BGIOSGA013167

From RiceWiki
Revision as of 09:58, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA013167| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013167, complete gene.| tag = OsJ_118...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA013167

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013167, complete gene.

LocusTag

OsJ_11802

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA013167-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA013167-PA

Length

5919

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:27764083..27770001

Sequence Coding Region

27764083..27764203,27764347..27764429,27764555..27764614,27764873..27764981,27766012..27766064
,27767367..27767447,27768386..27768498,27769944..27770001

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:27764083..27770001 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:27764083..27770001 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGTTGCAGTGTCTGGAGGGGGTGAAGCAGCTCTGCGGCGTGCTACTCAAGTGCTGCGACCTCGACCTCAAGCAGCCCAAGGGGCTCGAGGATCCCGAAATCCTCGCCAGGGAGACCGTCTTTAGTGTGAGCGAGGTTGAGGCGTTGTATGAGCTGTTCAAGAAGATCAGCAGCGCGGTGATCGATGACGGACTGATCAACAAGGAGGAGTTTCAGTTGGCACTGTTCAAGACCAACAAGAAGGAGAGTTTATTTGCTGACCGTGTATTTGATTTGTTCGATACAAAACACAATGGTATTTTAGGATTCGAAGAATTTGCCCGTGCGCTCTCAGTATTTCATCCAAATGCACCTCTCGACGAGAAAATTGACTTTTCTTTCCAGCTATATGACCTCAAGCAACAAGGGTTCATTGAAAGACAAGAGGTTAAGCAAATGGTTGTTGCAACACTTGCTGAGTCGGGAATGAATCTTTCGGATGAAGTCATAGAGAGCATCATTGATAAGACATTTGAGGAGGCCGACACAAAACATGATGGGAAAATTGATAAAGAAGAATGGCGCAATCTAGTTCTCAGACATCCTTCTTTACTGAAAAACATGACACTCCAATATCTCAAGGACATCACAACTACATTTCCAAGCTTTGTCTTCCATTCTCAAGTCGACGATACTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MLQCLEGVKQLCGVLLKCCDLDLKQPKGLEDPEILARETVFSVSEVEALYELFKKISSAVIDDGLINKEEFQLALFKTNKKESLFADRVFDLFDTKHNGILGFEEFARALSVFHPNAPLDEKIDFSFQLYDLKQQGFIERQEVKQMVVATLAESGMNLSDEVIESIIDKTFEEADTKHDGKIDKEEWRNLVLRHPSLLKNMTLQYLKDITTTFPSFVFHSQVDDT</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..121#265..347#473..532#791..899#1930..1982#3285..3365#4304..4416#5862..5919#ATGTTGCAGTGTCTGGAGGGGGTGAAGCAGCTCTGCGGCGTGCTACTCAAGTGCTGCGACCTCGACCTCAAGCAGCCCAAGGGGCTCGAGGATCCCGAAATCCTCGCCAGGGAGACCGTCTGTACGTCCTCTCTCTCTCTCGCTTGCTCGTGCAGTGTACTTGAGTGTCGATTGTTTCACTTGAACTGAAATTAATTGTGTTCCCTTTTTGTTTCGCGGCGCATGTGGCATTGGGGGTGGTGGTCTGCTCGTTTGTGCGTGCAGTTAGTGTGAGCGAGGTTGAGGCGTTGTATGAGCTGTTCAAGAAGATCAGCAGCGCGGTGATCGATGACGGACTGATCAACAAGGTCAGTGGGCTAATAATGCCCATCTGTTCAACTGAAAAAGGATGTCGTTTGTTATGATGATTTCATGATTCTTATGTTATATGGCCCTCTGGGGGTTGTGATCATTTTGGGTTGGTATGGTGCAGGAGGAGTTTCAGTTGGCACTGTTCAAGACCAACAAGAAGGAGAGTTTATTTGCTGACCGTGTAAGACCAACAATAATATAACTTGCCTACCATGGAAAATATCCTGTAACTGTCTACATTTGAAGTGAAATCAATTATGAAATTAGTTTGGTTATGCTCTGTAGCATCTTGATGATGCTATACATTGTCCAAACAATCAATAGAGAATGATGTTGCTGCATAATTTGCTTTCTGCTAACATCAGTCAAACAGAGAATGATGTTGCCACATAATTTGCTTTCTGCTAACAACGAGTGCATTTCTTTCCCTGTCTTGCAGGTATTTGATTTGTTCGATACAAAACACAATGGTATTTTAGGATTCGAAGAATTTGCCCGTGCGCTCTCAGTATTTCATCCAAATGCACCTCTCGACGAGAAAATTGACTGTAAGTGTAAATGCATCTGGGTGGGTAGCTTAACTACAAAATATAGCGCCTTACTGATAGGGAAGTCTATAACCTAAAAATAGAAAAGGACACATCTATGGTTGAAAATAGATAATGATCACTTAACATAATGCAACATGCTCATATGTGACAAATGCTACTACCTATTATGTACTTTGCAAGTTTCCTTAAAACCGCAATGCATAGATTCAGCTTGCTCTAATTGCATAAATAGTAACTGTTCATACTAAGGAACAAATTAAAGGCTAGAAAGGCACAGTTTAACTACAAATAAGAACACTCATGCTTTTTTCTTTTTTTCTTTTTGGTCTAGTCTCCTTTGTGCTGGATGTATTAATTGTTTGGCTACTGACAGTGGCTGACAAAATTTCACAATTAGACAAATGGGAAAGTACTACATGGTGCTACAGTTAATTCAAATTATGCAAACATGTACTGTAGCATCTTAGCATTAACCGAAAAGAAGCTCATAGTTATATATTGTGCAATGTAAACTATAGCATGTGAGATATCCTACCATTTTGTCTATCTGATTTCTGTTTAAATCATGTAATTTTTAACCATTACCGCTTGTCATGTATAATATACACGCCTTCATACCATGTGGAGCCAGCAAATTATATTTAATGTTTAAGTTAGCCCTCTTATTTACTTGATCCTCTGACATGTATTATGCAATTCATTTTTGTGCCATCTCAATGGATATAAGACTAAAATGCAACAAAACAAACAGTTCACAATATCCCTGAGATCAGACTTAACACCTGTATTTTATTTACCCTTTTTGGGTTATTTTGTGCTGATCCGAGAGTGGTCTTTATTGGAAGAAATGTTAACTAGGGGTGTTAATCTCTCTGCTTGGTTGATAATGCATCGCTATGCATTGAAATAAACCGGTTGCATGTTTTATTAGCATATGTTATGCCCTTTTTTTTTCTGTGTCTCTTGCTTTTATCTTCAATGTTGTGTGTGAAAAGAAATTCTTGCATTAACTCAATAATCCTTGCAGTTTCTTTCCAGCTATATGACCTCAAGCAACAAGGGTTCATTGAAAGACAAGAGGTACTTCTCTAATCAGCATGTTATGTTTCTCTCATAAAAGTCAGCATGTAGTATGTGTGAAGGTAACTTTACAATTAGAGTAAATTTCATATTGGACCATCGTTTTTTACCCATGTTGCAACTTGGACCAGGGCTAAACTACTTTGGTCTAGTACTCTTACAAAATATTTCACCTTAGGCCCTGTTCTTCTTCAACTCTCCTTCCTCTCTTCTTCCTCTCTTTCCTCTCATAGAGCCATGTGTGCCATGGCCCATGGCAGATCTAATCAGCACTGCTATGACCTGGGCATACAGATCAAAGCTCAAGCTCCATCCACAAGCCATCCCTGTGCTCTCGCTAGTTCTTCTCTGATGGAAAAAAAAATGAGGAAGTGAAAGGTCACTGTGTGCTGCTCGCTTCCTGGCAAGGTGCCTCAAATTTCCTGCACGCAGTGCCTCTACTCACTGGCTATTGGGGCTGCCATCTTCCATGGAAAGAGAGGGATCCCATTGGTGTTGGTAGAGCTCTCACCAGCCTCAACCAAGATGCTGTGCGCTCAAGCTTGAGCACCGGCCGCACGACCTCTATGGGTGTTAATCTGGCACTCAAGCTCAAATCCATTCTTTGTTGGTGAGCCCAAGATCCTCGAGCTCCTCTGCCTTTGGCTGCGTCGCTGACTTGCTGGCATGGGAGGCTCACCATCGTGGGTGAGTTGACGGAGAATAAGACTGGCGGTGAATTAGGATCGGAGAGGACTGGGGTATCGGTCACTGCCATGCGGGCTAACTAGTCCAAGGTGCAAAGGTTGGTAAGAAAACCCAATCTTAATTGAAAACATCTTCAATTGCATAGTCCAATATGCAATTTAGGTAATAAAAATTAGTCCAAAGTTCAATTCACTCTTTTAATTATGATCGTACCATTTAAAAGTCCCGCTATTGGCTAGTATGCTGGAAAACCAACCAGATGCCAGCTCATTTTCTTCTGCAAGACCTCCCCTCTTCTCCCTTTGCATTTTTTTTTACATTTTTTATGGGTGCTTTCATTGTCTTCTCTATTCACTAATGATCATGTATTATGAAAAATGCTATGGAACTAACCCAATTCAAGGCTACTTGTGGCCATATGCCTCCTTGTGGTTACCCTAGCACCACTTTCTTGAGCAGCGAATAGCATAGTTCAAAGTTTGTGTTCAGTGTAATTGATATATGTGTAAAATATTTGTGTCATAACTCAGAATACCATTTGCCTTCTGCAGATAATGCAACTGATCTTCTATCTTTTTTATGTTATACTTAATTGTTTCCTTTTTTGCCTATTAGGTTAAGCAAATGGTTGTTGCAACACTTGCTGAGTCGGGAATGAATCTTTCGGATGAAGTCATAGAGAGCATCATTGATAAGGTAAACATGAGTTGTTTACTTCAACGTATCAATCTGGGGATAGTTTTTTCATGATCATTTAATCAATCATGATGAGCATCATTTTCCCTTTTTATGCTCTCGAAATGCTGATGCAAGTACCACACTTGTTTCAACTTATGAACTTATACTCTGAACATGTTTGTCTCTACAATGTGTGCTTGCAAATGGATATTGCTTTAGCTAGTGGCACTCCTAGTGTCATTTATGTTGTGTTTTGCAAATCATAGTTAAGTCTTACTGCCAAAGCTTTGTATTGACATCTTTTGCAGAAATATGATATATTTATAGCAGTGTTGAGCAATCTTACTAAGTTGCCACAAACACAAAAATTGTCTGCCTGATAACACAATTTATTTTTGGACCTACAACAGTATTTGTGATGCTACATCAGTACTCCTAAATGGAAATATAGTTATATGCACATATGATTGCAGCGGCTGTAGTATGTATATCTTATTAATTTACATCATTATTAGACTCATCGTGTTTTTTGAGAAGAAAATCTAGCCATACCAAAATAAGAATTATCAATTCTTTTATTTTCGTTCGTAACTAATGAGATGATTTACAGTTACTTTTTTAGTCTTAGTCTTAGTACGACTCCTTTCAAGTTTTGCATTTATATTTTGTCACATTTTTCTTTTGTGAGGCACAATGGTTAAACTATCCATAAATGTAATATTTTCTGTTAACCTTCTGGTTTCTGGTAACTGGGCATTTATTTGATCAATCATACAAAGTGATATTTTCATTGTTTTGCCAAATCCAGCGTGGATCAGGCCAGCCCACTGGCCACGCTATACAGGCTTTGTTGCTAATTGCTACCTTTGTACATTTTACAAACTGACTAGTTGCTGTGATTGTTTATATTATTCTGGCTGTTTATATTATTATGTTTATATTGCACATTTTACAAGACATTTGAGGAGGCCGACACAAAACATGATGGGAAAATTGATAAAGAAGAATGGCGCAATCTAGTTCTCAGACATCCTTCTTTACTGAAAAACATGACACTCCAATATCTCAAGTAAGATATGTTAAACTTGTCTGTGTATTTCTCTATTTGCAACTGATGATCATTTACGTTTCTCCCATCTGGAGCTATATCATAGGACACTATTGCATTTTGAGTTATGGCAAGAAGATTAAAATCTGTATGGCTCACAGGTTGCTCTTGAGCGAAGGATACTAGAGACTATTTGCGAATATTATTCCTAAATTACTAGTACAGTATCTTAGTTGTAAACAGAATATGAAACAGCATGGATTATCTAGATGATATTTGAATACAGTGAAAATAGTATGCTATCCCAGAGCATTGGTTTTTAAGTTCTTATTAGTGGTTCAGATTCAACGAAGCCAGTTTGTGGTCAGCCCCTGATTCAAAAGGATATATTAAAGCATCTGTTGTCGGTATTTCAGAATGTCTTCCTGTGGAGGGACGCAAAATATAATTTTACACGTACAGTATTAAATACCACAAAACTGTACATATTCTGGACAAACTAATGTTTTTATTTCACAAAATTACACATAATTTGGTAGGACATTTTGTGAAACTACGTATTTGGTGATTTTATTAAATATGATAGAATCTAAATGCGGAACCACCTATCAGACAACATATGTGTAATTATGGTCATGGTGTAGTTTTCTGATAATGTTACATGTGTATGTATAATGTATTTCTCCAAAGTTTACTCCTGCGTATGTGCTATGCATGCATTTTTAGACTCTTAACTTGTTATTAAAAGATGTGGACAGGGTTGTTTCACAACAAGTAGCCAGGGCTTAATATATGATGTTAAAATCTTCAGTTGTACATAAAATAGAGAAATTGTTCTACCTAGAAACTTACCTATTTTTTTTGACTTGTGCTTTGGTAGGGATTTCCCTTCTTCGTTTCTCTGATTGTAGTTTAACTTCAATTGCTATATTGTCAACTTCGGTTACAAACTTTTTTGAATTTTCGTTTTCATTTTTGTGCAGAAAATTTAAATTTAGATAATTCCACAAAGTGATTGTTAATTTTGGTTGTTTGTGTTGCTAAATATAACTTGAGAACTTCTCAGTTTTATGATATGTTTTAAATTAATACTACTAATTGCTTTTTACCACATTTCAGAAAACACATATTTTGTTAAACCTATCAAAAACTGTACTCTTTCCAAAATCACACATGTTTCTCACTGAGGGGTAGGTCTCAGCACACCATCCACACATCTAGGTGGATTTCACATGTTATGTTTGTTGGAGTTTACCATGAATCAACAAATATTTAGTTTACTTAAATGTTTTGCAATTAATTCTTTGAAACACAGACTGAAATAGGTATTCTGATAGCTAATGTCAAATAGGTGTATTTTTGTGATGATTTAGTCTGGATACTTTTTTTCTTCCTATTTTACTTCGATTGCTCTTTGGTTACTCCATTTCACAGACCTAAGTACCTAACCATATCAACTTTGGCAGGGACATCACAACTACATTTCCAAGCTTTGTCTTCCATTCTCAAGTCGACGATACTTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA013167