BGIOSGA012776
| Gene Name |
BGIOSGA012776 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012776, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_11854 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA012776-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA012776-PA |
| Length |
3757 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:17209820..17213576 |
| Sequence Coding Region |
17209820..17209858,17210216..17210682,17210792..17210999,17211161..17211232,17211733..17211952 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:17209820..17213576 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGTGCTGTTAGTGGGATAGATAGCCCCTCGTCAAAGCTTCTGCAGTTTGAAGGTAAGCTCAAGGATGGATTTGCTCGGAGCAATAATAGCGAACATGAAAATGGAGCCGGGACTGTGAGTATATCCAGCAAGAAGTCGAAGCATGGGGTTGCCAGTGAAAAAAAACCCCATGTTGACATCTCTGGACTGATTGATTCAGATTCGCAGAAATGTAATTCAGAGCAAATCCATTCAGCTAATGGGATAGTATCCCGGGATGTCAACCATGATCACATAGAAAACTGCAAAGTTGAATCAAATGATTTTCCCTTGAATACTATCTCTGAAACAAGATATCCAACAGACAATTGGAACAGTTCTCAGTTTGCTCTGAGCAATGATGGTTCACCTGTTCTCAATAATCAGAGTACTCCACAAACTGGTCATGGCTATGGAGATAATGATCTAACCTACATTGATTGGCCTGCTATTGATAATTTTGAGGACGTCGACAACTTATTCAGGAGGTGTGATTCCACGTACGGTCAGCAGCAACTGCCGAACACGGATGAACTGTCATGGATTCCTTCTTCAGATGCCATGTACTCTTCTGATGTTGCTATGCAACCAGGGTTTGAATCCTCGTATTCTGATTATGGTATCCTGGATGACCTCTCCGCATTCAATTGTACGGAAGATAAATCCCTGACAACAGCTGATCCTTCAAGTGCTGCTTACCAAAGGGATGCGATGGAATTGTTGTCCAGCGACCAGATATGCACTGGGCAGGAAAACCTAGATATGATTGGAAATCGATATTCATCGGAAAATGCCATGGAACAGCCTGAAGATCAGAAGTTTTCTATAGCTTCAGGTTCTCAACTAAGCTCTTCTCAGAATTTATTGAACCAAAAGAACCACTTGGATTCAACTTCACCAAGTAACATAACTTCTGAGTCCTATCCAGAAAGAAATTGCCAGATCATTCCATCTGGGGCTTCCTTTGCAGAGAGAAACTTGAAGGTGCAGAAGAAAGTGGCCAGTTCGGCATCAGGACAACTTATCAGTGATAATGTGACTGGACATCCTGGTCATCAAACATTGACAAGAAGGGCTTCATATCCTTGTGAGAATCATGAAATTGGAAAGAGGTCCTTAGGAAAAAGAGGTTTGGGTCATTCTGATGTTGCAATGGGCACCTCAATGGTAGTTGATGGGTCCTTCGTATCGTCTATTTCTTCTGATAACTCAGTTGAAGAGAACAGCTTTCGGCAGCTTCAGGATGCAGTTAGTCAGTTGGATGTGAAAACAAAAATGTGCATTCGAGATGGGTTATACCGCCTGGCAAGAAGTGCGCAGAATAGGCAAGTCTTCCCAAATACAATGAACAACAATGGAGATAGCCACAATGTAAAGGACATGCAAAATGCAGAAACTTCGGGAAAGTTTGTTGATCCTGGGAGCATCGAGACACAGACAAATCCAATTGATCGGTCCATAGCTCTGTTGCTTTTCCATCAGCCATCAGAGCATGTCACTGGAGCTGTTGATGAAGCGGCTTCACTAAAGTCACATAATGATAACCACCAGGCTGCTGCTAAAAACCAAAGAGTGATGCATGCTTCATCTGTACATTCACCAAGAGGGCAGGGAGACCCCATGGATGCATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSAVSGIDSPSSKLLQFEGKLKDGFARSNNSEHENGAGTVSISSKKSKHGVASEKKPHVDISGLIDSDSQKCNSEQIHSANGIVSRDVNHDHIENCKVESNDFPLNTISETRYPTDNWNSSQFALSNDGSPVLNNQSTPQTGHGYGDNDLTYIDWPAIDNFEDVDNLFRRCDSTYGQQQLPNTDELSWIPSSDAMYSSDVAMQPGFESSYSDYGILDDLSAFNCTEDKSLTTADPSSAAYQRDAMELLSSDQICTGQENLDMIGNRYSSENAMEQPEDQKFSIASGSQLSSSQNLLNQKNHLDSTSPSNITSESYPERNCQIIPSGASFAERNLKVQKKVASSASGQLISDNVTGHPGHQTLTRRASYPCENHEIGKRSLGKRGLGHSDVAMGTSMVVDGSFVSSISSDNSVEENSFRQLQDAVSQLDVKTKMCIRDGLYRLARSAQNRQVFPNTMNNNGDSHNVKDMQNAETSGKFVDPGSIETQTNPIDRSIALLLFHQPSEHVTGAVDEAASLKSHNDNHQAAAKNQRVMHASSVHSPRGQGDPMDA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..39#397..863#973..1180#1342..1413#1914..2133#2238..2509#2816..2964#3437..3566#3662..3757#ATGAGTGCTGTTAGTGGGATAGATAGCCCCTCGTCAAAGGTACCAAGTGTCAATCAGGGGATAGTTCTATTTGGTTGAAGCAGAGTTGACAAGTAATATAATACAATTGGTGTTTGATTAGCGTATACCCTTCACTCCTACAGAAATAGTGAGTTAAATTCGTAGGCAAAGATAGGGCAATCCTACTAGGCGATCCAACCAGATATTGAATTCTGTCATGGATCAAACCTAGTCTATATTGAATTCCGCCAGGAATCAAACCCAGTCAATCATTTTTGTTGCATTGAACCTTGGATGCTCTCTTGTTTCTCTTATCATTGCACTGATTTTTCATGTATTAGCCCCATGACATGTAGACTTTAGTCCTTTTTCCCCTTTCAAATACATAACATGTAGCTTCTGCAGTTTGAAGGTAAGCTCAAGGATGGATTTGCTCGGAGCAATAATAGCGAACATGAAAATGGAGCCGGGACTGTGAGTATATCCAGCAAGAAGTCGAAGCATGGGGTTGCCAGTGAAAAAAAACCCCATGTTGACATCTCTGGACTGATTGATTCAGATTCGCAGAAATGTAATTCAGAGCAAATCCATTCAGCTAATGGGATAGTATCCCGGGATGTCAACCATGATCACATAGAAAACTGCAAAGTTGAATCAAATGATTTTCCCTTGAATACTATCTCTGAAACAAGATATCCAACAGACAATTGGAACAGTTCTCAGTTTGCTCTGAGCAATGATGGTTCACCTGTTCTCAATAATCAGAGTACTCCACAAACTGGTCATGGCTATGGAGATAATGATCTAACCTACATTGATTGGCCTGCTATTGATAATTTTGAGGACGTCGACAACTTATTCAGGTATTCAGAATGTTTCCCTTGCTAGCTTCTAAAGTCTTGAGACAGATTAACTTTAATTGGTAGTAAAAACACAATGCTATCCTTCTAATATACATTGTTTTCCTGGAAGGAGGTGTGATTCCACGTACGGTCAGCAGCAACTGCCGAACACGGATGAACTGTCATGGATTCCTTCTTCAGATGCCATGTACTCTTCTGATGTTGCTATGCAACCAGGGTTTGAATCCTCGTATTCTGATTATGGTATCCTGGATGACCTCTCCGCATTCAATTGTACGGAAGATAAATCCCTGACAACAGCTGATCCTTCAAGTGCTGTATGTGACGAGCAATTCGATGACTCTTATCTGTTCAATGAGCAAAAAACTGAAGATGTTTATGGCGAACAGGCAAGTAGAATGATTGCTAGGTTGAATTAACTGGCACAAAGCATTATGCTTTTTTCATTCCTTTTTCTTCTTCTTTTTTTTTACCATAGGCTTACCAAAGGGATGCGATGGAATTGTTGTCCAGCGACCAGATATGCACTGGGCAGGAAAACCTAGATATGGTAATTTGACCTTTTCAATTAGTTCAATTAAAAAGATAACCACATTAAAATCCGTATTTTGTCATTGGTGCGTTTCGAATAGTACAAGTGTAACTAAGATAATGTTTTTCATATTAAGTTCTAACTTTCTCTATCTGCAACCATTCTCTTGGAAGATTGGAACCAAAAAATGATTGAGTTCAGCATTAGCCTCTTTCATATAAAGATTATTTTTAATTTGTGTCCTATTTCCCTTCTGCACAGAAGCCACTTAAATATGCTTGAGCATGATCCTACAGTGCAGTAACTACCTAACTGCATTAGTTGTCATCAATATTCATAGTGCATTTTTTATGGGATTGTTTCTGTAGTGCAGCTTTAGGTATGCGAGTAGGCCTGTAACATCACCTATTACTATTACTTAACTTTCTCTTGGTAGAATGATGTCCATTAGAATGGATTTTTCCCAGTAAATCATAAATTTTGATTTCTTCTGGTTTATTGTGATGATCTTTACGCAGATTGGAAATCGATATTCATCGGAAAATGCCATGGAACAGCCTGAAGATCAGAAGTTTTCTATAGCTTCAGGTTCTCAACTAAGCTCTTCTCAGAATTTATTGAACCAAAAGAACCACTTGGATTCAACTTCACCAAGTAACATAACTTCTGAGTCCTATCCAGAAAGAAATTGCCAGATCATTCCATCTGGGGCTTCCTTTGCAGAGAGAAACTTGAAGGGTACTATATGTGCAAAATTGTCATACGGAATGCTTTCTAGTATGTTTTCCTTCCTTGTGGTGTAATTATCTTATTCAACGTTTAAAACTCTGTATTGAGTGCAGTGCAGAAGAAAGTGGCCAGTTCGGCATCAGGACAACTTATCAGTGATAATGTGACTGGACATCCTGGTCATCAAACATTGACAAGAAGGGCTTCATATCCTTGTGAGAATCATGAAATTGGAAAGAGGTCCTTAGGAAAAAGAGGTTTGGGTCATTCTGATGTTGCAATGGGCACCTCAATGGTAGTTGATGGGTCCTTCGTATCGTCTATTTCTTCTGATAACTCAGTTGAAGAGAACAGCTTTCGGCAGCTTCAGGATGCAGTTAGTCAGGTATAGCAGTTTATTTTCTGCAATGTGGTCCATTTTATGGTTGTGCATGAACTACATATTTGATATATCTTTCCTCCAGCTCGTAATTTAATTCTAGCGACCTTTTTCTCCTTGATGCTCCCACTACTACCTCCTTATGTCTTGACATTATAGCTCCCTTAAAAAAACAATCATAGCCTGGGGATTGATTACATTCATGGTCTGTAATAGCGCAACATAGTTATAACTAAAGTTCATATTTGTACCTGCATCTTGGATATAAGCTATATTTTTGCATTACTGAGTTCTTTTTCCTTGCTGTTTCAGTTGGATGTGAAAACAAAAATGTGCATTCGAGATGGGTTATACCGCCTGGCAAGAAGTGCGCAGAATAGGCAAGTCTTCCCAAATACAATGAACAACAATGGAGATAGCCACAATGTAAAGGACATGCAAAATGCAGAAACTTCGGGAAAGTATGTTGATTTCTCAGAAAACATGCTCTTTGTACCTCTCTAATTGTTAAAAATATTTATGAGTTCTATTACTGGCATTTTCCAGTGAAATACATTTCTCATATCGTTTGACCTGCAAACTTGTCTGTGCTATCCAAATATCGCCACTTATGCATGTTTGACCACATGCTACTACCTTATATCATTATGAAGTGTTGAATCTTATTTAAACGAACTATTTTTCTTAATTGATTCATTTTGAGGATTGATTTTTTTATGATGTGTTTAAAAAAAAGCTCGTTTAGCAATTCTACTGAAACACAACCTTTTTGACCATTTAGGTGAGATCTAGGTTATTGCCTTATTAGATGTTACCCTTCTATTATTCAGATAGAAGATTATTTGTTGTTTACATTACTTAAAATTTTAACACAGGTAAGAAGGCCGCTTTGTCTATATGTTGCCTTTCCACTTTGATATTCCTGTTTTGTAGGTTTGTTGATCCTGGGAGCATCGAGACACAGACAAATCCAATTGATCGGTCCATAGCTCTGTTGCTTTTCCATCAGCCATCAGAGCATGTCACTGGAGCTGTTGATGAAGCGGCTTCACTAAAGTCACATGTTAGTTTATGTTCCATTTTAACTCACTGCTCGGATTTGTTTGCTGTCATACTTCCCATGGCTAGCAAAGTCATGAGTTCTTTGTTGCCATGCAGAATGATAACCACCAGGCTGCTGCTAAAAACCAAAGAGTGATGCATGCTTCATCTGTACATTCACCAAGAGGGCAGGGAGACCCCATGGATGCATAA</dnaseqindica> |
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