Os12g0285600
| Gene Name |
Os12g0285600 |
|---|---|
| Description |
Oxysterol-binding protein family protein |
| Version |
NM_001073118.1 GI:115488197 GeneID:4351995 |
| Length |
9927 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0285600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:10861358..10871284 |
| Sequence Coding Region |
10861707..10861871,10862869..10863213,10864416..10864724,10864855..10865010,10865711..10866159 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaacccgctctgctgcatcgcgccggtctcgctcgacagcgccgtcgagcaccaccaccagccgccgcgcatcctcgcggcggcggccgcggcgccgacgtcgcccactccgccagcggcggcggtggctgcgcaggtggtgctggatgcggcgcaggcggcggttgcgggggtgctgcacaagtgggtgaactacgggaaggggtggcggctgaggtggttcgtgctcgagggcggggtgctgtcctactacaagctccgggttggagggggcggtgattccgcggcgtcgccggcggtggcggcgagggtgatcggggagggtggcgcgctgcggcgggcgcgggaggaggccgcggcggcggggaagcagtggaagccgttcggggagatacacctcaaggtttcgtcaatccgtgcaagcaagtcggatgataagaggttgtatatattcagtggaacaaagacgttacacttgaggtgtgaaactgaggaagataggaatgcctggatacaggctctgcaagcggcaaaggatcgcttcccacgttcactaacgagcaatgattttagtcccatgtctgatgttttgttgtccacggagaagctgagggtgcggctgctgcaggaggggctgaatgaaacagtggtcaaggaatgtgagtctattatgatgactgagcttttggaactgcacaaccagatgaagtcacagcagcagcagtattctattttgatagatcggctccgacaactagagacagagaaagttgagctggagagaactgttgtgcatgaaactaaggagagggaagcacatggatatgctaatggcagatatagtgatttttattcagttttatcaggaggaagtgcaagcgagtctgatccagatactgcaagtcaagtggcagatgttgaaactgatgaagatgaagtgatgtactttgatacaagagacttcttgtctgcagagtctcttcgaagtgcttcatgtcgaaggagagaacttttgacaaatggttgcaatggattagaacatacagaccctgctgcaaatgtcgtcaaaactactcagtatccctctgttaaacgtcgagataagttacctgagccaaaagaaaaagaaaacccagtagggttgtggtcaataattaaagaaaatattggaaaagatctctcgggtgtttgtctgcctgtttatttcaatgagccactgtcttctttgcaaaaatgttttgaagatctcgagtactcttacttggttgaccatgcactacagtggggaaaacagggcgatagcttgatgaggacacttcatgttgcggcatttgcagtatcaggctatgcttcaactgaaggtcggcaatgcaaaccgttcaatcctttactgggtgaaacatatgaagctgattatccagataaaggacttcgatttttctctgaaaaggtcagtcatcacccaatggttgttgcatgtcactgtgaaggaagaggttggaagttttggggggattcaaatctgaaagggaagttctggggtcgatcaattcaacttgatcctattggtgttctaactctccagtttgatgatggggaaacgtttcaatggagtaaagtaactacttccatatacaatatcataataggcaaaatttattgtgaccactatggtacaatgcgcatcaaaggaagtggcgactactcttgcaagcttaaattcaaagagcagtcaataattgatcgaaacccacaccaggtgcatggatttgtgcaagataatagaacagggcagaaagttgctatgttaatcggaaaatgggatgaagctatgtattatgttcttggggatccaagtgcaaaacccaaggggtatgacccaatgtcagaagcagttcttttgtgggagagagacaagtctctgaaccaaacacgatacaacctttccccttttgcaatttcactaaatgaattgacagctaacctggcgaagaagttgcctcctactgattctcgtctgaggcctgatcaaaggcatcttgaaaatggtgaatatgagatggctaatgcagagaaacttaggcttgaacaactgcagcgacaggcccgaaggttacaagagaaaggatggcaacccaggtggtttagcaaggatgacgacgacagctaccgctacattggcggttactgggaagcaagggagaaggggaactgggatgggattccagacatcttcggtcagcgcagcgcttcacctgggtggtcatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MNPLCCIAPVSLDSAVEHHHQPPRILAAAAAAPTSPTPPAAAVA AQVVLDAAQAAVAGVLHKWVNYGKGWRLRWFVLEGGVLSYYKLRVGGGGDSAASPAVA ARVIGEGGALRRAREEAAAAGKQWKPFGEIHLKVSSIRASKSDDKRLYIFSGTKTLHL RCETEEDRNAWIQALQAAKDRFPRSLTSNDFSPMSDVLLSTEKLRVRLLQEGLNETVV KECESIMMTELLELHNQMKSQQQQYSILIDRLRQLETEKVELERTVVHETKEREAHGY ANGRYSDFYSVLSGGSASESDPDTASQVADVETDEDEVMYFDTRDFLSAESLRSASCR RRELLTNGCNGLEHTDPAANVVKTTQYPSVKRRDKLPEPKEKENPVGLWSIIKENIGK DLSGVCLPVYFNEPLSSLQKCFEDLEYSYLVDHALQWGKQGDSLMRTLHVAAFAVSGY ASTEGRQCKPFNPLLGETYEADYPDKGLRFFSEKVSHHPMVVACHCEGRGWKFWGDSN LKGKFWGRSIQLDPIGVLTLQFDDGETFQWSKVTTSIYNIIIGKIYCDHYGTMRIKGS GDYSCKLKFKEQSIIDRNPHQVHGFVQDNRTGQKVAMLIGKWDEAMYYVLGDPSAKPK GYDPMSEAVLLWERDKSLNQTRYNLSPFAISLNELTANLAKKLPPTDSRLRPDQRHLE NGEYEMANAEKLRLEQLQRQARRLQEKGWQPRWFSKDDDDSYRYIGGYWEAREKGNWD GIPDIFGQRSASPGWS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9414..9578#8072..8416#6561..6869#6275..6430#5126..5574#1884..1968#943..1299#167..571#attactccgccacacccaagccacggtacggcctcctccgccgcggcgatctccatggcctcgcaaaccctagccaccggcggcggcggcggcggtggaggcggcgcggcattcttctgagaggctccgatccgggggcggagggtggtggtggggggtttcgtcgatgaacccgctctgctgcatcgcgccggtctcgctcgacagcgccgtcgagcaccaccaccagccgccgcgcatcctcgcggcggcggccgcggcgccgacgtcgcccactccgccagcggcggcggtggctgcgcaggtggtgctggatgcggcgcaggcggcggttgcgggggtgctgcacaagtgggtgaactacgggaaggggtggcggctgaggtggttcgtgctcgagggcggggtgctgtcctactacaagctccgggttggagggggcggtgattccgcggcgtcgccggcggtggcggcgagggtgatcggggagggtggcgcgctgcggcgggcgcgggaggaggccgcggcggcggggaagcagtggaagccgttcggggagatacacctcaaggtatggtccagcttggcttcccattggattgggtttgttcgtaagcgcggttgcggcttggggaagtgagatttttggagcggcattgctcgggtaatgattgggtggagagtattgtattcgaagtggggtagatgtgtttaggtttaaaaaatggggatcttattattattgtttgttatttgtttcaccttttcgattgatgagatgtgatgtgagggaggcctggtcatagatatgcttcgcgttgttgcagacaatatagtttaatactgaaattgaccattactacggaattatccaaatgatgtggcagaattctagagggacaagaccagcattgctaaggaatttcctgctctggtgttcaggtttcgtcaatccgtgcaagcaagtcggatgataagaggttgtatatattcagtggaacaaagacgttacacttgaggtgtgaaactgaggaagataggaatgcctggatacaggctctgcaagcggcaaaggatcgcttcccacgttcactaacgagcaatgattttagtcccatgtctgatgttttgttgtccacggagaagctgagggtgcggctgctgcaggaggggctgaatgaaacagtggtcaaggaatgtgagtctattatgatgactgagcttttggaactgcacaaccagatgaagtcacagcagcagcagtattctattttgatagatcggctccgacaactagaggtagctttccgtttcttgttttcattacttgttaatgttttttaggataaatctagtaatctgttcatgtgttctcgaaatttctgcaatagacatgatacatcttattcccttaatcagtgaaaaatactaagtgggctatcataattgtttgtcttagtttctaaatgccagacaataacatatgcctgcagcttttgtgcttggcattttttatgtacaatcaacattttgtaaatcaagctacagactatttgtcgatgtaaaatcatgtggataaaaatgggatatccattaattcgtctgcagtcctttgcattcatatgagaaccagttaattgtggtaaacaaagttacttatttatattgacaaacattgatttacagcaaaataaaacatttgcttagtctgaaacaattgcttgctgtgacaatagtgtggtttagttacataacacacttagtgtgtaagcttatcacaagctgccatttgttttgttcttagttcttgaatgtttttcttgtgagatggcataaatttgaccataatcttaaggaccaaaatggtccatttctgggtgcagacagagaaagttgagctggagagaactgttgtgcatgaaactaaggagagggaagcacatggatatgctaatggcagatatagtggttagtaatttcattaacccatatcttgcttctgattttggttgctcttttactttgttttgacttgaattttttttcaatcaaatcacctatttctattttgagtatttcttagcaaaaaaggtaattatcaacaaggatatgttaataataattcagagataagcatatccttccagtagcaagtagcaacagtacttaggaagcaatattcaatttacaagattattccactttttttttgcggggaagattattccacaatttgttacttagttgcattcaagatatatttgttatatgctggttgcatacaatattcctaattatcttcttagggacttgagagttgttatctcagttcaacaagcagtgaataaccagggcatctaaatcttcctcccatacgtttatccccctccttgtgtgccctttctttctgtcccttagcctaaggccctgtttgtttcagcttaagattattgtaatctagattattaaatcagattactctaagctggattataataagctgacataaaataagttacgagttgtttgtttctctggattattagcagtggcggagccaggatttcagcaaagggtattcaaagttgaaaaaaaatcttacagaactcaaaaaattggactggcaaaatttaaagtataaataatagcataacaacatagtggcaatgacatgtttaaaggtacaaacagtagcacaaaagtaaagatatctaaattataaatggtttgaatgaattacatgacaaatgaaataaattgtgcaaatcctttgtatctaattttgtgaaatcctttggataaaattgtgcaagcttaaccaagttttccttgtcataagcagcaaatgaatcaataggattgaaggacgccatgcaaagaagcaactttgtgtttacctcatcaaatctatcattaaactctcgaagttgtctatcaatgatgcttataaacataaaacatgtcaacatggaagcgagggaaattcttgacctttttgaataatcttttagatcttccaaccggcttgtagaagccatccatatcaacaactttgatgccatgcttcacacaaaaagaagtggcatatctttcagaaaagattaccattcatcttcatcatcctcacgcaatagctgcaattgcatctttgtattaattagttcaattgcattaccaatatcttgatccctcagctgctcagcgtcggcagtcgccgtcgaggcctcaggtgtgaggcgacgaccggacgacgcctcggccgctcggcggcgcggcggcggcagcggacggcctcggcagctgggcttcggcgatggcgatgctgcgtcgaatcagggacagggagtcagggagatgaggccggtggtgacgcgctaagctgccgagcgctgagccctcgatgtgccatcggccgtcgcgacgtcgcccgtcgttgcggagtggaggcgtggattgggaggagtgagaactggactggggacaccgggacagggagccagcagccagggagatgaggccagtggcgacgcgccgtcgctgaactgccgagcgccgagccctcaatgcgccgtcgcccgtcggcggggagtggaggcatggattgggatttgggtggagtgtggacttgggactagggtttagtctctttttgggccagtagcagtgggcttattcgctggggcaaggtggggaggaatttacgggctgctgctaataagtgggctttttttcatttgggctatacatactgcactttcctctaactttttacgtatatatgcataacatacctatatatatatatttttttggtaaaattctatgggcattcacgtgaatacccatgaatcacatgggatccgcccctgattattagaggcatctaagggtagtgggtctttagccactcaataatctggaaagagctcctctagaggagattattggattatagtaatttggcttatagattataataatctagcataataatctacttgtttgtttcagcttactcctaataatctagattataataatcctaagctgaatcaaacagggcctaagtgtcttcttatttgtccctatgccttttcccattagtctattgttcatcttcttcttctccaacatggaacctaccagcagggagcctgcctggatgttgcccacccctgttacactactcattacattttctaatctgaggccaaggcatggatgcaatttctttaaatgggtagtacttttttttttgtgtgattacaagtggatatattcataacttcatatacccatttagtatttcattgctttttcccattagtctattgttcatcttcttctccaccatggaacctaccagcagggagcctgcccagatgttgcccatccctgtcacactactcattacattttctaatctgaggccaaggcgtgaggcagatttatacacttgatgcaatttctttaaatgggtagtactattttttttgtgtgattacaagtggatatattcataacttcatatacccatttagtatttcattgaactttttctgaattgtgaactgaggtttttagatatgggaggaaaaataataaatataatatttgcaagtttaatatattgttattttagatgtttcatatgactcattaatctatttaataatctgtgagactttagcgtgttgattggtagtttgacttattagcttttatgcgtgttgttggaaatatgctgctgtagattaggtattctgttcaaccattgtcagagttatttgatggtatccaacatatcttgtttccattattttgaattgcttgttgcatgaatatggctggggctgttacatagtgcattttcacatggttttagagatagtctacattca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| External Link(s) |
