BGIOSGA011960
| Gene Name |
BGIOSGA011960 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA011960, complete gene. |
| LocusTag |
OS03G0174100 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA011960-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA011960-PA |
| Length |
3951 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:4379575..4383525 |
| Sequence Coding Region |
4379575..4379697,4380613..4381096,4381423..4381499,4381572..4381702,4382343..4382439 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:4379575..4383525 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:4379575..4383525 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCAGCGCCGTACCACCAGCCGACCAGCCTGGAGGAGGTCAGGACGCTCTGGATCGGCGACCTCCAGTACTGGGCCGACGAGAACTACCTCTACAACTGCTTCGCCCACACCGGCGAGTTACAATCTGTAAAAATAATACGTAACAAGCTAACAAGCCTTCCAGAAGGTTATGGATTCATAGAGTTCATTTCTCATGAAGTTGCCGAGAAAGTTCTACAGACTTACAATGGCACACAAATGCCTGGAACTGAGCATACATTCAGATTGAACTGGGCCTCTTTCAGCTCTGGTGAGAGGCGTCCTGATGCAGGACCTGATCATTCGATTTTTGTGGGAGACTTGGCGCCTGATGTCACAGATTACTTGCTACAGGAGACATTCCGTGTGAGCTATCCTTCTGTCAAAGGGGCTAAGGTTGTCACGGATCCAAATACTGGGAGGTCCAAAGGGTATGGATTTGTAAAGTTTGCAGATGAAAATGAAAAGAATCGTGCAATGACAGAAATGAATGGTATGTATTGCTCAACAAGACCTATGCGGATAAGTGCTGCAATACCTAAAAAAACCACTGGATCTCAGCTTCAGTATGGAGCTGCTAAAGCCATGTATCCAGCAGCAGGTTATGCAGTTCCGCAAGTCCAACCAGTTCTACCAGATAGTGATCCGACAAACACCACTATATTTATAGGTAACTTGGATCAGAATGTGACAGAAGATGAACTCAGGCAGATCTGTGTCCAATTTGGGGAGCTTATATATGTAAAAATTCCAGCCAATAAAGCTTGTGGATTTGTACAATATGCATCTCGGGCATCAGCTGAAGAGGCAGTACAACGTCTTCATGGCACAACGATTGGCCAACAAGTAGTCAGGCTTTCATGGGGCAGGAGCCCTGCGAGCAAGCAGGATCAATCAGCTGTCTGGAGTCAACAAGCTGATCCTAATCAATGGGCAAGTGCTTATTATGGCTATGGATATGATGCATATGGATATGCCCAGGACCCATCATATGCATACAATTCTTATGCAGGATATACCCAGTACCCCCAGCAGGTTGAGGGAGCGACCGATATGGCATCAGCAGCTGGAAGCCATGCCCCAGGAATGGAAAAGGAGGAGGTGTATGATCCAATGAACTTACCTGATGTTGACAAGTTGAATGCGTCGTACATCGCTGTTCATGGTAGAGCCATGCTTGGGCGACCCCTGTGGTTGAGAACTTCATCATTGCCTCAGTCAGCTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAAPYHQPTSLEEVRTLWIGDLQYWADENYLYNCFAHTGELQSVKIIRNKLTSLPEGYGFIEFISHEVAEKVLQTYNGTQMPGTEHTFRLNWASFSSGERRPDAGPDHSIFVGDLAPDVTDYLLQETFRVSYPSVKGAKVVTDPNTGRSKGYGFVKFADENEKNRAMTEMNGMYCSTRPMRISAAIPKKTTGSQLQYGAAKAMYPAAGYAVPQVQPVLPDSDPTNTTIFIGNLDQNVTEDELRQICVQFGELIYVKIPANKACGFVQYASRASAEEAVQRLHGTTIGQQVVRLSWGRSPASKQDQSAVWSQQADPNQWASAYYGYGYDAYGYAQDPSYAYNSYAGYTQYPQQVEGATDMASAAGSHAPGMEKEEVYDPMNLPDVDKLNASYIAVHGRAMLGRPLWLRTSSLPQSA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..123#1039..1522#1849..1925#1998..2128#2769..2865#3181..3327#3667..3767#3861..3951#ATGGCGGCAGCGCCGTACCACCAGCCGACCAGCCTGGAGGAGGTCAGGACGCTCTGGATCGGCGACCTCCAGTACTGGGCCGACGAGAACTACCTCTACAACTGCTTCGCCCACACCGGCGAGGTAGGTTTACACGCTGCGCTCCCATGCCGCGCGCCCCCGATGAACTAATTCCATGGTTCTATCTTAGTTCATTCGTTAAGCTAGGGTTCCTATTTAGGCGTTGGATTGACGCTTTGTCCCCCCCCCCCCCTCTCGGTGGTAAGGGTTGGATGGGTTTAGGGAGCTAGGGTTGTGGAGTGGCCGTCACGTTTTGAGATCGCTAATTAAGAAGGTTACATGTTTCCCTTTACTAGAATTAGCTACGCAGTTGTCAATGTGAATTGGGAAAAATAGGCTGTTTGTGTTACAAGCCTGAAAAGCCTCATTTGCTCAAGTGAAGTACCGAAGTGATTTTTTGCTTGTCATGTTTGTTGAATCATGTCATTGCAACAGTAGTGATTTACTTCATATAAAATCCAGTAAAAGTTACTCGTTTTGCTGGCAATCTGGCAGCAGTACTGTTCTAGAGTTATGTACAAATATAATTATCTTTTTGTTATATACTTATGTCAGAAGCAATGGAGGTTTTATATTTTGTAATAGGCAACAAGAAGTTAGATGCTCTATGGACTTTCATAGCTCAGATTTGCTACCGGATGCATGAGTAACATGGTGCTAAGATTTTAATTAATTGTTGTGATACAGTAAAATTTTCCTCGAAATTTTATACCTTGACATCCTATATGAATTATGAAACTCGCTAATAGTTGGATTTATGATTCATCCTCTTCCTTTGTTTTATTTGGCCTAGAGTAGAAAATATATGCACATTAACTTTTATATCATATATATATGCAAATTTATTGCAATATTAAACCTTATCATGTTGATTTCAAACCACTCTTGAGGATTACCAGCTGCCATTTTGTCCTATTGAATATATAAGAGTACCATTTGCACTCAACAGTACTAAGAATTGTTTATTTGGAACCGCAGTTACAATCTGTAAAAATAATACGTAACAAGCTAACAAGCCTTCCAGAAGGTTATGGATTCATAGAGTTCATTTCTCATGAAGTTGCCGAGAAAGTTCTACAGACTTACAATGGCACACAAATGCCTGGAACTGAGCATACATTCAGATTGAACTGGGCCTCTTTCAGCTCTGGTGAGAGGCGTCCTGATGCAGGACCTGATCATTCGATTTTTGTGGGAGACTTGGCGCCTGATGTCACAGATTACTTGCTACAGGAGACATTCCGTGTGAGCTATCCTTCTGTCAAAGGGGCTAAGGTTGTCACGGATCCAAATACTGGGAGGTCCAAAGGGTATGGATTTGTAAAGTTTGCAGATGAAAATGAAAAGAATCGTGCAATGACAGAAATGAATGGTATGTATTGCTCAACAAGACCTATGCGGATAAGTGCTGCAATACCTAAAAAAACCACTGGATCTCAGCTTCAGTATGGAGCTGCTAAAGGTAATTCTTGTCTATAATATACTACTATTCTGTTAGTTCTGATGCAACTCACGATCTCACTACTACATGTTATTTTTAGTTGCTCTGTTAATATGTACTCCTGCTTATGAGGCATTTATGACAGATCATGTTCTTGTGAGCTCGTATTATTTCTCCTATTAGCAGTAATAAGATAGAGATTCATCTGTAAGTGGATTTCTGCAGCGATTCATTTATATTGGCAGACAATGCAGCATATATCACAATTCACAAGTGTATAATTCATTTCCATAGACAGGTGCTTTTCTTGAATTTGTTTTAACCACCTGTGTTATTTTGATATGTAGCCATGTATCCAGCAGCAGGTTATGCAGTTCCGCAAGTCCAACCAGTTCTACCAGATAGTGATCCGACAAACACCACTGTAAGAACCCTTATCATTTAGCCTGCTGTTTGCACTGTTGAGTATGCAATTTACCCTGAGACACATTTGCAGATATTTATAGGTAACTTGGATCAGAATGTGACAGAAGATGAACTCAGGCAGATCTGTGTCCAATTTGGGGAGCTTATATATGTAAAAATTCCAGCCAATAAAGCTTGTGGATTTGTACAATATGCATCTCGGTGGGTAATCTTGCTTTAATTTAATAAATGGACATTCTGTGCTGTATGTTCTTTCAAGTTTCAACTTTTACAGAATCAAGCTTTCACAGAATTAGTTAGGAGGCTTAACTTATAATGGCATCATAGGTGGCTGGTTACTTTAAATTAATAAATGAAGCATACAGAGAAGGGTATCATTCGCGGTCTACCTTGTATAATTTTCATAAATACACCCAATAATGAATTATATCGAAGGAGAACCTTTGAAACTCATAGAACTATATCGAAGGAGAACCTTTGAAACTCGTAGATTCATATGCCACTCGGTGAACTGAATACTTAAATAAATTTTATACCTAGGAAAAGATGTATAAAAAATTAGTAACAGACTGAATGATTTATGCCTGTAGCAGGGACTCATTGAATCAGTTTGTTTTTCTAGGTATCTGCATACATTGTAGGCAAAACTTTGATACCTCAGACACTCAGGTGCAAATGTTGCTCTGCATTTATAACTTAATAGAAAGGAACAAAATGTTACCTTTGGTCTGATGTGTTCTTTTTCCACTTAAATATTGGACGATTAGGCAATGCATTTCTTGGCCTCTTTGCGAGCATGGGAATTTGTTTGGATGATGTGAACGATGTGTAACTGTTTCAGGGCATCAGCTGAAGAGGCAGTACAACGTCTTCATGGCACAACGATTGGCCAACAAGTAGTCAGGCTTTCATGGGGCAGGAGCCCTGCGAGCAAGCAGGTAATCTCATTAAGTTTCTATATCACAAACCTAATGCTCAATAAATCTCTTTAACCTCAGACGCCTTGAAATCCACTTAAACCAATATACTAATTGACAATGCAAATTATACTATATAAGCATGCAAAAGAAGAATATATTAATTGTAGAAGAGCGCTTGTATCCCCAGTATATTGTTCTTGTTTAGTCTAACTGATTAAGGGCATACTTGTTTGACCTTTCTTCTTTGGTATTTTCTCTTCATGTTCTTTTCTGATTTTGATATCTGTTCTATTTTGCTTTATCTCTTGGCATTTCATCAAATTTTGTATTCAGGATCAATCAGCTGTCTGGAGTCAACAAGCTGATCCTAATCAATGGGCAAGTGCTTATTATGGCTATGGATATGATGCATATGGATATGCCCAGGACCCATCATATGCATACAATTCTTATGCAGGATATACCCAGTACCCCCAGCAGGCAAGGATTTCAATTAATTTCACATTCATTCACACCTGAAGATTTTTTTTTCTAGTAGTACAGAAATTTTGCCTTAAGCTAAAGATGTTGGGTCCAGAAAGTGTATATGTTGAATTATTTGACTTGTTCCTGCCAGTATGCTATCACCATTAGTATGCTATCACATTGATTCATCTTGAGAATAATGGCTGTTTTATCTGCCATCTTCTGATATCGACAAACTTAGGATGTTTCACCTGCTTGACAATGAGACATGATAAGAATCGGCTAACATAATATCTACTGCACTCGATTTCCTTTTGAACTTCTGATTGAATTAGCAATCTTGCAATTTTCCAGGTTGAGGGAGCGACCGATATGGCATCAGCAGCTGGAAGCCATGCCCCAGGAATGGAAAAGGAGGAGGTGTATGATCCAATGAACTTACCTGATGTTGACAAGTACAGTTCCACTTATCTCACTTCCCCCTTTATTTTATATATTACTACATTGATGATGTGTCCTAATCCACGCACTGCTCTGTTTAAATCTAGGTTGAATGCGTCGTACATCGCTGTTCATGGTAGAGCCATGCTTGGGCGACCCCTGTGGTTGAGAACTTCATCATTGCCTCAGTCAGCTTGA</dnaseqindica> |
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