BGIOSGA009770
| Gene Name |
BGIOSGA009770 |
|---|---|
| Description |
Casein kinase II alpha subunit |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA009770, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1513_F02.134 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA009770-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA009770-PA |
| Length |
5341 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:35709840..35715180 |
| Sequence Coding Region |
35714930..35715180,35713434..35713563,35713159..35713353,35712335..35712492,35711671..35711761 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:35709840..35715180 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:35709840..35715180 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGACCGATGCGCCTCCGCCGAGGAGCCGCCCGCACCCACCCAGCAGCAGCGTCGCCGTGCCCGCCGCCGCGGCGGCAGTGATCGCAGCCGCCCTCGCGTCCTCCTTCCTCGCCCTGCTGCAGCCGCCCCGGCGCGCCCCGGTCGCCGCGGGATCCAGGGTCGGCATGTCGAAGGCGAGGGTCTACGCCGACGTCAACGTGCTGCGCCCCAAGGAGTACTGGGACTACGAGGCGCTCACCGTTCAATGGGGTGAGCAGGATGACTATGAAGTTGTCAGGAAAGTTGGAAGAGGTAAATATAGTGAAGTCTTTGAAGGCATCAATGTTAACAACAATGAGAAATGCATCATCAAGATACTCAAGCCTGTGAAGAAAAAGAAGATCAAAAGGGAGATTAAAATACTTCAGAATCTTTGTGGAGGTCCAAACATTGTGAAGCTTCTTGATATTGTCAGAGATCAACATTCTAAGACTCCTAGCTTGATCTTTGAATATGTCAACAATACAGACTTCAAAGTGCTGTACCCCACGTTGACAGATTATGATATCCGCTACTACATATATGAGCTACTCAAGGCATTAGACTACTGCCATTCACAAGGCATTATGCATCGAGATGTCAAGCCCCACAATGTTATGATAGATCATGAGCTCCGAAAACTTCGATTGATAGACTGGGGCCTGGCTGAGTTCTATCATCCAGGGAAGGAATATAATGTTCGTGTTGCTTCAAGGTATTTCAAGGGGCCTGAGCTTCTTGTTGATTTGCAAGATTATGATTATTCTTTGGACATGTGGAGCCTTGGTTGCATGTTTGCTGGGATGATATTCCGCAAGGAGCCATTCTTCTATGGTCATGATAACCATGATCAACTTGTCAAGATCGCAAAGGTACTTGGAACAGAAGCACTAAATGCTTATTTGAACAAGTACCATATTGAGCTTGATCCTCAGCTTGAAGCTCTTGTTGGGAGGCATAGTAGAAAACCATGGTCGAAATTCATTAATGCTGATAACCAACATCTAGTATCTCCTGAGGCTGTAGATTTTCTTGATAAGCTTCTACGTTATGATCACCAAGATAGGCTCACTGCACGTGAAGCTATGGCACATCCGTACTTCCTCCAAGTGAGAGCTGCAGAAAATAGCAGAGCACGACCACAATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTDAPPPRSRPHPPSSSVAVPAAAAAVIAAALASSFLALLQPPRRAPVAAGSRVGMSKARVYADVNVLRPKEYWDYEALTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLCGGPNIVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEYVNNTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNHDQLVKIAKVLGTEALNAYLNKYHIELDPQLEALVGRHSRKPWSKFINADNQHLVSPEAVDFLDKLLRYDHQDRLTAREAMAHPYFLQVRAAENSRARPQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..251#1618..1747#1828..2022#2689..2846#3420..3510#3628..3693#4256..4338#4415..4478#4556..4624#5282..5341#ATGACCGATGCGCCTCCGCCGAGGAGCCGCCCGCACCCACCCAGCAGCAGCGTCGCCGTGCCCGCCGCCGCGGCGGCAGTGATCGCAGCCGCCCTCGCGTCCTCCTTCCTCGCCCTGCTGCAGCCGCCCCGGCGCGCCCCGGTCGCCGCGGGATCCAGGGTCGGCATGTCGAAGGCGAGGGTCTACGCCGACGTCAACGTGCTGCGCCCCAAGGAGTACTGGGACTACGAGGCGCTCACCGTTCAATGGGGGTAGGTAGCACAGCCAGCCAGCTGACGTCACCTTCCTGAGCCCCCTGATCAGCGGCCGTAGCTTGTATTCTCCAGATTTAGTTCGCGATCCGTATCCCGTACACCTGGGCTGGGTTTGCTTATTGGGATTAGGTTGGATTATTGGGTTATGCGTAGGTTTGCTTGTGCCTGTAGATTTTGGTTTTGGTCAGGGAATTGGGAATTTATTGTAGCTTGAAGGTTAGATTGAATTGCTTCTGTTTCTATTAGGACGAACTCAATACCGAAGACTGCTTTGGTAGTTTTACATGTTTGTACTATAGGAGTAGGGGACACATGTTTACCGAATGGTTGAAGAAATTGTTATGAATTTGCAAGGTTATGATTTTAATTTTGGAATCAATCTCACTATATCTTCCTTTTAAAGTTGATACTAGTGTTGTTCAGTTAAGAGCCTTTGTTTGATTGTGAATGGCAAGCTGTAGGTATTGATCCTATTTTTGTTGGGGATAAAATCTAAGTTAAGGCAAAATTAGGCAGTTTTATGTTTAATCATTGGAACAAAGTAAGTTGGTGATGGGTTTCTGGGTGTTTCTTTTGCATCATCTGATAACCAAGATTGATGAGTAAAGCATAACTTGGTAGTATAGTGCTTTGGGCCTAATCTTCTTTAGCACTGAACATTCACCAAGTTCTATGCTTTTATGTAATCTCAAATTTAACATTGTGTTTTCCTTCACTCACCCTAGAATATACTACCTGAAAGCAATCAATGAAATCAAATATAACTTCGTTTCTACCTATATGATTGTAACATGCTGAGTAATATGGTGCCAAACAACTCAACACATATAGTACTGTCCTTAACAACCCATCTTCTTTTCCCTGTAGAAGTTACAGCCCTAGTATATTCTGTACATGTCATGCTACCTAGATGACAGTTGAGGCCTGGTAGGAGTGTGCTTGTTTAATTTTGGTACTCCAAAAGTGCACTGTTTTTCTCAATCTGACTCTGTTACCAGTTGTGTTTCCTCTAGATGTATTCCTTATCTATGGTGAATTATTAAATAAGTTGTCTGGTGACAAAAAAAAAAGAAAAATAAAAGAAGAGATGAACAATATGTAGCTCATTGATGATCCCTTGTCTGCTTGAACTTTATGAGAAACTATAGAAAGCAGTGGTGTTTTCCCTGACCTGATGTTAAATACTTGTTAAGAATTGAGCTTTCTTCGAAGTTTGTTCAGTTTACACACCAACACTAAGAATTGCCATATATCTCCCATCTTTTGTCCATTTAATTCTTGTTACCTCAAGTCATTGAGGGACCTGGCAGCATGTTATGACTTACACAATACCTCGCTAACTATTATGGTGCATCTTTAACAGTGAGCAGGATGACTATGAAGTTGTCAGGAAAGTTGGAAGAGGTAAATATAGTGAAGTCTTTGAAGGCATCAATGTTAACAACAATGAGAAATGCATCATCAAGATACTCAAGCCTGTGAAGAAAAAGAAGGTATTTAATTGATCTTATTGACTGTTTTTTTTAATTGCTAGTGTTGAAGTTCTTAACCTACCTTTCATATGTTTGAACAGATCAAAAGGGAGATTAAAATACTTCAGAATCTTTGTGGAGGTCCAAACATTGTGAAGCTTCTTGATATTGTCAGAGATCAACATTCTAAGACTCCTAGCTTGATCTTTGAATATGTCAACAATACAGACTTCAAAGTGCTGTACCCCACGTTGACAGATTATGATATCCGCTACTACATATATGAGCTACTCAAGGTCTTCATTGAGCCTTCATTGTCATCCCTATTTATTTACTCTATTCAGTAAAACATCCTGTTCTGTGGATCTGTAGAATGATGTATCTCTTATAGAAATTGTTTCACAATTACTTTCCTATTATGTGAAGATCCAACTAAACACACTTGTAATATATCCTAGACAAATATCACCATTCTCACTGCTTGCAAGTTGCAACATATCTTTAATTATTTATGTATATATGAACTTGATTATTTTCTAAGTTACATGGCTTAAAACTTGTCACAATCTCAAGCAGTTTATGGATCAGTTTTGTTTTGAGTTTTAATTATAGTAGCATCTTGCACTTCATAATGTACAGATGACAAAAGAATTCCTGAATTGCATATGTGCTATAATGGTTTATGATCTGGGATTTTGAAGAGAAGTGTCGTTTTATACATTTCTAAGTTCAGCACTATGTTGGTGTTAAGAATTCAGCCATCAATGGGCATCTTAACGTATGTGCTAGGTCATGCCTTCTATCCATGGGTAATAAACTGTTAACACACAGTGTGTGTTTTTCATATCGATATTCTTAGCCAAGAACAGTAGCATCATTTGCCCTTAATCCTGTGTGTTAAGTTTGTTTAAAGAATCTAGTTGATTTTCTTTACAATATTTTCCTTCTGTTTATGGCCCCAGGCATTAGACTACTGCCATTCACAAGGCATTATGCATCGAGATGTCAAGCCCCACAATGTTATGATAGATCATGAGCTCCGAAAACTTCGATTGATAGACTGGGGCCTGGCTGAGTTCTATCATCCAGGGAAGGAATATAATGTTCGTGTTGCTTCAAGGTTGGTGTAGTTACAAGCAAACTACTTGTTTGGTTATGATTTTCTTGCTTTTTTATTGAATTGGATTGCACCCTGATAATCACTTGAATCATGAGAGGAAGCTAACTTAAGAAGGTAGCATCCCTGTTTTGCAGTTTGTTTGCTAACTTGGCTCTAGAAGCAATACGTGAACCGATAAATTACTTGGTTTGAATTCACTGCTACTGTTGAAGTCTGAATTGCCTAGTGGTCCTTTTGCAACATTAATGTTACGAAATGCTGAAAGTTAAGCAATGAAGCTGTTTACCCTTAAACAACTAAGTTTACGTCTGAAAAAAAGGCAATAAAACAGATACCATTACTAGCCCTTTATTATTTTTGTAAGCATGTTATCACTGGAGTATATCATGCAATTATTGGGTGTACGTCTGAAAAAAGGCAATAAAACAGATACCATTACTAGGACTTTATTATTTTTGTAAGCATGTTATCACTGGAATAGATCATGCAATTATTGCTTACTAATGCGTCAATTCTTTGCTCATTTTTGCTTTGGTACCTGAGTTGAGCATATGGTTTCTCGTTTTTATTCAGGTATTTCAAGGGGCCTGAGCTTCTTGTTGATTTGCAAGATTATGATTATTCTTTGGACATGTGGAGCCTTGGTTGCATGTTTGCTGGGATGGTATGTGTGGCTGTAAAAAATATCGCCTGTCTAGGTCAATGTCTGGATATCTAATGTACTATTGTATTGATAATAAGTCTGACGTCTGAACTCAGTTAACTGTATGCTATGATGCAGATATTCCGCAAGGAGCCATTCTTCTATGGTCATGATAACCATGATCAACTTGTCAAGATCGCAAAGGTAAGTCCCAGTTTGATTCTGGCCTCTCACATTTCTCAAGGGAAAAAAAATGGTTTGGTATGCCTGATAAAATGTTTAGTTATGCAACTCGTGTTTTGGACTGGTTGGTATACATGTTTTACTTTGTTTCTAAAAAAAATTGCTGTTTGTGCTCCTTTTAGCTTAGTACTCATATGTTATTCTGACATATAAGCAGTGTGATGTCGTCAAAATAAATTATGTTCATTTGTAAATTGTGATTTTTGAAGTTCTTATTTGTTGCTCTCGAACTCTTACTAGGACGGTTATTGGCATTTAAAGATGTTTTAAGCATCCAATAATGCCTCGAGTGTGTGTCAGCAGTGTTGATTCGCTTGTCATCAGTTGAAAACTAAGTACTTTTCCAGCATTATGCTATTGATATCGGACTAAGGCAGATGTCATAATGTACTTTGATATCTATGCAAATTTTATTCTTGATCTGTTTTAGTGGTTTATATAAGTGCTTATTTTGGAATAACAATAAAACAGCTATATGTGAAATATTGGTATCTGATCCATGTGTTTTCCCCATCATTCTCAGGTACTTGGAACAGAAGCACTAAATGCTTATTTGAACAAGTACCATATTGAGCTTGATCCTCAGCTTGAAGCTCTTGTTGGGAGGTACGTTGCCATGCTTTTAGATATTGGTTTTGAACGGGAAGATTCAGAAGTATAACACTTACATATACATATGCAGGCATAGTAGAAAACCATGGTCGAAATTCATTAATGCTGATAACCAACATCTAGTATCTCCTGAGGTTTGTCAATGGCTCTTGCTGTTTCCAAATCAACCTTAAGATAATGTTTGCTTAACATCATGCTTGTACATTTGTAGGCTGTAGATTTTCTTGATAAGCTTCTACGTTATGATCACCAAGATAGGCTCACTGCACGTGAAGCTATGGTAAGTCTACCCCGACAGATAATATTTGTTACATTCCAAGAAGATACTGATTTTGTTTGACTGGATATTTCCTATTTATGTAACAGTATTGACTGTTCACTGAGATTGTTAGTTTATTGCTGAATATTTTAGTATATATCCTCCTTTTTAGTCATAAGAATTACATCAATGATGTCATAATAGTACTTTCATCTTCCTATCCTATCACACCTCTGTTCAATTTTTATTTTAGGCATATTCTGTTTCACTTATTGCT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| External Link(s) |
