BGIOSGA010879
| Gene Name |
BGIOSGA010879 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA010879, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_11254 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA010879-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA010879-PA |
| Length |
6658 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:12106992..12113649 |
| Sequence Coding Region |
12113515..12113649,12112977..12113092,12112760..12112871,12112564..12112677,12112420..12112467 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:12106992..12113649 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGTTTCATGTCAGCGAAGCTCTTTCCTTCGTGTGAGAGTATGTGCGTGTGCTGTCCAGCTCTGCGCCCAAGCTCGCGGCGCCCTGTCAAGCGTTACAAGAAACTGCTTGCCGAGATATTCCCCAAGACGCCTATTGCCAAGTTTCTGGAACAGAGGAGTCACAAGGAGCTACGTTCTGCTCATGTGAACTTTATCAAAATTATCACTGAGGCATACAGCAAGCTACTATTCATTTGCAAGGAGCAAATGGCATATTTTGCCATTAGCCTGGTGAATGTTCTTACTGAGCTCCTGGAAAGCAAGCAAGAGAACATTCATATTCTTGGATGCCAAACTTTGGCGAAGTTTATTTATAGCCAGGTGGATAACACGTATGCACGGAATATTGAAAGCTTGGTTCGCAAAGTATGTGTGCTCTCACGGCAACAGGGAGTGCTTCTCCGGGCAGCAAGCCTTCAGTGCTTATCAGCAATGATCTGGTTCATGAAGGAGCATTCGTACATATTTGCGGATTTTGATGAGATTTATAAGAAGAGCATGCCAGAAGTTATCTATCAGTTAAGGGAGGAGCGTGAATCTCCAGAAGTATGGGCACACATTTGTGTTCAGAAGCTTGCTGAGCTGGCCAAAGAGAGTACAACAATGCGACGCATCCTAGATCCAATGCTTTCTTACTTCGATAAAAAGAAGCAATGGGCTCCTCGACAGGGATTAGCTTTGCTTGTTTTGTCTGATATGTCTTATCTTGAAAAAAGTTCAGGCAACGAACAATTGATTTTAACTTCTGTCATCCGGCACCTCGACCACAAAAATGTTTTGTATGATCCTCAGATTAAATCTGATATGATCCAGACAGCTACTTTATTGGCACGGCAGCTACGATCACGAGGAATTGCTGCTGAGCTTGTAGTAGCAGGTGACTTGTGCAGACACTTGAGGAAAACACTAGAGGCCATGGAGTCAGCCAGTATTGAAGAGCTGAACTTGAATGAATCACTTCAAAATTTCTTGCAGGACTGTCTTCTAGAAGTTGTCACAGGAATTAATGATGTGCGGCCGCTCTATGACATGATGGCAATTACACTGGAGAATTTGCCTTCTATGCCTGTGGTTGCCAGAGCATCGATTGGAAGTTTGCTGATCCTTTCGCACATAATCTCCTTGACATCAATGTCTTCAAACGCTCCTATGCTGTTTCCAGAAGCACTCCTCCAGCAGATACTGAAGTCCATGGTACATCCAGATGTTGACACTCGTGTGGGGGCACACCACATGTTTTCTGCTGTTATTGTTCGAGGACCAAGCCGTCAGAGGAGTGAATCAGACTTTCTATATGAAACAAAAAAATGGCAGTCTCGGACTACATCAGTATTTGCTTCAGCTACTGCTCTACTTGAGAAGTTAAGGAGAGAAAAAGAAAGTTTAGGTTCTGATAAGACAGGAAACATGGATGATGAGAAGGAAAAAAGCATAAGTGAAGAGGAAAATAAACATGTTTGGGCACGTAAAAACTCGGCTTATTTTTCAAAGCTGGTTTTCTCTTTCACTGATCGATATGCAGCACTAACTAGTTCTGCAGAGGAGGCTAATATTGTCATGCTAACTGAAGATCAAAAAAATCAATTGCTCTCCGCGTTTTGGGTACAGGCAAATCAGACAGATAACACTCCTTTTAATTATGAGGCGATTGGTCACTCGTACAGCCTCACGGTTATTTCTTCTCGCCTTAAGGATTCAAGGAACAGTAATAACATTCAGTTTTTTCAGTTGCCGCTGTCCCTTCGTAGTGTTTCCTTAACCTCAAATGGAGTCCTTTCCCCTTCTTGCCAGCGGTCTATTTTTACCTTGGCAACAAGCATGCTAGCTTTTGCTGGGAAAGTCTGTCACATTACTGAATTGTTTGATGTGCTGAGGTGCTTTACATCTTGCAATATGGATCCTTATCTAAGAATTGGTGAAGACTTGCAACTCTATGTAAGGTTGCAATCTGATCTAGGTAACTATGGTTCTGATAGCGATCAAGAAATCGCTAGATCTGTACTTTCTGACTGCAGGACAAAAGTGGGGATTAATGATCAGCGAGTACTTGATGTAGTTGCTTGTGCACTGTGTAATTTAACTGAGATGGACAAGGATGTACTGGTGAAGGAGCTCACAGAAATGTTTACACCTGAAGAGGTGCCCTTGTTTGGGTCAAATTCAGCATTTGACTGGGCCAATTTTCATGTTCAGGCATTTTCTGATGAATCCCTTTCTTTTGATGAGGAGTGTTCAAGAACCTCTTCAGTAGATGGTGGGTTGCATGAGTCACCAATTACAAACACCGGTAGCTCAATATCAAAGACTACGATGCCACAATCTGTTCCTCGTGTCTTAGGTGTTGGCCAGTTGCTTGAATCGGCGTTACATGTAGCCGGCCAAGTTGCGGGAGCATCTGTTTCGACCTCCCCGCTCCCATACGGCACAATGACCAGTCAATGCGAAGCCTTGGGATCAGGCACTAGGAAGAAGCTCTCAAGCTGGCTTGTCAATGGCCATGACTCTACGCCAGACAATCCTGCTCCAAGCCTTCCATCTGCGCAGCATTTCATCATTCCTAAAGTAAATTCATGCGGTTTCGAGAGCAGCATCCGGACGACTTTGGAGCCTTGCTCGGCAGTGAAGCTCCCACCCGCCAGCCCCTTCGACAACTTCCTGAAGGCTGCATATCGTGCCCAGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGFMSAKLFPSCESMCVCCPALRPSSRRPVKRYKKLLAEIFPKTPIAKFLEQRSHKELRSAHVNFIKIITEAYSKLLFICKEQMAYFAISLVNVLTELLESKQENIHILGCQTLAKFIYSQVDNTYARNIESLVRKVCVLSRQQGVLLRAASLQCLSAMIWFMKEHSYIFADFDEIYKKSMPEVIYQLREERESPEVWAHICVQKLAELAKESTTMRRILDPMLSYFDKKKQWAPRQGLALLVLSDMSYLEKSSGNEQLILTSVIRHLDHKNVLYDPQIKSDMIQTATLLARQLRSRGIAAELVVAGDLCRHLRKTLEAMESASIEELNLNESLQNFLQDCLLEVVTGINDVRPLYDMMAITLENLPSMPVVARASIGSLLILSHIISLTSMSSNAPMLFPEALLQQILKSMVHPDVDTRVGAHHMFSAVIVRGPSRQRSESDFLYETKKWQSRTTSVFASATALLEKLRREKESLGSDKTGNMDDEKEKSISEEENKHVWARKNSAYFSKLVFSFTDRYAALTSSAEEANIVMLTEDQKNQLLSAFWVQANQTDNTPFNYEAIGHSYSLTVISSRLKDSRNSNNIQFFQLPLSLRSVSLTSNGVLSPSCQRSIFTLATSMLAFAGKVCHITELFDVLRCFTSCNMDPYLRIGEDLQLYVRLQSDLGNYGSDSDQEIARSVLSDCRTKVGINDQRVLDVVACALCNLTEMDKDVLVKELTEMFTPEEVPLFGSNSAFDWANFHVQAFSDESLSFDEECSRTSSVDGGLHESPITNTGSSISKTTMPQSVPRVLGVGQLLESALHVAGQVAGASVSTSPLPYGTMTSQCEALGSGTRKKLSSWLVNGHDSTPDNPAPSLPSAQHFIIPKVNSCGFESSIRTTLEPCSAVKLPPASPFDNFLKAAYRAQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..135#558..673#779..890#973..1086#1183..1230#2133..2173#2421..2617#2941..3221#3424..3573#3795..4184#4478..4627#4748..4823#4903..5027#5246..5437#5563..5703#5856..5990#6233..6433#6539..6658#ATGGGTTTCATGTCAGCGAAGCTCTTTCCTTCGTGTGAGAGTATGTGCGTGTGCTGTCCAGCTCTGCGCCCAAGCTCGCGGCGCCCTGTCAAGCGTTACAAGAAACTGCTTGCCGAGATATTCCCCAAGACGCCTGTATGTGTTTGCTTTTCACTTTATTTCTGTGCAAGTTTAGATTAGCAAGTCCTGTTTGGACATTGTTGCTGCAACTTTAATGCATTGTGCTGTTTTTGATCTATAAGCAGTTAATAGTCCTTGTTAACCTGCTCTATGGAGTTTGCCTATCAAATGGTTATATTCTCCACTGACGACATATTCGTGGACAATGCAACTTCACTGTCAAGTGTAGCGCTGCTGATTTTGCAGAATTTACTTGCAGGATGGCCTTCCAAATGAGAGGAAAATCATGAAGTTATGTGAATATGCAGCGAAGAATCCCCTGCGCATTCCTAAGGCATGTGCTGATATCATATTGCTACCTTTTATTATACTGATAAAATACTCCTGAGTATGTGGTTAATTTTTTTCATGTTTCCATTTACCGTTGCTTATTGCAGATTGCCAAGTTTCTGGAACAGAGGAGTCACAAGGAGCTACGTTCTGCTCATGTGAACTTTATCAAAATTATCACTGAGGCATACAGCAAGCTACTATTCATTTGCAAGGAGCAAATGTGAGTGTGCAAACTTATTGGCTGACCCTTAGGTTTCCTATATCGAACTGTTATTTGACAGGAAGAGTTCTTATTTCTTGTTATTGTGTGCATGTGATGATATAGGGCATATTTTGCCATTAGCCTGGTGAATGTTCTTACTGAGCTCCTGGAAAGCAAGCAAGAGAACATTCATATTCTTGGATGCCAAACTTTGGCGAAGTTTATTTATAGCCAGGTCAGGCATTGTAAATACTACCCTTTGATCATTTGTTTTCTTTAGTGAATGTATCAGAATCATTATTATGGTACATTAACAGGTGGATAACACGTATGCACGGAATATTGAAAGCTTGGTTCGCAAAGTATGTGTGCTCTCACGGCAACAGGGAGTGCTTCTCCGGGCAGCAAGCCTTCAGTGCTTATCAGCAATGGTAATATATGCCTTTTCAGATCCTTTTCCTGACTTTCTCTTGCACGACTTAGTTTCAAAGTGTAGTTCTGTTAACTACTATCATAATATTGTGCAGATCTGGTTCATGAAGGAGCATTCGTACATATTTGCGGATTTTGATGAGGTAGCAACAATAGGTTCCTTGTGGGAACCACCTATCGTTCATTCCTTGTGTAATCTATTGGAAATTAAACCTATTTGCTTGAGTTCAAGATACCATACTAGCACATGAACCTGTTTACTGGGTTGAGGTTATCCATTTGCACTAACTTAGAGATGCCAATTTATCCCCACATACTAGAGCAGTTATTTTTCTTGTCATCTGTGCAAACACACATATCCAACTTTTTAGTTATTGTTGTTCTGACATCTACCTGATTTATCGGGCCATAATACATTAACAGCCAAATAGTTCATTTATGCTCTCTCTCCTTAGAGGAAAGGCTTCTTGTTGAACTGTTTTCATTTTTATTATTACTGGCGAATAACTCTACTTTCATTGGGTGTGCCAGATTGTCAGTCAGTCTTGGAGAATTATAGAGTGGAAGAATCTGCTGCTGGTGACGAAGAAAGCATGCACCACAGCATAATGGGTTGATGAAATAGTAAGACGTGAGGGGAGAGCTGGCTTAGGTGGTGGTAATGATGTAAATTGCAACAGTACAGCTATTAGACTGCGATCAGCTAGGGATTCTTCAGCCCTGACCAGGTGAAGTATCTTTATTATGTGCTTGCTACACAATTTCCTAAACTTTGTGCTGAAATTGTATACTTTGTAGATAATAAGTGTTTCTGCACTCTCGTTTCCTAATCTCTGTGCAGAAAAGTGTAATTATTGTGATACCCCAGTCCTTCATTTTATTTCAGTCTTGTTTGTTGTCAATGCAATAAATCATGTCTTTATCCTTCCTATTTTGAAGGATATATACATTCTATAATTGGAAAACTAACACACTTTAAGCTGTATATGTATTTCAACTATTATTTAATGTTGTTTGTCTAAAGTAAGTAGTGTTGCATATGAAGATTTATAAGAAGAGCATGCCAGAAGTTATCTATCAGTTAAGGTAGAAGGATATTGAATGCATTCCCCATCTAAAAAATTCCCCTCGGAAGAATAGCAGAGTTATCTTGCTGATTGATTCACCAATCAATAAATGAATGTGGACTTGATTTCATAAGTGCATTTCTTGCGATAGTTACCGATCTATATTTTTAACACACTTCTTCAAGTCATACTTTGTGCTACATAAATATTTGAAGCATCTTATCTGTTCCCTTATGCTTAACCAAGTGATGTAATCGTCAATGCAGGGAGGAGCGTGAATCTCCAGAAGTATGGGCACACATTTGTGTTCAGAAGCTTGCTGAGCTGGCCAAAGAGAGTACAACAATGCGACGCATCCTAGATCCAATGCTTTCTTACTTCGATAAAAAGAAGCAATGGGCTCCTCGACAGGGATTAGCTTTGCTTGTTTTGTCTGATATGTCTTATCTTGAAAAAAGTTCAGGTAAGTTTTTATACATAATAAGGTTTGGAAAACTGCTTGCAAAATAAAAATAATAAAAAATTGCAAACAGCGTGATATCTGACAATCAACATGAAGTTTCCTAACTCTTCCAGTAATACCAAGTGTGTTACTAATTTCCTCTTTTTTTAAATAATAAATAAATGTCATTCCATTTAAATATCTTTAAACTAGTGCTTCTTGTTACAGAGCTTGCTGTCAACTTCATTACTGAACACATTGCAGCCTGGGCTTGCACTTTATTTTACTCTCTGTATTTTCCAGGGGGCTTGTCCTTGTCTGATAATTCATATTTTCCTTCTCAGGCAACGAACAATTGATTTTAACTTCTGTCATCCGGCACCTCGACCACAAAAATGTTTTGTATGATCCTCAGATTAAATCTGATATGATCCAGACAGCTACTTTATTGGCACGGCAGCTACGATCACGAGGAATTGCTGCTGAGCTTGTAGTAGCAGGTGACTTGTGCAGACACTTGAGGAAAACACTAGAGGCCATGGAGTCAGCCAGTATTGAAGAGCTGAACTTGAATGAATCACTTCAAAATTTCTTGCAGGACTGTCTTCTAGAAGTTGTCACAGGAGTATGTTATCCACTATCCCAGCCACATGCTAACATTTTATCATCTGCCACAGATTACTTTGGTGTTTCTTTCTCAGTAATGTTTAATTGCATGAGCTTGCGTTTCAAAAACTTTACACTAGTATCACGCCAGTTCATAACTATGTTACCATATATTCTTATAGTTTCACCATTTTTTGCTAATCTCTGGGATATTCTTCCAGATTAATGATGTGCGGCCGCTCTATGACATGATGGCAATTACACTGGAGAATTTGCCTTCTATGCCTGTGGTTGCCAGAGCATCGATTGGAAGTTTGCTGATCCTTTCGCACATAATCTCCTTGACATCAATGTCTTCAAACGCTCCTATGGTTAGTCTGAATCTATACTATCTACTCACTATTTGAGTTAAGTATCAAAATAAAAAGGATTGCAATCAAGTTCAGGAACTGTGTAGCTCATATACGGATAAAATAGTTAACTTTTGTGGTTGATATTCTTCTCTATATTTACAAAATACTATTCTCTGACCAATGCTATGTGGATCACTTCTGCCATTCTTTACTAATTCTTTAATAACTCTTCTTAGCAGCTGTTTCCAGAAGCACTCCTCCAGCAGATACTGAAGTCCATGGTACATCCAGATGTTGACACTCGTGTGGGGGCACACCACATGTTTTCTGCTGTTATTGTTCGAGGACCAAGCCGTCAGAGGAGTGAATCAGACTTTCTATATGAAACAAAAAAATGGCAGTCTCGGACTACATCAGTATTTGCTTCAGCTACTGCTCTACTTGAGAAGTTAAGGAGAGAAAAAGAAAGTTTAGGTTCTGATAAGACAGGAAACATGGATGATGAGAAGGAAAAAAGCATAAGTGAAGAGGAAAATAAACATGTTTGGGCACGTAAAAACTCGGCTTATTTTTCAAAGCTGGTTTTCTCTTTCACTGATCGATATGCAGCACTAACTAGTTCTGCAGAGGTATTTTTTCTTTCAGTGAGTTTGATTGTTTGTCCTGCTTGCAGTGACATGGCACTTCTACTAGTAATTGAAGCACACATCCTTTGTTCATTTCTGCTCTAGTGTCATTGTCTCCGATGTTTTTTTTAAATGTGTGTCCGACGTAGTAATTGAAGCACACATCCTTTGTTCATTCTTTGCTTTAGTGTCCTTGTCTCCGATGTTTTTTTTTGTGTCGGATGGGGCATGCATGTATATAATCCTAGAGTATGGTAATCGTGATATTTGAATAATCCGCTCTATGTATTTCCCAGGAGGCTAATATTGTCATGCTAACTGAAGATCAAAAAAATCAATTGCTCTCCGCGTTTTGGGTACAGGCAAATCAGACAGATAACACTCCTTTTAATTATGAGGCGATTGGTCACTCGTACAGCCTCACGGTTATTTCTTCTCGCCTTAAGGTACAGGTTGATTTGAAAATATATAACTATTACTGTTATTCCTGCATGCAGTGGAAGTTCACATGGTTTGTCTAAGCTATATTTTTTTTTGCCATGGAAATATTTTTTTTGGTGCTGCAGGATTCAAGGAACAGTAATAACATTCAGTTTTTTCAGTTGCCGCTGTCCCT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