BGIOSGA010555
| Gene Name |
BGIOSGA010555 |
|---|---|
| Description |
von willebrand factor type a domain containing |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA010555, complete gene. |
| LocusTag |
OS03G0407000 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA010555-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA010555-PA |
| Length |
8009 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:18595998..18604006 |
| Sequence Coding Region |
18603593..18604006,18602406..18602555,18602081..18602293,18601914..18602003,18601033..18601149 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:18595998..18604006 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:18595998..18604006 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGGAGGACTTCGCGCGGGCGGTGGAGGACGGCCTCAAGCTGTCCAAGCGCCTCGTCCTCCCCGGCGGCGCGCCCTCGCCCCGCCCCGTCCCCGGGATGGACCGGGGGCTGCTGCCCGACGCCGCCGCCGCCTCCTCGCTGCTGCCGTCCGCGCCCATGGCGTACGCCGTCGTCGTCGACCCGGCCGCCGTCGACAGCCCCGACGTGCCCAGCTACCAGCCCCACGTCTACGGCCGCCTCGACCCCCCCGCGCTCATCCCGCTCCACATGCGCGAGGTCGCCCTCGCCGTCGACTGCGCCGCCGCCGGCTGCGCCGCCGCCGAGGTCACCCTGCGCGCGCGCTGGTGGGTGCACTGCCTCACCCGCAGCTGCGACTGCCACTGCCGCATCGTCGTGCCCATGGGCGAGCAGGGTACAATTCTAGGAGCTGAGGTTACTGTTGGGAAGAGATCATACAAAACCCATGTAATTGATGTAGAGGATCAAGGTGCAGTGAAGATTGCTAAAACTGAGAGTGGGGGTCTTTTAAAGCGCCAATTCTTTTCCTTGACAATACCACAGGTTGGAGGAGGAGAAGACATATTTGCCACGATTAGATGGTCACAAAAGTTACTATATGACAATGGACAGTTTTCTGTTGATATTCCTTTTCAATTTCCGCAATATGTGAACCCTTTGCCAAAAGTGTTTATGAAAAAGGAAAAAATTCAGTTGACTCTGAATAGTGGTGTGAGTAACGAGATTGTTTTGAAGGGCTCAAGTCATCCATTGAAGGAAAGAAGTAGGCAAGGTGAGAAACTGTCTTTCTTCCATGAAGCAGTTGTTGAGAACTGGTCAAACAAAGATTTTACCTTTGCATATAGTGTATACTCAGGTGATTTATCTGGTGGAATGCTCGTGCAACCCTCAACATCGGATGACTATGATGATAGAGACATGTTTTGCATTTTTCTTTTACCAGGAAATAACCAAAAGAGAAAGGTCTTCAGAAATGCCTCTGTGTTTATCATTGATACAAGTGGAAGCATGCAAGGAAAGCCTCTTGAGAGTGTTAAGAATGCCATGTACACTACTCTTTCTGAGCTTGTGCAAGGAGATTACTTCAACATAATAACATTTAATGATGAGCTTCATTCATTCTCATCTTGTTTGGAGCAAGTAAATGAGAAAACAATAGAAAATGCAAGGGAATGGGTGAACACAAACTTCATTGCTGAGGGTGGCACTGACATCATGCATCCATTGAGTGAGGCAATAGCTTTGCTATCAAACTCTCACAATGCACTTCCACAAATCTTTCTTGTGACTGATGGATCTGTTGAGGATGAACGGAATATTTGCCGCACTGTGAAAGAACAGCTCGCAACTAGAGGATCTAAGTCCCCCAGGATTTCTACTTTTGGACTAGGCTCTTATTGCAACCACTATTTCCTGAGGATGTTGGCATCCATTGGCAAGGGGCATTATGATGCTGCATTTGATACAGGATCAATTGAGGGTCGGATGGTTCAGTGGTTTCAGAAAGCTTCAAGCACAATAGTGATAAATATTTCCATTGATGCCACTAAGTACATTCGAGAATTTGAAGTGGATTCTGAATATATTCAAGATATTTCTGCAAAATGCCCACTATGTGTGTCTGGGAGATACCAAGGCAAGCTTCCAGAGACACTTACTGCCAAGGGTTACTTGGCTGACATGAGCGAAATATCGATTGAATTGAGGGTCCAACATGTAAAGGATATTTCTCTTGACAAAGTGTTAGCAAAGCAGCAGATGGATCTTCTCACAGCAAAAGCATGGTTTTATGAAAACAATCAACTAGAGATGAAGGTGGTAAAATTAAGTATACAAAACAGCATTCCTTCGGAGTACACACGCACTATCCTACTTCAAAACTTCGTGGAAAAAATAGAACAGGGAAAGCAGAAGCCAAAGAAAAACAGCACCCAGAATGAGCAATCAGCGACGTCGCTCAACGGACTGACGCTCGGGTTCGGTGACACAGCTGCAACGAGGGAGAACCTTTCCGCTGGGTTCGGGGACACGAAACCACCAGAGAGGTTCGAGATGTTCGACAAGGCCGTCGGCTGCTGCAGCCGCCTCACGGACTGCTGCTGCTGCATGTGCTTCATCAACACCTGCAGCAAGATGAACGACCGGTGCGCCATCGTCATGGTGCAGCTGTGCGGCGCGCTCTCGTGCCTCGCATGCTTCGAGTGCTGCTCTCTGTGCTGCGGCGGGTCTGACTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEEDFARAVEDGLKLSKRLVLPGGAPSPRPVPGMDRGLLPDAAAASSLLPSAPMAYAVVVDPAAVDSPDVPSYQPHVYGRLDPPALIPLHMREVALAVDCAAAGCAAAEVTLRARWWVHCLTRSCDCHCRIVVPMGEQGTILGAEVTVGKRSYKTHVIDVEDQGAVKIAKTESGGLLKRQFFSLTIPQVGGGEDIFATIRWSQKLLYDNGQFSVDIPFQFPQYVNPLPKVFMKKEKIQLTLNSGVSNEIVLKGSSHPLKERSRQGEKLSFFHEAVVENWSNKDFTFAYSVYSGDLSGGMLVQPSTSDDYDDRDMFCIFLLPGNNQKRKVFRNASVFIIDTSGSMQGKPLESVKNAMYTTLSELVQGDYFNIITFNDELHSFSSCLEQVNEKTIENAREWVNTNFIAEGGTDIMHPLSEAIALLSNSHNALPQIFLVTDGSVEDERNICRTVKEQLATRGSKSPRISTFGLGSYCNHYFLRMLASIGKGHYDAAFDTGSIEGRMVQWFQKASSTIVINISIDATKYIREFEVDSEYIQDISAKCPLCVSGRYQGKLPETLTAKGYLADMSEISIELRVQHVKDISLDKVLAKQQMDLLTAKAWFYENNQLEMKVVKLSIQNSIPSEYTRTILLQNFVEKIEQGKQKPKKNSTQNEQSATSLNGLTLGFGDTAATRENLSAGFGDTKPPERFEMFDKAVGCCSRLTDCCCCMCFINTCSKMNDRCAIVMVQLCGALSCLACFECCSLCCGGSD</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..414#1452..1601#1714..1926#2004..2093#2858..2974#3337..3606#3695..3851#4204..4281#4550..4650#5121..5291#6186..6260#6868..6954#7677..8009#ATGGAGGAGGACTTCGCGCGGGCGGTGGAGGACGGCCTCAAGCTGTCCAAGCGCCTCGTCCTCCCCGGCGGCGCGCCCTCGCCCCGCCCCGTCCCCGGGATGGACCGGGGGCTGCTGCCCGACGCCGCCGCCGCCTCCTCGCTGCTGCCGTCCGCGCCCATGGCGTACGCCGTCGTCGTCGACCCGGCCGCCGTCGACAGCCCCGACGTGCCCAGCTACCAGCCCCACGTCTACGGCCGCCTCGACCCCCCCGCGCTCATCCCGCTCCACATGCGCGAGGTCGCCCTCGCCGTCGACTGCGCCGCCGCCGGCTGCGCCGCCGCCGAGGTCACCCTGCGCGCGCGCTGGTGGGTGCACTGCCTCACCCGCAGCTGCGACTGCCACTGCCGCATCGTCGTGCCCATGGGCGAGCAGGTCATCACTTAATTATTACTCCATCCCCTTCCTCATCTTTTTTTTTTATTATTTCTTCTTCCGTTCGATCGGTTGAAATCTTCTATACTAGGCTGTTGGCTGTTGCTGTACTAGTGCTGGATTAGTTGCCTGATTGCTTGCCGTTACCACGCGGGCGATATGCTTCCTGTTTGTTTGGTGGTTGGGGCCCCCATGAATTGGCTGTAGTTTAATCATTTGCCTTGGACTGGGGCGCCTGTTTGCCCAACTTGAAGCTGCATTTGTTGGCACGTTGATGATCCAAGTATATATGGACGATCATGCCGTTTCAACATTCTGCGCGGCAGCCTGGCTACTATGCTGGCAGTGGGTTCCAGCGCGGTTTTGGAAGCAAGCAAGATAAATTCCTTGCTTTACATGTTGCTACTAGATAATAAGCCACAAGGAAGAAATATTGGATTGTTGACTTGCAAAGGGAGGGATAACTGTGTCTGCCCATTTGCCCAATAAAGGCTTTTTACCTGGTGCACTTGATGCTATTCCTTTTTCTTGTAGTACATCACTTGGATTGTTTCTTATTCTTTAATTTCCTTCTGTTACAGCTAAAAACAGAGAGCAACGTTGCTTTTAATCAACCACTAATGTATGCTTACGTTACTAGAAAAATATGCTTTGTGTAACCCATTCAGGTGCGTTTAGGCCTCCATTACTAGCAAACCACAAATCACTTCTTTCTAGTACAATGCTTGTCGATTGTCAACCAAAATATGCTTTTTGATCATCTCTCATTTCGTGGACTTTTTTTTTGACTAATAGGTGGTTGATTAGGAACTTATTATGTGATGAACAGTCTTACCAAAAGCCAATGAATTTCTGTTGTCCTTTTGGTGAATTGGTTGACAGACTAAAGATAGGTCTCAGTGCATGGGATTTCTCTGATTTTCTTTTTCCTTCTTATATATATATTAATCTAATAACTTGGTTGTTACCATACAAACCTTTTGCCGTTCTTTTGTAATTTGCTGGTGATCTCAATCTAAGAATAATTTGGCTAATAGGGTACAATTCTAGGAGCTGAGGTTACTGTTGGGAAGAGATCATACAAAACCCATGTAATTGATGTAGAGGATCAAGGTGCAGTGAAGATTGCTAAAACTGAGAGTGGGGGTCTTTTAAAGCGCCAATTCTTTTCCTTGACAATACCACAGGTACTTTTGCTCCATGTTTTTAATGCTAGCCTGGTCCCCTCTACCTTGTCAAGTTTCAAGCTTTTAGCAGCTGTGTTGTCCTTTGCTGAATGATTTCTTTTACTTCATCAAGGTTGGAGGAGGAGAAGACATATTTGCCACGATTAGATGGTCACAAAAGTTACTATATGACAATGGACAGTTTTCTGTTGATATTCCTTTTCAATTTCCGCAATATGTGAACCCTTTGCCAAAAGTGTTTATGAAAAAGGAAAAAATTCAGTTGACTCTGAATAGTGGTGTGAGTAACGAGATTGTTTTGAAGGGCTCAAGTCATCCATTGAAGGTAATTAAGTGTTTATTGCTTTGTCAGTACTAGTGGGGATGTAATTAATAACTATTAGTTGTCTTTTGTGTTTTCAGGAAAGAAGTAGGCAAGGTGAGAAACTGTCTTTCTTCCATGAAGCAGTTGTTGAGAACTGGTCAAACAAAGATTTTACCTTTGCATATAGTGTAAGTTCTTCTCTAGTGGTACTTTTTTTTTTTGGATCAATTGCACCTGCTCTGTTATATGTTTCTGAATTCTTCATACTTTATAGTGTTCTACGGCAGGTTGAGGCAAGGTGAGAAATTCCGGAAAATTCATAGCATTTATTGCAACTGCATGATCTTAGGATAGCATATTGAATCATATGCAAATGAGATACATTCTTCAAATTTTGCCACCCTTTAGCAAATTTTGCTGTGAGATTTTAGCCTTTTCTTTTCTTTTGTGTCGGTAATGGTGGTGCTCTGACGCACCGCGCAACCTTGTACATTCCTTTTCTCTCTCTTCATATACATCGGCCGGCTATTCGCTGGCCCGGCGAAAAAAGAGATACATTCTTCAAACATTTTCTTTTTAATCCAGTGAGTATGAGCTACACCATCATTGCTGACTAATTCAAGTTGAGCTGAGATCTTCGCGATTACTGTTACCATTCTGAAACCAAAGAGAAATGAATGCTTTTCTGTTCAAAAGGGATGCACCCAAATGTTTTTATTATGTTATGACAGTTTGGATGAATTTAGCTTTATTTGATATCTCAAATTCTAAATACTAAAGTACGAAAGCTTTCTTCCTCATCCTGTTCAGACTTATGGCTTGAATGTTTCATCCAACAAGAAACATCTTCCGATAAGGAAACTTTTACGAGTTCACTGCTTGAATTTAGCTGCACACTTGCAATGGAGATGAGTATGCACTAACCTGCCTATATTTTTTTTCTTGTCTATAGGTATACTCAGGTGATTTATCTGGTGGAATGCTCGTGCAACCCTCAACATCGGATGACTATGATGATAGAGACATGTTTTGCATTTTTCTTTTACCAGGAAATAACCAAAAGAGAAAGGTAGTTGCTTTCACATGATTACTCTCATTATTAATATTATATATTATACGTGAATACACTTAAGTTAAAGGATCTCATGATAACTGTGTTTTCCCTGTTTACGAGTATCAAAACCTTTTAGCTTGCTAAAAAATACTTGTATCTTTGTAAACAGTTCTAATTTCTATTGCTGTTTCTTAGACATGATATTTTTATAAATGTAGTTTGACTTTTTTGTTTACTGCATACTGTTGAAGCTACAAATGCTATCCGATGATGTTCAGTATTGATTCAAGTTGCAGTGGGGTTTATTGGAATCCGCTTTTGTGCAACATAAAATTGTTTCTCTCAGAGCAATTTATCTAATTCGACTTATGCGATAGGTCTTCAGAAATGCCTCTGTGTTTATCATTGATACAAGTGGAAGCATGCAAGGAAAGCCTCTTGAGAGTGTTAAGAATGCCATGTACACTACTCTTTCTGAGCTTGTGCAAGGAGATTACTTCAACATAATAACATTTAATGATGAGCTTCATTCATTCTCATCTTGTTTGGAGCAAGTAAATGAGAAAACAATAGAAAATGCAAGGGAATGGGTGAACACAAACTTCATTGCTGAGGGTGGCACTGACATCATGCATCCATTGAGTGAGGTATTAGAAGATGATGTCAGTTGATAATTCTTATGCAATTGTGGCTTTTTTTGTTGCTCATATTTTCCATCCATTTCTCTGATGCTAGGCAATAGCTTTGCTATCAAACTCTCACAATGCACTTCCACAAATCTTTCTTGTGACTGATGGATCTGTTGAGGATGAACGGAATATTTGCCGCACTGTGAAAGAACAGCTCGCAACTAGAGGATCTAAGTCCCCCAGGATTTCTACTTTTGGACTAGGTAACATGCCAGATTATTTATTTCTTTTTATTACTGACCTCTTCACAAGATTGACTAATCTATGTACTGGATGAAATATCAGCTGATTTGTGGTGATGTAAGTAGTATCTTCATTCAAAGTTTTCAATGTAAATGGGAATTTCTAAATTGTGATATACATAAAAGTTAGCATATTCTCTTATGTGTTTATTAGTTTCTTCAGTACAGTTAGTTTTTGTGGAGCTAATTAAGAGGCATTCCCATAGTGTTGTTTCATTCTCTATATTCATTTCAGAAATGATATTTACACGCTTGTAATTTGACTAGTTGGTGCATTTTATAATTAATTCTTTTTTCACTGCGAAAACATTAGGCTCTTATTGCAACCACTATTTCCTGAGGATGTTGGCATCCATTGGCAAGGGGCATTATGATGCTGCATTTGATACAGGTAATGTCGATTTTCCCCTTGACTGGAGCACTTTGTTTGGCACACTATCTCGCATTATGCTTTGAAATGCTTCTAGAAACTTTTTGTAAGTTAAATGTGTCGAAATGAACTTCTATAATATTTCCACTGATGAACTTGGGAATCTCTTTTTGGTGAACTTGGGAATGCATTAAATGTGCCAAAATGAACTTCTATAATATGCTGCCAGTAGTCGAAGTCAATCAAATTAGTAAAACTTCTGATATGTTTTCATCGTTGTTTGCACCAGGATCAATTGAGGGTCGGATGGTTCAGTGGTTTCAGAAAGCTTCAAGCACAATAGTGATAAATATTTCCATTGATGCCACTAAGTACATTCGAGAATTTGAAGTAAGTTCTTCCCTAGTAATTTTTCACTTTTATTCATGTCAAAAAACAACATATGCCATTCACGATTCACCTATATTATTAATCTTTGTCGACTTGTGGTGAGTGCTGAAATCATATCTATTAATACAAACATGCAATTGCACATACTGCTAGTCAATTCATTACCGAGTAGATTGTCTCCATATCTCAGCATCCTC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