Os12g0236900
| Gene Name |
Os12g0236900 |
|---|---|
| Description |
Nuclear protein SET domain containing protein |
| Version |
NM_001072998.1 GI:115487957 GeneID:4351854 |
| Length |
7550 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0236900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:7545629..7553178 |
| Sequence Coding Region |
7545687..7546037,7546118..7546193,7547227..7547432,7547529..7547615,7547704..7547796 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:7545629..7553178 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcctcctccgcctccgtttctcccgccgccgcctcccaccaccgcctcctcctcccctgctccccgcgccgcctcccccgcccccgcccccgccctagcccgcgcctcctccgctccgcccgcccccgcctcgtcgcctgccacgccgacaccctcctcccctcctcgtcccccgccgccgccgccgccgcgtgcgcctccaccgcctccgccaacgggttctccgactggctgcgggagcacgggctgccgccggggaaggtggccatcctcgaccgacccgtcccctgcttccgggagggcaaggacctgccgctgcactacgtcgccgcggggcaggatctcgaggctggggatgtggcgttcgaggtgcccatgtcgctcgtcgtcacgctggagagggtgctcggagacgagtccgtcgctgaattgctaacaacaaacaaattatctgagctggcatgcttggctttgtatctcatgtatgagaaaaagcaaggacaagattcattttggtatccttacattaaggagcttgatcgccagcgaggaagggggcaattagctgttgaatctccacttctgtggaccgaaagtgaactgaactacctgaagggtagccccatcaaggatgaagttgttgcaagagacgagggaataaggcgagagtataatgagctcgacacactgtggttcatggcaggttcattgtttcagcaatatccttttgacatacctaccgaggcttttccatttgagatcttcaagcaagcttttgtcgcagtacagtcttgcgtggtccatttgcagaaagttagtttagctcgaagatttgcgctagttccattgggcccaccactattgacctacaagagcaactgcaaagcaatgctgacagctgttggtgattctgttcggttggttgtggatcgaccatacaaagcgggagaaccaataatcgtctggtgtgggccacagcctaactctagattgctcctcaactacggttttattgacgaagataatccatatgatcgtatagtgattgaggcatccctaaacatagaagatcctcagttccaagagaagagaatggttgctcaaagaaatgggaagctggctatccaaaatttccatgtctgtgtgggtaaagagaaggaaacaattgcagaaatgctgccctatttgaggctaggatacatttcagatccagatgaaatgcaatccatactttcttcagaaggtgatacatgtccagtcagtccatgcacagagcgagcagtacttgaccaacttgttggatacttggagtcacgattggctgattatccaacaactttggatgaggatgatgctatgttggcagatggcaatttggaaccaaaaaaggaagtcgctactaggcttgtaagattggagaagaaattgttgcatggttgtctccaggctgctaatgagttcataaatgatttgcctgaccacactgtgtcaccttgccctgctccatttgctcctgaattgaaataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASSASVSPAAASHHRLLLPCSPRRLPRPRPRPSPRLLRSARPR LVACHADTLLPSSSPAAAAAACASTASANGFSDWLREHGLPPGKVAILDRPVPCFREG KDLPLHYVAAGQDLEAGDVAFEVPMSLVVTLERVLGDESVAELLTTNKLSELACLALY LMYEKKQGQDSFWYPYIKELDRQRGRGQLAVESPLLWTESELNYLKGSPIKDEVVARD EGIRREYNELDTLWFMAGSLFQQYPFDIPTEAFPFEIFKQAFVAVQSCVVHLQKVSLA RRFALVPLGPPLLTYKSNCKAMLTAVGDSVRLVVDRPYKAGEPIIVWCGPQPNSRLLL NYGFIDEDNPYDRIVIEASLNIEDPQFQEKRMVAQRNGKLAIQNFHVCVGKEKETIAE MLPYLRLGYISDPDEMQSILSSEGDTCPVSPCTERAVLDQLVGYLESRLADYPTTLDE DDAMLADGNLEPKKEVATRLVRLEKKLLHGCLQAANEFINDLPDHTVSPCPAPFAPEL K</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>59..409#490..565#1599..1804#1901..1987#2076..2168#2575..2729#2873..2957#3035..3121#3204..3323#4110..4211#4306..4473#gcctccaccgccgtccttctcctctctcccccaatcaccgcccacgccacccaccaccatggcctcctccgcctccgtttctcccgccgccgcctcccaccaccgcctcctcctcccctgctccccgcgccgcctcccccgcccccgcccccgccctagcccgcgcctcctccgctccgcccgcccccgcctcgtcgcctgccacgccgacaccctcctcccctcctcgtcccccgccgccgccgccgccgcgtgcgcctccaccgcctccgccaacgggttctccgactggctgcgggagcacgggctgccgccggggaaggtggccatcctcgaccgacccgtcccctgcttccgggagggcaaggacctgccgctgcactacgtcgccgcggggcaggatctcgaggtgcgttagcaagcggggatttcggggttgattccggtggtaaatggtgtgagatctttgactgtggtgggctgttgcaggctggggatgtggcgttcgaggtgcccatgtcgctcgtcgtcacgctggagagggtgctcggagacgagtccgtcggtgagtgctcttgtgatctattctagtgttgaattctgtagtttggttgctttggggttgagaggaaatggcgatttttttgtttcctggatgcacatttcacagtatatgacctgaatttagcactgcaatagtcctcctgttgggggcattttgtgtaaatggcagaatctggttttaatttatctgatgtccaccttataagtacaccgaaatcagtaaagtatagcttcacttcaaggaattcataattgttagtaagaagtaagatataggttgaattagttgactttgttaagtaatcttctatctgttcacttcaatttatttcaaattttcaataccatgtagggcactggatttgatattgttaccatcaatattaatatgtgtgtgttttgaggaatgctttttgaatgtttttaatccgtgttcaactggttcaagagtctgaatctgccggtttgatatgcaactttagctaatcatatctttcttgcgtatcttcaggatataatcaagtattatcaatctctctttgtgtgaaatgttgtgcattgtaattaaacaatgggtttatagcaatttcatctttcaaccttaggtgctgattcgaattttctctctttttaagcagtctcttcacgagattgcattttctttactattgcatttgtcataaaaggtaaggtcacaatttttaataaattaatcatcaaacaatgttagcatgagagtaatataagaaagtagccctatgtttacaactttgttaaaaatagtttaatgtgaaattgtggatatgtttacattggcatgatatttctgttagataggtcttccatgcattatttcttcagtccttgtatatttgtttgctaatacctgatctgtgaaacttatttgtggtttatgtctgtccacttgcgctaacaccaaaagaagaatatggaaattgatatgtccttttcatgtatggtatttgttttcatttttgtactatggtaaccagctgatattttgaaccatacagctgaattgctaacaacaaacaaattatctgagctggcatgcttggctttgtatctcatgtatgagaaaaagcaaggacaagattcattttggtatccttacattaaggagcttgatcgccagcgaggaagggggcaattagctgttgaatctccacttctgtggaccgaaagtgaactgaactacctgaagggtagccccatcaaggttagtgttttttcctatccactatatgtcaatatattatgagcacattttatgcagtgtcaagtaatatacaacttagattttctaatatttcaggatgaagttgttgcaagagacgagggaataaggcgagagtataatgagctcgacacactgtggttcatggcaggttcattgtttcaggtgctttcttttgaccttccaaaatgttcctgtctctgggattctgttgcactagctgcttgttgttctcatgtcaactgttatgcagcaatatccttttgacatacctaccgaggcttttccatttgagatcttcaagcaagcttttgtcgcagtacagtcttgcgtggtccatttgcaggtaacataatgagcaatgagatttcatttatcaaaaaaattagatattaccccgattggttgttggttggtttaaataattatctctggtgttgaactgaagtttaagatttacttagagtgtacaccatttatgaacagaacagtttagtgctaaataccttgcccatataatagattatacaagcctcgcagtatttttgtcaaattcaataaatttggaaatttgcttcttcaaattatgtagatttgttctgtaagtatttttttttgtttcatatgttttatttgcttaatacttcagtttgggatcaacagttcatagcatgccagccttttattttattactggataaatactgaacctgctcgtcgctaagttatttttatttttcattgaagaacagaaagttagtttagctcgaagatttgcgctagttccattgggcccaccactattgacctacaagagcaactgcaaagcaatgctgacagctgttggtgattctgttcggttggttgtggatcgaccatacaaagcgggagaaccaataatcgtctggtataatattttcttcagatgcattaaaattcttgttgtacctcatcatatttggcaacttcagtgcttatttactgtttgcatatttcatttctgttgtttgtgcatctccactgtaacgtcaagctatgcaaattgtacaggtgtgggccacagcctaactctagattgctcctcaactacggttttattgacgaagataatccatatgatcgtatagtgattgaggtggaatttgttttgctattgttctacattcatcttcttattggatttgtgtaagcaatactgaatcattgttacaggcatccctaaacatagaagatcctcagttccaagagaagagaatggttgctcaaagaaatgggaagctggctatccaaaatttccatgtgggaactatgatttcctttttcttttccatttggaatgcaactacaaatgttgtatattgacatgccttaggtgcattaggtctgtgtgggtaaagagaaggaaacaattgcagaaatgctgccctatttgaggctaggatacatttcagatccagatgaaatgcaatccatactttcttcagaaggtgatacatgtccagtaagtctacttgcccttaattggccttactattagaattttcagaattttcagttacggttagaatttttaattacacatatgagataaaatggagcagggcaaggtgacagtgtcgtacattgttgttttatttattacatttttggggtcattatgcttgcgcagttagccagtttatagtttctgccttttttctttacaagactccaaaagcactttccaatgggctcagtttttatggggcttctgcctttaaatattgcttcaagccttgaagacccagaagtattgatctagtgtcattagtcattactatgtttgtaacaaattgaagctagacaaacaggcatttgatctgaagatcttgtgttatgtgaaatgcaataattacatctggttgaacatttaggaagagagaacatttcacaagtagataatttggaaaatgcctttacatttgaagctttcttttaggccatcacatttgtcattccaggtttttaggatttcattcaagttataagttcatctaacccattatttatttttagtcgggttgatctaaggtgcagattgttcaaaactaaaccggcttgctacaaagcaaatccatcatacatttaaagtgcaatattttgccatgcaaatatcccacagtagcatgtagggtttccattgagtttttatggaagttgagcaatggttctaaatagactatgtggtaatagtagtgttatgcataacactgtgtaaattgtgacatgtttccaactatgattataggtcagtccatgcacagagcgagcagtacttgaccaacttgttggatacttggagtcacgattggctgattatccaacaactttggatgaggatgatgctatggtaacgagttgcaaagcactatgtgtatgtttttttgtaaaatctctgatacgtaatgtaatgaagagcatttcatttctctggtattgggcagttggcagatggcaatttggaaccaaaaaaggaagtcgctactaggcttgtaagattggagaagaaattgttgcatggttgtctccaggctgctaatgagttcataaatgatttgcctgaccacactgtgtcaccttgccctgctccatttgctcctgaattgaaataaggtaggcaaagctcaataagttttcactgcttcccaaagtaaatttattagaccgtttactgtgtaccatgttgatgtaattgatctaatagactgaattttatggatgtgcagaaaagtaaagcatgcagcgagcattaattcttgcaacatgggtgtcacttctaatggtgttctcattaatgatcacatccagttgaagtgcattagaaggtaataaatctgataaattgttactcctttaaaatacattcaagtagtaggatttaaaccagtactaatattgctctggtattataatttttttattgttagaagtttagaacctactgaaagtgtgtaactgaaagataaaataccaaataaaacttatgattcaactattccattgttactt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