Os12g0233300
| Gene Name |
Os12g0233300 |
|---|---|
| Description |
Histidine triad (HIT) protein family protein |
| Version |
NM_001072981.1 GI:115487923 GeneID:4351835 |
| Length |
4915 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0233300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:7292459..7297373 |
| Sequence Coding Region |
7292554..7292814,7292994..7293049,7295305..7295362,7295808..7295874,7296492..7296547 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:7292459..7297373 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcgccgccggtgagctcgggggcgccggtgcaggagcggcgcctcggggtgctcctctcccacctccgcccgtgcgcgccgccggccgcgcggcggggcaaccaccaccaccaccaccacgacctgcgggtgcgggaggcggagggaacgggcggcctcgccgcgtctccctgcgccgccgacgggagcggggagacctcgggaggccagcgctgcgtgttctgcgagatcgtgaagggcaacaagccagcctacaagctctacgaggacgatgtgtgcttgtgcatcctggacaccaaaccactgagcactgggcattcactgatcattccaaaacgtcactttccatcactacaggcaacaccgccatctgtaatagcagctatatgttgtaaactcccacttatttccagtgcaatcgtgaaggctactcaatgtgatgcattcaatgtgcttgtcaacaatggaaaggtagcagggcaggttatttttcacactcatgttcacctcattccccgtagaaaaggcgataacttgtggtcttcagagacttatgaaaggaactctatcaagcacaaccaggaaaccaaagatcttgttagcggcatcaaggaactactcttcccacctcaggatgacagcgctgaagggtcaacgataccgaaggaactctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSPPVSSGAPVQERRLGVLLSHLRPCAPPAARRGNHHHHHHDLR VREAEGTGGLAASPCAADGSGETSGGQRCVFCEIVKGNKPAYKLYEDDVCLCILDTKP LSTGHSLIIPKRHFPSLQATPPSVIAAICCKLPLISSAIVKATQCDAFNVLVNNGKVA GQVIFHTHVHLIPRRKGDNLWSSETYERNSIKHNQETKDLVSGIKELLFPPQDDSAEG STIPKEL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>96..356#536..591#2847..2904#3350..3416#4034..4089#4211..4264#4409..4534#aaccacgctctctctctctctctctctctctcctcgcgccgcgcacgaactccaaagcacacgggcgcgcgccgccgccgcctccgccgcgccccatgtcgccgccggtgagctcgggggcgccggtgcaggagcggcgcctcggggtgctcctctcccacctccgcccgtgcgcgccgccggccgcgcggcggggcaaccaccaccaccaccaccacgacctgcgggtgcgggaggcggagggaacgggcggcctcgccgcgtctccctgcgccgccgacgggagcggggagacctcgggaggccagcgctgcgtgttctgcgagatcgtgaagggcaacaagccagcctacaaggtactactcacgcgcagcgcagctgctcagtcaccgtccctgctctggtctcgggtttctctgcttcttcaattcgcgtttctccgccatttcgtgcggtgaaggctctcaccttctctgcgcatcaacattttttctttcgcgtcactaatcgttttggtgtttttgtgtggttgcagctctacgaggacgatgtgtgcttgtgcatcctggacaccaaaccactgagcactgggtaaggcgctagctagttgcgtgtcctcgctctcgatttcgtctctgcaacttttaaaatccatgactcgttttgtctctcttgttaaatttctagtgaaatttggttgagttttaacacctttgattgtgtcgccgatgagtaggcatgaatgaataagtgctagattccgtttggatgaataaactgatcgtgcatttgtgatttgtgcatgcctgcatggtacgtcgctaacttctccattgtgttggattatgtgctgcatgtattcttcatgtgcgcaatatagatggcactttgttttttttttcatttcactaatgtggtgggttgaacaaaaaataataatactccatattttccatgttgttgaagtatgcaaggcacacgtggcaacacgttataccatgcatcaattgtgtgatggttgcatagttacgtcttgtactcattttcagttgatgaaattgaattgtacatctcccaatgctgtaatattgctactggtccggtatggtggttttggtttttggtagttcagtaaattgcatgccattgatgcttttactagttcattactccctccggttccatattaattaacgttttggacaaggttgaggtcaaacttttataactttgtccatcaataactttaaaaatatttagtttaaaggaactagaacaacatatatagatttgtcttttaaagcactataataaaagtaaacatgcatttatttattatatatattatagtagaaaaataaagttaaagatatatcttgtagaccgtgtcattgtccaaaacgtcaattaaaatgaaaccggagagagtacaaatttaacatagtgcgtcaggtcaacatgattaactcctggttctgcttggatgtgcatactctatgctgtattggggtgctttacattcatgtgttcaataagtatgagacatttaagatgttgcatttgtttgacatcattaatgatcaatgtaaaatacgactgctggatgtctgggcatgattatttgatctgttggaaaatttaaatacttactacatcaaccatttttttctgcttttgcagtttgtaaaattgtgaaggaactaatgttttgtagtctgtatgccatcttaatcttgatgtaaagatccctttgtgagaaatgaatttgcatgtttttccccaaaattattggaaatgtgaatgtcatttttcatcaatcgaatttgagcatgtgcttgatgccaccaaatgtttgttgccagttagtctagtatgatggtccattggtcatatcatggtccctagtattaagaccgtttaaaaatgggaaataataaagtttaaagttgcatcagtattggtcaaatattttattgtatttgcaatcatagctactttgcttataaaacttaaaagaacaagataatggttctgctcgctgaaacctcaatttacctatttgatagtggtgtacaacatagcttttttttggccagtttgctgttgatgtggcttgctgtatgatcattgtggggatgagatgatcggccatattgctgggtcaatccctagtccaaattgaagccaaactgaatatttaggggtaaatttgaaggattgggaagccaatcatggaagaaccagtgatgtttttcatgttaacctaataattgtgcttagagatagaatatcagagtcagaatgataaaaatgtctgtgcctcactgagagctgtagtttcagacctctgttgtcatagcctttgcttaatggatgttattcttgcttccctcctcaagccatcctcttcggctgctctactagttgtctctcggtcctttcttgtcttgacctctttaacactctttagtctttaatacttaaactacgaaatggaagagctgatatatcagttttatgaagaaaagtttgcattgttgtgattctgatactggttgcagatttatgttctaatgcctgtttttgacagaacagaacaaaagttaatagaaactattacaaattgaatatagattgcataaaatgtggtgaattagttccaaagtatttttgaataatgcggcaactctgggcagcttgggccaactgactgattaaataatttctgcattgaatctacccttatatagtatttctatctgagatttaacgaattggttccttttcacatgccaagatgcttttgcgcttaactcatgatcagtcctttctgtttacaattgtaggcattcactgatcattccaaaacgtcactttccatcactacaggcaacaccgccatctgtaagttttggttatgatgacaatgatcttgatagttatgcagaccgtacatgaacatttacattttaacaaaatttataggacagagattttgcagattaccatatacccattctggccacgagaacatgtctttttggacatggaacagtcttcaaaatacaactttgaccacttttttttattgataatattagcaaacccctatgaagttaaattattatcttgtattggggcatattctcttctcagtaattacttgtaacccctataaaagcattatatgtttcattccatttgttgtctactctgtgtttgatagtaattagtaaacattgcacgataggagtcattagaaattgcatgctgcttgttttgctttacctctacttgacacaactgggaaatttctctggtttgattttttttttaaaaaaaaatacaggtaatagcagctatatgttgtaaactcccacttatttccagtgcaatcgtgaaggctactcaatgtggtatgtgcactacaagcctacaactttgcaattgttaggacaattatgctggtgttttgcactgtcctctgatggcactaaagaatgccaaaagtggctttgctcgtgtaaagtagtttaataaaactatgtagaaaatcttctgagctctatctttatctttctgccccattttgtcttgtaagtattgtctgtgcgggacctttccaagtttcccattgtccacctacatgttaaatatttgttagactatacattactactatattagcagtgcaatgatgaatgtagtcttgtttgtggcattttgtacataaataaattagataactcatattctatgtttcttccttctcaagttgacctttcaagcaatctaaaactgaatatcatatatattagaaacaaaaatgctagaactgatcccattcattctattttttgggttaaacccttgtctccttgatgttgaggatatatttatatgtgccagatgagacatagttcccttgtgttggactgtgtttgattcccttgtatatgccaaaatatttttctactttacgccaacatatattactttgctttgacttataaaatctttgtaacatgtacagatgcattcaatgtgcttgtcaacaatggaaaggtagcagggcaggttatttttcacgtgagtaaaacatcatactttctataattgcccaccctagatgttttgtctaattaagcttctcaatgtagaatgtctgtctgtgcatatcaagttttctaagagaaatgtattattgcagactcatgttcacctcattccccgtagaaaaggcgataacttgtggtcttcagaggtactcagtaattatatactcaatatctacatatgtctcgcgagttatcaaaatagctgcatgcctgtttgaattgtacctaatgatagttgaaattgttgccgaagtttgtgttgatgtgctggaattgtgaatacactgcagacttatgaaaggaactctatcaagcacaaccaggaaaccaaagatcttgttagcggcatcaaggaactactcttcccacctcaggatgacagcgctgaagggtcaacgataccgaaggaactctaagaagtagataaccaagtcaacaggcttattttctgcttctctcagtcatcttgaagagcactgctgcgagatgagttgatgtatagtttgtacctcatgcttcaaaattttgatactaactggctaagtaatcatcctagaaaagccaaatggcagaaacttgctagtgatctgaacacttcatgtgaaaaaaaaaatagtaaaattgggcttgttaaacttggtaggctttagctctgtggtttcatggaagcgaagaactggcaaacctgggccggccggtggtgaatcgtgggttgttcccacctgcacaatgttttgatctttttttttttgaacatatggaagatggatgaatataaggcgtacatttggtggga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