BGIOSGA010841

From RiceWiki
Revision as of 09:22, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA010841| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA010841, complete gene.| tag = OS03G03...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA010841

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA010841, complete gene.

LocusTag

OS03G0321400

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA010841-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA010841-PA

Length

5540

Source

Oryza sativa Indica Group 

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:12981375..12986914

Sequence Coding Region

12986776..12986914,12986064..12986137,12984696..12984779,12984488..12984568,12983808..12983888
,12983552..12983644,12982808..12982891,12982547..12982614,12982404..12982464
,12982209..12982262,12982043..12982132,12981583..12981649,12981375..12981466

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:12981375..12986914 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:12981375..12986914 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGATCTGTGGAACAAGCTGCGGAGCCTCGACGCCTACCCCAAGGTGAACGAGGACTTCTACAGCCGCACCCTCTCCGGCGGCCTCATCACCATCGCCTCCTCGCTCGCCATCCTCCTCCTCTTCCTCTCCGAGATCCGGCTGTATCTATATTCTGCTACAGATAGTAAGCTCACAGTCGATACCTCAAGAGGGGAAAGGCTACACATCAATTTTGATGTTACGTTCCCAGCTCTTCCTTGTTCACTTGTTGCTGTTGATACAATGGATGTCAGTGGAGAGCAGCACTATGATATAAGACATGACATAATAAAGAAAAGAATTGATAATCTTGGTAATGTAATTGAATCAAGAAAAGATGGAGTTGGTGCCCCTAAGATTGAAAGACCACTGCAGAAACATGGTGGAAGACTTGACCACAACGAAGTTTACTGTGGATCTTGTTATGGTTCTGAAGAGTCAGATGATCAGTGCTGTAACTCCTGTGAAGACGTCCGTGATGCCTATCGGAAAAAAGGGTGGGCACTCACCAATATAGAAGAGATTGATCAGTGTAAGCGAGAGGGCTTTGTTCAAAGGTTAAAAGATGAACAAGGAGAAGGTTGCAGCATTCATGGATTTGTAAATGTCAACAAAATAAGTCACAAGATAAACAAGCTTTCCTTTGGGGTAGAATTCCCTGGTGTTGTCAATCCTCTTGATGGTGTAGAGTGGATACAGGAGCACACAAATGGATTAACAGGAATGTACCAATACTTTGTCAAGGTTGTTCCCACAATCTATACCGACATTAGAGGACGGAAAATCAACTCAAATCAGTTTTCTGTGACGGAGCACTTTAGAGAAGCAATTGGCTATCCCAGGCCTCCGCCTGGTGTATATTTCTTCTATGAATTTTCTCCAATTAAGGTTGATTTTACTGAAGAAAATACATCGCTTCTTCACTTCCTGACAAACATATGTGCTATTGTTGGAGGGATTTTCACTGTTGCTGGCATCATAGATTCTTTTGTCTACCATGGTCATCGTGCTATAAAGAAAAAGATGGAGATCGGAAAACTTGGATAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDLWNKLRSLDAYPKVNEDFYSRTLSGGLITIASSLAILLLFLSEIRLYLYSATDSKLTVDTSRGERLHINFDVTFPALPCSLVAVDTMDVSGEQHYDIRHDIIKKRIDNLGNVIESRKDGVGAPKIERPLQKHGGRLDHNEVYCGSCYGSEESDDQCCNSCEDVRDAYRKKGWALTNIEEIDQCKREGFVQRLKDEQGEGCSIHGFVNVNKISHKINKLSFGVEFPGVVNPLDGVEWIQEHTNGLTGMYQYFVKVVPTIYTDIRGRKINSNQFSVTEHFREAIGYPRPPPGVYFFYEFSPIKVDFTEENTSLLHFLTNICAIVGGIFTVAGIIDSFVYHGHRAIKKKMEIGKLG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..139#778..851#2136..2219#2347..2427#3027..3107#3271..3363#4024..4107#4301..4368#4451..4511#4653..4706#4783..4872#5266..5332#5449..5540#ATGGATCTGTGGAACAAGCTGCGGAGCCTCGACGCCTACCCCAAGGTGAACGAGGACTTCTACAGCCGCACCCTCTCCGGCGGCCTCATCACCATCGCCTCCTCGCTCGCCATCCTCCTCCTCTTCCTCTCCGAGATCCGTACGTCACGCGCCACCTCCCTGATCCCTCCCTCTCCGCCTCAGATCCCCCTTCCGATTTTTCGGGTTTCCGCCTGCCTTGGGTGTGGGGGCGCGGTGGCTTTTTTTGCGGATTGGTTCCTTTTGTTCACGTGTGTTAGGGCGGGTGCGAAACGGGAGGAGTCTGTGGTTGGTTGGCCGTCCGATCGAGTGGGAATTGGAAATAACGGGCGGATAATTAACAGTCCAATTTAACATGCATTTGAATCGTGTATTCGTATTGGTTAGAAGGTGGCGTGAGGAATTAATTACATGAAGGTAAGAGGCGCTTGGTGTGGAGGGTACGGTAGATTAGTAGGATGTATGATCTAGTATGCTGTTGATTTCAATTGCCATGCTATGGATCAGTTGGTGTTATCACTTGTCAGAGTGTTGGTATTTGTTTCATTTTGCAAGGATGTTTTTGTGTGGATTTAGTGAGTCATATGTAAATTGTTCTGTTATGCTAATATCATTAATGTGAAGAGCCATGGTTTGATTAATTTGAGAGCATTTCATGTTACCATTTCTAGTTCTTTTTTTCTGATGGGTAGATTAATTGTTATTTGCCAATACTTTACTAGTTATTTCCTGCACTGAACATTCTTAACTTTTCTGCAGGGCTGTATCTATATTCTGCTACAGATAGTAAGCTCACAGTCGATACCTCAAGAGGGGAAAGGCTACACATCAATGTTAGTGTGGATGTTCATTTTCATTTTCCCCGAAGTTTCCAATTTTCTTGTATTGCTAAGACATTTTGCATCTCCAGTTTCCTCTTGTTAATTTGTGCCCCTCCATGCATGTATTCCTATTTGGAAAGCCACGCTCTTGGGCATTTAGGCTCCATCTATATATTATATTATTAAGACAGGCTTGATAGGAGACATCATGTTCCTTGTGGAGGCTAGAAATTCCCACATTAATCGGAGGAAAACAAAAAGAGAGTTAAATAGGAATACAATTTAGAAATAACTGAAATTCGGAATTAGAAATAAGGAATATTGGAATAACAGTCCATATAGAACCCAATACGAGAACAATTAAAATCTCTACTACTTAAAAAGACTAAGATGATTCTGTCGTCCATCATTGACGTCACAGCGCCTCACGCGCATTCGCGTCCAAGTCGTGTGCGTTTGAATCCTGCTGCATGGCACCGTATCGATTTAAAGGATTTTTCTTTTAAATAAAAGGGGAAAGGAAAACGTGGCAGGAAGACTGCCTATGATAATCTGAGAGCAAATCAGGAAAGAGTTCCAATAAAAACGACTTCACGCCAATTCAATCGTCACCCAATTTCTTGCTACGTAATAGGAGTTTTGGGTTGTGCTTTTATAGAGAATTGAATCGGGTTTTTTCTTAAGATTGGTTTGAGATATTCTTGTGCCTTTCATCCAGAAAAGTAAGATATGCCCCGGTCGATGATTGGCGATTTATCTGTAGCCCGCTTGGCTCCGTAGCTCCGTATGCATGCACATCCAATTAAGCTCTCTGATGCAAAGATGGACATGTTTATGAGTAGATTTTGGGATTTCTCCCTGATGTGCAATCATGCCAAAGATGTCTAAATTGAATCCTAATCATTTAAGATTGATCGTAAATATTAATTAGTTTCTCCCATTACAAAGCTCGGGCACATTTGCTAGTTCCAGTCTAATTTATCTTTCTTTACTCTTCTAAAAAGAGGAGTTGAGGTGATTGGTGTGTTCTCACCCCCACATTATAAGATCTTTAGTGGTTGCATATACGTGGTAACAGGATATTTATACGTTCTTTGCATTTTTTTTATGTGAAAAAAAGGCATTCCATGGACGTATGCGCTAATTGGTCTTATGTAACCATGTAAACAATCTTGAGGTCCGAGGTATTTTTTTTTGTATGTGTGTAATCTTATGTGGCCACTGCACATGCCATTTTCTGCAACTAGTTGAGGAATCCTATACTTATTGTTAATTTATGTTGCTGCACTTTTGCAGTTTGATGTTACGTTCCCAGCTCTTCCTTGTTCACTTGTTGCTGTTGATACAATGGATGTCAGTGGAGAGCAGCACTATGATATAGTATGTACGACAGTTTTCATCAGTTTCCTTATTATATTATATATATTTTGATCTGTTTTAAAAAGTGCTTCCCAAGCACTGTATCACATAATATTCTACCTGAGGTTCCAAACCATCTGCTTTGCAGAGACATGACATAATAAAGAAAAGAATTGATAATCTTGGTAATGTAATTGAATCAAGAAAAGATGGAGTTGGTGCCCCTAAGGTATGTTTTCTTACTTTTAACTTGAAAAGGTGTACAGGTGAAACTGTTCTGTTTCTTTTTCCTTCACATTCATCACCATTGGAGCTGTTCACTAGTTTTTATCTTAGAAAATTTGAGATATACTTTAGTTAGCCAATTAATTTTATAACCAGACCTTGAACATTGTGGTCTGTGATATTTTTCTTTTACTCTGGAAAATAGCTGGTCCTATTGTGCTTCCATTATAAAATTTTGGCCTTCATAGTGCTTGCATGCAGCCAGGAAGTTATTTTAGATTCTTCTAGTTGTTAGTGACTATTCTTGTTGTGATTTTCCAGAAAAACAAGCATAGGTTATTTATGCTGCCACTTTATTTATGTCAGTAACCTCTATAGAGAAACAAATTGAATATAAATCCAGGCATACTGGCATGAAGGGATCGGTATAATGGTTGTGAAATATGCTGTCAAGGATAATGTTCTTATATCATATCCACGCATAGTAGTGGTGTACTGGCATGAAGGGGTTGTCATATTATTATTCCTTACTGTATGATGGGTGTGCGCTATGTTGGCAAAAACAATATTTAACTTTAACTAACTTGAATCATGGAACTCTAGATTGAAAGACCACTGCAGAAACATGGTGGAAGACTTGACCACAACGAAGTTTACTGTGGATCTTGTTATGGTTCTGAAGAGGTACCTTGTACACTTCTCTAATACCATTATGTTGAGTTTGCCTATTTTTATTAATGTAACTATTTATGTATTTACACCTATATTATTTGCAACACTAATTTTTATCCTTCCTCTTCCATTGAAATTGTAAGAAAAACTAATATTGTTTTTATTAATTCATCAGTCAGATGATCAGTGCTGTAACTCCTGTGAAGACGTCCGTGATGCCTATCGGAAAAAAGGGTGGGCACTCACCAATATAGAAGAGATTGATCAGGTACTACGCACTTAACCATTTTTCTTCACACTTACAAGAGATTGCATAATCTTGTTCAATCTTCCTGCACATGGTTCTTAGCAAAACTCGTCCATGTATTGCCCCTTGTCATGTGTTTGTCCTTGGTCTGTTCATTTGCTAACTAGTCAGTTCTTGAAACAGTAATTTGTGGTTGAGCATTGTGTTTCCTTATCACCACATAGATCAATATAGAATATTACTGCACTACTATCTTGATGTCGACGGCATGTTCATTATATATTTGTGTAATGAATTATATTGGGAGCCATGGCTTGTACTGCATCTAGCCATATGCTAGTAAGTAGCCTGCAACCCAATTGGCAATCCAAAATATGTCTATAAAAGTTAAGTTTGAATTATAGCCTCTATCATAATGTTGTTTGGAAAAAAAATCTGTATTAATTTTGATCAAACTATCTTATAGCTTGCACTTGATTTTCTCTTATGTTGCAAAATGCGATGTTTGGTCATTTTGTTGCATGCAACATGAATATGTTAACAAATTAATGCAACCCATTTTGTCTTCCTAATGAACTTATTTAAGAGTTTGTGCTGCCTGCTGCCTGCAACCAATGCATGCAGACATCTTCTCTATCAGTTTTATGCTTCTATCTTATCCTTAATTGACTTATGTTCCAGTGTAAGCGAGAGGGCTTTGTTCAAAGGTTAAAAGATGAACAAGGAGAAGGTTGCAGCATTCATGGATTTGTAAATGTCAACAAAGTAGCTGGAAATTTTCACTTTGCCCCTGGGAAAAGCTTGGACCAATCATTCAACTTCCTTCAAGATCTCTTGAACTTCCAACAAGAAAATTACAATGCAAGTTGATTTTTTTTCTTCATCCACCTTATTGAACCATTGATAATACTGAGCATAAACAATTAAACATGAACTTATAATGGTTTTACTGAAACAGATAAGTCACAAGATAAACAAGCTTTCCTTTGGGGTAGAATTCCCTGGTGTTGTCAATCCTCTTGATGGGTATGTTTGGAATTTAGAGAAGCTATATCACATCTCTCTTTGGTCCTTATTTTCCATGTTCCTGATTTCCTGTGTATTTCAGTGTAGAGTGGATACAGGAGCACACAAATGGATTAACAGGAATGTACCAATACTTTGTCAAGGTAATATTTTTAGTATCTAGTCACGTTTTTCTCTTGTGGGGAACTAGTCATGCTATTTAATATGGTTGCACAATGTCATGCTGTTGGCGTATGAAGAGATGTCATGCTGCCTTCTTTAGTTTATGTGCCTCTTTTGTGCAGGTTGTTCCCACAATCTATACCGACATTAGAGGACGGAAAATCAACTCAAATCAGGTAAGCAACACCGTTCTATAACATACTTTATTCTGAAGCCAAAACTTTTGATTTTAATTCTTTTTTTCTTTTGCAGTTTTCTGTGACGGAGCACTTTAGAGAAGCAATTGGCTATCCCAGGCCTCCGCCTGGTGTATATTTCTTCTATGAATTTTCTCCAATTAAGGTGAAGAATGGATATACTGATTTTATGTAGTCCTTGAAGCATTAGGTAGCGATATTTCTGTGCTGTCTATTGATTAGTCTGTAACTATGCTATCTAGTCTACTTAGCTGCATGCTTTAAAACCACAAGCATATGCCTGTTTTTGTTTCCTGAAAGCATCATGTCAGTTTTCTAGTTACATGTCAATTTGTTTAGCTCTTAATACATACAATTAGTCAATATAGGCTATTTAGCTGTATGCTCGGATGATCGTCACAAGCATGCCTGCATTTATTTCCTGAAAGCAACGCATTTGTATAAGATATTATGCAACAATTACCATCTTTGCCTGCATTCTTCGTCCTTTAGATTGAAGTTATGTCATTTGCCTGATAATTTGATTGTTCTTTGGCAGGTTGATTTTACTGAAGAAAATACATCGCTTCTTCACTTCCTGACAAACATATGTGCTATTGTTGGAGGTCTGTCATAGCTCGCAAATTTGTTTATCTTTTTGTGCTTTCCAGAAAACATAAGCAATAGACTGATTTTTGCATGAACATATTTTCCAACCCATCTTTCAATTGCAATCGTACAGGGATTTTCACTGTTGCTGGCATCATAGATTCTTTTGTCTACCATGGTCATCGTGCTATAAAGAAAAAGATGGAGATCGGAAAACTTGGATAA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA010841

Retrieved from "https://ngdc.cncb.ac.cn/ricewiki/index.php?title=BGIOSGA010841&oldid=55664"