Os12g0480000
| Gene Name |
Os12g0480000 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, DHHC-type domain containing protein |
| Version |
NM_001073299.1 GI:115488559 GeneID:4352214 |
| Length |
4567 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0480000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:17764156..17768722 |
| Sequence Coding Region |
17764301..17764349,17764434..17764551,17765028..17765102,17765188..17765259,17765356..17765490 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgtccacatccgccgcggagcctggcgtccggttctccgaccgagcggcgaggaggtcgtcgctgggcctgaggtcgatggtgctcctgatgcacgtggtcttcgtcggcgccgtcttcctgctcgatccgaccctcgacaggcgaatccgcgaggagccctggtacataggggcatatggagcgcttgttttgatcgccttagtgcagtatttctacacagctggttcatctcctgggtatgttctcgatgcaatgaaagctggttcgacgatgcacgcaacctacatcaatactgccactctttcgaaacaatcaagtccaaacaatggtagcttaaattcccctttgagcctccctcaacagcagaaacttaatccgaccacttctacatcaacatggttgcagcgagttgcagaattatacccccctgggtcaagtagcagggattggacttgcacttactgcagggttattcagccacctcgtactaggcattgccatgactgtgacaaatgtgtccttcagtttgatcatcactgtgtttggcttggaacatgcattgggaaaaagaaccactgcagattctggtggtacatatttgaagaaacaatcctgagtatctggacagttgctctctacattgactcgatacgtttagatgttgacaaggcctggtggaaggattttattggcgtaatcctgttggctgtgttgatctttattctcatattcttgctactattgttgatctttcatacttacatcgctcttacaaatcaaacaacctacgaagttgcccgaaggaagcggatattctacatgaggggtatacccgacaaagttcatccattcagtaaaggcatctgtaggaacatctacgtcttctgcttctctagacagaagggatatgatctagaagaggtgcccccacttgaagagttggaagccagagctgctccctacacatgccgcgatataatctgctgccggtgctgttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASTSAAEPGVRFSDRAARRSSLGLRSMVLLMHVVFVGAVFLLD PTLDRRIREEPWYIGAYGALVLIALVQYFYTAGSSPGYVLDAMKAGSTMHATYINTAT LSKQSSPNNGSLNSPLSLPQQQKLNPTTSTSTWLQRVAELYPPGSSSRDWTCTYCRVI QPPRTRHCHDCDKCVLQFDHHCVWLGTCIGKKNHCRFWWYIFEETILSIWTVALYIDS IRLDVDKAWWKDFIGVILLAVLIFILIFLLLLLIFHTYIALTNQTTYEVARRKRIFYM RGIPDKVHPFSKGICRNIYVFCFSRQKGYDLEEVPPLEELEARAAPYTCRDIICCRCC </aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>146..194#279..396#873..947#1033..1104#1201..1335#1450..1483#2088..2197#2820..2906#3026..3109#3683..3748#3834..4008#aaaccggaccgctcctcccaccagaagcgtcgtcgtctccgcctctggaggcagcgacgccggccggttgccgccgccgcctacccttcctcactccacctctccgactaatcgccgccgccttcgccgccgccggaggcctagaatggcgtccacatccgccgcggagcctggcgtccggttctccgaccgaggtacacgccctccctcacccgattttctctcgccctatagctaagctctgatttgatctcggggggtttttgtctgcgcggcagcggcgaggaggtcgtcgctgggcctgaggtcgatggtgctcctgatgcacgtggtcttcgtcggcgccgtcttcctgctcgatccgaccctcgacaggcgaatccgcgaggagccctggtacgaaactatcctcgcccgattccctctgacaaaggctccatttccgctcgaatttaagctcagttttagggtgccgcggctctctctagattttgggtagatttgtggatttagctgtttttttttcctcttcttctagcgctaggtggcagtacatttgatttccccttttcagcttatgctctgatctagttttagtcgaaagtagctttcgtggtgcccaacctcgcgagtgattctgcatcggatcaatgatactccagcaaaaagctcattatataatatacatcgcggagagaacatggtctcttttgagaagaattctagctcgtgatttccgtcggagatctgatcacattgtgattcttatttttcgtacctgcaagttgtgctctggcttgtgataagtttatagttccgtgtctgtttttaagagccaggatctctgttttaatggcgttgtttgattgcaggtacataggggcatatggagcgcttgttttgatcgccttagtgcagtatttctacacagctggttcatctcctgggtatggagtttcctgagtttattctcatccaccagggattgtttgaaagtgtttgattttgtattttgggcttatctgttatcaggtatgttctcgatgcaatgaaagctggttcgacgatgcacgcaacctacatcaatactgccactctttcgaagtaatgtcttaatccacagaaattgtagtgttcaaaactgattgtaagctgatatttatactttcgtgtgtgtctgtttttgatgattaagaaaagacaatcaagtccaaacaatggtagcttaaattcccctttgagcctccctcaacagcagaaacttaatccgaccacttctacatcaacatggttgcagcgagttgcagaattatacccccctgggtcaagtagcaggtaaagctccaagtcttgacaaaagaatgatgttattttaaagatattttcaacaatagatttctttgtgtttgtctcctaactgttaagctatactattctattgtattgtagggattggacttgcacttactgcagggttattcaggtagttgttctccttcaaactctaagcactagagctcctgtacctctaaacttcaagcactaaagatcctgtacttagaatgatttattataattatcacttagaatgtgtagttaccgtactacacattaagtgtgttgcaaagtgctcaaatatgtttgactaaattcagtgaaacctacgaacctattcaacatttgctaatctggtcagtgacgattcagatggaattgttggaaaagtggttgcatttgatggtacaattaaaatagtctactactctactctactgacagtcttgtattcttattattggttgaaactgttccattttattcccattcaaagttccatctatgtttctgaagatcattatgaggacatttacaatttgatgcttcgttggaataattagcacttagcaatgtcttgaataaactactgtgaatttgacaaagtgaactaacgcttccccattactttagtatttctcttttctgaaatgccgttttgctatattgatttgagttgcccaggccctcacattttttgcatgcaaagctgctgctaactgcccacgttcattttctgctgcaatctacagccacctcgtactaggcattgccatgactgtgacaaatgtgtccttcagtttgatcatcactgtgtttggcttggaacatgcattgggaaaaagaaccactgcagattctggtgagttttggcacgtgtgtattttgcacgcttacataatacttgtgctgcatcctggaggtatcattagggtttgtgttgcactttctgctctatgtgataatacattaggaagaacacctcggttgtttactatgcacactgcacactgcagaaatactgttatgcgcagcagttctatttgttcccaaccatgtggctcaaagtgtttttttttttaaaaaaatcttcttttattcttgttaaggatttggaaagttctattgcatatctgcagtctgcactatgataagagtttctggtgaatgtacagttataggtctgccttgtaaatatacacaccacttcattaaaattgtaaattcttggatacactaatttgatgcacccgtcccttgcggtgtgtttgaacttcaaatttctatgattgctcaaaggttcaattatgcaccttgcaggatgctattttaaatggtgatatttgatttatgtacctgggctacttttttcttacactatacacaggatatgctgtgatgtgaaagttgtagtattaccttgtccgtgctactattaaaatcctgtaattactgtcacctaacaattaaaaaaaaaatcttaggtggtacatatttgaagaaacaatcctgagtatctggacagttgctctctacattgactcgatacgtttagatgttgacaaggcctggtatgatgtcattcccttttaacatcactgctctggtgacattgctttaatcctttctattgaacctcacttttcctttttttcccctcatctgagcaccttattttttaccatggcaggtggaaggattttattggcgtaatcctgttggctgtgttgatctttattctcatattcttgctactattgttgatctttcatacgtaagtcttattcatttgtaatgcaactggtaggaccagcgtttagttgctgaaaagaaatgacaaatcagtagctccacaagcgttcttttcagctactaaattatcacgggcacacttcccaaggcaataaacggtgcactttttgaaaaaaaaatctatacacaagtttcttaaaataataaaacaaatccatttttcaagtttatactagttatcacttaattaaccatgcatagttgagtgtcttctctgataagccaaacagctacttagccaaaacagagaaatgaacgctgccttagtttttatcgaatttgtaggttagttcctatcttttcctttagagaaatgtgatttttagctttggcatggatgaaactttactgtttacctaaatatgaatgcgataggcggatgaccaaagagctaaacattttctattctgctcacggaatcatcatcagagattaatttgctttcctatgagctggtttatatcctttgactattgcaaagcccaaatcaacaacacttcgtgtataataatgcatgttttctgacttctctcagttacatcgctcttacaaatcaaacaacctacgaagttgcccgaaggaagcggatattctacatgaggtatggaatacttaggaatggattcagatatgctaacttattattgcgatcaggtgataatacattcgtgctgtatcattcgcaggggtatacccgacaaagttcatccattcagtaaaggcatctgtaggaacatctacgtcttctgcttctctagacagaagggatatgatctagaagaggtgcccccacttgaagagttggaagccagagctgctccctacacatgccgcgatataatctgctgccggtgctgttgatcttgtacatgtcaatatatgttactaccatagcattctttttttcacatgtggaagcatatgcttagcctgtgtagtgtaattcctctgccttctttttttttagcctgtggaagcatgcatgcctttttcgtgagctgcacctatgtggttgttcatgtaaagagagtcaggcctggttgttcatgtaaagtacatgaccgcatgtacattttcaagcacaagacgtgtgtctgtgtgggcttagatccaatcgttgtggtagattagttccaccatttttctttttgaaatcagggatggttgattactgataagttggttttgagcacacaagctttagtaggaaaccgttactacttgtgtcgaaaatttgtattctgagttcgagttgtggcagtaaatgttacacgtggtatttgtcggacgtattgtattgtcaatgtcaggcacgtacgcaatgctgaagacaagtgctgcgtgttctcggtggtttttttgtatcagatttacctcgttggcttgccataatgttgtttgctattgctgaggctgcgtt</dnaseqindica> |
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