Os12g0409700
| Gene Name |
Os12g0409700 |
|---|---|
| Description |
ABC transporter related domain containing protein |
| Version |
NM_001073174.1 GI:115488309 GeneID:4352060 |
| Length |
5724 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0409700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:12581530..12587253 |
| Sequence Coding Region |
12581530..12582156,12583925..12584011,12584114..12584305,12584381..12584509,12584583..12584669 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcgacgctctcagtgagggaggccatctactactcagctcacctgcaactaccggacacaatgctggtgtcggagaagcgcacccacgctgagcacgtgatccaggagatggggctcgatgacatcatggacacacgcatcggtggccggatcactaagggcatcagcggtgggcagcgaaagcgggtgagcatatgtgtggagatgctgacacggccacggctactcttccttgacgaacccaccagcgggcttgacagcgccgcctcctaccacgttatgagccacatcaccagcgttgctgctggggagggcatgaccgtcgtcgccgctgtgcatcagcccggcgaagtcttcgagctcttccacagcctctgcttgctcgcccatgggaggacggtcttcttggggacagtttctgatgctaccgagttttttaacctgaatggtttcccatgtccatgcctgaggaacccgtctgaacattttctaggaacaatcaataaagattttgatgaggaaattgtggaagattccagatataggagaaaaacagcagctaaagcaatagataccctgacaaatgcatatcagtcctctgcttattcagaaaaaacaacaaatcagataattcagatgaaagaaatgggtggagctccatttaggacgagagaacgggccagcttctgcacaaagctccttgcactcaccaaaaggtcattcgtaaatatgcacagggatatggggtactactggatgcgttttgctgttttcaccgtcgcttgcacatgtgttggcactgtgttccaccatattgataatagttacaattctatacagactagatgcaatgtgataatgtatatgacgatatttctaacttttatggccattggaggattcccttcttttgcagaggatataaaggtattcaggagagagagactaagtggccactatggtgtcaccgagtttgtcatctccaacactctctcggccactccttacctagccgtcatgatcataatccccggcgcaatactgtactacctcactgggctaacaagaggggggagcaacatcgcctacttcgtcgtcaccctctacatgtgcatcgtgttggtcgagagcataatgatggtgattgccgccgtcgtcccagacttcctgatgggcatcgtcgtcggctccggcgtgcaggctttgatgatgacaaacggcggcttcttccgcctcccgaaccagctcccgaagccggtgtggaagtacccttgctactacatctccttccataagtacgcggtgcaggggttttacaagaacgagtttgtcgggcagacattcgcgagcgatcagctcatcatggcaaatgccaccattactggccatcaggttctcgaggcgttgcaggtggagatgtggtactccaagtgggtaaacctcgccatcctgtttggaatggcggtgatatacaggatgatgtttttcgcaattgtcaaggttgcggagggaatcaggccaaagatgagaaggatgaaatgctctctaatttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSTLSVREAIYYSAHLQLPDTMLVSEKRTHAEHVIQEMGLDDIM DTRIGGRITKGISGGQRKRVSICVEMLTRPRLLFLDEPTSGLDSAASYHVMSHITSVA AGEGMTVVAAVHQPGEVFELFHSLCLLAHGRTVFLGTVSDATEFFNLNGFPCPCLRNP SEHFLGTINKDFDEEIVEDSRYRRKTAAKAIDTLTNAYQSSAYSEKTTNQIIQMKEMG GAPFRTRERASFCTKLLALTKRSFVNMHRDMGYYWMRFAVFTVACTCVGTVFHHIDNS YNSIQTRCNVIMYMTIFLTFMAIGGFPSFAEDIKVFRRERLSGHYGVTEFVISNTLSA TPYLAVMIIIPGAILYYLTGLTRGGSNIAYFVVTLYMCIVLVESIMMVIAAVVPDFLM GIVVGSGVQALMMTNGGFFRLPNQLPKPVWKYPCYYISFHKYAVQGFYKNEFVGQTFA SDQLIMANATITGHQVLEALQVEMWYSKWVNLAILFGMAVIYRMMFFAIVKVAEGIRP KMRRMKCSLI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5098..5724#3243..3329#2949..3140#2745..2873#2585..2671#1..435#atgtcgacgctctcagtgagggaggccatctactactcagctcacctgcaactaccggacacaatgctggtgtcggagaagcgcacccacgctgagcacgtgatccaggagatggggctcgatgacatcatggacacacgcatcggtggccggatcactaagggcatcagcggtgggcagcgaaagcgggtgagcatatgtgtggagatgctgacacggccacggctactcttccttgacgaacccaccagcgggcttgacagcgccgcctcctaccacgttatgagccacatcaccagcgttgctgctggggagggcatgaccgtcgtcgccgctgtgcatcagcccggcgaagtcttcgagctcttccacagcctctgcttgctcgcccatgggaggacggtcttcttggggacagtttctgatgctaccgaggtaaaattttcctcttccaagactaatgaattggtcatcttcaacaccttgatgcagacttgtttatatgcgcgtgtacagtttgaaaacttacatggacagctttctcaaccatctattaaaaaaattaaatgtctgttggtatcatgttggtgagagaaaaaaatcacgccactgtcaccatcaaatataggtaagttatcaccctaaccttctcatcatacaagtcatcatcgtgcaccccccatccagagtttgcattatttctgatttaggggagttatcgaccccagtcggtacgacgggttttactacggtaaccactcatttattacctacaaaatttacaaaacaaaacatgaattcaaacgagaagacaaactcagattgaaatgggtaactgagttgtatgtattgataaatcgatatttataggtaacgggagtttattgacaaaaaagaatcatcgtcaacatttgcaaattataatcttaggggactaagattttcttttatatgtttatcttttttcaatttaatgcctcctttggaattgagggacttaagaaattttggaggaaatgtaattaaatccttgtaaaattcattgttcctaaggatcactaacagttgaatttaaaaccaatataggcgattattgtagatagtttaaaaacaaatagcatctgataaatacatttttagctaacttttttactaacttatgcaaaattctcatagcaacttaattgttttaggtagaaccatttgaagaacctgtccatcacaaggaatcctgtataagcttgttaaggggcgaggtgggatcctatctaagcttgtttaggggtggctagttggcacgcacgcgttggctgcgtaagtcgcttagccgccgattaatggcactgattagctctaatggcattgattagcgctaatggttagtacttttttttgagaatatacataaataatttatttcaatgtttaaaaaatagttgagatttttgaatttgtagttcaagattttaaagtttgagttaaaagttttgaattttgagttgaaagtactaaattttgatatgaaagtatttaattttaggttgagagctttttaacatttatttgaaagtttttaaatctgagttgaaagttttaaaatcttgacttgaaagtttttaaatccaagttgaaatttttcaatgagggaaaggaaaggcaattagataaggcatgcgcttcttttaaaattgaaggtcccccgtgcgaaatacataataagaccataaagttttaaaaatacactgttctagaacaggtaacagtgaagattgcagcagtggcttggagtttgtccgtgccctagcaacacccgacatcataaatatgaagagccaaaaggacaactatcaatagaaacaaaacagaatgttgcttttttttccctgtgtatttttttctgttttccctattaatctgcttagataattagggcatgtacaatagttgtcaatagtggtctcttagcgttgctaattaggaatgcttgttgacatggaagaaagagacaaagacatcattatcatgcataacaacggcttaacaacgactcttaatcactacaatatgaaaatatggttgcatgagggtaaaaaaatagaaagaatattaacaaagggaatatttttttgagttaatgattagagcctttgttgtcttgactattgtaaagacacggtctctaaataatcttatactatcttcgtttcaggttataagactttctagtattgtctatattcaaatagatgttaatgaatttaggcacacatatatgtctagattcattaacatgtatataaatgtgaaaaatcttagaaagtcttataatataaaacggaggaagtattttttaagaggccatactcgtctctactattgaacataccttagtagtactaaaatatttggaggcccctaatttttggtggcctcaacaggtgcacacctatgaaccgaagctagtcattctatcaactcattcaaaagaaaatatttatatatattattaacacataaaagaaccttcaacatatgcccgttgtaaaaataataatttgtaggctaacttatttatttcttgcagttttttaacctgaatggtttcccatgtccatgcctgaggaacccgtctgaacattttctaggaacaatcaataaagattttgatgaggtatgtaatagttcaaacagttatatatttatcgcatgtcctcaactttcattaagacaaaaactatatgtaggaaattgtggaagattccagatataggagaaaaacagcagctaaagcaatagataccctgacaaatgcatatcagtcctctgcttattcagaaaaaacaacaaatcagataattcagatgaaagaaatggtaagtaaattgcatatttagatatggtgcataccttcttggataattatgtttctaatgtgcggtgtgttaaagggtggagctccatttaggacgagagaacgggccagcttctgcacaaagctccttgcactcaccaaaaggtcattcgtaaatatgcacagggatatggggtactactggatgcgttttgctgttttcaccgtcgcttgcacatgtgttggcactgtgttccaccatattgataatagttacaattctatacaggtaaattaaattgcttaatagaggaatatattgttttcttatgaccacgtagaactttatttgaactatcattgatacaaatgttgttcttaaacttttcagactagatgcaatgtgataatgtatatgacgatatttctaacttttatggccattggaggattcccttcttttgcagaggatataaaggtgataagtttgttgcacattgcacctgatggaattaagtttagccagtagccagtagggactgtctaatattttgttgtgattatgaaatagtacataatctttcggaaaaaaaagtacttaaccatccatgaagtttccgttattttttcctcgaagaagggagtcatcaatgtaactagatgaaaccgcgtattgctacggaagttatatataataatgatataaataacatgatagctagacgatataactttatatactttatataattttctttttatggaccacggaacaaataagcaattaagctgatgttgtttgtaacaatttaaatttcaaaagcaaaactaaagcgatatgcctcaatgatacaatgaaaagaagaaagataatatagattaatcatccaaagataaaattaaggtgatatagataatttggaccatagattaatcatatttgagatgatgtgacttaatgagagaaaagaaaaatagcattacatatacttcgtggggataaactttatagatatataggatattacgggcctgtttggtacagctccaactcctaaatttagctccaggagttgagtctggagtggagttgtggagctgcctaaactcagctccacaactctagttcattttgtgagagagctccatccagctccactcccagttttggtgaagctgaaactgtttggctgagctccaactccaggaggggtggagctggacctggagctgtgcaaaaaggccctacataaacagatactccagttgtcattctagttttgttgtaagtcaaacatctgtatattaatttactattaccttttcgaaattcatgcagtttaacaccaaaaaaaaatatatgttgttaggttgaccataggaaatactttcctaatatataaccgacatgctggattgctagaaattaatgatcatagatagaaataatatttaactcaaaacaaaactacaacaaaaagtaatttgaaacagtggagcattttaaattgcgttataaaatatgtggatatgccactaggtttccctatatttattgaatgctactgtttttgtcagaattgctaaaatgacactagttttatgcaaaagttgtaactatgccactctactgttaaattggattaacgttgtcaagtcaggatggttagactatacaataacaacagacaaaaatgccccttgagtaaaatacaacaaaaggagaaaattttgtgctagccatcaaattcctcttttgccaacctttgtatcactttccatgtgtactataaggattcttctcttttttttttttagaaaacataactattaacaatattaaaaaaaaactaccagttgtggcaagtttgctaggtaaacttcaatctgatggcgctatagcaatttgacaaaaacaaattatggcatattgacaaatggagcattaaagattggttaaaaatgtgattctatgttattcctaatcatatatatttagaatatgtatggtcatcacaagtattgtgtttttttttggcaagaagaaactacactatataaatgtttacaagg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