BGIOSGA012560
| Gene Name |
BGIOSGA012560 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012560, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_11428 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA012560-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA012560-PA |
| Length |
10008 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:13699398..13709405 |
| Sequence Coding Region |
13699398..13699538,13700306..13700452,13700520..13700610,13700724..13700842,13701136..13701326 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:13699398..13709405 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:13699398..13709405 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCCCCGCGGACGGCGGGGGAGAGCAGCCGCACAAGGCGCACCGGCAGCACAAGTCCGGCGCGAAGGCGAGGAAGAAGAAGGGGAAGGGCAAGGGCGGCGGCGGCGACAATGACGGTGGCGAGAGGAAGAACCCGAAGGCTTTTGCCTTTCAGTCAGCTGCAAAGGCCAAGCGTCTACAAGCACGATCGGCTGAGATTGAACAACGTCGTCTTCATGTGCCAATTATGGATCGCTCAATTGGTGAACCACCACCTTTTGTTGTTGTAGTTCAAGGGCCTCCTCAGGTTGGGAAGTCGCTGCTGATAAAATGTCTAGTAAAGCACTACACGAAACAAAATTTGTCTGAAGTCCGTGGTCCAATCACTGTTGTGTCAGGTAAAAGCAGGCGCGTACAGTTCTTGGAGTGTCCAAATGATATCAACGGAATGATTGATGCTGCTAAAATAGCTGATCTTGCTCTGCTGCTTATTGATGGAAGCTATGGATTTGAAATGGATACATTTGAGTTCCTAAATATTATGCAAGTGCACGGATTCCCCAAGGTGATGGGAGTCCTTACACATCTTGATAAGTTTAAAGATGTAAAAAAGCTTAGGAAAACCAAGCAGCGCCTGAAGCATCGATTTTGGGCTGAGATAAAGGAGGGAGCAAAACTTTTCTACTTGTCTGGTCTCATTCATGGAAAGTACACGAAAAGAGAAGTCCATAATCTTGCAAGGTTCATCTCTGTTATCAAGCCTATCCCACTGAGTTGGAGGATGGCACATCCTTATCTGCTAGTCGATAGATTTGAAGATGTAACTCCTCCAGAAAGTGTGCGCTTGAACAGAAAGTGTGACAGGAAAATAACATTGTATGGCTACCTTCGTGGCTGTAACATGAAAAGAGGGACAAAGGTACATATCACAGGGGCAGGTGATTTTAGCTTGTCTGGGGTAACAAGTTTGGCAGATCCTTGCCCATTGCCATCAGCTGCAAAGAAGAGAGGACTACGTGACAAGGAAAAGCTGTTCTACGCGCCAATGTCTGGCCTTGGTGATCTACTGTATGACACAGATGCAGTTTATATAAACATCAATCCTCATCTTGTTCAGTTCTCAAAGACTGGTGAGAATGATGCATCTAAAAAGCAAGGGAAAGGACAGGATGTTGGTGTAACCCTAGTAAAAACACTTCAGAACCCCAGATATTCCCTTAATGAAAAGTTGGATCAGAGTTTTATAAATTTATTTGGTAGAAAGCCTGCTGCTCAGTCCGAAGACATCTCTGGCAACCAGAATGATCAGGGCGATGCTAATATTTTGGAAGAAGCAGATGGTAATAACATATGCAACGCAAACACATTGGAGAGCAATGATCATTCTTATTCTGAGTGCTCCAGCGATAGTGAACATGATAATGATGAAGCAACTCAGCAAAATGACCATGAAGTTGGCTTGAGAGAAGAGGTGGAATTTTGCAATGGAAGGATGAGGAGAAAAGCTGTATCAGCTAATTTTAAAGATGATGACGATGATGAGGGTGCGGAAGAAGATGACGTTGACAGTGAAAATTCTGGTGATGACCAGTTATCTGAAGGTTCCGCAGATGACAGTGAAGAATCACTTGATTCAGATGATGAAACTGAGAACAATTCAAAGTGGAAAGAGTCCTTGCTTGCTAGAACACTGTCCAGACGGAGTGCCAATCTAATGCAACTTGTATATGGCCAAGCTTCAAAGAAGCTGGATGAAGGAAATGACAGTAGTGCAGAAGAGAGTTCAGATGAAGAATTTTTTGTACCAAAAGGACAAAAGAAGCAAGCAAAGAATGAATCAACAAGCTTTGATGATATGGATGCTGAGGATTACTCCAAGTTTTTTAAAACTGAGCTAAGAGATTGGTCTGACGAAGATCTCATCAAGAGCATTCGTGACCGTTTCGTGACTGGAAATTGGTCAAAAGCAGCTCTAAGAGGACAGGAAATAAATGAAAACGATGTGGATGACGAAGAAGTCGATGGAGATTTTGAAGATCTGGAGACTGGTGAGGAAGTTGATAATGACACAAAGAAATCGAAACGAGAAGAAACTAATGGAGGGGGCTATTTCGATAAGTTAAAGGAGGAAATTGAAATTCGCAAGCAAATGAATATTTCCGAACTCAATGATTTAGATGAAGATACCAGGGTAGAAATTGAAGGGTTTAGGACTGGTTCTTACATCAGATTAGAGGTACATGGTGTGCCGTTTGAGCTAGTTGAATATTTTGATCCTTGCCATCCCATTCTCGTTGGAGGCATTGGCCTTGGTGAGGAGAATACTGGATATATGCAGGCTAGCCTGAAACGACACAGGTGGCACAGGAAAGTACTGAAGACAAAAGACCCAATTATTGTCTCTATTGGTTGGAGGCGTTTCCAAACAACTCCTGTATATGCAATAGAGGATCGAAATGGTCGGCACCGCATGCTCAAATATACACCTGAGCATATGCATTGCTTTGCTATGTTTTGGGGACCGCTTGCTCCACCAAAAAGTGGTGTACTGGCAGTCCAGCATCTCTCCAACAGTCAGGTACCATTTAGAATTACTGCAACAGGCTTTGTTCAAGAATTCAACAATACTGCCCGAATCATGAAGAAAATCAAGCTCACAGGTGTACCGTGCAAGATATTTAAGAAAACTGCCCTAGTCAAAGGCATGTTCACATCTGACTTAGAGGTTGCTAGGTTTGAGGGTGCAGCTATTCGGACAGTAAGTGGAATCCGAGGGCAAGTTAAAAAGGCAGCAAAGATTGAACCAGGAGATATGGCAAGGAGAAAAGGGGAAAGTATAGACGGGATTGCAAGGTGCACATTTGAAGACAGAATTCTTATGAGTGACATTGTCTTCATGCGTGCATGGGTCAATGTTGAAGTTCCCACCTACTGTAACCTTGTGACAACTGCTCTTCAACCCCAAGATGAGACTTGGCAAGGCATGAGAACTACTGCTGAGCTGCGGAGGGCACATAATATTCCTATACCGCACAACACAGATTCAGTTTATAAGCCCATTGAGCGGAAAGTGCGGAAGTTTAATCCTATAGAGATCCCTGCAAAACTGCAGCATCTACTTCCTTTTAAATCTAAACCGAAGGATACGCCCAAGCATAGAAAAACACCAGTGGAGAACAGGGTCCCTGTCCTTATGCAGCCCAGTGAAAAGAAGACACATGCAGCCATTCAACAGTTAAGGCTGCTAAAACATGAGAAGGCAAGGAAGAAGAAATTGCAGGATGAGAAGAAGAAGAAAGCATATGAGGCGGAGAAAGCAAAGTCTGAACTTCTAACGAAGAAGCGGCAGAGAGAGGAGAGGCGTGTGAGGTACCGAGAGGAAGATAAGCAAAAGAAGCGAGCCCGCAGATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAPADGGGEQPHKAHRQHKSGAKARKKKGKGKGGGGDNDGGERKNPKAFAFQSAAKAKRLQARSAEIEQRRLHVPIMDRSIGEPPPFVVVVQGPPQVGKSLLIKCLVKHYTKQNLSEVRGPITVVSGKSRRVQFLECPNDINGMIDAAKIADLALLLIDGSYGFEMDTFEFLNIMQVHGFPKVMGVLTHLDKFKDVKKLRKTKQRLKHRFWAEIKEGAKLFYLSGLIHGKYTKREVHNLARFISVIKPIPLSWRMAHPYLLVDRFEDVTPPESVRLNRKCDRKITLYGYLRGCNMKRGTKVHITGAGDFSLSGVTSLADPCPLPSAAKKRGLRDKEKLFYAPMSGLGDLLYDTDAVYININPHLVQFSKTGENDASKKQGKGQDVGVTLVKTLQNPRYSLNEKLDQSFINLFGRKPAAQSEDISGNQNDQGDANILEEADGNNICNANTLESNDHSYSECSSDSEHDNDEATQQNDHEVGLREEVEFCNGRMRRKAVSANFKDDDDDEGAEEDDVDSENSGDDQLSEGSADDSEESLDSDDETENNSKWKESLLARTLSRRSANLMQLVYGQASKKLDEGNDSSAEESSDEEFFVPKGQKKQAKNESTSFDDMDAEDYSKFFKTELRDWSDEDLIKSIRDRFVTGNWSKAALRGQEINENDVDDEEVDGDFEDLETGEEVDNDTKKSKREETNGGGYFDKLKEEIEIRKQMNISELNDLDEDTRVEIEGFRTGSYIRLEVHGVPFELVEYFDPCHPILVGGIGLGEENTGYMQASLKRHRWHRKVLKTKDPIIVSIGWRRFQTTPVYAIEDRNGRHRMLKYTPEHMHCFAMFWGPLAPPKSGVLAVQHLSNSQVPFRITATGFVQEFNNTARIMKKIKLTGVPCKIFKKTALVKGMFTSDLEVARFEGAAIRTVSGIRGQVKKAAKIEPGDMARRKGESIDGIARCTFEDRILMSDIVFMRAWVNVEVPTYCNLVTTALQPQDETWQGMRTTAELRRAHNIPIPHNTDSVYKPIERKVRKFNPIEIPAKLQHLLPFKSKPKDTPKHRKTPVENRVPVLMQPSEKKTHAAIQQLRLLKHEKARKKKLQDEKKKKAYEAEKAKSELLTKKRQREERRVRYREEDKQKKRARR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..141#909..1055#1123..1213#1327..1445#1739..1929#2400..2610#3032..3269#3904..4289#4943..5036#5300..5484#5984..6214#6624..6689#6775..6993#7723..7962#8203..8412#9229..9495#9572..9775#9856..10008#ATGGCCCCCGCGGACGGCGGGGGAGAGCAGCCGCACAAGGCGCACCGGCAGCACAAGTCCGGCGCGAAGGCGAGGAAGAAGAAGGGGAAGGGCAAGGGCGGCGGCGGCGACAATGACGGTGGCGAGAGGAAGAACCCGAAGGTACGCACGCACGGGCGCACGGACAAGTGAACGGGCTTCATGTTGGGTTCTGTCTGGTGGGGGGCGTGAGGCTGTGTGCTTCCATGGATTAGGATTTTGACGCTCTGGCGAGTGTGCTATCCGGGTGGTAGCTGTAGGAGTTGGTTCGTTTAGGTGGCGATTAAATGTAGCTCGTGGCGATCCTGTTTTTCGTTCATGCGGATATACTGCGCGGTTCCAACTTGTTCCAGAAGATATACATCTTGCTTATCACGATGAAGTCTCATTTTCTCGGTTTTCTATTGGAGAAATTGGAACAATATTAATTTGAGCATCTGATGCAAGCCATACAGATTGGATATTGTAAACTGTGTTTAAATCTGTGCTAACAGCGTTGCTCTGTATTAATACAGTGTTATAGTCCAGTGCAATTAGCTTAAAATGTAGAATTTAGATAGCATTGAGTGCCCGTGCTCGTATTATTAGCAAGCTATTGCAATAGATGCATTTATTTATTTATGCTTTGGTGATATTTTCTGCCTGTCTATATGTGGAATTTTATGAGTTTGGTTGGAGGTCATGTGGTCACTGGCTATGATCCATGCTTTTTAAAGAAAAGTGGTAAATATCCTCCTTAAAAAGGACACGGTTAGATCTCTGTAACTAAATGGTTCTTTACACTGTGCAAACGAACTCAACAACTCAAGAATGGTTTGTCTATCTGTTTAACCTTTTCCTTCTCTAGTTTTGGAGTATTTATTTTAATAGGTTACCATTCCTTGTCCCAGGCTTTTGCCTTTCAGTCAGCTGCAAAGGCCAAGCGTCTACAAGCACGATCGGCTGAGATTGAACAACGTCGTCTTCATGTGCCAATTATGGATCGCTCAATTGGTGAACCACCACCTTTTGTTGTTGTAGTTCAAGGGCCTCCTCAGGTATGCTCTGCCACCTGGAGAAGATGATGTATGTGGATTGTTTTCTGATCATTACATTATTTATCAGGTTGGGAAGTCGCTGCTGATAAAATGTCTAGTAAAGCACTACACGAAACAAAATTTGTCTGAAGTCCGTGGTCCAATCACTGTTGTGTCAGGTTAATGAACCCTCTGAACCTTGTACTTGAGGACAATCTATATTGTTCTTCTGAACAATTGAATTATTGTGAAGATATGAAACTAATGTATGCAATTTTTTCATCATGTGCAGGTAAAAGCAGGCGCGTACAGTTCTTGGAGTGTCCAAATGATATCAACGGAATGATTGATGCTGCTAAAATAGCTGATCTTGCTCTGCTGCTTATTGATGGAAGCTATGGATTTGAAATGGTGTGCTGTTGAAGCCTATATTTTCACAAATATTTCTAGCTTAGGATGTAGTCTGAAATATGTTTTTTCGCCCTTAGGAGCACATCCCCGATAAAAGTTTCATCTTATACATTTAACTAAAGTTCCATTACTAGCAATTAAAGTGCTGTCCATTACTGCCTACCACTCCTACTAGTGATGGAGCTGACATACTGTATTTATTATGCTGATCTATTCACTGCTTTCTATCCGCGTGATTAATTCCATTTATGCTTTATTGTACTACTGGCACCTAAATAACTGCTTGTTTCCAGGATACATTTGAGTTCCTAAATATTATGCAAGTGCACGGATTCCCCAAGGTGATGGGAGTCCTTACACATCTTGATAAGTTTAAAGATGTAAAAAAGCTTAGGAAAACCAAGCAGCGCCTGAAGCATCGATTTTGGGCTGAGATAAAGGAGGGAGCAAAACTTTTCTACTTGTCTGGTCTCATTCATGGAAAGTAAGTTGGCATAAAGCTGGTATTTCTTCCTTCAGACTCTTTGTTTGTTCTCCCTCTGTCCACAAATATAAGGGATTTTGAGGTTCAAGTTTTGTACACAAATATAATGGATTGTAGAGTACTACTTGCCCATTCAACCATCCCTCATGTAATTTTCACCCAATCTTACTTCCAACCACCTCTCATTTAATAAAGAGCATCACAGTCTTTTCCCTTCATCCTTAAAATCTCTCCAAAATAACCTAGAATCCCTTATATCATGGACGGAGGAGTGGTTATAGCTGAACTATCAATCGATACTTATCAGTAAACAAATCTATGCTGATTTAAGCTCACCATATTAGCAGGGAGTTACTATACATTATCTTTCTTCATGCTGCAGTTATAAGTGAGAATGCTTGTTTTTATGTTCTTTTCATTTCTACTATTTGGTCATTTAGTGTAGAAGTTTCATTTTTTGTCTCATGCAGGTACACGAAAAGAGAAGTCCATAATCTTGCAAGGTTCATCTCTGTTATCAAGCCTATCCCACTGAGTTGGAGGATGGCACATCCTTATCTGCTAGTCGATAGATTTGAAGATGTAACTCCTCCAGAAAGTGTGCGCTTGAACAGAAAGTGTGACAGGAAAATAACATTGTATGGCTACCTTCGTGGCTGTAACATGAAAAGAGGGACAAAGGTGTTCTTCATCATCTCTGGAACTTAATGTTAAACTAACCCAGATTCTACTTTGTAGCAGATAGATGTTATTTAACTTGTTACTTTACTTAATGTTAGTACATGATTTTGGGTCCCTAGTTGATCTTATTTGAACAGCCTTAGTAAATATGACAAAATTGAGGGTGAAGATAATGACATCTTATTTTACAGGAAGCATGAATTTACTGCCAATGAACCTGATGAATCTTCAAAAATTTTTTAATTTTGAAAAATTAGCTAACAGAATGTGTGGCACTATCTACATTAATTATGCTTCAGTCTGGTTGGCAAAACTGAAGCTAATTACTTTTCCTTTCTGTGAGGAGAAATTCTAAGTTCTTTCATGTCTGACTATAGTGCCCTAAACTTTTGGATAGTAAAACACACAATTATCTGTGCAGGTACATATCACAGGGGCAGGTGATTTTAGCTTGTCTGGGGTAACAAGTTTGGCAGATCCTTGCCCATTGCCATCAGCTGCAAAGAAGAGAGGACTACGTGACAAGGAAAAGCTGTTCTACGCGCCAATGTCTGGCCTTGGTGATCTACTGTATGACACAGATGCAGTTTATATAAACATCAATCCTCATCTTGTTCAGTTCTCAAAGACTGGTGAGAATGATGCATCTAAAAAGCAAGGTATGTTTAAAGTATAAACCATTCATAATGATACTAGGCACCTCATTCCTTCATCCTCTTTGCATTTGAAGTTTCTTGAAGTATGTTGTTTAGGACGATAAGGTCCTGAGGACTGTGCAATGCACAAACATACTTTAATAGACAAGACCCATCAAGTTGAAAACTCACTTTACTTATGTTTTCTTGTCTATTTATTTCTTTGGTAGAGTGGTGTGCAACCTGAAAGAATGTTTTGGCGTTGAAAGTTTTTCAGTGTTTTCTGAGCTTGGATTGCAAAGCAAGGCACACACTGTTACTGTTACACCTGTTCCTTGTGCCTGGAAGAGATTTTAGCAAATAAAAGAAAATCTAAGAGTTAGATCTTTAACAGATTATTTGTCTATTTACCCTTATAGTATCTGTCCGGTTTCATATATTCACATTTATCATGCAATTTTAGCTTGCCATCAAAACACAAGTAGGAATATGTATCAGATCTATCATAGAAGAACTTCCTACAATAGATGCACGCTTGTGCTTGAATGGAAGTAATTTTAGTTTTGTTGGCTAGAATCCTGCTCTAGCTTTTTTTTTGTCTTCTTTATGTATGGCCATCCTTTGTTGTTTGCTAGATTACTGACTTATCATCGTACAGGGAAAGGACAGGATGTTGGTGTAACCCTAGTAAAAACACTTCAGAACCCCAGATATTCCCTTAATGAAAAGTTGGATCAGAGTTTTATAAATTTATTTGGTAGAAAGCCTGCTGCTCAGTCCGAAGACATCTCTGGCAACCAGAATGATCAGGGCGATGCTAATATTTTGGAAGAAGCAGATGGTAATAACATATGCAACGCAAACACATTGGAGAGCAATGATCATTCTTATTCTGAGTGCTCCAGCGATAGTGAACATGATAATGATGAAGCAACTCAGCAAAATGACCATGAAGTTGGCTTGAGAGAAGAGGTGGAATTTTGCAATGGAAGGATGAGGAGAAAAGCTGTATCAGCTAATTTTAAAGATGATGACGATGATGAGGTTTTTACCATTTTCCTTTGTTCTTATTAATTAATAGTTCTCTTGCTCTCACATTCTTTTTTTTTCTTGCTCTCTTACTCTTAAGTTCCCTGTTTAGTTTTGTTTTGCCCGATGTAATCCATCCAGGAAACACATGGCTTTGCATCACTACTCCAGACCAAGAAATTTGACATAAAACACTATGCAGCTGAATAACATTATGTTAGCACAGCTATTGGCCATTCCTAAGTCACCAGTTGTAGTTCATGTCTCAACATCATTTGAAGTGTAGAACAATGATATTTTTTGAATAATTATCATACATAAATATTAATGTTAAATATTTACGTTAATATTTAACACTAAATATTTACTTACAATATCTAGTTTGTTTTAGCACCGTATTAACATAAATATTTGCAATGTGTACTTTGATTTCTAGTACAACTCACTAATATTACTTACAGATACATATTTGGAATAGTTAGAAGAACACGTTTTATTGTAACCCTTGACTTCTAGCA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