Os12g0255200
| Gene Name |
Os12g0255200 |
|---|---|
| Description |
Staphylococcus nuclease (SNase-like) domain containing protein |
| Version |
NM_001189946.1 GI:297729022 GeneID:9272184 |
| Length |
11883 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0255200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:8725124..8737006 |
| Sequence Coding Region |
8725294..8725416,8726531..8726599,8726705..8726864,8726945..8727001,8728120..8728298 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:8725124..8737006 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:8725124..8737006 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggggaacatcctcaagtgcttcatcagttgcttcgacggagaagacgaagatggtggtagtggccatggtcgcttccccaacagctatcctccggtctcaagtctccattaccagcctctgcatttggatgaccttcaagtgccattatcgcctccaccaccatcaactaggcagcagcagccgccaccgcgaccggcgctctcaagactccattaccagcctctacgtttggctgaccttcaagtgccattatcacctccaccaccatcaactaggcagcagcagctgccaccgcgaccggcacgtcctcttggttaccatcatggagtcctctggccgacgatagagatcaccccatgcgatgacttcctcaacttagaattcacaactaaggtttgtgaagggccccagcatcacagtacaccatccaggaagacggaccttaataggtgtatccatgaaaaagacgatggcaacagtaaaccctcctactactggctgaccaagaacaaagacaatcatgtagtaacccctcagaccaaacggtcacctcggccccctagtggggtagctgccctggagcgtgacctcgtcgactttactcggacctttgaggttcctgaagggcttgcacagcatgttacatcacctatgcaggcacaggttacatggtataggaaattgttggccgcatacaaggatataaaatatccacccaaagaatcagcagatgctgctgtgcttgttgctgcaaccttgagagggatcgaacgaactaatttggagggcattcttgcattttatggctttccaattcctacaatctccaaagaggcatcagaaaatcatccatcatcaataccaaagggtgtgctgttcgtgctaaaaacattgccggttaatgcaaagtgcatagtagatggtgatggctttactgcttatgtcgacacactggatcctatagaactgcgtcaggattgcaatgcaagctgtcaatcccgtaactctaagaagcaaaaattgtgggacaaaacagcagctgatctacaaataagtctcgaaaatactggacaaaagaaaatgttctttgggggccgtgagatcctcgcaagaaaatacgaaataagactgaggggcattgatgcaccggagataggcatgcagtatggaaaggagtcgcaggatgcactggtgaaactgatcgctaggaagtgtgtcacgcttcatgtttatgggcaggaccaatttaagcgcttcgtctgtgatatccattgtggtggtgtgttcatccaggagcaaatgctggtgaatggtcatgcctggcacttcaagaactatgacaaacggccacaatttgcaaagtgggaaaaaatggcacgggatgcacgtcaagggctttgggcatatgataaccttgagaagccatgggaatggagaaagaacaagaggaaggcatcgcgacatcacaattcagatgtacgttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGNILKCFISCFDGEDEDGGSGHGRFPNSYPPVSSLHYQPLHLD DLQVPLSPPPPSTRQQQPPPRPALSRLHYQPLRLADLQVPLSPPPPSTRQQQLPPRPA RPLGYHHGVLWPTIEITPCDDFLNLEFTTKVCEGPQHHSTPSRKTDLNRCIHEKDDGN SKPSYYWLTKNKDNHVVTPQTKRSPRPPSGVAALERDLVDFTRTFEVPEGLAQHVTSP MQAQVTWYRKLLAAYKDIKYPPKESADAAVLVAATLRGIERTNLEGILAFYGFPIPTI SKEASENHPSSIPKGVLFVLKTLPVNAKCIVDGDGFTAYVDTLDPIELRQDCNASCQS RNSKKQKLWDKTAADLQISLENTGQKKMFFGGREILARKYEIRLRGIDAPEIGMQYGK ESQDALVKLIARKCVTLHVYGQDQFKRFVCDIHCGGVFIQEQMLVNGHAWHFKNYDKR PQFAKWEKMARDARQGLWAYDNLEKPWEWRKNKRKASRHHNSDVR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>11591..11713#10408..10476#10143..10302#10006..10062#8709..8887#8525..8635#6860..6974#6247..6302#5207..5372#3584..3639#146..541#gtagcatcatcctttttgggtccttagctcagaagcaaggatagctttccatgattccatcactcattaatagctaggtacaaggagaagatggcaaactagagggatcaggagtagcaccagatcacatagaaggtgaggttccatggggaacatcctcaagtgcttcatcagttgcttcgacggagaagacgaagatggtggtagtggccatggtcgcttccccaacagctatcctccggtctcaagtctccattaccagcctctgcatttggatgaccttcaagtgccattatcgcctccaccaccatcaactaggcagcagcagccgccaccgcgaccggcgctctcaagactccattaccagcctctacgtttggctgaccttcaagtgccattatcacctccaccaccatcaactaggcagcagcagctgccaccgcgaccggcacgtcctcttggttaccatcatggagtcctctggccgacgatagagatcaccccatgcgatgacttcctcaacttagaattcacaactaaggtaatttaattataactcgttataacataaatgtttatcaatatacactacggtttggcacctaagaactctgatacttcaaattttgagaaacctatagtaaaacaacctaacatgtggcccattacacatacaaattttcgctgtaccaactgaactaattaaccatgtgttgctaattacagggttgtcacccgatgactttggagtgcatagttttatttagcaagtcataaagtttgacacataaatttttatttataactaaaaattatattcctcaaaataaatagctatcgtagtattctaaaccaatatactagtggaattttcattttatttaattactattgaacgactaaaaggttttcatagtaatgcagtaaaagaagctttaaattgccacttttacctgtgcataaaaggaataaaacgattgtgttgaacctactggtgaagtcataggcagtgtttggcaaatgtctaatggaaattatttcccacccatctttaaatcctaaccattcattctcccctatccatttaatcctaacccttcattcatttcccaatcccaatcccacccctcatttcccattatccaaacacacccatacagtatacgtcacttcagccttttaaaagttttgccctttttattccatacctttgagaattttcttctccccctttgtgaaccttatcttcttattttttttcttttcttttgggatatatttggttagggtatccacaatgtgaccaaaaagtagtccttataactctatatgggtacctttaccattgtgagaggtggcattaggaatagccatatgataagctacccatagctataaagaccacctgtatagattaaaatatactatctctctccttttgcttctttcatgtgagagaactatagcatttggaagtactttttttagtgtgggtcccatcttaatgtcaattgctatctatacacattgtgaaaataggaataacaaaagaccatttatgtgggtcccacctatatggactagttgatccatatacattgttgatgccctggttgaagatggtacggaaggggctgtacttttttcttcttttcatattttcttcttttcataatttttcatacttttttcttctttgtactatgtgccggtacctatgtgtcggtaccttcatagaaggaagatatcggaagataatatcataaattatattaccttttggcaatcttttcaaatgcatattttcgcaagatagggtatttccagcccttaattactcagggaagaaattgtgaaaacaacatagctctttgtttgcatagtggtaaaacatgccccaaagatatgtgatatctatatgttcaacaaatatcaaatgcacatcccactgtcattaagatacatgttggacaataacagaggatacatgagtggtgagtatcagaccaattaatgttaaatttcagaacatatgaacaaagtgtatcaagaattgcctaaggccgtgtttttttgcttattcaccggactatttttttaatgtttcaaaaatacgtttttttctaaaaacatttttcttctatattatttataccaattatttaagctatatggtaaatttacttttaaaaatatttaatttatcactatcaagcacataatgcgcagcaataatccacttaatagaccaactcaatttgggcttaagtaattaacagatcatctagtaaaagaaattatgaggtacgacttttttatgttgttgaagatacttcattttaaatatgatactgttgatttttggacacagcgtttattaaaaaactattctctctgtttcatattataagtccttttaacttttttcaaagtcatttatagagaaacgtaacaatattttcgacacaaaataaacatactattataatataatcaatattagatttaatgaaactattttgatgttgtaaatgctactatatctatcaatttcatcaaacttagtgtagtttgacttagaaaaagtcaaaacggcttgtaatatgaaacaaaggcagaatgtaaatattgtagttactttatttaccattaaaggtattataacaataactttgcatatttgcactaaaattatgaataaggtggctgacatatccaaatgtaatcatcgtcatgtattgagaaatagagggagtaaaactttatccataacttcttattataactttttgttataaaagttagaactactatagcacacccagtacattatataccttatacaacagaccagaacaaagtgagagtgatatatttacttgatatgtgtattcatgtactgggtacgtaaattaatctgctagtagggcgtgtgatacgttataccatgcccactgcttgtgttttagaaggacctttatgaaaatttatataatctaatagatttatgatattatgaaagtatttttcatgacaaattatacattccaattttaatcttttcaaactatgtaatttattatttatttatagtaccttttttaaaaaattaaaaaaaagtcaaatgcaacattcttgaccagacagcgtatttgttctaacaaagggcatcgataagaaatcaatcccaaacacatatactcagtctccaatttgactgagttcaaccatttcttccatatcaagtataaagttgattgatctacccacacatacaaaagaattgccaaaaaaacacataaaattaggtatctgttcaactattcaatgacagcatgcacacaagcgcacatgccccgcgagttggttactttctcttgaattgcagtaagtttaaataatacaaacactaaattattgagtataaaatctctatcttggggcatttgtaacacaattctaggttttataatttggttgatggaagcccagtttcatttcaaaacaagattactttttgtctatgtgatatctttgcctatagtatttctatatagcatatacttatagaaaatattggcaggtttgtgaagggccccagcatcacagtacaccatccaggaagacggaccttaataggtaggcatcagatcctaacatctttttttgtttgattattttttcaaaagctgaaacattggtgacacatacatatatagtaatacgtatctgagttgttttctaattgtttgagaaacaagccatccaacaatatttgttttgtagatctaaggccctattctaacttcataaatatacatatttttcctcgttttccgttagcccgtttttcaaactgctaaataacatattatatgcgaaaactttctatacagaaattgctttaaaatattggataaatccattatcaagtttgtaataattattaaaacttaattaatcgcgcgttaatagttttctcattttgtgtaccgcttttaagtatatctcaccaagctacatagccgatgaggcagcctttcagtggtggttgttgcccctctcttttttttttgacgtgaaacagcaggaggagaggctcctactgcgctctatatatatatatatatatatatatatgacactcatatggggcaccatggtgcccgggcaccatggtatctaatgtacaaaatcactcaaatttttcaaaattttcaaattgtgagtatatacctagttataataattcaattcatatctatacctatcaacaaaacaactcaaatttaactttatttcacaatccatgattacatacctaactaattatatgtatggatgctatatatctagaatcaaaatctaacaaaaacaagttcaaattcagtacaaacatgctttgaactagttagtaaagtagttaatgttaatacctaagtaattgaaaaagtttcatactcatttgaattgggtatatactcaatttcaacaatggtgcccgggcaccatggagcaccaaacaaatttactatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatattaattacaaagagaggaagatcaggaaaaaaaagattaaaaaatgctatctatccatgattgccaaactggtttatctactaactttgccttgtgcatatgcataattgtacatgcatttttttattctctgtttacagtatataatcatttggatcaacatttcgttttatttttaaaaaagtattgagcaataaaatccattgatgcctgggccataaatggatgattttctcatgatttgtactatgtatacatgcacccttaggtgtatccatgaaaaagacgatggcaacagtaaaccctcctactactggctgaccaagaacaaagacaatcatgtagtaacccctcagaccaaacggtcacctcggccccctagtggggtagctgccctggagcgtgacctcgtcgactttactcggacctttgaggtaactcgctacacctataaagtatccctatatataaagttgagtgaagtgcatgagcggtccctaaacttgtgcggacgtgtcatctaggtccctaaactcccaaaatgtattttcgggtccccgaacttgtcttgaggtgtcatctaggtccaaacgacctctaacccgctccatgcgctgatgtggcatgccacatagcacctacgtgttagtcggacccacgcgtcaatcacatagaaaaaataaaattaaaaaaaaaacatattttctcttctctaccttagaattttttttaatctttttttgtttacctaagaggagaaaatatggtttttaattttattttttatatatgcttgacatatagatttcactgacatgtaggtgccaccgtggcaatgccacgtcagcgtatggagcgggtttgaacccgttaggacctatatgacacacatgacaagtttagggacctaaaaatgcattttaggagttcagggacctagatgacacacctgcacaagtttagggaccgcccacgtacttcactcaataaagttctatgcatcatacatgagaaccacttgatttgaaatgtatttactgacaaagccgagtaagcagggaggatgcttatcctcaggtacatgagtaaataaccaaaatacagtttgtatgcttgtctttgtgataattaatgtgatagttccattgctatatgtgaagtatttcttttgttattaaagtttgcatgcatgtcttgcagcaatatatttaccttcctgttagcagttttgccttctacattcctgtattgcagaagaatattatgtttttgattattcttaaggggattttcatttgtggtatttaggttcctgaagggcttgcacagcatgttacatcacctatgcaggcacaggttacatggttaggagaagatccagatttaacagcttctgaacttaattttccattaaccattacattttgtatacataagtcaataattctaaagctgcattgagtcctatagttcaatatagaaatccagttagccacccaaagctgatactctcttcgattgctatcaggtataataccctctttataatatccaatgatttttagcaatggaactatcacaattaacactgctgtatacatgtattttaatgagcacatacacagttttttgaaacaaatttgtactttatttttttggtataaatctatatagcttataaataatgaatttatatcctgtaggcctcgtgatcatctgtaagacatattacccaagccactgtatcctaaacgtagaggtttaaaaattaataattttcattgttttttttaactcggaacaatatgctttagttctattctttgcgaagaacaatattcttagtcaagggccattcagctaaaatttttgtttctctaactaaattaagataatagttttgcacttttacttttgataggtataggaaattgttggccgcatacaaggatataaaatatccacccaaagaatcagcagatgctgctgtgcttgttgctgcaaccttgagagggatcgaacgaactaatttggaggtaattatttgaaggtattaggatagtcacaaaatttatctacatatatatgaagcaagtaaagaaatattattcaaatgctagtttctctatttcttagcaactgaagtactcaatctatcccagaatagttttttacatggtctctaacatagaactttttccttttaatttattttccataagatattatgaatgctcttttaaatacgaatctaataatatcacatgcatggcacaaaacattgttagttattttacttattagtcaagggaaaatgttgattttcctaaattatattctgaaaaaatgtctcaattgttggtgatatagtacatgcagatacaacaaaatttcataaggacgttagattgttcgcatttcctgggacatgaaaaaatcgtatggatcttatttcaaaaaaaattgtatggagaggctatacgctataatattgtgcacatttaacaaaaagattgttggtagataaaaaatctattttccctagaagtgtaagagaatgtctaggtttaccattagggcagtattgttagttaaattaaaatcattctttttgtatcaactcaaaattataacattggataatactatcaactcagagaataatctgttaattgttgatgattttctccaaatctggactgctaaagaaattataaaaccagttaccattgttttatttttgtctggtaactgttttacttttcagattaacactacaacaaggcaatgtggacatatgtttaatatattcagtctcctaaactcaggaagaaattaatatttttttatattgtctgttattagaaatgagcatcattttggaacgttcaggtaaaatgttatccaggattgttttacaaattgtcctcaaggaaaagtttggactattttggtttgaagccctacaaaaaattttgtaatgccaaaatttaggcatgttttggcactaccaatttttttagttaaaattgtctagttaatgttccatttgctaccaatatgatgagaataaatttctagaatgtgaccgaatagagcatggccaacaacaattatttcacttcattccaagctatccctattactattcaagttgccaaaagattggtagagcatatattggcatcaatccaaaacggtcctttgtaaacattattatgtgtatcgtcaatgcaaatgagcaaatctgcagaaattcttagaacatcaggtgttcatactttgtaatattaaatgatagttgtgaactaaggctgtgtttagttcacatcaaaattagaagtttggttgaaattgaaacgatgtgacggaaaagttggaagtttgtgtgtgtaggaaagttttgatgtgatggaaaagttggaagtttgaagaattattttgaaactaaacatgacgcaaataaattgtagcaaaatccttaatcatccaggatattctttggattctatttaatgtaagttggcataatagttcaacaaatcgattctatcaccatggaaaaaaatgtgtgtttggttcacagggcattcttgcattttatggctttccaattcctacaatctccaaagaggcatcagaaaatcatccatcatcaataccaaagggtgtgctgttcgtgctaaaaacattgccggtcagatttcacatgatatatcaccagtattgagtaaaataatgattctcacaaatctaaacatttatatcaggttaatgcaaagtgcatagtagatggtgatggctttactgcttatgtcgacacactggatcctatagaactgcgtcaggattgcaatgcaagctgtcaatcccgtaactctaagaagcaaaaattgtgggacaaaacagcagctgatctacaaataagtctcgaaaatactggacaaaagtaagtaaactgaactttccctcttctccatgttgtttggaagtcaatagtttcttgtgaaacagtacatgtcattgatctgggcagaacaaatgcatttgtgtttcagtactatgaaatactcctatggtaaccaatcagcgccagaacaaatgcacatttggctttccatattctgatacatattcagttatgattaagtgggatttaaacttctcagggaaatgaagagagaatatcaaagaaaccaaataaaagtacattagaaatgtgtttatttaactagaaaaaaatacccgtgcgtggcaaaggggaagattattttattcttattattgttatacggtttagctataagataaaattcactgtagtaatttatttggatatatattttttaagaaaaccatgagctgcaattaggattccgacttttatctcaagttagtatttttttaaagagatttcttatacgactcattttgtttttccaaaagcaaatgaacatcaaatccgactcatacacagatctgtatttccaaaagcgagcgaacataaaaactgactcaaacacaaatgaggtaccaaaataccggaaaaacatctttaatttttataatagtagagatttattattttttgaaaaaatacaacagcagaggcttctactgtgatgtatatagaagggcaaagagtttctttaagttttatagaagaacatagtatttcaagaagagactaggaaattatgtagaatatgctaagattgcatatagcttaacattataatattaacttaactaaaaatggtccctacaaagaaaaacataactaaaatgctactacaattgtgaaacaaatactggaacgtaataataaacaacctattctctctctggaaacgtatagaagcagagcaaatttagcactcacaatgatcatgcaaatagagtacatattgaattaattactattttccgtgcaactataaattaaaacttgcaagggttgcaaaccaactcttggtcgtctagtttatttaagtcttattatgctgttgatcttttttagttcacatagaaatttatacataaattcaaatcgctacgtacgagcaggaaaatgttctttgggggccgtgagatcctcgcaagaaaatacgaaataagactgaggtatactctatatgcacaacacaactcaacacagaaattaatcagatatacagtgttaaatttggcattcatattgacaggggcattgatgcaccggagataggcatgcagtatggaaaggagtcgcaggatgcactggtgaaactgatcgctaggaagtgtgtcacgcttcatgtttatgggcaggaccaatttaagcgcttcgtctgtgatatccattgtggtggtgtgttcatccaggtggacacaaagccatacaccattgtgtcattagtcattgattttagtagaacaattttgtttggatggaaacgatggtgaatgtggtgtaatctttaatttcaggagcaaatgctggtgaatggtcatgcctggcacttcaagaactatgacaaacggccacaatttgcaaaggtaagaaactatggagtatatttcagtatattctttaattgcgatattcatatatatattctgttatgtaaatattccgttttgaactttgaaaatgataaatattattagcaacataagactaataaattgttagtcatacttgcagtattgaagtaagggatcatattaccgcacaccgaatcagcacgatttctgattatgtttaacatagtatttctattcaatttatcatatattcctgtataatttttgtgacatcctggcccaattaggatgaggcatgtgttgtccatgtgagctgtgtgcgcatatttactaccacattgctagtttagcacgagtggaaccaacttataaggcatcttccctctaaccatattactctcgagttaaccctttttacacaaagcgatgacaaaagtgtacctggggtggtatgtttaagtgggcccgcccgtcgaatgggctggctaaatcggttctggatggagggttgttacaaatggtatcagagccaaccctcgcggttacgcgtacgggttagtgtacgggcatatggcgcatggttgttacaaatggtatcagagccgaccctcgcggttacgcgtacgggttagtgtgcggacatatggcgcatgtgggctctatatgtgaggcacatggcatggtatatggcgctagcattagacgtacggacgtgccctaagagtaccacattgctagtttagcacgagtggaaccaatttataaggcatctttcctctaaccatatcactcctgggttaacctttagagagggttttttacaattttctattcaaattcaatttatgttgaaatacaacagtttggtgcatcactgcaggttcttttctttccatgttgaatatttggaacataaaagagcgtagttatcttgtacttgataccatgcaagatccagttttaaacagtagttctccatattgaacttatcttttagaaaagaaatttaccatacagttgaaattccaatctcgtttgagaactctatagacatacgggtgtgtgtatttgtgtgcattttctgatgaaactgctttggttacttcttctccctcggattgtgaagtgggaaaaaatggcacgggatgcacgtcaagggctttgggcatatgataaccttgagaagccatgggaatggagaaagaacaagaggaaggcatcgcgacatcacaattcagatgtacgttgatggactctggtcacttggatgatgatcttatctgaaatgacataatttggaattggatctatggttactagacagttagccccagttgagtatgtataaaagtatgatgtactttgtatatagtaagattattaatctcgatctgtattatttataaactaatatttgag</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
