Os12g0479900
| Gene Name |
Os12g0479900 |
|---|---|
| Description |
Conserved hypothetical protein |
| Version |
NM_001073298.1 GI:115488557 GeneID:4352213 |
| Length |
6194 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0479900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:17757124..17763317 |
| Sequence Coding Region |
17757260..17757428,17757892..17757986,17758178..17758291,17758860..17758964,17759044..17759115 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:17757124..17763317 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:17757124..17763317 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggaggaggaggaggagaagaggaggttgggggagggggaggggggtggggtgatgagggacgcgaggaaggacggggtggtgagggaggtgatacggatggagagggaggcggtcatccccgtgctcaagcccaagctcgtcatgaagctcgcctacctcatcgagcatgatttggaccgttctgagttcttgaagctatgtaagaagatcgagtacaccatccgagcttggtatcttctccaattcgaggatttaatgcaattgtattctctgtttgatcctgtttctggcgagaagaggctggagcagcagaacctgacacctgaagagattgaaactctggagttcaatttcatgacatatcttttccaggttatggaaaagagcaacttcaagttgttatctgatgaagagtatgatgttgcacaatctggaaaatatcttctaaaccttcccataaaagttgatgagcctaagctagacagtaagctgttgtcaacatactttaaagagcatccacatgataatctgccttcatttgctaataagtatattatctttcgtcggggcattggaattgaccgtacaaccgattactttatcatggagaaactggatgtgatcatatcccgagcttggagctcattgctcagagttacaaggattgatagattgttctcaaaaaaaccacaggtgaagtccaagaaagacacaaagaagaccgatgaaattaatgaagacttagaagaaccagaactatttgtcgagcgtattaggctagaaaaaatcgagctaagcgtgagaaatctgatgagcaagatgacaattcaagaacccacatttgataggatgattgtggtgtacaggagggcaggtactaagactaagcctgatcgaggaatatttgtaaagcatttcaagaatatcccaatggctgacatggaaattgttcttccagagaagaagaaccctactttaacaccaatggattgggtcaagtttcttatttctgctgttattggtctggtcactttatttggttcccttgaaatgccaaaggctgatatatgggttgtcatagcaatcttgtcgggtgtgattggatattgtgctaagatctacttcacgtttcagcaaaatatgacaatatatcaaaatttgatcacaaaatcaatgtatgacaaacagcttgatagtgggaaaggaacactgcttcacctgtgtgatgatgtgatacagcaagaagttaaagaagtcataatttcttactatatcttaatggaacaggggaaggcaactgaacaagatctggatttgcgctgtgaagagctaattaaggaagagtttggtgcagagtgcaattttgatgttcgtgatgctgtaaagaaattggagaggcttggtatcgttcatcgggactcgattggaaggattgtctgtgtctcattgaagcgtgcaaatgagatattaggcaacactactgaagaattggtgatgcgagcgcaacagagcccaactgcttcttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAEEEEEKRRLGEGEGGGVMRDARKDGVVREVIRMEREAVIPVL KPKLVMKLAYLIEHDLDRSEFLKLCKKIEYTIRAWYLLQFEDLMQLYSLFDPVSGEKR LEQQNLTPEEIETLEFNFMTYLFQVMEKSNFKLLSDEEYDVAQSGKYLLNLPIKVDEP KLDSKLLSTYFKEHPHDNLPSFANKYIIFRRGIGIDRTTDYFIMEKLDVIISRAWSSL LRVTRIDRLFSKKPQVKSKKDTKKTDEINEDLEEPELFVERIRLEKIELSVRNLMSKM TIQEPTFDRMIVVYRRAGTKTKPDRGIFVKHFKNIPMADMEIVLPEKKNPTLTPMDWV KFLISAVIGLVTLFGSLEMPKADIWVVIAILSGVIGYCAKIYFTFQQNMTIYQNLITK SMYDKQLDSGKGTLLHLCDDVIQQEVKEVIISYYILMEQGKATEQDLDLRCEELIKEE FGAECNFDVRDAVKKLERLGIVHRDSIGRIVCVSLKRANEILGNTTEELVMRAQQSPT AS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>137..305#769..863#1055..1168#1737..1841#1921..1992#2238..2350#2451..2585#2694..2762#2878..2965#3072..3143#3229..3329#3448..3565#3657..3716#4317..4427#5768..5878#gttttttcctttttttttcttttctttttctctcttccccattcgccttcctccaaaaccccattcgcttcgctcctcctcgtcgtcgtcgccgccgccgctgccgctcgccgtagttagtatccgcgcggtgaggatggcggaggaggaggaggagaagaggaggttgggggagggggaggggggtggggtgatgagggacgcgaggaaggacggggtggtgagggaggtgatacggatggagagggaggcggtcatccccgtgctcaagcccaagctcgtcatgaagctcgcctacctcatcggtgagtagtagaacccatcgcccggccgccctctcactgatcaagcattcgttgagtcgagttcagttcagtgctccgtggtgtgatttttttgtttcctactactagatgttttctgcgggcgtatgaactcgaattcccagcgaggctaaactttttttttttggcgagtagcgcctctgcggttagagtgcctgccgctgcaatcgtgttacagtctgcacgacgctggcatatgatatgtttggttgaaattgggggcatgtgtcaatatcataggaataatggaatgcgatttggatgatgacgcagagtctataggcgtgaagatcttgttgaattgataatgatgcgaccattttttttttcaacttttggtttatgctaatggaatgtatggaaaagaactgtaatcttagaaattctttccatattcattaaattttgtgcaattcatggtcagagcatgatttggaccgttctgagttcttgaagctatgtaagaagatcgagtacaccatccgagcttggtatcttctccaattcgaggatttaatggtaggcctcttgtgttcattcccccctctccccccaattttgttctgttctttaggatcatttttatagtacaaactaattctagcctgactatcaactctattatgcagcaatttttacttcctgtttgatcatgtttctattgggtccagcaattgtatgctatgtttgatcctgtttctttcatgcagcaattgtattctctgtttgatcctgtttctggcgagaagaggctggagcagcagaacctgacacctgaagagattgaaactctggagttcaatttcatgacatatcttttccaggttgatccactaaatatgcatatatactatggaaatcatatataggctgctcctgtttgatgcatatgcaatcactgatttctcatggtgaacatgtcaaagaaccccttggaaggatagtcgaagtcaaatgtgtgatattccaaatggtgcttgcaaacattgcttctggcatgaagcttatgaccatgcttcttttttcttttttattgaatcggctctctctctctctctctctctctcggcatgggaactttggaagatttgaatttgtacccaaatggcctttcactattgaattggacaagattgatttgttatccttcccgtgttcagtacatcagttaggggcgaattgggttagttgaaacagatcgactttatgcatttcatcagaagaggtgctgttgtactgagaaaaattacattccacaatctgaacataggaaagatcgttatgcttatttgatgatgcaagacacccaatcgacatcgttgtaacaaagctcttgcatagagttattttatcctgtgtgagttgtaactgtttggtctctgttttaatcaggttatggaaaagagcaacttcaagttgttatctgatgaagagtatgatgttgcacaatctggaaaatatcttctaaaccttcccataaaagttgatgagcctaaggtctggaactatggccttttcaagcatgtactgtaacgtttcatgttcggatgactgaattgatttcgttgaattgtagctagacagtaagctgttgtcaacatactttaaagagcatccacatgataatctgccttcatttgctaataaggtaatcttcatttcagtaaggtggtttctttttcttgtcatcctttcccttaatatcatgttttatatttccaatctgaggaaattatgattggttctacatagaagcactccaattgtttggtggttctcatgattttatatcctttattacacttgcctgtcccacaaggacagtaagtcatttttttctgctaatgctggagaatattcttattttattttacactggccacatttttgcagtatattatctttcgtcggggcattggaattgaccgtacaaccgattactttatcatggagaaactggatgtgatcatatcccgagcttggagctcattgctcagagttacaaggtatctgtcattttgaatagaaacttttaggtcttggaaaatcaatccagaaaacaaaattattgtggtgcacagtactgagaatcctactttcttgcaggattgatagattgttctcaaaaaaaccacaggtgaagtccaagaaagacacaaagaagaccgatgaaattaatgaagacttagaagaaccagaactatttgtcgagcgtattaggctagaaaaaatcgagctaaggttggtaattggttttctcaaattgattctgaactataatttttgaaaggagattctgaactataattgggcctactttaagatgcattatcttttctggtgagacagcgtgagaaatctgatgagcaagatgacaattcaagaacccacatttgataggatgattgtggtgtacaggtaactttgaccctttgatattttgtttagccaatctccacattcatgaaggatcctaattttagaagtgctgatgtagtacaattggttccttccgatgattgtatatgtgcaggagggcaggtactaagactaagcctgatcgaggaatatttgtaaagcatttcaagaatatcccaatggctgacatggaaattgttcttgtaagatgaatcactagagttgagataaatgtgtagcatttttagcatcttttagctatatctgtggctgttagcaaggacctgaaattgaaacttacttttgcagccagagaagaagaaccctactttaacaccaatggattgggtcaagtttcttatttctgctgttattggtctggtatgtttctgatcttttggctatccctgcatgcaactctagcaatattttactatatcgatcccttacccttggtcccttgcaggtcactttatttggttcccttgaaatgccaaaggctgatatatgggttgtcatagcaatcttgtcgggtgtgattggatattgtgctaagatctacttcacgtaagtgcttaggttttgtatattattatccatttgatcaatgtcgttctacatggtgaaggaagatttcctagggcaaatgtagtgcaatgtgatagatttatcttttgtgatacaggtttcagcaaaatatgacaatatatcaaaatttgatcacaaaatcaatgtatgacaaacagcttgatagtgggaaaggaacactgcttcacctgtgtgatgatgtgatacagcaagaagtacgaaacaaatgaaacctcttttgcaccataagttgaatatatatctttgttatcctgagaactgatactcttatcttctttcatgaaggttaaagaagtcataatttcttactatatcttaatggaacaggggaaggcaactgaacaagtaagcatgctaaccagtactccctccgtcccaaaatataagagattttgggtggatgtgacatatcctagtatgtctagattcattgtactaggatgtgtcacatccacccaaaatcccttatattttgggacggagggagtattatgcaatatatcttgttttcccctggctgtatctctttgtacagactgagacatttatgccttaagaccattctgtctgttttctagaactcctgtctcatcagttccctgattcattatttttctttgttttccttattcctatcggtttactagcacattatcctgtattgcagctgacaaagtgatttctttaatatattggcacctttggcccttgacactggtcaggagcaaaagtttcctgtgtattctctgtaatgagttgttatgagcacagtacatttagcattgatttatgactgggaattaacaagatataaatttctggattgttgtgaggaacaaaatttgggttatcacacctaagtacaaacatatactgttttatctcttgcgaggaccgttaatatgaaacctagaatcctaacagtgttctattcatgccttgcaggatctggatttgcgctgtgaagagctaattaaggaagagtttggtgcagagtgcaattttgatgttcgtgatgctgtaaagaaattggagaggcttggtatcgttcatcgggtaaatctcttaatcaaccaactatagtctaaaatattaaacttactgagggtctctatatatcgaagtaggaaattttttattatttaaccctttttattaaataattttaaaaacaaatcctctgaaaatttattttcaaaaatgaaccttttggccacgccagtctgaatagcgtgaccaaagtacacagccacgccacatgcactggcgtgacaaaagaaaccacgcggactggtctgccacgtcaaagtgttgtcacgccactgtgcttggcgttgcaagcaagtgctgcaacgccattcttgatggcgtggctagcttgctgcaatacatacgtggaccacacataagtgtttgctgtggattctcactttattagagataatgaccatgttgttaatcacagcaaaccaacaaagaacgtgctgctagtatgagtcgattttccttctttgctatctcatatctcttcaatggtgcatcatattagaaatccgtttgaaccattatttttcatttgaaatatatacaacagaacgagtctaatattgattatatttagatatcagttgatatttgattatatttaaacaaacttgtattatatattccattaatttaaatgccatacatagtgttaacgtgtgcaccgtacaaccaaatgcaccgtatgtgtttaaaattatttaataaaaagggttaaataataaaaaaaaatctcgaagcagtcagtttttgagaacttatcagttccagctggtgaactggagctgggaactagggacagatccaggaaataatgccactggggtcattatcagttggcagcagtgccctaattcccttgattttgaattgaaaatatgtgaaattctagtttaaacttagaaactagtttctattgcagaatattaagaaaatgatatagcgatacaagagagatatgttgttaatcttttttgcaagtttctgagcagcatgcaaaatttttttaataatcaaatacaaagtaattgtccatcagaatggtgccaatcatgtaatggatggaagatgtgaaccttttgggcaatcttaataacattagctttatgctgattgtgaaagtgtcttcacactgaatttccgtaagctttatttggactatggagtccttcagttaacctaattccttttgggactacttttattctgagggcatgtcaaattgttggctttgcttgtttttgctgccaagttgttggctcctggattatctgatatatctgaatgaataccaacacgatcaattccaaggtatcttcttgtgtgcttataagtacagttttgctgctcaggactcgattggaaggattgtctgtgtctcattgaagcgtgcaaatgagatattaggcaacactactgaagaattggtgatgcgagcgcaacagagcccaactgcttcttaagtttcacgatggacagctggactggaatgcactcctcatctttctgtaaattacgctgccatgacggacttgttcatcctgaaaacagtccttcatgttttgttggcaaatgtgccatacgtgctctgcactatagttaggcttccttttattttcggcgagttttaatgtgtaactatgttatgcttcagtttaaaatgggtacgggtgatttgtacataacacgtgtaataaaaacaactgtacaaaaaccctcatacctgccttggttctttttactggcaggtttacgagtccactgttgcttgcttccttt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
