BGIOSGA012580
| Gene Name |
BGIOSGA012580 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012580, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_11468 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA012580-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA012580-PA |
| Length |
5712 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:13958403..13964114 |
| Sequence Coding Region |
13958403..13958459,13959663..13959848,13960385..13960567,13960679..13960781,13961256..13962254 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:13958403..13964114 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGATCTTGACTGCCTGCCAGGAGAAGCAGTACCCTTCACGGTTCACTCTGTCCATGGTCTTTGCATATGGATCAGTTCCATTGAAGACTTACCTTCCTGATGGGGACGTTGATCTGACTGTACTCGGCAATACATCTTATGGTAGTACTTTAATTGATGATATCTACCACATCCTTCAGTCAGAAGAGCAGAATTGTGATGCTGAATTTGAAGTAAAGGACTTGCAACTGATCAATGCTGAGGTTGACCGTAAAGTTGGAAAAAATCATCTAGTCAAGAATAGCATTATATTAATCAAGGCATGGTGTTATTATGAAAGTCGTCTACTAGGAGCTCATCATGGACTGATATCAACTTACGCACTGGAAACTCTTATTCTTTACATATTCAATCTATTCCACAAATCTCTCCATGGCCCTCTGGAGGTTTTATATAGGTTTCTGGAGTATTTCAGCAAGTTTGACTGGGACAACTATTGCATAAGTTTAAATGGCCCTGTTGCATTATCGTCTTTGCCAAATCAAATTGCCAGCTTTAATCGTATTCGGACTGCTTTTTCGTATGGTGCTCAGAAGCTTGGTCAAGTTCTCTTGTTACAACCAGAACTTATTCCTGATGAAATTTATGGATTTTTCAAGAATACATTGAATAGGATTGGAAGTGGAGTAAGGCCAGACATTGGAGATGAAAGCTACAATGATGCATTTCGTTGTGAGTCCTTCCTTGGTCCTGGCAAGGCATTGTGGGACGAGATGTCGAGCATGAAAATTTCCTGCAATAATCAAGATGAGAACAGAGGTCCTCACCATCTTTCAAAGTGCTTAGTTAACAATGACTCATATGCCACCTTGAATGTGCCTACACATTTTCATGGAGATCACATGGTAGCATCAAGTACTGATTTGAGTCTAAAATCGTCCTGTTTCATCCAAGAGACACCAAATCAGTATCCTTTGTTTTACCTAGAAGATGGCAATGGTAGCAGCGAACAGTACTTGGACCATGAAATGGTGGAACAGGCATCTTGTTGTACAGCTGAAACCTGCCATGCGAATGAAGAACCAACAATGCATCCACAAGTTTATCCAAACAATACGTTACATACATTTTACTCAAGTTTGGCCAATAATTTGGAATATTCCAAATCTGGTCAGTCAGACATGACAAATTCGAGTATAAATGTTGCCCATGAGGAAAAACAAAAATTTTCTCCCTCCCCATTGAGCTTGGTGGATCTATCAGGTGATCTAGATTTGCAATTGAGATGCCTCCGCCAAGTTCAGTATCACCTAGAATACATGTTTGATGGTTTTTTGCAGTCTGTTCAAGAAGCATCTTCTGACTGTAAGGTTGCAAGGGACTCGTTTGAAATTCCAGCTGTTAACATCACATCGAATTCTGATGTGGTGCTGCCAGGTCTGTTATCACCTTCATCTACTGAAACTGATGAGAGGAGATTATCTCCAGTTTCCTCTTCTCATAGCACCGAAGATTCTTCACAGCAGTCACATGATGAGAGCAACTGGGATAATTCTGTTCAATTGTATGATAGCTCAGATGATATCTCCAATATGCATGAAACAGATCAACATATTCTCCAAAAGCACATGGTATCTTTAGGACAGAACAAGACACTAATCAATCGACAAGTGAGAGTTAAAAGCAATCAAGCATCAGTTCCAAAAGGAAAATTTTCCATTTGTAAGGAGCAAATAACACAAGACACTGCAACCAAGGACATAAAGTTAAGCCGGCATTTGAGAGTCAAGGACAGTGAGCATGAATATATAAGCACTGCTAAGAAGATTTCGAGCTATAATTGTGACACTTGCTTAGAATGTGTCAAACCTGAAAGTGAAGCAATGATACCAAGGCATTACAAGCATGCCCGCTCAAGCAAGAACTCATTTGAGCATCGGATTTATGATATTGACATGGGGTTTGCCCGATCTGGTAGTCCAAGGAATCAAATGCCAAAATATCAATCACTGAAGAATCAGGATATGTCAAGCTTAAATGTCCAAAAAGAGCATGAAATTAACTGGCCCAGAAAACAAATGCCATCCGAGCTGTTGAAGCTCCAAAACAGTCTACGTGGCAGGGCTTGCTCAAACAAGAAATTAGCTGCAAAACAAATTAACAATAATCACAAAGAACATCTATCTTTTGTAAGGGATCCAGAACAGATGCCATATAATCAGGTTAACTCAAACAAAGAGTTTGAGACTGTTGGCAAATCCAGCCAATTATTGCCACGGGTACAGCTCTCTCTTCATAACGACAGAAGCCTTACAGCATCTACTTGTCAGTCCTCATTCCCTGTGACAAAAGGATCTACTCAATTCAACGACTTGGAGATGCCTTCACTAGAAAATATTGAGTTTGGAACTTTGGGGTCTTTTTCATTGACACTTGTGTCACCAAAATCGAATAAGAATCCCAACACACACTCAACCAGTAAGACATGTGCCGATGCTGCTGCATTGGCATTGCAAAGCCATCCAACACAAAGCAGGTCACCAGGATTCTACAAAGTTGGAGATGAAGATCACTTCCCACCTCTCCGTGCTGGGACTCGCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MILTACQEKQYPSRFTLSMVFAYGSVPLKTYLPDGDVDLTVLGNTSYGSTLIDDIYHILQSEEQNCDAEFEVKDLQLINAEVDRKVGKNHLVKNSIILIKAWCYYESRLLGAHHGLISTYALETLILYIFNLFHKSLHGPLEVLYRFLEYFSKFDWDNYCISLNGPVALSSLPNQIASFNRIRTAFSYGAQKLGQVLLLQPELIPDEIYGFFKNTLNRIGSGVRPDIGDESYNDAFRCESFLGPGKALWDEMSSMKISCNNQDENRGPHHLSKCLVNNDSYATLNVPTHFHGDHMVASSTDLSLKSSCFIQETPNQYPLFYLEDGNGSSEQYLDHEMVEQASCCTAETCHANEEPTMHPQVYPNNTLHTFYSSLANNLEYSKSGQSDMTNSSINVAHEEKQKFSPSPLSLVDLSGDLDLQLRCLRQVQYHLEYMFDGFLQSVQEASSDCKVARDSFEIPAVNITSNSDVVLPGLLSPSSTETDERRLSPVSSSHSTEDSSQQSHDESNWDNSVQLYDSSDDISNMHETDQHILQKHMVSLGQNKTLINRQVRVKSNQASVPKGKFSICKEQITQDTATKDIKLSRHLRVKDSEHEYISTAKKISSYNCDTCLECVKPESEAMIPRHYKHARSSKNSFEHRIYDIDMGFARSGSPRNQMPKYQSLKNQDMSSLNVQKEHEINWPRKQMPSELLKLQNSLRGRACSNKKLAAKQINNNHKEHLSFVRDPEQMPYNQVNSNKEFETVGKSSQLLPRVQLSLHNDRSLTASTCQSSFPVTKGSTQFNDLEMPSLENIEFGTLGSFSLTLVSPKSNKNPNTHSTSKTCADAAALALQSHPTQSRSPGFYKVGDEDHFPPLRAGTR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..57#1261..1446#1983..2165#2277..2379#2854..3852#3946..4022#4253..5163#5646..5712#ATGATCTTGACTGCCTGCCAGGAGAAGCAGTACCCTTCACGGTTCACTCTGTCCATGGTGACTCATGCATCCACGTGGATTTATCCAATAGTGTGGCAACTGATCAATGCTGTAGCTGAATCTTCTGGGCATGTTGTGTCTGAATTGAGTATTTTGACATAGCATCTGGGCATGTTATGTCTGAATTGAGTGTTTCGACAGAGCAGGGGGTGACATTTAGCCCATGTACACGGACAGCTGCCTGCCAACATCCTGCATTCAGTTCTACTGCGTACTTTGAATTATTACGAGCTCACAAATTCACAGTTGTTTACTGATCGGAATTCATCGGTCCACTGTTTTTAGTCGTACTTGAACTTTGTCCGTGCGCTCCTTTACTTATGTGTAATCTCTTCGCTCCGTACCCACAGATGGTAGATCTGGAAAAGTGGTCCTTATCTGTTGCTATTCTGCTGAACACTTTTAATGCGTACTACGAGATGTCTATACAGTCTTTGTATAGCTGGAATTGCTTGGAAACGTGTGGCAGGCTATGGTTGATAGGCATTAGTTTTGCAGTAGGAGTCATGTTGTGGTGTCACCTAGCAAATGATATTCATTGGGCATCGAAGCAGTAATGTTTTCGCAGTAATGTTTTCGCTTAATTATTGTCACGTGTGTATGTGTGCCAATAGCGCGCAACACAGAATCCCTGCAAGATGCCAATTGACTTTGACTTTTCTCCGCCTTATATGTTGTTTCTAGTTCTTGTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAATGTCGTATTTGCTGATTGGTTGCTTACCTGCTTGAAAAATATGACTTTGTGATTCATGATAGCAGCTCACTTGGTGGCATATTGGTCGCTATTTTCTAGTCATTTCATCATTCATACTTAAGACAGTTATATTATGATTTGTTTCCATGGATGTATTTAGTTGTTTTGGCGCATGCAAAACTGACATGACTAAGTATATATGTTTCTTAGTGGAATAACATGATGGTGACCCAACAAAAAGTTCATCTTTTAATTGTTCTCTTGGAAAAACCAATGGTAACACACTCACATACCAGGAATCTTCGTGGATATGTGATATATCTTGGTTGTGGTTCTCTATCATATTACTACCTGTATATGATTGTTGCAATGACTTCTTATTCTATCTAGCAATATCTGTTGGACCTTTTGACGTGCCAACTTTTTGTGCAAAAATATTTCTTTATTATTTCCTAGTTCTAAAATGTTTCTTCTTTATTCGATATGTAGGTCTTTGCATATGGATCAGTTCCATTGAAGACTTACCTTCCTGATGGGGACGTTGATCTGACTGTACTCGGCAATACATCTTATGGTAGTACTTTAATTGATGATATCTACCACATCCTTCAGTCAGAAGAGCAGAATTGTGATGCTGAATTTGAAGTAAAGGACTTGCAACTGATCAATGCTGAGGTGCAATTTCTTGTTGGCATGTTTATGCTTGCTAATTGCTACACATTCCTAGCCATTCATGTGAACTGTAGTTTGGGAAAATCCTTTTGTTTCTGCTGGTAACATGTGTAATCATTTCACTTCTTTTAATAATTGATTGAAATCACATTATAAGTTAAGCTTATAAACTATGTGCCTCTTGTTATCCCGATATGTTATATTTCTCACACATAAACCACCTCTTAATTTCTGCAAATGTTTATACATTCAGGTCAGACTTATTAAATGCACTATTGAAAATATTGTCGTGTGACATCTCATTCAACCAAACTGGTGGAATCTGCGCAGCTTTGCTTACCTTGAGCTGGTATAATAATACTTTTCTTTTCGAAAATTTTATGTACTTCTATTCCACTTTAATGTCCTTCTGGTTAATTAAACAAACAGTTATTGAATGTGTATAGCACTCGATATTGGTTTTGTGTGCTTGTCTAGGTCTGCTTTTATTTTGTTACTATGCCAAACCTTGGAAAAGTAAATAGTTGTTCATTCTTCAGGTTGACCGTAAAGTTGGAAAAAATCATCTAGTCAAGAATAGCATTATATTAATCAAGGCATGGTGTTATTATGAAAGTCGTCTACTAGGAGCTCATCATGGACTGATATCAACTTACGCACTGGAAACTCTTATTCTTTACATATTCAATCTATTCCACAAATCTCTCCATGGCCCTCTGGAGGTAAGTACAAATAGGAAGGAACTGGCTTCTTCAGTCATGTAAAAACATCTTTAACCAATAATACGGATTATAACTCTTGACCTTTTTACTTCATGTTTGTCTTGTTAATAGGTTTTATATAGGTTTCTGGAGTATTTCAGCAAGTTTGACTGGGACAACTATTGCATAAGTTTAAATGGCCCTGTTGCATTATCGTCTTTGCCAAATCAAATTGGTGCGCTACACTGTAATCTTATCCTTGACTGTAACCAACTAATACATATATTCTGTTTTTACCCTAAAACTTTGTATGTCTTGCAGTCGAAGCAACAAATACACCTGGCAGTGATTTGCTGTTGACAAGAGTTCCTCAATAACTCGGTGCAAAAAACAGATTCTAATGCATGCAATACTGGTTCCGTTCAAAATATCTGAACATAATTGATCCACTAAAGGAACACAACAATCTTGGCAGAAGTGTGAACAAAGGTCTGAAACTAAAGGCACCTGTCTGTTTTCTTCCTCTAAATTATATTTCAAAAGAATTTCTACAAAGATGTATGGGCATGCATATCATAGCATGTGCTGAGATGCTTCCTATGTGCATATAAACCATAATCAGCATGCGGTTGAACTTGCACATAGTAGGGGTTTTCTGTACATTATTTCACTTCTACTAAGTTTATGTAGACATTTTACTTTTGTGCAGCCAGCTTTAATCGTATTCGGACTGCTTTTTCGTATGGTGCTCAGAAGCTTGGTCAAGTTCTCTTGTTACAACCAGAACTTATTCCTGATGAAATTTATGGATTTTTCAAGAATACATTGAATAGGATTGGAAGTGGAGTAAGGCCAGACATTGGAGATGAAAGCTACAATGATGCATTTCGTTGTGAGTCCTTCCTTGGTCCTGGCAAGGCATTGTGGGACGAGATGTCGAGCATGAAAATTTCCTGCAATAATCAAGATGAGAACAGAGGTCCTCACCATCTTTCAAAGTGCTTAGTTAACAATGACTCATATGCCACCTTGAATGTGCCTACACATTTTCATGGAGATCACATGGTAGCATCAAGTACTGATTTGAGTCTAAAATCGTCCTGTTTCATCCAAGAGACACCAAATCAGTATCCTTTGTTTTACCTAGAAGATGGCAATGGTAGCAGCGAACAGTACTTGGACCATGAAATGGTGGAACAGGCATCTTGTTGTACAGCTGAAACCTGCCATGCGAATGAAGAACCAACAATGCATCCACAAGTTTATCCAAACAATACGTTACATACATTTTACTCAAGTTTGGCCAATAATTTGGAATATTCCAAATCTGGTCAGTCAGACATGACAAATTCGAGTATAAATGTTGCCCATGAGGAAAAACAAAAATTTTCTCCCTCCCCATTGAGCTTGGTGGATCTATCAGGTGATCTAGATTTGCAATTGAGATGCCTCCGCCAAGTTCAGTATCACCTAGAATACATGTTTGATGGTTTTTTGCAGTCTGTTCAAGAAGCATCTTCTGACTGTAAGGTTGCAAGGGACTCGTTTGAAATTCCAGCTGTTAACATCACATCGAATTCTGATGTGGTGCTGCCAGGTCTGTTATCACCTTCATCTACTGAAACTGATGAGAGGAGATTATCTCCAGTTTCCTCTTCTCATAGCACCGAAGATTCTTCACAGCAGTCACATGATGAGAGCAACTGGGGTGCGTCTTGTCAGCAGAACTTTTTATTAATACCCTCTCAAACAATTGCTCCAACCAATGGACTGTCACCATGTTCTTCTTATGCTAATTCAGATAATTCTGTTCAATTGTATGATAGCTCAGATGATATCTCCAATATGCATGAAACAGATCAACATATTCTCCAAAAGGTAGGAGCTCTCTGTTCTCAGTTGTCATGAGTTTGTATCTCTTACTTTTTTTTGGCATACATTTTCATTGTCCTCTTAGGGCCAAGAAAATCTAGATCCGATATGAATACTTGACTATTTTATATCTTCATTATATATGCTATACATCTTGTCCCTTGGATGTCTGACACTGACAGCTTCACTTAAACCTTTAGTTGTTCTGCTAATCAGTTACCTTATTTGTGTTACAGCACATGGTATCTTTAGGACAGAACAAGACACTAATCAATCGACAAGTGAGAGTTAAAAGCAATCAAGCATCAGTTCCAAAAGGAAAATTTTCCATTTGTAAGGAGCAAATAACACAAGACACTGCAACCAAGGACATAAAGTTAAGCCGGCATTTGAGAGTCAAGGACAGTGAGCATGAATATATAAGCACTGCTAAGAAGATTTCGAGCTATAATTGTGACACTTGCTTAGAATGTGTCAAACCTGAAAGTGAAGCAATGATACCAAGGCATTACAAGCATGCCCGCTCAAGCAAGAACTCATTTGAGCATCGGATTTATGATATTGACATGGGGTTTGCCCGATCTGGTAGTCCAAGGAATCAAATGCCAAAATATCAATCACTGAAGAATCAGGATATGTCAAGCTTAAATGTCCAAAAAGAGCATGAAATTAACTGGCCCAGAAAACAAATGCCATCCGAGCTGTTGAAGCTCCAAAACAGTCTACGTGGCAGGGCTTGCTCAAACAAGAAATTAGCTGCAAAACAAATTAACAATAATCACAAAGAACATCTATCTTTTGTAAGGGATCCAGAACAGATGCCATATAATCAGGTTAACTCAAACAAAGAGTTTGAGACTGTTGGCAAATCCAGCCAATTATTGCCA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