BGIOSGA010936
| Gene Name |
BGIOSGA010936 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J023131F23, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA010936, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA010936-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA010936-PA |
| Length |
5481 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:11198358..11203838 |
| Sequence Coding Region |
11203806..11203838,11202759..11202885,11201585..11201655,11199036..11199110,11198358..11198510 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:11198358..11203838 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:11198358..11203838 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGCTCGCGTTGATGGGACACCATCACCAATTGGCGACCTCCCCCGCGCACTCCCTACTGCGAGCCGCTGCTGTCGCCGTGCCGTCGTCCTGCCATCGCCATCCTTTCGCTCCCGCCGCCGCATCCGCCAACGAGGAGCCCGGGACTGTCGGATCCGCTTACTGCCTCTGCATCGAAGACCAGCCAATCTGGAAGATTGAAAAAATGGATTGCTTGAAGAACAGAAGAGCCATTGTTATTGAGCAGCCGAAGCCCAAGGCTCCTGTTTATCAGCTAACAGAGGGAACCAACACACTATTTCAGGATAAGCCACATGACATGCTGCCAAAAACCTGGTCATGTCAAGGACAAATCCTGACACCCGGTAGGTGTTTGCTACACATGTCACTCCTATCATTCTTGTTATATTGCAATTGTCAAGAGAAATTAAGCTTTGGAATAAGTGTGGTTATCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MELALMGHHHQLATSPAHSLLRAAAVAVPSSCHRHPFAPAAASANEEPGTVGSAYCLCIEDQPIWKIEKMDCLKNRRAIVIEQPKPKAPVYQLTEGTNTLFQDKPHDMLPKTWSCQGQILTPGRCLLHMSLLSFLLYCNCQEKLSFGISVVI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..33#954..1080#2184..2254#4729..4803#5329..5481#ATGGAGCTCGCGTTGATGGGACACCATCACCAAGTAAGCCGGTTCTAGGATGGTCATTTTGTTGTGTGGATGCGATCGTGCACGAGGCCCCCAAGGATGCCTGTGATGCTGCAAGCTCCGGATCGCTGGCAAGAACGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACACGTCAGCCCGAGCTGGAAAACGATGGGATTTCGCGAGCTCTCGTGCGGCCGCGTCGTCCTGGTAAATTTGCAAAAATGCCCTTCATTTACTTGATAATTTGTTATAGGTCCCTGGTCTTAATTCTAATGGAGTGAATTACACTTTGGGCCATGTTTTATTACCAAAGTTTCACTTTGGACCACCCTGTACATAATCTTTTCGCTTTGGACTAGGTAACTTTACCTTTGTTGCACAATGGGCTACCCTAACTCTGTTCGCTTGTGATGTCTAGCGTCTCTTTCGACAAAAGTATGTCATGCATATAGGTATGAAAGTTTGCTGGCATGCCGTTAACAATTTGCTCGAAGTTATCGAAGAAATGAAAATGTGTTTTGGGGTGGTCCATTGTGCAACAAAGGTAAAATTACCTAGTCCAAAATGAAAAAATTAGATAAAGGGTGGTCCAAAGTGAAACTTTGACAATAAAACATGGTCCAAAGTAAAATTAACTCATTCTAATGTTGTGCGTTCTTACTTAGAGTCCTCTGAATAAAGCAATATTCTATACGAAGAAGCGAAAAATTGGAAAATCGAACCGCGCTCTAAAAACTATAAGATTAGGGGTGTTTTTGCAAAACAAAAACCCTAGCCCTAACCCCCTTCCCCAAACCCTAGCCGGCACCATTCCTCTGCCTCTCCTCCTCTCTCTCCGCTCTCTCTCCTGCCAAGCGACGGCCGCCGCCGCTGCTTGCTGTCCCCCTCATCCTCTTCTTCCCGCAGTTGGCGACCTCCCCCGCGCACTCCCTACTGCGAGCCGCTGCTGTCGCCGTGCCGTCGTCCTGCCATCGCCATCCTTTCGCTCCCGCCGCCGCATCCGCCAACGAGGAGCCCGGGACTGTCGGATCCGGTGACTCCGGCCTCCTCGCCGGCAGATCCGGCCGCCCTGAAGCGGGGGAAGCCTGGAGCCGCCCTCTACTCTTCTCCCTCTACGCCCGGCACCGCCCCTCCCTCTCCCTCTCCATCTTCATTTCCGGATCGATGGATGCCTGTGATTAGGTGGCCTAGGGCTCATGGTTGACGGCGTTGGTTGATCCGGCGGCGCAGCACACGATCTGGTGGTGGTGCGACGCAAAGGGATCGACACAGTTCAGCCAAGCAAGGCAGATATCTGCATCTCAGCAGCTACATGCGCATCCAACCTCTGCCATCAGGCTTTGTACGGAAGCCTGATTTCTTGCATTCTTCTTCATTAACCTACCCTCTATTTCTATTGGTGATGTGGTAGCAGATTGTTGGTAAGGTACAGGGACGCCCAGTTGCTCCGAAAGATTGTCTTCGCCCGCAGCCCCCTGTTGCTGTCTTGAGCTCCTTGGTCAGTTCAGTGCCTTCTTTAATGTTTGTTTCTCCAATATTTGAAGAGTGGTGATGGATAGAAATAGGAAATGAAAGAAGCCGCTTTTGAGAGGTACATATTGGTTATTCAACTACACCAGAAATTACCCTATTTAGCACAGAGTTGATTGAAAGATTGAGATGTATTTCTTGCTTTCTCACATCTGTTTCATTCACCTGTTGTGTAATGCAATATACAGATAATAAGTTTGTTCTTTAGAAAACCCTTCCTGTAGATGGTGATTAATATATGCTCTAGAATTTAAATAGCAGCTGTCATTTTTTCTGCCTTTCATTCATGGTAGAGATAACATGAACAAAGAGCTGCAACCTTTTAAGTTTTAACCTTTCTAATTCTGATTTACTCACCTTAATTTTTCCCTTAGGTATAGCTGGCTTCAAAACATATATGCTCCCTCTCCACCCATAACAGCAAATTCAGATGCATTTCATCCTTTCCCGCATAGTTCCAGTGGAGCTGAATGAACACTGGGTTTTATTATTTTGTACAGAACTCAAATGCAACTTAATATTTGCATAAATCCAGTATGCATTGCTTCTCCGTGCACCCACAACAATAAGCATTCTTTTTGGCACAATCTGATGATGTTTCTACAGCTTACTGCCTCTGCATCGAAGACCAGCCAATCTGGAAGATTGAAAAAATGGATTGCTTGAAGAACAGAAGAGTAAGTGGTCCAATACCCCATTCTCACTTTATCTTTACATGTGGATCTTGGTGGTGTTGTGATGCTTTACTAAAACTTTGGTATCTGAATCTGAAGCATTGTAGGAGTTCTCTTTGTATGGCTACAACAAGATGGTTGTTGTAGCACTGAGCATCAGAAGTCACTGTTGCCAAACTCATAATCTGAATGGTAATGCGTGAAATGTTTTGGTACTATCAGTCACCGACTCATGATGCTCTCTAATTTGACAGCAAAATTTGTTGCTGAACAGGACTACTTAATTGCTATGATCTAATTCTTACTATTTCGTATATGATCTAATTCTTGATCATCTGGTGTGGCACTTTATTCTAAATTTTTGAAGCGCCTATGTGTTCACTCCCTTTATTTTGTTGTTTTCAAAGGTAAAACTCCATCATATTTTTCTGATTGTTATGTCGTTTTCAATTGTTATGTTTCAATGTGTAGCTTAAAGGATATAATAAATACTTTGGTTGCAGTAGATAGTTTTTACTAATTAATGTTCATGCTTGCAAAGAAAAAAAATATGTTCAGTTCTGCAAAGAAAAAAAAAAGAGGTTGACTCTATATAGAAGAACATAGAGGAATGCATGTGTGTTTTCACAGTGCATGAGAAAATCAGTGAGAAAGTTCAGCCATCTACCAATTCTATCATTGATTGCTCTAATGGCAATATTATATCAAACGAACAGATTGCATTGGTTTCCACTAAATCTAGGGAGAAAACAAATTTATGAAGAGGCATGTTTATTCTTGACAAGAAGGGACCAGTATAGTAGCTCACAACTTCTCTGTCAAGCCAGAACATATACGTTGCTTGTAGATTGTATTTTTGTGCTTAGAATACCAAAATGCAAGTAAAACTTACAAATATAATTACCACATTTTGCTATTACAAACTAATATGGAATGACTGACCACGCTTTTTGTTTTTGTTCCTTAATTTTGCTTGTGGCAAGAAAAAATGGAGGATTTTCCTTTTGCCATGCTGTATTAGCTTCCCTTTTACCGGCATGCTTGTTTCTTAAAATTTGGTTTGCATCTTCATTTATCTAGGCACATAAATTTGATCATTTCATGCCTACATGTGTTTGCTCTTAGGCCATGATCTGCCAATGGAACTCAACAGCTCATCAGTGCTAATTACCAGAGGAGATAATGAAGTGAAGGTGAATGTTCCATCTTTCTTGATGTTTCCCCTGGATTTGCTCATGATTTTAGATTTTTTACTATTGAAATTTGGTTCCGTTGATCAATGTATTGTTTCAGTGCTAATGACCAGAGTATAGTGTACTGTTGATATTCTGCTAGAGGTTCAATTTAATTTTTTTGTACATCATACACAAAACATTTTTGCAATGATTTAATGTACAGAAATTTAGTTGGAAGCTCCATAATACATGTCAGTTAACATTTTAAATTTCAGTAGGATTGATCTTTTGTTGTTGAATGTTCTTTTTTTTTCTGTGTGCAGATCTGCAACACTTATTTGGATGCATTAAGCTAACAGTCTTTTCTGCAGCAAAATATAATGCTCAAATCAGTGTCTTAATTATAAGCTGGCTTATTGCGCCTAGGAACTTGGAATATTTTTTATTTCCTTTGTTTGTTTTGCCTTCAGGAGGGTTAGCATCCGGCAGTGGTAGTGCCTCCAGGAGGGGTAGCAAGTCCCCGTTAACCTTTCTCCTGCTGTTCAATCATGTTAGATTACTTCAATTTTTCGTCCGAAACTTGTTCATGGGAAGAAACTTCATGATGTATGATTCGCCTGTTGGGCTCTGCTAAGATTGTGTCTTTTGTTATAGTTCTGGCAGTTCTTAGTCTGTGTGTGTTTTAAAGCCCTGACTAAGTGTTAGGTTAGACCTAAATTCCGTAATATGGTTGGTGAGTTAGAACAACATAGTGGGGACATTGTGGTGACCTTGGTGTTTGGTAGTGATGGGTTGTGCTAAATGGCATACCTTTTTTATGATGTGAGTTTCATTTACAAAATCCCCATGTTTTTTTTGTCATAGCAGTAGCCTCATGGTTGCTTGCCATGGCAGTAGCATGAGGTATTTCGTTGTGCCTCTGTTTCCCATGGGCAAGAATTGAGCTCATTGTGGCCTTTCTACATTATTAATTAGATTGTGGCATTGCATATAGTACTGGAGTTCTTACTAGAACTATATATCGCCACGCTTCAGTTAAATATAAGAACAAGCCTTAATTAACAATATCATGTCAATTTTGCAGGCTTTGGTTGCTCCTGCATCACTGCTTGCCCATAATGCTGAATTGGAGGGGAAGTGGTGGTTCAGAAGATCGAGGACAGTGAGTGTAAAGTCAGTTACAATGCGATGAACATTAAGTATGAGAACTCGATCAAGGCAAGTGTTATCAACCCAGCTAAGGTGAGAAGATGCATGCTCCAGAACGCAGCCTGAGTGGTTGCAATGGTCCTCACCTTACAGGCCATTGTTATTGAGCAGCCGAAGCCCAAGGCTCCTGTTTATCAGCTAACAGAGGGAACCAACACACTATTTCAGGTAAACTTAAATCTTAAAATCACATTGCATCTACAACAGGCTTGGGTACTGTCCTGTTGCTGAAACTTAATTAGACAATATTGACTATCCAGTTTCAATTGTCATTTGCCCAATAAAAACAGGTTAGCTTCAGA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| External Link(s) |
