGAGAGTGGTCTGAGCGGATGCTTCCGTGATCAAAGTGGCTATCCGGAGTTTGGTTTTTCTGCAGCTTCGTCGTCTTCCAAGCTCAGGCTGCCTCCTGCTGCTGCTGCCATGGTTTCCTACTCGCAGCAAAACCAGCAGCTCGAGCAAGCTCTCCATGCTCGCCCTCCAGAGAAGAGGCAAAGGGTACCTTCAGCCTATAACAGATTTATTAAGGAAGAGATACGAAGGATCAAAGCAAACAACCCCGACATTAGCCACAGGGAAGCCTTCAGCACAGCAGCCAAGAATTGGGCACATTATCCAAACATCCATTTTGGCCTAAGCCCTGGCCATGAGGGTGGCAAGAAGCTCGTCGACGTCGACCCCATCCCAACTGCTCCATCTTCCAAGAAGATCCAAGGTTTCTACTCATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSAQIAPAEQVCYVHCNFCNTILAVSVPGNSMLNIVTVRCGHCTNLLSVNLRGLMHSAPALQDHHHHHLQESGLSGCFRDQSGYPEFGFSAASSSSKLRLPPAAAAMVSYSQQNQQLEQALHARPPEKRQRVPSAYNRFIKEEIRRIKANNPDISHREAFSTAAKNWAHYPNIHFGLSPGHEGGKKLVDVDPIPTAPSSKKIQGFYS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..72#4578..4715#5950..6112#6468..6516#6618..6693#7651..7776#ATGTCTGCCCAGATCGCTCCGGCAGAGCAAGTGTGCTATGTGCACTGCAACTTCTGCAACACGATTCTCGCGGTAAGAGATATATATGTCCTGCCTGCATCTCTACCTGTATATCATTTGCATGCATCTCTCTCTTCTAATTTCTCTCTAATTTGCCTGCACATGTGTTGATGTGTAGCTAGATCTGCCTTCATGAGAGAGTTTCATGAAGTGATTGGTCTGGCTCATGCATCTGTCCTCTTCCAAGTCTTATGTGATGTGTGTATATAGCTTTTGATTTGAAGTGTGTGAAAATTTGATCATTCTTCTTGTTTTGTGTTGGTAATTCTTCTTGTTTCGCTTTGGTTGCTCCTTCTTCTAATTTGATTTCTTCTTTCTTCATCAATATTGTTGATTTCTTGAAGACTGAAAGATTCTCACCAAAAAGAGAACCATGCTCTCCCTGCCCTGCAGGATATTATGAATTCTTCTTTCTTCAGATTTCACTGTTATTCACAAATTCCATTTAATTAAGGTGGATTCATTTTCACTCCAGAAACATTTGCTAGAGAATCCACAATATATACAACATATAGATGTTCTTCTTCTTTTTCCAATGTTTCTCCTCTAGTGTTTTTCAGTCTTCAAAATTTCCAATATTTTCTCTTGTAATTTTTTTTCAGTTTTCTATTGACACAGTATTTTCCTCATGCATAAAACATCAGCATGATCCTTGTGTTGCACACTGTGAGTCGGTGGTTTCAAATTAATCGCCTTGATTTTTGAAACTAGTATCTGGAGAGAAACAGTGTTCCACACTAACAAACAAGAATCAAAATAAAACCACACAGTATTACGGTGTCTACACGCATGTGCCTGCTTGCGCCTTACTTGTGCATACATCTATGTGCACGATATTCCAAAAAGATTTCCATAAAATAATTTATTTTTACTTATCTTTGATGATCCCTTTCTTTTCCCACATTGCTTGCATGAAGGGCTCTTCCTTTATCTTCGCATTATTTTTGTCTCTTTTGGGTTGGAAATTGAACTACACATGAATTCATATTTTGTTTTAAAACATATATTGATTCATTGATTAGTAAGTTCCTATATGACATATATTGATTTATATTGTGTCTACAAGATATCTTTCTCAGAACTCGCAACCATGTCTAGGATGATGTTTTGCACACATGCCTAGCTAGATATATAAATAAATCTGGTGGATGGACTGATCAAATTAATTACAAGGATCTCTGATTTTTTTTATCTGAACTATTCCTTGGTTTATTATCAGAAAATTCCTCAGTTTTACATGTGCATATATATGCAAGAGGTTTGAAAAAAAAAATCGACACCATGTAATAATAACACAGTATAATCCTATTATTGTTAATTAAGAATCCTCTTCTGAATCGAAGTTAACTGAAACACATCTTGCTATGCTACTGCTTATGTGCCAATATATAATTATTTGTGCATGAAAATGTCTTACAAGTTAGAACAAGAAGATTTAGAGGGGGATCGGATTAATTAATAAGATCTCATATAGTATAATTTCAGAGAGAGTGGAAATTAAAGGATGTTTCAGTTGTTTTTACCTTGTGAATAACAATAATTAATCTATCAACTTATATACAAATGATCAGCAATACATCGATTTCGCACTATCACAGGAACATGCAGCTAGATTTGCATGCACGGCATATATAGATCGATGCATGTCAAGATTGTGAGATGATGGAATTAATATAATTCAGCCTTTTATTTTAGATGGAGCTTAGAAAATAAATTGAATCACTATTGAAAAAAAAAGAGGTGCAATATAATATTCAGTATCCATGTGAAAACATGAAAACTATTGCAAACAAAACGGAGGAGATTATATATAATATTGTGCGAATGGATTTAATTTGGTTCCTCTATGATTAATCTACACATCATGCTTGCATATATACATGGTAGCCGATAAATAGAAGTGACTCTAGTAAGTGACGGACTGCTCAAAAGTGATCTCTCTTTTGTTCTTGGTTTAATTTGGTGCGAATATTGCAGATAGATTAACCTTAATTTTATCATAGATCTGTGTCATCAAGGATAACACATCATCATGATTTAGCTTTTAGAGTGATTTACATATAGAATATATAGATTGATAGTCTAATACACACGCGTGTTTTATTAAAAAAGAATAAGCTTTTTTTGACTTGTTGATGGGTTTCACTAATTTAAGCATGACTCGAACAAACGCAGTAGTGTACCCGTCAGTGGTACGGTTAGTGGTGTTATGAACGATCAGATCTAATTAATTAACAGAGTGGCCAGTACAAATGTCGACTGGTAAGCTAAATAATCATGATCTAGTCAGTACATCTGGTACTGTGTGTATGCATGTGTTCAGAATGTATAGAAGGGAAGGTTTTTTTTTGTTTTTTTTATCACACATTGTATACTACCCAACTAGCTGAAGTTCAAGTTAAACCTAGCTTATAAGACAACTAATTTAGTGTTAATTAAACATGAGTTTATATTTTTCATTTTATTAGCTAACTTGAAACTTGTCGTCAACCATGTTAAGTTTATTTCAGCTAGAACGCAAAAGCTGAAGCAAGATTTATGGTATGATTAACTAACTAGGGTTTACAGGATATATAGGATCAATATATGTCCAAGTTTAACTATAACACTTATAACTACTGATTTTATAATTAACTAAGGCCCTGTTTAAATCCCACCCTGAATTTTTTTACCCTATCACATCGAACGTTTGAACACATGTATGAAGTATTAAATATAGACTAAAAACAAAACTAATTCCACATATTGTGACTAAGTTGTGAGACGAATCTTTTAAGCCTAATTGCTCCATGATTTAACAATGTGTTGCTACAGTAAACATTTGCTAATAACGGATTATTTAGGCTTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTACAGGTGGATTCTGTAATTTGTTTTGTTATTAGACTATGTTTAATACTTCAGATGTGACACGCCAAAACTTTACACCCCTGAATCTAAGCACCCTTAAGCTGTAATAAGATAGGAGTAGTATTTCTAAAGGACATGCACCACCAGGTAGGCATGCATAGCATAGAGCTATATATACTGTACCAATAGATGAGCATAGCATGCATATGCTATACATAGCATAGAGCTGTGAATGTGTAAAATCTTGTGCATGTGAGTGTGTGAAGTGGTCTCTGCATGAAGTGTCACTATCTGCTCCATCTTTTCCCTTAGTGTAGGGGACACACATCTCTGCTCCTTCACTAGTTTAACATATTTTGCCTTGTTGGGCTGAGAGATGGGGGCAGCCATTGTACACTGTAGCTGGGAAGCCAATGAGCATACTCTTTCAAAGCAATGCATATATGAATTTTTACTTCTCATACTCTCTCTGCCAATACAGACATGGACTGTAGATGAACTTTTCAATCCATATCTTGGCCTTTTAATCAATTGTATGTGTATATATGTGCATGGGCAAATTAAATAAAACAGCAGCCCTACATACACAATGATTGTTAGGGATCATGCATGGGATAGTTTATTATTTGTTATGGGAGTGAGTGCCCAAAAAGAGATGAAAAGAATCAAACTGATCAAGCCATGATTCTCATCTATCTCAGCTAGATTGAGTGAGTGTGATCCTGCAGCAGCTGCATGCTCCCAAAAGAGAAAAGAATGGGGAACAAGAGAACAAAAGTGATCAGCTGTATGCAGGTATTATAAAAGGAGGAACCAATGGTGGTTCAGGCCAGAGGGTGCAAGCCTCTGATAAAAGTCATAAACTGGGTCAGCATAACATGTTAAAGCTAGTACTATAATAAAAACAACCACAAAATAAAAGTAGGGCAAGAAAAGTCACTGATCAACACAACCCTGCTGTGAATCTCACTATCAGTGCTTTTCAATCTACCTTGATATCTGACATTTATCCACTGCTTTTTTCTCTTATTCATGTACTGTTCTCATGTGGAACTTTATTACCTCATGTTAATCACACTAATCACAATGAACAGTGCCGCCTCTTCGTTTCATTAATTTCTTGCATGTGCTCACGCAGCAGAAGCTACTCTAGCAGCAAATACCCTTCATGTATTAAATGCCAGTAATCTAATTATAGCATGACTCTTGGTTAATTACTACCTCCATCCCAAAATACTTGTCGATTTGAGTTTTTATTTTTAACTTTTGATCATTCATCTTATTCAAAAAATTATGGAACTATTATTTATTTTGTCTGTGATTTGCTTTATTATCAAAAGTATTTTAAGTATGACTTAATTATCTTTTTTTTATATTTACACTAATTTTTCAAATAAGACGAATGGTCAAAAGTTACAAGAAAATAGTCAAAGCAGCCACTAATTTAGGATGGAGGTAGTACTTCATTTGTATTAAAATATATTAACCCATTATCTATGAATCTGAACATTGTCCATAGATTCATAGTTAAAAGTTGGTATATTTTAAGAGAGGGAGGACTATCTATATTCTGATTAATTATATACGCAGTAATTTAATTAATTAGCTACTACATATATATTAATTGTTGCATATATACATGATGATCCAGGTGAGTGTCCCAGGAAACAGCATGCTGAACATCGTGACCGTCCGGTGTGGGCACTGCACGAATCTGCTGTCAGTGAACTTGAGAGGACTGATGCACTCAGCCCCAGCACTACAAGATCATCATCATCATCATCTCCAGGTTTAATTAATTAATTATTAATCATAAATATTTCACCCAATGAATATATAGTAGGTGATGTGCCTACACTTGTTGTCTGAGTTGTCTCTGCTATCCATTATCTGCATATATACATAACCACACACCACACAAATTATAGTACTATAATTTCTGTAAGAGACTGTAATTAACCATCGTATCAGTTAACCACCAACAAGCTAAGCTAATTAG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