BGIOSGA012981

From RiceWiki
Revision as of 09:55, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA012981| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012981, complete gene.| tag = OS03G05...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA012981

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012981, complete gene.

LocusTag

OS03G0564200

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA012981-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA012981-PA

Length

4491

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:22843040..22847530

Sequence Coding Region

22843040..22843180,22845607..22845678,22847351..22847530

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:22843040..22847530 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:22843040..22847530 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGATAAACCAGCGCCGCAGGCGTTCGTATACCGTATCAGCACGGCGGATGAGTGGGCGCAGCTTCAGCGCACCGGCGGCACCCTTGGCGGTGACCTCGACCGCTCCACCGGCTGTATCCACCTCAGCGACCTCAGTCAGGTGAGGAAAACGCTTAAGAACATTTTCCTAGGAAGGAATGATCTATACCTACTACAAGTTCACACTTTCAAGCTTTCAGATGGCTTAGTTTATGAGGCAGCTGATGATTCAAACTATTTTCCTCATTTCTATGGCCCTGGTCGGAGTTTTGCACCTCTTCAACTAGACGCTGTTATCAAGGCAGAGAAAATAGTTCTGGTAAACAATGATTTCACCTGCAGTCTACTTGATGGAGCAGACCCCTTATCGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDKPAPQAFVYRISTADEWAQLQRTGGTLGGDLDRSTGCIHLSDLSQVRKTLKNIFLGRNDLYLLQVHTFKLSDGLVYEAADDSNYFPHFYGPGRSFAPLQLDAVIKAEKIVLVNNDFTCSLLDGADPLS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..141#2568..2639#4312..4491#ATGGATAAACCAGCGCCGCAGGCGTTCGTATACCGTATCAGCACGGCGGATGAGTGGGCGCAGCTTCAGCGCACCGGCGGCACCCTTGGCGGTGACCTCGACCGCTCCACCGGCTGTATCCACCTCAGCGACCTCAGTCAGGTAATTCCCAATTAGAAAGCAGGGACGTCTGATTTCTTCCGACTCGCGGGATCCCCATGGATCTCTCTATTTATCATATGCACATTTCAAGTGGAGATTTGGGCCTAGTCATTGGTTCTCTGATTTTTCAGTGGATCTAGGGTGCTAGACTACTTTGCTGAAAATTGCTGTTTAAAATTAGGGATAAAGCCATCCAAATATTACAACCCAAGCTTGGAGGTTGGACGCAAATCAGTAATGCTATTAGAGGTGCCTCTCGCAGCATGTGTGATTTCATCTTTTGTTTGCCTACAGAGCTTCGTGTGGAGATCTCCTGCTTCTTGTGTGTGTCCAATTGGCCATCCTAGATGCCATTTCCTTTGGAATCTTTTGATTCATTTAGGGCATCCACAATGTTAGGAAAAAACAGGTATTAGACAATATACTATTCCTATGACTTAGTAATAAGCATTGTGGAAGTGGGTAGTAACTAATGCTAGGTAGTAAGCTTATGACCCACTCATAAGAATAAAAAAACATTAAAATCTCTCTCACTCTCTCCTTCCAACACAAGATGTGCTACTACTGCATGCTGAGTTGGACAAAAAGCAACTAAAAAGCAATATTTTTTTTCTCATGGGACCCACTTTACAAAGGCCTACTACTTAGCCCTGCTACTTATTACCTAGTTAGGTAAGATACATTGCTGTTGCCCTTAGGATGTTTCTGAGCAGTGACCGTAACAAAGCAGTGAAGAATAATCTATATTATCTATAACTAGCATGTGGCCCGCACAGATTGCGCGGCTAGCATCATTATATTTTCTCTCATATAATAGCATATATGTTTTCTCATTATATTATTCAAATATATTAAAATTACAACATAATTTAAATTTTGCAATAACTTTACAAAACTACTAATGTATAATATTCATATTATATTTTATATACGTGTTAGTTATTAGTTATTTTTAATATCAAATTTTAGTTATTTGTAAATTATATAAATTCCTCTATGGACTCTAGACTCGTCTTTTAATATTTTTTAATTCCGAATTTTTTGTAAATTGTATTTCTATATAGACTCTATGCTCTTCTTCCAATATTATTTATTTTTATTTCTGAATTTTTATTATTACTAATTGTATTTCTATGTGGACTCTAAACTCATTTTTCAACTATTCTTTAATTTTTAATTTCGAATTTTAGTTAGTTCTAAATTGTATTCCTATATTGAATTTAAACTCTTCTTCCCATGTTTTCTTAATTTCTAATTTTAGTTATTTGTAAATTGTATTTTATACGGACTCTAAACTCTACTTTTAATTTTATTATGTTATTCCAAATTTTAGTTAGTTTTAAATTCCTATATGGACTCTATACTCTACTTCTAATATTCCTTACTTTTTTAATTCTGAATTTCTATTTTTTTCTTAATTGTATTTCTATATGGACTCTATACTCTACTTCTAATATTCCTTATTTTTAATTCCATATTTCTATTATTTCCTAATTGTATTTCTATATGGACTCTATACTCTACTTCTAATATTCCTTATTTTTAATTCCAAATTTCAGTTATTTCCTAATTTTATTTCTGTATGGACTCTATACTCTACTTCTAATATTCCTTATTTTTAATTCCGAATTTCAGTTATTTCCTAATTGTATTTCTACATGGACTCTAGTCTCTTCTTCTAATATTCCTTATTTTTTAATTCCGAATTTCAACTATTTCTAAATTGTATTTCTATATGGACTTTAGTCTCATGTTCTAATATTCCTTATTTTTTAATTCCGAATTTCAGCTATTTCTAAATTCTATTTCTATATGGACTCTACTTTTTCTTTTTCTCCGATTAAAGTGAGAATTTCTAGGCCATGAGAGCGAACATGGATGCTTCTTTTTCTATTCCTTTAATAATATAATAGATAATGTGCGGAAGTCGTTCTGTTTGGCTTTAGAAGGACATACTATTTCCCTTGATTGCTTTGACAGACATGCAAATTGGTGACCATTTGTAGTTTATGCAAACAGGTTGTAGGTAAATGCTAGCGAAAAGAAAACATGGCATCTCATTATATCAGGATGTTAAATTTCAGAAATTGTGGCCTATTAAGAAAGGGCCTGCTATTCATATTGCGTTCTTTGGCTGTGTTTTCATATATGATATATGGAAATGGTTTTGCTTACTCAACAATCCCATATACATTTCTAAACTGTGACACCTATTGTTTGGTACACTCAAGTTCTACAAAACAATTTTGTGCAAAAGTATGTTACTACTATTGCATTAAGTACTTCAATTTATATACTTTTCGTGATACACTGAATAATATATTTGTCTTGTAATTTGATCTGGGCGTTGTTTATATATGACCTCCAACCATTCCTTTTTGGCACTGTATATGTATTCTTTAGAACTCATTCTCAACCTGTTTTAGGTGAGGAAAACGCTTAAGAACATTTTCCTAGGAAGGAATGATCTATACCTACTACAAGTTCACACTTTCAAGGTAACGTGTGTCAGTGTATTTAAACTCCATTGGATGTAGCCACATAATAGATCATTTTAAATTAAACTAGCTGGCTGGCCCGCGCAATTGCGCGGCTAGCACCCATATAAAATTATATATTTTTTTAATATGATTTTACTTAAAACTTATTAGATAACTATCTTGTTATCTTAAGACTTAAGACTTTGAAAGAACAAACCTTATTATCCCTGTGTTTTTAATTTTATAATTTTTAAAAGTCACACCAATTGCTACAACTTTCTTTTGTCATCTCTTTTTTTTATTTGCTAACTCGATCTACCACTTTTTCTATTCATTCTCCTTAGAACCTTTATAAATTGGATCGTATAGTTTTTAGAGTTTATTGTCTCGTTGGGTTTCGTTTTTATAATTTTTAGAAGTCCCATCAAACGCTGCCATTATACTCCTCTACAGCTCATCCACTGCTTCTTCTGTTTATTGTCATTGGGATTTTAAAAGTCGAATGTAATTATCGATTGGGTTCAGTTTTTACTTTCTAGAAGTCCCACCAAACCATAAGTGACTTTGCCACTGTACTCCTCTATGGCTCACCCACTGTCTCCCTTCTTTATTGCTATTGCGATTTTAAAATCAAACATGATTATTCTTTTACCTTTTAGAAGTCCTGAACCTTTAAAAATTGGATTTCGTAGTTTTTAAAGTTTATTGTCTCGTTGGGTTTCATTTTTTATAATTTTTAGAAGTCCTGTCAAACACTGCCACTATACTACTCTACGACTCGTCTGCCGCTTACTCTTTGTTGTCATTGGGATTGTAAAATTTGAACATAACTATCATTAGAATTCATTTTTTACTTTCTCGAAGTCCCACCAACTGTCGACGGCTCTGCCATTGTACTCTTGTACAACCCGCCCGCCGCCTCTTCTTTTTATTGTCATTGAGATTTTAAAAATCGAATATTATTATATCATTATGCTTTTTTACTCTCTAAGAAGTCCCGCCGTCCGCCTTGACCTGTTACTTCACGGCCTACGCGTTATCCCTCCTATTAATCGTCATTAGGATTCCATTTGGTGTTTTATTAATAGTTTTTTAGATGTCACATCAACCGCCACCACTCTAATTTTGATTTTTTTTTATTTTTTTTATTCTGAATTTTTATAATCTCGTATTGGGATTTTATATGGACTCTTCTTTCAATATTGCTTAATTTTAATTCCGAATTTTAGTTATTTTTAAATCGTATTTCTACTCGAACTCTTCTTTTCCTTTTTTTTTTGCTAATTTTGGATTTTATTTTTTTATTTTTAATTTTGACTAATCTCGTATTGGGTTCTTATAAGGCCTCTTGTTTCAATATTGCTTATTTTTAATTTCGAATTTCAGCTATTTTAAAATTGTATTTCTAGTTGGACTCTTCTTTTCTTTTTCTCCGATTAATGTGAAAATTTCTAGCCCTCACAGTGAACGTGGTGTCTTCTTTCAAAGTTGTTTTAATAATATAATAGATGGATACTTCAGAACGCACCAGGTTTTTTTGTTATCTCTATTCATGAACAAAAACTATACATGTATTTTGCCCTGGTAACTAGGAAAGTAGCAAGCCCATGCCTGTTTGTATTTCAGTAGAATTCATCTGTTCGTTGTGCCACTTCACATTCATAGCATTTTCTCTTCTTGTTTGTTGTAGCTTTCAGATGGCTTAGTTTATGAGGCAGCTGATGATTCAAACTATTTTCCTCATTTCTATGGCCCTGGTCGGAGTTTTGCACCTCTTCAACTAGACGCTGTTATCAAGGCAGAGAAAATAGTTCTGGTAAACAATGATTTCACCTGCAGTCTACTTGATGGAGCAGACCCCTTATCGTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA012981