BGIOSGA012090
| Gene Name |
BGIOSGA012090 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012090, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_10476 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA012090-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA012090-PA |
| Length |
9272 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:6210884..6220155 |
| Sequence Coding Region |
6210884..6210919,6211429..6211548,6211922..6211958,6212825..6212901,6213824..6213891 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:6210884..6220155 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:6210884..6220155 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCAGCTTCGGAGTTCAGGATTCCTTATCAGCAAGTATCATCTTCACAGACTGCTGAGAATGCAGGTCAGTACAAGATCTGCCGGTGTGGGGAAGGAGACCCAAACACATCTGAAACTGGTGACAGTTCGCCAACTAGTTGTCCTAATTGCCAGGTTCTTAAGAGTGGGCATCTACTGCTCTCATCTAAAGGAATTGGTTGGACCACATGGAAAAAGCGCTGGTTTATTCTTACAAGGGCATCATTAGTGTTCTTCAGAAGTGATCCTAATGCACCTGTCAGAGGAAATGAACCGGTTGTTACACTAGGTGGAATTGACTTGAATAACACCGGAAGTGTTGTGGTCAAAGAAGACAGGAAACTTTTAACGGTGTTATTTCCTGATAGCCGTGACGGCCGTACCTTCACTCTGAAGGCAGAAACTACAGAAGAGCTCAATGAATGGAAAAGTGCATTAGAGAATGCTCTGGCACAAGCACCTGCTGTAGCAAATGCTGTTGGCCAAAATCCAATTTTCAGCACTGACATAGCAGAGCCTGCTGAAGCTCCAGCTGAACAGCCGGACGACAAATCTGTTATTGGTAGACCTGCAGAGTTTGCCCTTGTAGATGCTGATGGTAGTCCATCTTTCCTGGAGAAGGCCTTGAAGTTCATTGAAGATTATGGTGTCAAGGTGGAAGGAATCCTCCGTCAGTCTGCTGATGTTGAAGAAGTCAAACGCAGAGTCCAAGACTATGAAAAGGGGAAAAATGAGTTCTCCCCAGAAGAGGATGCACATGTTATTGGTGACTGTATCAAGTATGTTCTTCGAGAGATGCCATCATCTCCTGTTCCTGCACCATGTTGCACTGCGCTGAATTACAAACGGATAAAGATGTTTGATTGCACAGGAACCGACAAAACAAAAAGGCTTGATGCTATGAGTAAAGTGATTTATGAAGTTTTTCCGGAACCAAACCAGCAACTATTGCAGAGGATTCTTAAGATGATGCAGATTGTTGGATCACACAAAGCTGTGAATAGGATGTCTCCATCGGCTTTGGCGGCTTGCATGGCACCACTCCTTCTCCGACCTCTTCTTCTCGGTGAATGTGAAATTGATAGTGACTTTAGTATGGCTGGGGATGGTTCATTCCAGCTGCTTCAAGCTGCAGCTGCTGCCAACCATGCTCAAGCAATTGTCATCATTATGCTCGAGGAATACGACGAGATATTTGATGACTTGGAAGACGGTTCCTGCTCTTCAGATGCATATACTGATTCAGAAGATGGCGATGTTGACAAGGAATATTCTACGGACAATGATGTGGATGGCTCTTATGATTCTGGTGAAGATAACATTGAAGAAGACATGGAAGATGATACTGAGTACTCCTCTGGTGGCAGTGAATGTGATGACAAGGTTAAAAGGAATAACTCTGGCAAGGCATCTAATGGTAATGATAAGGGTTTTCAACCTCCTAAGAAAGCAGCAAGAACAGAACATGGTGTGCTAAGGGAAGACACTAATCAAATTTCTTCTGTTCCACCAGTGGAGAATACTTCCCAAATGGAGAGCAATGATCCATCCCATCGAAAATTACACGAATCAAATGGATCCACAGATCAAATAGAAAAGTCAAATGTTCGCGCATCATCATCAAGAGCAAAATTTATGGAGAAATCAAGCTCAAGAAATAAGAGCAAAAAGACCTTATTGGGCCGTGCTTCAGCAAGAAGAGACCTGTCGGCAGATGAGACTGACTTTTGCAGTGATGATGAGACTCTTATTGAGAAGCTTGAGAACAACAAGACGGATCTCCAATCTAAAATTACAAAGGAGGTGAAAGAAAATTCAATCCTCCAGGCAAGTCTTGGAAGGAGGAAAGAAGAATTGCATGAACGCCGCTTAGCACTTGAAAAAGAAGTGGAAAATTTGCGGGATCAGCTACAGAAGGAGAGAAAATTGAGGGCCTCATTGGAGTCTGGGCTGATGAATTTGCGTAGAGGACAGGTGTCCTTCCCATCAACAATTGATAGCAAGACTAAGGCTGATCTTGAGGAAGTTGCTACTGCTGAAGCTGATATTTTGAACTTGAAGCAAAAGGTTTCTGATCTCCGTGGACAACTCAACAACAATGTCCAGATGAGCTCCACCTCATTATGTGACTCTTGCAACAAACGACTCCTAAGTACAGACAAGCTTTTCGAAGATGAACAGAATACTTCACCATCAAATGTTGGGCCCAATTCTATGTCTGACATGGCATCGGCTACAGACATGGCAGATATTGAGCAATCAAGGAAGCAAACCACACAACATTCATCTTCTTCCATAGACAAGCCAACTCTCCACAAGCATCAAAAGAGTATTGCATCCAATGAACAATCAAGTACCATCAGCCAAAGGGCTCAAAGGATCTTATCTTCTAAGGGTGGGATTATGAAGGATGGCCAAGATGGATCATTTACATCAAAGTGGAACCTTGCACAGAAACAATACTCAAACAATCCACTGTTAGGCAGGCTTGGATCAAATGCCTATTCGAGCACTAGAACAGAGGAATCTGGGGCAGTGCCATTTGCATTAGCCAAGCTGACAAACCGGCTCAATTTTTTGAAAGAAAGGAGGGCGATTCTTGCAAGTGAGATGCAAAACTTAAATTTGGCTCGCCCACCAGGGCCTACAGCTCCAGCACCAAAGAAAGACTCCACATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSASEFRIPYQQVSSSQTAENAGQYKICRCGEGDPNTSETGDSSPTSCPNCQVLKSGHLLLSSKGIGWTTWKKRWFILTRASLVFFRSDPNAPVRGNEPVVTLGGIDLNNTGSVVVKEDRKLLTVLFPDSRDGRTFTLKAETTEELNEWKSALENALAQAPAVANAVGQNPIFSTDIAEPAEAPAEQPDDKSVIGRPAEFALVDADGSPSFLEKALKFIEDYGVKVEGILRQSADVEEVKRRVQDYEKGKNEFSPEEDAHVIGDCIKYVLREMPSSPVPAPCCTALNYKRIKMFDCTGTDKTKRLDAMSKVIYEVFPEPNQQLLQRILKMMQIVGSHKAVNRMSPSALAACMAPLLLRPLLLGECEIDSDFSMAGDGSFQLLQAAAAANHAQAIVIIMLEEYDEIFDDLEDGSCSSDAYTDSEDGDVDKEYSTDNDVDGSYDSGEDNIEEDMEDDTEYSSGGSECDDKVKRNNSGKASNGNDKGFQPPKKAARTEHGVLREDTNQISSVPPVENTSQMESNDPSHRKLHESNGSTDQIEKSNVRASSSRAKFMEKSSSRNKSKKTLLGRASARRDLSADETDFCSDDETLIEKLENNKTDLQSKITKEVKENSILQASLGRRKEELHERRLALEKEVENLRDQLQKERKLRASLESGLMNLRRGQVSFPSTIDSKTKADLEEVATAEADILNLKQKVSDLRGQLNNNVQMSSTSLCDSCNKRLLSTDKLFEDEQNTSPSNVGPNSMSDMASATDMADIEQSRKQTTQHSSSSIDKPTLHKHQKSIASNEQSSTISQRAQRILSSKGGIMKDGQDGSFTSKWNLAQKQYSNNPLLGRLGSNAYSSTRTEESGAVPFALAKLTNRLNFLKERRAILASEMQNLNLARPPGPTAPAPKKDST</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..36#546..665#1039..1075#1942..2018#2941..3008#3090..3168#3406..3550#3666..3770#3956..4033#4231..4286#4376..4432#4572..4690#4892..5135#5242..5424#5996..6304#6390..6439#7085..7145#7227..7310#7504..7620#7708..7874#7981..8053#8541..8625#8737..8930#9117..9272#ATGTCAGCTTCGGAGTTCAGGATTCCTTATCAGCAAGTAAGTGGGGATATGCTTTCCTTATAGTTATTCCTTTTCTATATCTTCTCCATGGCTCATTTTCATTTGGCTTTTGAGATACTGGACTAGTTCAATTCATTTAAAGTGAAGAGCAAGGTGAAGGTCTCATTTTGTTGATCAGGGTGAATCCCTGTTGTATGTTTCAATACAGTTATATTGATGCTAGTTTAAGACAATATTTTAGCAGTCGCCAGTTACTTCTTCAGGCATAAAGAGTGAATCTCACTGAAGCACAAAATATCATTTCAAAATCTTTAAGCAGTCTTGACAATGAAAGTTCTGAATACACTGTTGCTCTATAGCACCTCTCTATGGCAAAATATTAGCATTTTGTCTAAAGACCACTTTATGACATTACATTAAACACTATTTGTGTTCATACTACTGTCATGGAAAAGCTTTTTTGTGAGTTTCACAAGGTCAGATACATCTCTTGATTGTGGCATTAGTGTGAGTATTCACTCCCTTTTATTTCATACTTTTGATAGGTATCATCTTCACAGACTGCTGAGAATGCAGGTCAGTACAAGATCTGCCGGTGTGGGGAAGGAGACCCAAACACATCTGAAACTGGTGACAGTTCGCCAACTAGTTGTCCTAATTGCCAGGTTTGTGAGATCTTGCACTTAAAAGTTATGACATGCATTTACAAATAACCTTGCGAATGATTTATTGTACATTACTTGAGCAAGGGATACTCTGCTTGACACATCACTGATTCACAGCAAAATTATCAGATTGACTATAGATACATAAGCTTTGATATTTGCCACTTGCCTCATACTTGAAACTTCACTTTTTATGTTCTTATGTCTCATTTGTGCTTTGGTGTTTGGTGAGCATAGAAGAAAGGGGTGGGGGTGGGTTAGCTTAGCTCAGAGTTATGTTCAGTAGAAAAAAGGAGTAGACATGGTTGCTTGTGTGCTTTGTTGTCATGTGCACAAATCTTCATAACCAATGTTAAGTACTCTTCTGATGTAGGTTCTTAAGAGTGGGCATCTACTGCTCTCATCTAAAGGTATGTTTTTGTGGTTATATATGTAATGGTTGAATAAATTCTGTTTTTAGCATTACCAGATACATTGTTACATCAGAATAATGTTTGCGGTAGAAAGCTTCGAGTAATATATCTATGGATATGAATATTGTCCATGCAATGGGCTAAATAAGACCAATATAACCTCGTCTCGCTACTTCAAGTACACAAGAACCAATAGCACACTATCCTGAAGTCACACAATTATGAAAACGTCTTGACTCTTAATGTCAATAATACCATCTGTCATGGGTGTTTTGGTAGCATCATAAATTATTATGAGCTTTTATTATGCGGTTACAAAATTGACAATTGTTTTGATTGGCACATTAGACTGGAGAAGACCATGATTCGTTTTAGTCTCTCTAGTATCAAGTACAAAAAGTAAATCAATATACAATGCTTTTATTATTTAGTTGACCTAGAGAGCTTATAGGTATTGCCTCTCTAAAAATCAAATCCTTTAAAAGTTTCAGCATAGTGTAACACAAACAAATATTCCTTGGAATGCCAAACTTCTATTTGCTTCAGAATCATTTAACCGTACTAAGCCCCACATATAAGAGTAAAGAGAGTCAAGCTAAAAAAATTGCTTTGCTTATTTTGAAATTTTTTTTGTTGGGAGCTTCTTCATGCAGTTTCAGGATGATTAGTTTTATCTTTTGCATGTGACAAATTAGAAGCTTGATTACCTACTGACTCTTTCTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACACGTGAGACTTTTCTTGGAAGTTTAATGTACTTTTATCTACAGTATTCTTCATGTTTCACTAAAAGTGATAAGTAACAGGAATTGGTTGGACCACATGGAAAAAGCGCTGGTTTATTCTTACAAGGGCATCATTAGTGTTCTTCAGAAGTGATCCTGTAAGATATATTACAGTAGTTTTTTGTGTGATCTGCCTTTTTTGACCTAGTACTGTATTATATCGTACTTGTACTATGTTGTGTTCCTTCACATCCATTCTTCATTCACCAAGCTAATGTGGATGATTTATTTTGCTATTCAAGCTAAGATAATGTTTGTTGTAACGAAGCATGCTGTATGGTATGCATATTTTTACATTGTAAATTAAAAAGTTTTAGCAATGCTAAACTGCTAGGTCTGCTGTGATACACGAGGCTTTTCTATTGCTTTAGCCTTTGACCTGTCTTTCTCTAAGTCTTTTTTGTCGTATTACGTTCCTACTCATTGCATTGCTATCACTGGAGGTATAGTCTCTGCTGGTCTTTCTAGGTTCTGTTTTGGGGCCTCTTGATATAGATATACCCTATATATGTCTGGTCATGATAACATTAGTTTAACACCTGATGAGCACAGTAGTCATTTTGAACTTTGAGCACTAACGAAATTGAATTATAATTGTAGTATATTCAGGAATAGGACAGAGGATTTTTTTTTAAAAAAAAATGCTATTTGTACCTGTTCAGCACTCCCCTGCAATAGCATCCTGGCTTGGTCATGGTTTATGACCTATACTTACAGAGATTATGAAAAATAATAATATGTGGACCTGAATGTGAAGTAGAATACCTATTCTTTTGCATACTATTTGGACATGAAAAGTGACAATGCAAACACTAAGGCTATTGGCTGTCAGTGCAGCCATGTTGAAGAGGATAAACATGATTACAATAATTTCGTAAGCATACTTTTTTGTTCTTAATAATGTATGTTTCGGATAGTTGGTGAAATATCATGAGGATTTGTTTGATAATATGCAAACTTAAACAGATTAGGGTATCTATAACCATGATAACTCATCCCAATTTTCTGCTTTAATTTCAGAATGCACCTGTCAGAGGAAATGAACCGGTTGTTACACTAGGTGGAATTGACTTGAATAACACCGGAAGGTATATATTGAAAAAATAAATTTTGTTGAAAGTCTAAAATTCCTGTAATCTGAGCTATGTAATCATGAGCTATGGTTTCAGTGTTGTGGTCAAAGAAGACAGGAAACTTTTAACGGTGTTATTTCCTGATAGCCGTGACGGCCGTACCTTCACTCTGAAGGTTGGTAGCACACCTGTTTCAATTCTCAACATACTATTGTCGGCGTTTGCTGGCAGTACATACTGCTGCCCATGAGTGTCAGGAATTAATGCAGCAAAAAATACTAGGGAAGAGAGGGGAGGATCATCACCGGCAGACCAACTGTTTGATAGTGATTAGATCATGCAACAGCAAGGAGCTGTTCCATTCATATTTGATACACCTGTCATACTTAATGGAATGATTTTCACTGAGCAGGCAGAAACTACAGAAGAGCTCAATGAATGGAAAAGTGCATTAGAGAATGCTCTGGCACAAGCACCTGCTGTAGCAAATGCTGTTGGCCAAAATCCAATTTTCAGCACTGACATAGCAGAGCCTGCTGAAGCTCCAGCTGAACAGCGTAAGTTATGATAAATTCATCAGTTGCTCACCATCTGAGGTACTAGATTCCAGTTAGGGGGGTTGAGATTCCTACATTCAACTTGAACAAACAAATCCTACTGTTTCCATTGCAGCGGACGACAAATCTGTTATTGGTAGACCTGCAGAGTTTGCCCTTGTAGATGCTGATGGTAGTCCATCTTTCCTGGAGAAGGCCTTGAAGTTCATTGAAGATTATGGTGAGTGTTTGTCTAATCGTAATTAATCAGCAAATGGCCTTCACTTATTTGTGTTCATGATATCCTAGTTATATCAAACAACAATAAAGTAGAAGTACGATACTTGTCTAACAAACTAAAAGAATTGTACATATGTTTACTAATCCTATGGTTTAGTGACAAGCAGAAACATACTCTGTTTGTAGGTGTCAAGGTGGAAGGAATCCTCCGTCAGTCTGCTGATGTTGAAGAAGTCAAACGCAGAGTCCAAGACTATGAAAAGGGTAATTTGTTCGCCCTGCCCCTTTCCCTTCTCTTCTATCTAAGAGCCTGATGAGTGTTACTCTAATCAAAATAATGAAGTGTTCTTTTCATAAGGATATTTTTGTCACTTGTAAGCCATTAAGCATTGGTTAACATGTGATCCTTAATTTTTTTTGTCCTGTTCACATGATAAAAATGTACCATTTAAATCATGTAGGGAAAAATGAGTTCTCCCCAGAAGAGGATGCACATGTTATTGGTGACTGTATCAAGGTATTTATTTGGCAACTGTTGATTATATTGTGACAAATAGACTTACCACATTCCTTGAAGTAACATATTTAGGTTTTCCTTTGCTACAGTATGTTCTTCGAGAGATGCCATCATCTCCTGTTCCTGCACCATGTTGCACTGCGCTGGTTGGAGCTTACCGTAAGATTGACTTGATATTTTTTTCTATCACCTAAACAACCAGTCAATGTAGTCTTGCATTTAACTGATGTTTGCTAAAATCAGCTCAGAACATGCCCTTAACCTGAAACATGCTGATGTTCTTAGAATTACAAACGGATAAAGATGTTTGATTGCACAGGAACCGACAAAACAAAAAGGCTTGATGCTATGAGTAAAGTGATTTATGAAGTTTTTCCGGAACCAAACCAGCAACTATTGCAGAGGTATCACCTTGGATGCTTTGATTTGAAATTTCTTGTCAG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