BGIOSGA012609
| Gene Name |
BGIOSGA012609 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012609, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_11548 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA012609-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA012609-PA |
| Length |
11624 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:14549883..14561506 |
| Sequence Coding Region |
14549883..14549969,14550856..14550915,14551510..14551566,14552272..14552343,14552489..14552551 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:14549883..14561506 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:14549883..14561506 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGCGCGGGCTGGAGGACGCTGCTGCTGCGGATCGGCGACAGGTGCCCGGAGTACGGGGGCTCCGCCGACCACAAGGAGCACATCGAAACTTGTTATGGTGTGCTTTGTCGAGAATACGAACACTCCAAAGATGCAATGTTTGAGTTTCTCCTCCAATGTGCAGATCAATTGCCTCACAAGATTCCTTTCTTTGGAGTATTGATAGGTTTGATAAACTTGGAAAATGAAGATTTTTCCAAGGGTATTGTCGATACAACACATGCCAATTTACAGGATGCCTTGCATAATGAAAATCGTGACAGAATCAGGATATTGCTGCGATTTCTCTGTGGCCTGATGTGCAGCAAAGTTGTCCTGCCAAATTCTATTATTGAAACATTTGAGGCACTATTATCATCTGCTGCAACAATATTAGATGAGGAAACCGGAAATCCTTCGTGGCAACCACGTGCTGATTTCTATGTTTATTGTATCTTGGCTTCCCTTCCATGGGGTGGCTCAGAATTGTTTGAGCAAGTTCCAGATGAATTTGAGAGAGTTCTGGTTGGTATACAGTCTTATATAAGCATTAGAAGGCATTTTGATGATATTGCTTTCTCAGTCTTTGAAACAGATGAAGGCAACTCTCCCAACAAAAAGGATTTCATCGAAGATTTATGGGAGCGTATTCAAGTTCTTTCTCGCAATGGGTGGAAGGTTAAGAGTGTTCCAAAACCTCACCTGTCGTTTGAAGCTCAGCTGGTAGCTGGAGTTTCTCACCGTTTCTCCCCAATTAGTTGCCCCCCACCTACTATCTCGCAATCATCTTCTGAAATAGTAAAAGGTCAAGAAAAGCATGAAGCTGATCTGAAGTATCCTCAAAGGCTTCGTAGGCTTCACATATTTCCAACAAATAAAGCTGAGGATTTCATCTTTTCAAGTTTCAAGAACGGAGACAGTCGCAAAGAATGTGCATTTTATCTGGTCAGCTTACCTGTGCCTTTCCGTTATGAATACCTGATGGCTGAGACCATATTTTCACAGCTACTGTTATTGCCGAATCCCCCTTTCAGGCCAATTTACTATACCTTGGTTATTATCGACCTTTGCAAGGCATTGCCAGGTGCATTTCCTTCAGTTGTGGTAGGAGCAGTACATGCTCTTTTTGACAGAATTAGCAACATGGATATGGAGTGCCGCACCCGACTTATCCTATGGTTTTCACATCACTTGTCAAATTTTCAGTTCATTTGGCCTTGGCAGGAGTGGGCTTACGTCAAGGACCTTCCAAAATGGGCTCCACAGCGTGTTTTTGTCCAAGAAGTATTAGAAAGGGAAATTCGCTTGTCCTACTTTGACAAAATTAAGCAGAGCATAGAGGATGCTGTTGAATTGGAAGAACTGTTACCCCCAAAAGCTGGGCCTAACTTCAGATATCATAGTGATGAAGGCAAAGAAAGCACTGATGGCCACAGACTCTCCAAGGAACTTGTTGCCATGGTTAGAGGAAGGAAGACACAAGGTGATATTATTTCATGGGTAGACGAAAAAATAATTCCTGTAAATGGTGCCAAATTTGCACTTGATGTAGTTAGCCAGACACTTCTGGACATTGGCTCAAAAAGTTTCACCCATCTTATCACTGTTTTGGAGAGATATGGTCAAATAATATCAAAGCTGTGCCCGAATGAAGAAATGCAGTTATTGTTGATGGATGAAGTCAGTGCTTATTGGAAGAACAGTACCCAGATGATTGCCATAGCTATTGATAGGATGATGGGTTATCGCCTACTTTCCAATCTGGCTATAGTCAAATGGGTTTTTTCTCCTGCTAATGTTGATCAATTTCATGTTTCAGATCGTCCATGGGAGATTCTTAGAAATGCTGTTAGTAAAACATACAATCGGATTTTTGACCTCCGGAAAGAAATTCAGACACTCAGGAAAGGTCTTCAAGCTGCTAAAGAGGCCAGTGAAAAGGCCGCCAGAGAGTTGGAGGAGGCTAAATCTATTATTGAGATTGTAGATGGCCAACCTGTGCCATCTGAAAATCCAGGAAGGCTAAGACGACTTCAAGCGCGTGCTGACAAAGCGAAAGAAGGAGAAGTAACCACTGAAGAATCTTTAGAAGCAAAGGAGGCCCTCCTTGCTCGAGGGCTTGAAGAAAGCAAGGAATTGCTTAGGTTACTATTCAAGAGCTTTGTTGAAGTGCTAACTGAACGTTTGCCACCTATTTCTGCTGATGGAGATGTTCCTAATTTACGTGCTGGAGACCCGAATGTAAATTCTTCAGCCCGTGACCCTGAAGCAACAACCATGGAAATAGACAATGAAAATGGAGGAGATAACGATAGTCAGCTGAATGGTCAAAACAAGAAAATCAGTCACAATGTTGGAGAGCTTGAGCAATGGTGTCTCTGCACATTGGGCTATCTCAAGTCGTTTTCTCGTCAATATGCTACTGAGATCTGGTCCCATATTGCCATGTTGGATCAGGAGATTTTCGTTGGGAATATTCACCCTCTTATCCGGAAAGCTGCTTTCTCCGGTTTGTGCAGACCTACCAGTGAAGGGTCTCACCTTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSAGWRTLLLRIGDRCPEYGGSADHKEHIETCYGVLCREYEHSKDAMFEFLLQCADQLPHKIPFFGVLIGLINLENEDFSKGIVDTTHANLQDALHNENRDRIRILLRFLCGLMCSKVVLPNSIIETFEALLSSAATILDEETGNPSWQPRADFYVYCILASLPWGGSELFEQVPDEFERVLVGIQSYISIRRHFDDIAFSVFETDEGNSPNKKDFIEDLWERIQVLSRNGWKVKSVPKPHLSFEAQLVAGVSHRFSPISCPPPTISQSSSEIVKGQEKHEADLKYPQRLRRLHIFPTNKAEDFIFSSFKNGDSRKECAFYLVSLPVPFRYEYLMAETIFSQLLLLPNPPFRPIYYTLVIIDLCKALPGAFPSVVVGAVHALFDRISNMDMECRTRLILWFSHHLSNFQFIWPWQEWAYVKDLPKWAPQRVFVQEVLEREIRLSYFDKIKQSIEDAVELEELLPPKAGPNFRYHSDEGKESTDGHRLSKELVAMVRGRKTQGDIISWVDEKIIPVNGAKFALDVVSQTLLDIGSKSFTHLITVLERYGQIISKLCPNEEMQLLLMDEVSAYWKNSTQMIAIAIDRMMGYRLLSNLAIVKWVFSPANVDQFHVSDRPWEILRNAVSKTYNRIFDLRKEIQTLRKGLQAAKEASEKAARELEEAKSIIEIVDGQPVPSENPGRLRRLQARADKAKEGEVTTEESLEAKEALLARGLEESKELLRLLFKSFVEVLTERLPPISADGDVPNLRAGDPNVNSSARDPEATTMEIDNENGGDNDSQLNGQNKKISHNVGELEQWCLCTLGYLKSFSRQYATEIWSHIAMLDQEIFVGNIHPLIRKAAFSGLCRPTSEGSHL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..87#974..1033#1628..1684#2390..2461#2607..2669#3512..3688#4060..4185#4268..4334#4576..4772#7075..7105#7265..7353#7671..7739#8514..8632#8855..8993#9090..9590#9845..10144#10246..10427#10829..10940#11505..11624#ATGAGCGCGGGCTGGAGGACGCTGCTGCTGCGGATCGGCGACAGGTGCCCGGAGTACGGGGGCTCCGCCGACCACAAGGAGCACATCGTGAGCGCCCCCCCCCCCCGTTTCCCTCCCCTCCCCGCTCGTTTTGTTCTCTCCCCCCCGGGGGGGCCTCCCGCGCCCGAACCCTAGGTTTTCGGCGTCCGGATTTGGGGGGCGTGCTTGCGTTGGTTCGTGCTTGAGTGGGCGTCGTTCCTGGTTGCCTGCGGTAGGGGGAGTGAGGCGGTAGTGGTGGAGCTGGGGAGCTCAAAACCCTAGCCACCTGTTAACAATTGCTGGGCGCTTGGGGTTTGGGTGTGTGGAGCGGAGCCGTGACGGTCTTGTCCGGATGATGGAGATGAGGAGAGTAGTAACAACAGGAAGGACAGAACGACGTGTTTTGATAATTTGTTCTGCATAATTTCTACCATTTGAATATTGGAAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTAATGATGAAAACAGTTCAAGGTAGAGAGATCAAAATTGAACCCTGCTAAAGTACTTCACAGATGTAGTCACAAGGCAATGCACATTTGGAAGACTGTAGTCTGTAAATGCACAGCAATCTTGATGTGCTTTAAGTGTTGTTATTACACTATGTTCCAGCTTCTAGTTGAAAAGGCTCTTTTTTTAGTGAAATTGTGGCGCTATGCATGGTAGCATGGAAGGTGGTGCTGTAATGTGTTGATGCAATTCTGAACTTTTTACTCTTTTATATGCTATATGTGTTGATGGCATGTTTATTTGAGAACCAGTGCAACCAATGGACAAATATTCTAGTCAACTAATTTGACCTTGCTTACATTCATGAATCCTCTGAAGATTAGCTCAGAGCACAGCATCACCACCATCAACTCTTTTAAGTAGTATAAATTAATATTTTTATTTTATGATCCTTCTACACTTGTTTTGACCAAGCGTTTTCTTTGTAGGAAACTTGTTATGGTGTGCTTTGTCGAGAATACGAACACTCCAAAGATGCAATGTTTGAGGTCAGCACCCAATATTCTATCATGTGCCTTTTCACATAGTATTGTCTAAATTCACAATTAATTCGGTCTTTTGTTTTTATAGCAAGCTATATATTGTCTTAGTCCTATGAAGAAATATCGATGCCTAAAATTGGCATATTTCCAACTGCAGTCAGTTTCCCCTTCTAGAAAAAAAAAACTATAGTCCATTGGCTAAGCCAATCTTAGTATTCCCTACTTTCTCAAATATAAGCATTTCTAGGATTCGAATTTTGTACACAATATAAGCATTCCTGTAGTACTACTTGTCCCATCAACCTCTCATTCAAAAGTTCCCCATCTTTATCCGCAACCACCCTCCCATTCCCAACCACCCCTCATTTATTTTCAAACCTTATTCCTTAATCTCTACTAAACAACCTACAAATACTTATATTTGGAATGGAGGTAGTATTTGTAAAGAATTCTAAAGCCAAGATGTCTATTTATCTTGTCAACTTTTCTGCAGTGAAGGCAGAAAATAAAGATATCAATGGAGAGATAGTATATCTTATATTCTGCATCTTGTGAATGAATTGATATGATACTAACTGAACATACTTTTTTTTTGAGCAGTTTCTCCTCCAATGTGCAGATCAATTGCCTCACAAGATTCCTTTCTTTGGAGTATTGGTGTGCACCTACTTGAACCTTATAAAACTACATGCTATTTTATGGCCTTATAACTTGGTTATTGCTATTTGTGAGCATTTTATTTTTTTTGTCACAATATAATGATATGCTACTGTGCCCTCTTAATCCTTTGTTATCCCCAGAAGGTGAATGCACAACAAATTCAACCACTATTAGTGTAGTACTAAAAAAAATCTAGTACTCATATGCCTTTTGAATTTATGAAGCCTTTGAAGTTTTTATTTTTCGAGAACAAGCCTTGAGAAGTTAGATTAGCTCTTAAAGGTGGTTGCAAGCCACAAACACACTGCATAATTGTGAGTGCTGATTAACATGATTGATGAAACTATTGTGTGAGAGGAATCCGAAGTTGACATACGCTTTGCTTCATATTTTGTTTTGCTTGGTCCTGTTATTTCTTGAGCTGTTGCATATGACTATGCTCTGTTCTTTTAAATATAGTTTTTTTTCCTGAAGCTGTTATTGTTCATTATTCTGCCGCCTATGCGTGTTTGACTGTTCACTATGTATCCTCTATGGAACTTGGATTGTCAATTTCGTTCCAAACATTACCTATATCTTGTTTTAAGTTTATTTTTACACAATATTGGTGTAAGAACAAGACATGGCAATTTAGTTTTTATTATTTGACCTAGGCATTAAACTAAGTCCGTAAGATGGCTCTTTTTTTGTTTCTAATTTCAGATAGGTTTGATAAACTTGGAAAATGAAGATTTTTCCAAGGGTATTGTCGATACAACACATGCCAATTTACAGGTACATGTAGATGTTTTTCTTATGCCCCAGCAGTATTAGGTCTATGTAGATGTTTTTCTTTCGGTGCTGAATACTAAGTCGAAATCACATTATGGTTCTCCTTCTTAAAGATTATCTTAGGTTATAAATGATGTCTTAATTGCAGGATGCCTTGCATAATGAAAATCGTGACAGAATCAGGATATTGCTGCGATTTCTCTGTGGCCTGGTAAGTTTTGTATTTGGTTGATTTGATTTGATTTTGTTGTTGACATTATTGTGCTTGTTGCTTTCCTAATCTTAATTGGTGATGCCTGAAATGTGTCTAACTGACGTACTATCATAGTGTTATGTTTCATACAAACAACACATCTTTGCGAATAATTGAATCTGTTTGTCAACATTCCCAAGTATGCAAGGCTATTAGTTCTTGTCTTTCAACCTTACTAACTTGAGCGCTTATGAATCATGCAACAGTGCATTTGCATGACACAACATAGCAAACTCACAGGCATTTATAACTAGTGATTCATAAAATTTGCATTTGGTTAGCATAATCTTTACTTTTGGTCTGCATTCTAAAAGTTAGTGCTAGGCGCTGGGTAGCCATTCCGATTAGGCATTAGATGGTCAATCAGGCAGCTAACTATCCGTGGCGACTCTTGTGCTACTATTTTAGTGTTCATTTATCTAACTTCTCTGTCATATACTTGCTAATTGCTTTTAATTGACTAATTATGTTGGACCTAGGTGCCACCTAGGCGGTGTGCAGGCACCGACCCTGCCCGATCCTCTAGCACCTAGAGCCTTCTTGAGCCATGTTTTTAGTTCTGATTCTCCAAATTGCCACCTAGGACTGAGTTGACAAGTTATAAACTGTGAATGCTTTAGGTCTCCTCTCCAAAAGAGCAGAGTGACTTCTTTCTACACTCTTCAATTCTTCATATGTCGTGACAAACATTTTCTTTAATTGCACACTATATGGATATGATTGAGCTGTTTGTGGTGCAACATAGTTTTGTTTTTTCTTTTCTCCATTCTTTTCATAACTATTTAATGTTTGCCTTGTAGATGTGCAGCAAAGTTGTCCTGCCAAATTCTATTATTGAAACATTTGAGGCACTATTATCATCTGCTGCAACAATATTAGATGAGGAAACCGGAAATCCTTCGTGGCAACCACGTGCTGATTTCTATGTTTATTGTATCTTGGCTTCCCTTCCATGGGGTGGCTCAGAATTGTTTGAGGTAACTTGAACTGCTGTTCTTTACTGCTGATGTGAACATATGCAGTTCAGCATGACTGTATCACTGTATCTAAATTAGTTGTGCATGTGAATACTATTTCATGTACATTTCTGTTTTATCATTTTTCTTAGTTTTATTTCCTATATGAGCAGCTAGAGGGAAAGCTGAAGCGTCAACAATTTTTTGAAACATGTGAAACTATATGAAAATACAATACATTTCCACTTTAGGAGCACCCGTTGTTCAATTATTCTTTTACCTTGGGATCCATGACATGCTACCTTCGTTTTTGAAGCCATTTTGAAATTGTATACTAGAAAATTCTGCAGATAATCCAGTGGTATAATACACTAATGATATGTAACATGCAGCAAGTTCCAGATGAATTTGAGAGAGTTCTGGTTGGTATACAGTCTTATATAAGCATTAGAAGGCATTTTGATGATATTGCTTTCTCAGTCTTTGAAACAGATGAAGGCAACTCTCCCAACAAAAAGGTGAACATACACTGTTTCTCCTTATCAACTCAGACTCCACTAGTGATATCTAGATCAATGTTATTAAAGTTAGTCCTTGCAGGATTTCATCGAAGATTTATGGGAGCGTATTCAAGTTCTTTCTCGCAATGGGTGGAAGGTTAAGAGTGGTATGCGATAGTCCATATGATTTCTTAATGAACAAATGTTGTTGACCTTCAGTTGCAATTGCATATGATATGTGACAATTATACAGAGTTATATCACAATATGTTTCAAAAACCCTATATGCATCCAATAGTTACATTCAGAACACCTTTTTCTTATATTAAATTGGGCTGGTGGTATTCCAAAATCTTAGACATGCTTGTGTCTAATTGGTTTCTGCACTCTATTTTACTTCCTTGGCAGTTCCAAAACCTCACCTGTCGTTTGAAGCTCAGCTGGTAGCTGGAGTTTCTCACCGTTTCTCCCCAATTAGTTGCCCCCCACCTACTATCTCGCAATCATCTTCTGAAATAGTAAAAGGTCAAGAAAAGCATGAAGCTGATCTGAAGTATCCTCAAAGGCTTCGTAGGCTTCACATATTTCCAACAAATAAAGCTGAGGTAA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| External Link(s) |
