Os12g0238000
| Gene Name |
Os12g0238000 |
|---|---|
| Description |
Myb, DNA-binding domain containing protein |
| Version |
NM_001073000.2 GI:297612917 GeneID:4351856 |
| Length |
7602 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0238000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:7611529..7619130 |
| Sequence Coding Region |
7611625..7611759,7612092..7612307,7612536..7612620,7613201..7613403,7613966..7615754 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:7611529..7619130 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcttcagtcatgatgacaagcgacaacggaaaggctccagagaagggtggagaagcttctggaccttcatcagctccccaagaaggtgaaatcagcaatgaaccacaaaggcgccggccgctcagtgggaggaccactggtccaacacggcgttccacgaaaggaaattggacccctgaagaggattccatattgtccagagctgttcagacatataaagggaagaattggaaaaaaatagcggaatgttttccggatagaaccgatgtacaatgcttgcacaggtggcaaaaggttctaaaccctgaattggtcaaagggccatggtccaaagaagaagatgacatcattgttcagatggtaaacaaacttggaccaaagaaatggtcaaccattgctcaagctttgcctggacgtataggaaagcaatgtcgggaacggtggcacaaccatcttaaccctggcataaacaaggaggcatggacacaagaagaggaaattaccctcatacatgctcatcgaatgtatggaaataaatgggctgagctgacaaaatttttaccaggaaggacggacaatgcaattaaaaatcactggaacagttcagtaaagaagaaagtcgactcatacatgtcatcaggtttacttacccaagtctcgtgtctccctctaaatgaatactctgcacactgtaattcctcacctgcgttgacccaacaaaacagcgaagacagtggtagctatgctgttcgagaggttgaaaattcatcagtgtgtagtcaatcatcacttgccaaggtttcttgctcccaagtgcacaatgctaatgtggcattgggctgtgatttgcaagtaaatgcgaatgttgacaataatgaagcgcatgattctcaatcttctgtgggtcacgaagcatgctatacttctgtgggggctgttgcaactgctatacctgaggtgcactaccacgtttcttcctctaacttcgatccagatcaacacttgcaagaggagtttgctcaaggattgaatttgcatatgagtatggatgaagtgccaagtaattctagttttgcagacaacccaactatctgtagtatagaaaatcatgaaaggtcattggaaccatatgatgtagcaatggagatgcctctctctatgttaccaagtgattctggagctgagcaaaaactacattttatgtcggaggctgacttcaatagtcctaattgtctgaaatctgaactttggcaggatatttccttgcaaagccttctttctggacctgatgcagttgaaactgattctttttcaagatcaaatcatcaatcggatgtatattcctctcaagcagataatgaatttttagcaccaccctacctattacagacatcaaattcttccagtgtgatggaggctacttatggacagagtccacagatgtcagtaccaccatctcttatctgttcaaatgttatgactgatgtaccttctgataatagatcagaaccaaaagaaatgacagtttctcaggcagaaatggtcacacaatcttccagttcttcaggtgacgctgaaatgtctgctaaccctggtagtagtaatggcagtgatattccttcaatgatggaaaggatacctgaatgtgcggaccaacatgttactaatgcggaagaacctgaagccagtatagagaaagaaccatcggttacaccgagtgctacagcagatgaaaagcaggatgagggagccctattctatgaacctcctcgttttccaagcatggatgttccatttgtcagttgcgaccttgtaacttctggtgatctccaagagtatagtccccttggtattcggcagttaatgcggtcgaccatgaatgtctgcactccaatgagattgtggggctcccctacacatgatgaaagccctgacattttgctgaagagtgctgccaaaagcttcatatgcacaccatcaatactaaagaaacgtcacagagacctcgtgtctcctattccggataaaagaatcgagaagaaatctgggactgaaaaggattgtggggtatcagacacatcctccatcggcattcaaacatgttttattaatgccactaaagatgatgctgttataactaaatcagttttgcgtattgagcgatctgcttcttctaaacctctggaaaagaaacttgagttctctgatgagaacaaggaaaatttggacaacacaattgaacaggcaaaagatggacagagtgcaggaaattacaaacacattgacgagcaggcaaggggggaacggcgtactgcaacaaatataactactacttatgatgatctgccaggcaatttacaacctgcaggtattcttattgagcacaacggtgatgatcttgtttccccagattatggtaaaaacaccatgaaacagaagcaaaacacaaatatggaatctttgtcagtctgtaaggagggagtgtctgctaaaaagcctgcggaacttattgtggagaaatcttcagcatgcataaatgtggattatgaatatgtgaacatattggctgataccccaggcatcaaaagaggactagaatctccttcagcatggaagtccccttggtttgtagatatgcaatttcagggttcatacttcgtcagcccagctaatggaagttacgatgcgctaggattggtgaagcagataaatgtgcagactgctgctgctttggcagaagcccgtgaggtgctggcaagtggtggccaatctgagaacataaattctgataaggaaaacctggagaatccagatgccaagaaggaaccaggagcaacaaccaaattgcaagcaaaaatcaagaccgaggggaaaatcctggatttcaacgaatgtgccacacctataagatcatcagataaaaaagctggcagcagtctgggaagatctttgagctcccctattccttcgtcccatctcctgaaaagttttcgatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSVMMTSDNGKAPEKGGEASGPSSAPQEGEISNEPQRRRPLSG RTTGPTRRSTKGNWTPEEDSILSRAVQTYKGKNWKKIAECFPDRTDVQCLHRWQKVLN PELVKGPWSKEEDDIIVQMVNKLGPKKWSTIAQALPGRIGKQCRERWHNHLNPGINKE AWTQEEEITLIHAHRMYGNKWAELTKFLPGRTDNAIKNHWNSSVKKKVDSYMSSGLLT QVSCLPLNEYSAHCNSSPALTQQNSEDSGSYAVREVENSSVCSQSSLAKVSCSQVHNA NVALGCDLQVNANVDNNEAHDSQSSVGHEACYTSVGAVATAIPEVHYHVSSSNFDPDQ HLQEEFAQGLNLHMSMDEVPSNSSFADNPTICSIENHERSLEPYDVAMEMPLSMLPSD SGAEQKLHFMSEADFNSPNCLKSELWQDISLQSLLSGPDAVETDSFSRSNHQSDVYSS QADNEFLAPPYLLQTSNSSSVMEATYGQSPQMSVPPSLICSNVMTDVPSDNRSEPKEM TVSQAEMVTQSSSSSGDAEMSANPGSSNGSDIPSMMERIPECADQHVTNAEEPEASIE KEPSVTPSATADEKQDEGALFYEPPRFPSMDVPFVSCDLVTSGDLQEYSPLGIRQLMR STMNVCTPMRLWGSPTHDESPDILLKSAAKSFICTPSILKKRHRDLVSPIPDKRIEKK SGTEKDCGVSDTSSIGIQTCFINATKDDAVITKSVLRIERSASSKPLEKKLEFSDENK ENLDNTIEQAKDGQSAGNYKHIDEQARGERRTATNITTTYDDLPGNLQPAGILIEHNG DDLVSPDYGKNTMKQKQNTNMESLSVCKEGVSAKKPAELIVEKSSACINVDYEYVNIL ADTPGIKRGLESPSAWKSPWFVDMQFQGSYFVSPANGSYDALGLVKQINVQTAAALAE AREVLASGGQSENINSDKENLENPDAKKEPGATTKLQAKIKTEGKILDFNECATPIRS SDKKAGSSLGRSLSSPIPSSHLLKSFR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7372..7506#6824..7039#6511..6595#5728..5930#3377..5165#2650..2778#2172..2275#1992..2086#941..998#321..375#110..240#gcctatgatcgcttattccttgaagcaactccctgaaggccttactcaggcttgaccgtataatgatttttatatcccttagaggtttctattgcaaagtgaggattgaatgtcttcagtcatgatgacaagcgacaacggaaaggctccagagaagggtggagaagcttctggaccttcatcagctccccaagaaggtgaaatcagcaatgaaccacaaaggcgccggccgctcagtgggtaaaattctaagctcttctaaccatgctaatgtatattctactaaattttattatgcttctttgtccttgtaactttaggaggaccactggtccaacacggcgttccacgaaaggaaattggacccctgaagaggtataacatgtgaatgtcagcttgtgtttctgttgatgaagagtcctttcatgtacacataattaaatgatgattgaaaaatcttgttttatgtaactgtgaaacatctaatgtgtttactggtaaagactggacttgtttaatatgaaaaaaatatttcacttcatttggtgttttattcctcctacaaacaaagttgaatctgataatttactaatttctctagcatccaagggagccatgggcaactttaactctttaaaagtcaacaaatgcatgtattctgaggcgaatcataaacttcacttttctaccttgggattaccttctttgttctgtttctgtcatatagtcatgtgcaattctgttctagttccatgctttgtacaaaattgtaacagcagcattttggttctattttgtatgtctcaatgaaatgtgagccaagatccatattatcatccacacaatgcaaaatttcaaatttcttagatgcatatttttttttgtgcttattatctacttacactgtttaacgttgcacttatgtgctattcaaatgtaggattccatattgtccagagctgttcagacatataaagggaagaattggaaaaaaataggtacgttctttggattgatgcttatatgtggaaagtcatgcaatgattctatttttctatttgcttagtcctactctttaccttagtccttactcttgcccggcgagtccttactctttatcattgcatttctacaatatcctttagctgtcatacttttctttttctttatcttcaatatagttattttttttatgatggaacatataaacgaaagagccttctaaaatccaatccccacccattgcactatttttttgagagaggaaataacatagggaagcaccttcaaaagtgtgtcctttggtatctacattactctacattttatagcctactccctccgtttcaggttataagacattttgactttggtcaaagtcaaactattttaagtttgactaattttatagaaaaaagtagtaatatttttaacccaagaccaatgtattatgaaaatttattcaattatagatttaatgaaactatgctggcattgtaaatattactacatttttctatagagttagtcaaatttagattagtttgactttgaccaaagtcaaaaagtcttataacctgaaatagagggtgtattatgcatgtctgcttccctttggtttttcttttggtcacatttgctctttgattacatactgttgtacggcaatgcatgtcaggttgtaacaggaacaatatattatttcacaatattatccactatccagggtttacaattcatttttaccatattgttctcaagcctcttttgtcctacaattgtttagtgcagtaggatatcataaaccatgcagcatattttatattttttcttcgatgttatgggaactcgtgtgcaggaaagcattgtgctgtttcattaacttacactcaagtcatgctcttctggcattgtttttcctactttgttgatgagattcttgtatatcgttaaaaatccaagctttgacagagatccttctaattttccagcggaatgttttccggatagaaccgatgtacaatgcttgcacaggtggcaaaaggttctaaaccctgaattggtcaaagggccatggtccaaagaagtaggatgctattccatttattttcatttcttagatagtattgattagtcataatacgctcacaatgacttgttccctttttcaggaagatgacatcattgttcagatggtaaacaaacttggaccaaagaaatggtcaaccattgctcaagctttgcctggacgtataggaaagcaatgtcgggaacggtaatgctatgaaaattacttattcattttattttatttcatctagcttgcactgaagaaaaatgatataacaagaagttttgtggggctcaacagagcaacttctttgtgctagcaacaactgatttcttctagcccgttgttctgctggtgaatgcaggttttctttggacatagttttcgcatagaccatatatgttgtacaatgatgtctggcaaaacatgtgttagattgttaataagatttattttcacaatgcagtattttgtaaactatgctaatttatttcttaatgtgcatgccattatttttaatcgagtatcattactgtggattctacgtcttaaagatggactatctaatctgcatttaggtggcacaaccatcttaaccctggcataaacaaggaggcatggacacaagaagaggaaattaccctcatacatgctcatcgaatgtatggaaataaatgggctgagctgacaaaatttttaccaggaaggtaatgatttttatttttaacctaagagctgtttgcagacctctagttttgatctgatattgtcatgatgactgctattatgggggaaatctttcctctaatttttgttccaaattctatttttttttctgtggtaagttcccaaactgtttagctcagcattctttccaccttcctttcagacatcatttggaatctatggtgttgtataaatttagggaagatggtaacctaaaaaagaaacttaaatcgtttttgctttgggagaatagaatgaggacgcgggtccatacttccaccgaatgtgaaatagagatgccactgcttaactgcaatatcgttcctttattttcagcaagcgaaatttaaaatcaatctgttattttctatgaagtgaaaatagatgcgaaatttatgttttactgccattttgacacatctattgatgtttaacattcttgtcttctctaaatgtttatgacctaatgcacaatgatctatatgtacttctgctcaattaacgcttgttattataaaaatatgccctttttggactactgaaatgattgaacctgtaacattctatttcccttatcaggacggacaatgcaattaaaaatcactggaacagttcagtaaagaagaaagtcgactcatacatgtcatcaggtttacttacccaagtctcgtgtctccctctaaatgaatactctgcacactgtaattcctcacctgcgttgacccaacaaaacagcgaagacagtggtagctatgctgttcgagaggttgaaaattcatcagtgtgtagtcaatcatcacttgccaaggtttcttgctcccaagtgcacaatgctaatgtggcattgggctgtgatttgcaagtaaatgcgaatgttgacaataatgaagcgcatgattctcaatcttctgtgggtcacgaagcatgctatacttctgtgggggctgttgcaactgctatacctgaggtgcactaccacgtttcttcctctaacttcgatccagatcaacacttgcaagaggagtttgctcaaggattgaatttgcatatgagtatggatgaagtgccaagtaattctagttttgcagacaacccaactatctgtagtatagaaaatcatgaaaggtcattggaaccatatgatgtagcaatggagatgcctctctctatgttaccaagtgattctggagctgagcaaaaactacattttatgtcggaggctgacttcaatagtcctaattgtctgaaatctgaactttggcaggatatttccttgcaaagccttctttctggacctgatgcagttgaaactgattctttttcaagatcaaatcatcaatcggatgtatattcctctcaagcagataatgaatttttagcaccaccctacctattacagacatcaaattcttccagtgtgatggaggctacttatggacagagtccacagatgtcagtaccaccatctcttatctgttcaaatgttatgactgatgtaccttctgataatagatcagaaccaaaagaaatgacagtttctcaggcagaaatggtcacacaatcttccagttcttcaggtgacgctgaaatgtctgctaaccctggtagtagtaatggcagtgatattccttcaatgatggaaaggatacctgaatgtgcggaccaacatgttactaatgcggaagaacctgaagccagtatagagaaagaaccatcggttacaccgagtgctacagcagatgaaaagcaggatgagggagccctattctatgaacctcctcgttttccaagcatggatgttccatttgtcagttgcgaccttgtaacttctggtgatctccaagagtatagtccccttggtattcggcagttaatgcggtcgaccatgaatgtctgcactccaatgagattgtggggctcccctacacatgatgaaagccctgacattttgctgaagagtgctgccaaaagcttcatatgcacaccatcaatactaaagaaacgtcacagagacctcgtgtctcctattccggataaaagaatcgagaagaaatctgggactgaaaaggattgt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