Os12g0428300
| Gene Name |
Os12g0428300 |
|---|---|
| Description |
Retrotransposon gag protein family protein |
| Version |
NM_001073201.2 GI:297613084 GeneID:4352106 |
| Length |
4647 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0428300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:13814543..13819189 |
| Sequence Coding Region |
13814543..13814794,13817804..13819189 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggaggcgatggaggagcgtgtcatggaggtgttgacgcgactggcggggaaggtggagaacattgaggtgatcaccaagcacttggaggagatcgacgccaagcttgtctctcatggggagagactggatcgggttcaagcaaagatggatctctcgatgacgtcattagggcaagttcaacaagagcagagtcaagtcgcgcgcgtgttgaaggcggcggcggcggctccgagttcggcggcgccatcaactccgcacgggcaaccaccgttgttggagactccgcggggggcttcgtcggcgaccacttcgctgacaccaccaccaccaccaccaccaccaccaccaccaccgtttgggcgtcggccaccgcaggtatccagttccccttcgctgtctgcttccgagggtggggattctgcgcctagacgccagtggacacctaagatggattttccccgtttcgatggcaccgatgtgagggtttggttggataattgtgagacttattttgggttttatcaaatcactgagggttttcaagtttctgccgcttctctgaatatgattggggatgcagcaaattggtaccaggcttggaagttagagacgggctggcataattgggaatccctgaagacagcagtcttaaatgaatttgaagtcaatttggaaagtgtgaaaatggatgagctgttattgttgacacaaacgggttcggtgactgagtaccgctctaagttcaatcagttggtgtatcagcttaggctttatgatccactgttgtctgatacatttttgattaggcattttctgttgggattgaaagatgagttgaggtctgcagtgcaggcacaacagcctacttctgtttctcaggcttatttggttgctttggcacatgagtctgctcagttggggactggcactaagaaagggcattataagaaagagcatgtggctattaggggcactgataagctgaagttggctcctggtgaattgtggaaagcacagcaactgaaagagtataggcgggctcagggcttgtgttttaaatgtggggagaagtatgctcctggtcatgtgtgtgctaaacaagagggtgttcagttgaaggctttgcatgttcaggaggagtctgaagtattatctgatgaagtgttggatgctattactgctttggatgtttctagtgatagtattagtctgtctttgcatgctatggcgggtacttgtccctctcatacagttcagttgcgtgccttggttcaaaatcaagtgattattattcttgtggattctggcagcactcacagcttcattgatgctggcctttgtcacagattgcagttgtctactgaatctattcagcctacttctccggtgtttgctcaattgcctactgctgctcagttggatattgccgatttgattccatctgctgtgttggagcgccgcctggtaaagaagggtaatgcagctattgttcaggttcttgtacagtggggttctcttcctcctgcattggccacttgggaggactatgatgttgtgcgcacgaggtttcctgatgctgtcgcttggggacaagctccaattggtgggggggaacctgtcacggctgttgcctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEAMEERVMEVLTRLAGKVENIEVITKHLEEIDAKLVSHGERLD RVQAKMDLSMTSLGQVQQEQSQVARVLKAAAAAPSSAAPSTPHGQPPLLETPRGASSA TTSLTPPPPPPPPPPPPFGRRPPQVSSSPSLSASEGGDSAPRRQWTPKMDFPRFDGTD VRVWLDNCETYFGFYQITEGFQVSAASLNMIGDAANWYQAWKLETGWHNWESLKTAVL NEFEVNLESVKMDELLLLTQTGSVTEYRSKFNQLVYQLRLYDPLLSDTFLIRHFLLGL KDELRSAVQAQQPTSVSQAYLVALAHESAQLGTGTKKGHYKKEHVAIRGTDKLKLAPG ELWKAQQLKEYRRAQGLCFKCGEKYAPGHVCAKQEGVQLKALHVQEESEVLSDEVLDA ITALDVSSDSISLSLHAMAGTCPSHTVQLRALVQNQVIIILVDSGSTHSFIDAGLCHR LQLSTESIQPTSPVFAQLPTAAQLDIADLIPSAVLERRLVKKGNAAIVQVLVQWGSLP PALATWEDYDVVRTRFPDAVAWGQAPIGGGEPVTAVA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4396..4647#1..1386#atggaggcgatggaggagcgtgtcatggaggtgttgacgcgactggcggggaaggtggagaacattgaggtgatcaccaagcacttggaggagatcgacgccaagcttgtctctcatggggagagactggatcgggttcaagcaaagatggatctctcgatgacgtcattagggcaagttcaacaagagcagagtcaagtcgcgcgcgtgttgaaggcggcggcggcggctccgagttcggcggcgccatcaactccgcacgggcaaccaccgttgttggagactccgcggggggcttcgtcggcgaccacttcgctgacaccaccaccaccaccaccaccaccaccaccaccaccgtttgggcgtcggccaccgcaggtatccagttccccttcgctgtctgcttccgagggtggggattctgcgcctagacgccagtggacacctaagatggattttccccgtttcgatggcaccgatgtgagggtttggttggataattgtgagacttattttgggttttatcaaatcactgagggttttcaagtttctgccgcttctctgaatatgattggggatgcagcaaattggtaccaggcttggaagttagagacgggctggcataattgggaatccctgaagacagcagtcttaaatgaatttgaagtcaatttggaaagtgtgaaaatggatgagctgttattgttgacacaaacgggttcggtgactgagtaccgctctaagttcaatcagttggtgtatcagcttaggctttatgatccactgttgtctgatacatttttgattaggcattttctgttgggattgaaagatgagttgaggtctgcagtgcaggcacaacagcctacttctgtttctcaggcttatttggttgctttggcacatgagtctgctcagttggggactggcactaagaaagggcattataagaaagagcatgtggctattaggggcactgataagctgaagttggctcctggtgaattgtggaaagcacagcaactgaaagagtataggcgggctcagggcttgtgttttaaatgtggggagaagtatgctcctggtcatgtgtgtgctaaacaagagggtgttcagttgaaggctttgcatgttcaggaggagtctgaagtattatctgatgaagtgttggatgctattactgctttggatgtttctagtgatagtattagtctgtctttgcatgctatggcgggtacttgtccctctcatacagttcagttgcgtgccttggttcaaaatcaagtgattattattcttgtggattctggcagcactcacagcttcattgatgctggcctttgtcacagattgcagttgtctactgaatctattcagcctacttctgttcgagtggctaatggagaaactctttgttgtgaggccaaggttcctcagtttgcttggtgggttcagggacacgagttttcatttcctatgagggtgctgcctatggggggttatgatttggtgttagggatggattggttaacacaattcagtccaatgacatgtgattgggcagcaaaacagttgcagttttcttataacggttcagtcattactttgaagggcatacagacttcagatgagttaaggcctgtcagtgaagtttctgctgttcaggttatgaagtggactaaaggaaatgatatctgggcaatggctgttgtggaaccctctcagtcagtggacaattcagcctctacatttcctgaaatacaacagttactgcaagagtttcagtctgtgtttcaggactctaatactctgcctccccacagggtgttagatcatgttatttccttgctgcctaattctgtccctgttaatgccaggccatatcgatattctcctgctcagaaagatgagattgaaaggcaggtctctacgatgctgtcagctggtctgatttccccaagttgcagtccctttgcctctcctgtgttgttggttaagaagaaagacaattcttggcgtttttgtgttgattatagaaggttgaatgatctcactattaagaacaagtttcctctgccaattgtcgatgagttgttagatgagttagcaggcactcagttcttttctaaactcgatttgcgcagtggttatcatcaaataaggatgcaggaatctgatgagtttaagacagcttttaagactcaccatggacattttcaattccgagttatgcccttcggattgactaatgctccagccacatttcagtgtttaatgaattctatttttgctccttatttgaggaagtttgtgctcgtttttatggatgacattttggtgtatagtaagtcgtggactgaccatttaaagcatttgagatgtgtgctacagctacttcagcaacatcaactttgtgcaaagctatctaaatgctcgtttgctgctcctcagttggaatatttgggtcatatcatctcagctgctggtgttgccacagatgctgaaaagaccaaggtgatgttgcaatggcctgtcccgactaatcttactgagttaaggggatttttaggcttgactggttattataggaagtttgtcaagaattatggcattttggctaagccattgacagtacttcttaagaaaaacgtcaagtttgtttggactgaacacactcaaaaagcctttgattctttaaaacttgctatgagctccactcctgttttagtcttgcccaactttgccaagccttttacaattgaaacagatgcttgttctacgggtattggggctgttctgtctcaggaaggacacccggtggcattttatagcaaggcattggggattaacaatcaaaagctgtctatttatgaaaaggagttcttggcaataatgatggctattgataaatggagaccttatctactcagggggccgtttgtcataaggactgatcaccaatctttgtgccatttagatgatcagttactgggttctgaattacagcgcaaggctatgactaagctcattggtttacaatataagtttcagtataagagaggtgctgaaaataagtctgctgatgcactttctcgggtggggcatttcttttccttacaggccatttctatagcacaacctgtttgggtgcaagaggtggtgaattcttatgtggtggataatcaagctcagtctctactcactgaattggctattatgtcacctaatgcaagtggcttttctctggttcatgggttaataaaaaagaaaggtcgtatttggttgggagctaactctgccctgcacactaaaatcatttcttcgtttcatgattctgctattggaggtcattctggagtaatggctacttatcaccgagttaaaaaattgtttgtgtggaaaggtcttaagcattcagtagaagagtttatacaacaatgtgtggtttgtcagaaggccaaacatgagcactgttcgtccccaggattgttgcaaccattgcctatccctactggtgcatggcaggatatatctatggatttcatagaaggattacctttgtccaagggctctgatgttatattagtggtggtggatcgctttacgaagtatgcacactttctccccttaaagcatccattcactgctgtccaagtggctgataattatctcagtaaagtggcttctctttatggtatgcctaagtctatcgtttctgatcgagacaagatttttaccagtcacttttggcaacatctgttcaaacgttttgcaattcctctgaatcttaccacggcttatcaccctcagtctgatggtcagactgagcgggtgaatcaatgcttggaaatgtatttgcgttgtgctgtggcttcagctcccactaagtggtcttcttggttaccccttgctcagtattggtataacacaagttttcattcggctctgaaatgctctccacataaagcactctatggcactgatcctacttatggtctcctcccggctcctttgactgatgatgctgaacagacttctgatgatattgatgattcttctggagtatcagccttgttgaaagaaagggagttgttttctaccatgttacagcatcatttagccagggatcaaaaccggatgaaacagtttgctgatgctaagaggactgctcgttcttttcaagtgggtgatttggtacttctgaagttacaaccatatgctcaacgttcagtgattgcacggccatttccaaaattggctttcaaatactttggtccatttgagattttggctgttgttgggtcagttgcttaccgtttgaagttaccagctgacagcctcattcacccggtgtttcatgtctcccagttgaagtcatttgtgcctgatactaagccggtgtttgctcaattgcctactgctgctcagttggatattgccgatttgattccatctgctgtgttggagcgccgcctggtaaagaagggtaatgcagctattgttcaggttcttgtacagtggggttctcttcctcctgcattggccacttgggaggactatgatgttgtgcgcacgaggtttcctgatgctgtcgcttggggacaagctccaattggtgggggggaacctgtcacggctgttgcctga</dnaseqindica> |
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