Os12g0289800
| Gene Name |
Os12g0289800 |
|---|---|
| Description |
Tetratricopeptide-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001073129.1 GI:115488219 GeneID:4352006 |
| Length |
3519 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0289800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:11164844..11168362 |
| Sequence Coding Region |
11164844..11164855,11165164..11165214,11165400..11165501,11165919..11165979,11166318..11168362 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:11164844..11168362 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:11164844..11168362 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcagctgcgaagctcaccgcctctgctgtgtttaggagcaaccaggagctcacgtcgctggcgcgctcgggccagctggccgccgcgcgccgcctgttcgaggagatgccccgccgcaacgtggtctcctacaacgcgatggtctccgcgctggcccaccacggccgcctcgccgaggcgcgcaggctgttcgacgagatgccgcgccgcaaccccgtgtcctggaacaccatgatggtggcatgctctcagcacgggcgcgtcgaggatgcgcgagggctattcgatgcaatgcccgcccgaaacgagtactcctggacaatcatggtatcctgctacgtgcgggctggtgagctcaccctcgcaagggagctgctcgaccgcatgcccggggagaagtgcgcggcgtgctacaacaccatgatctccgggtatgccaagaacggcaggtttgaggatgcaattgctttgttgcaggagatgccggcccctgatattgtttcatggaactcagtgttgggggggctcatccggaatgaggaaatctctcgatcagtgcagttctttgatgagatgccagataaggacttggtgtcctggaacttgatgctagaggggtatgtgcgtgctggggatttggatgtggccagtgcattcttttcaaggatcccctcacctaatgttatttcttgggttaacttggtcaatgggtattgtcaggcagggaggatgggcgaggcaagagaattgtttgatagaatgcctgagcgtaatgttgtggcttggaatgtgctgctttctgggtatgtgcagttctctcaggtggaggcggcctataatctgtttatagagatgccagagaagaattcaatctcatggacaacgatggtgagtggttttgtacgttctgggaagctccaagaagcgaaggatgtgctcagcaagatgccttccgacaatgtcggagcaaagactgcactgatgcatggctatttgaaaagcaacctgattgatgacgcccgtcaactatttgatggaattgtggttcgggatgcagtgtgctggaatacaatgatatcaggatatgttcagtgtggtatgcttgatgaggccatggttttattccagcaaatgccgaacaaggatatgatttcttggaacaccatgattgctggctgtgctcagggtggacaaattcgcaaggcagccagtattttcaggaaaatgaagaggagaaatacagtttcatggaattcaattatctctggatttgttcaaaatggtctatttgttgaagcactgcagcattttatgcttatgagaagggatgcaaagagcgctgactggtgtacatatgcatgttgtctaagtgcaagtgcaaatttggctactctgcaaatagggagacaattccacagtcttcttgtcaggactgggtttatcagtgattcttctcctggaaatgccttgatttctgcctatgctaagtgtggaaggatgttggaagcaagacaagtctttgatgagatggtagtacaagacatcgtttcatggaatgcactcatcgatggctatgcttctaatggtaatgggtctgaggtgatagcagtattccgggaaatggaagctaacagtgtcagacctgatgagatcacgttggtagttgtgttatcagcttgcagtcatgctgggttaattgatgaaggattgcatttcttcaattcgatgataaaattgtactcgttaaagcctgtggctgagcattatacctgtatggttgatcttcttggaagagctgggagactaagagaggcatttgaacttgttcagggaatgcagatccaaccaaatgctggtgtctggggtgcattgcttggagcatgccgcgtacacaagaatcacgagatagcatggcttgcagctgagaagttatttgaattggaaccttgcaaggcctcaaattatgtcttgctgtcaaacatctgtgtggaggcagggaaatgggatgatgctgacaaggtgagggttttgatgaaagagagcatattacgatcatgcaatattcatatcagcaataaaatgttggataattctggatataggtgttatggagcttcctggaagcctaggcattgtttgtggaagtggcaagaacaaaaggatttcaaggcattgcttgagctatctttggagtttggatccaagaaagatgatgcagtgcaacaatacgatgatcatgggctcatggatggcagaataaaacaatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAAKLTASAVFRSNQELTSLARSGQLAAARRLFEEMPRRNVVS YNAMVSALAHHGRLAEARRLFDEMPRRNPVSWNTMMVACSQHGRVEDARGLFDAMPAR NEYSWTIMVSCYVRAGELTLARELLDRMPGEKCAACYNTMISGYAKNGRFEDAIALLQ EMPAPDIVSWNSVLGGLIRNEEISRSVQFFDEMPDKDLVSWNLMLEGYVRAGDLDVAS AFFSRIPSPNVISWVNLVNGYCQAGRMGEARELFDRMPERNVVAWNVLLSGYVQFSQV EAAYNLFIEMPEKNSISWTTMVSGFVRSGKLQEAKDVLSKMPSDNVGAKTALMHGYLK SNLIDDARQLFDGIVVRDAVCWNTMISGYVQCGMLDEAMVLFQQMPNKDMISWNTMIA GCAQGGQIRKAASIFRKMKRRNTVSWNSIISGFVQNGLFVEALQHFMLMRRDAKSADW CTYACCLSASANLATLQIGRQFHSLLVRTGFISDSSPGNALISAYAKCGRMLEARQVF DEMVVQDIVSWNALIDGYASNGNGSEVIAVFREMEANSVRPDEITLVVVLSACSHAGL IDEGLHFFNSMIKLYSLKPVAEHYTCMVDLLGRAGRLREAFELVQGMQIQPNAGVWGA LLGACRVHKNHEIAWLAAEKLFELEPCKASNYVLLSNICVEAGKWDDADKVRVLMKES ILRSCNIHISNKMLDNSGYRCYGASWKPRHCLWKWQEQKDFKALLELSLEFGSKKDDA VQQYDDHGLMDGRIKQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3508..3519#3149..3199#2862..2963#2384..2444#1..2045#atggcagctgcgaagctcaccgcctctgctgtgtttaggagcaaccaggagctcacgtcgctggcgcgctcgggccagctggccgccgcgcgccgcctgttcgaggagatgccccgccgcaacgtggtctcctacaacgcgatggtctccgcgctggcccaccacggccgcctcgccgaggcgcgcaggctgttcgacgagatgccgcgccgcaaccccgtgtcctggaacaccatgatggtggcatgctctcagcacgggcgcgtcgaggatgcgcgagggctattcgatgcaatgcccgcccgaaacgagtactcctggacaatcatggtatcctgctacgtgcgggctggtgagctcaccctcgcaagggagctgctcgaccgcatgcccggggagaagtgcgcggcgtgctacaacaccatgatctccgggtatgccaagaacggcaggtttgaggatgcaattgctttgttgcaggagatgccggcccctgatattgtttcatggaactcagtgttgggggggctcatccggaatgaggaaatctctcgatcagtgcagttctttgatgagatgccagataaggacttggtgtcctggaacttgatgctagaggggtatgtgcgtgctggggatttggatgtggccagtgcattcttttcaaggatcccctcacctaatgttatttcttgggttaacttggtcaatgggtattgtcaggcagggaggatgggcgaggcaagagaattgtttgatagaatgcctgagcgtaatgttgtggcttggaatgtgctgctttctgggtatgtgcagttctctcaggtggaggcggcctataatctgtttatagagatgccagagaagaattcaatctcatggacaacgatggtgagtggttttgtacgttctgggaagctccaagaagcgaaggatgtgctcagcaagatgccttccgacaatgtcggagcaaagactgcactgatgcatggctatttgaaaagcaacctgattgatgacgcccgtcaactatttgatggaattgtggttcgggatgcagtgtgctggaatacaatgatatcaggatatgttcagtgtggtatgcttgatgaggccatggttttattccagcaaatgccgaacaaggatatgatttcttggaacaccatgattgctggctgtgctcagggtggacaaattcgcaaggcagccagtattttcaggaaaatgaagaggagaaatacagtttcatggaattcaattatctctggatttgttcaaaatggtctatttgttgaagcactgcagcattttatgcttatgagaagggatgcaaagagcgctgactggtgtacatatgcatgttgtctaagtgcaagtgcaaatttggctactctgcaaatagggagacaattccacagtcttcttgtcaggactgggtttatcagtgattcttctcctggaaatgccttgatttctgcctatgctaagtgtggaaggatgttggaagcaagacaagtctttgatgagatggtagtacaagacatcgtttcatggaatgcactcatcgatggctatgcttctaatggtaatgggtctgaggtgatagcagtattccgggaaatggaagctaacagtgtcagacctgatgagatcacgttggtagttgtgttatcagcttgcagtcatgctgggttaattgatgaaggattgcatttcttcaattcgatgataaaattgtactcgttaaagcctgtggctgagcattatacctgtatggttgatcttcttggaagagctgggagactaagagaggcatttgaacttgttcagggaatgcagatccaaccaaatgctggtgtctggggtgcattgcttggagcatgccgcgtacacaagaatcacgagatagcatggcttgcagctgagaagttatttgaattggaaccttgcaaggcctcaaattatgtcttgctgtcaaacatctgtgtggaggcagggaaatgggatgatgctgacaaggtgagggttttgatgaaagagaggtgtgtatacaagccacctggattagctggatcaatgtagtcagtactcttggatataacgatcagtactcctggatatatataacaaggaatcacaaggccgagcccatcagcagcaggggcacaggcgcacagcatggggaagttggcagcagcaccaccaagaagggtgaccaccatcgtgccactgcaagcccgatggaattgaagtgggaggctgcaagcagcataagaacaaaagggaacctatcagctcctcaatcaagtacttccgtattttgttctatcaaatttttggaccaacaaagctttggatgctcatgcataataatttgcagcatattacgatcatgcaatattcatatcagcaataaaatgttggataattctggatatagggttagttgttttgatttatttgtaaactactactccctccgtcccaaaatatagcaacctaggatgggaatgggtcctaggttgctatattttgggacggagggagtatatgactcgtcttcccttccctaagtaccaaaatgcggagaagaaatgtaggacttagaaatatgatgattgatgttaaatttatgtattatctcactgtttaaagaataaaaggaatgtttttttcccgcagtagcgaggatgtaattagatactttaatttatttcccagctgtaacaaacattttttctaattgtctgaattaattgtacagaatttctaattatttgctaatcagaactaaaaaaatgtgtgttacaattatagatgcttaatgttatttttctgttgaatttcttatattgcagtgttatggagcttcctggaagcctaggcattgtttgtggaagtggcaagaacaaaaggatttcaaggcattgcttgagctatctttggagtttggatccaaggtggaaatcagaagggcgtttcagaaaaggatactgtcaagttctagaaatcgtacttggtaagaggttgccaaattcttgccttactgctgttctgtgcactgagtcgagtgatgcactttaggaccaagtttggtggaattgagttgatgcttcagtagtggctttttttgtaatgacaacagaaagatgatgcagtgcaacaatacgatgatcatgggctcatggatggcagagtaagtcattgaactaattatcgatgattatggcttacattattctggcttttttttttgaattgattgatccctgtggcattagatttcataccatactgttaagtatttaataattgacccacttgattttcttatgttaagaattttttaatatccccacgtaatctcacttgcttttactcacttcattgtactgcacatgtgcattgtcagtagataactacattttctaaatccatgtttaagtaattctgtaatcttgcaatatcttgcttttactaacttctgaaaattttcattaccagataaaacaatga</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
