BGIOSGA013333

From RiceWiki
Revision as of 10:00, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA013333| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013333, complete gene.| tag = OsI_130...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA013333

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013333, complete gene.

LocusTag

OsI_13027

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA013333-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA013333-PA

Length

8805

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:31048973..31057777

Sequence Coding Region

31048973..31049018,31049124..31049246,31050369..31050533,31052538..31052677,31052985..31053095
,31053361..31053486,31053881..31054033,31056125..31056238,31056944..31057114
,31057202..31057281,31057711..31057777

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:31048973..31057777 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:31048973..31057777 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGTGCTCAGCAAGTCCGACGTCCTCTCCTGGATCACCGACCGCACGAAGCGGCGGCGGCGGCTCGAGGGAGAGCGCGTTCCTGGAGGCCGTGGCGGAGGGGAACGTCCGCCGCCTGAAGAGTGAGTGCTCCTCCCTCCTCGTCTCACCGCCCTCCGACGCCGCGGCGGAAATGGTGAATAGAATGGATGAGAAGGACAGGGCAAAGCTTACTGATATGCATATAGATGGCATTGGGTTAATGCAAGTGGCAGCAAACCTGGGAAAAATTGAGGTCATCAGGTACTTTGTGGAGGAGCTTGGCTTTGACGTCAATGCTGGTTGCCTCTGTGGTGGGCATGAAGAAGTAGCACATCTCTTGTTATCTAGTGGATCCAGGGTTGATATAGCTGTTGCTCACGGGACACCACTACATATTGCTGTTTCCTTTGGGAAGACTGGGGTTGTCAAGATTTTATTGGATCACCATTCAGATCCAAACAACACTTCAGGAGTTTGGGGTACCCCTATACTTACGGCTCTTCATTCTACTAAACATGGATTGGATGAATCTGATTCTTTGGGATGTGTAAAGCTGCTTGTCAAGGCTGGTGCTGATGTGAACTATGCTTGTCCAAACACTCCCTTGGTGGTGGCCACGACAGAGGGTTTAACTGATTGTATGAAGTACTTGCTTCAGGTTCACGCAGATCCTAACATCCCAGATAAACAGAGCGGACGCACACCAATAGAAATCGCTGCAAGCTTACGAAGAAGAAATCATGTGGAGATTCTATTTCCTTTCACTTCCCCTGTTAGAGCAGTAACAAATTGGACAGTTGAAGGAATTATTACTCACGGGAAATCAAGATTCTCAATGCCCAAGATTAAGGATGAGCCATGTAGCAAGGTCAATGACAGAAAGATTGAACTAAAATCACTGGGAGGAAAAGCAGTTAAGAGAAAGGACTACCTTGGTGCATCAAGGATATACTCTGAGGCACTTGAGCTAGATTATTTTGATGCAACCTTGTATTCAAACAGAAGCCTTTGCTATCTACGAATTGGAGAAGTGCAAAAGGCTTTTCTTGACACAGAAATGTGTATAAAACTGCGACCTGAGTGGGTGAAAGGCCACTACCGGGAAGGAGCTGCTTTGATGTTGCTAAAGGAGCACAAGAAAGCATTCGAGGTGTTCTTGAATGCACTGAAACTGGATCCTACGAATGCCGACATTGAGAAAGTGTTGTGGGAAGCATTGGAGGCGATGAAAAAGGATGATGCTGCTGAAGAGAAAACCTTAAAGTCGGTAGATTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MCSASPTSSPGSPTARSGGGGSRESAFLEAVAEGNVRRLKSECSSLLVSPPSDAAAEMVNRMDEKDRAKLTDMHIDGIGLMQVAANLGKIEVIRYFVEELGFDVNAGCLCGGHEEVAHLLLSSGSRVDIAVAHGTPLHIAVSFGKTGVVKILLDHHSDPNNTSGVWGTPILTALHSTKHGLDESDSLGCVKLLVKAGADVNYACPNTPLVVATTEGLTDCMKYLLQVHADPNIPDKQSGRTPIEIAASLRRRNHVEILFPFTSPVRAVTNWTVEGIITHGKSRFSMPKIKDEPCSKVNDRKIELKSLGGKAVKRKDYLGASRIYSEALELDYFDATLYSNRSLCYLRIGEVQKAFLDTEMCIKLRPEWVKGHYREGAALMLLKEHKKAFEVFLNALKLDPTNADIEKVLWEALEAMKKDDAAEEKTLKSVD</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..46#152..274#1397..1561#3566..3705#4013..4123#4389..4514#4909..5061#7153..7266#7972..8142#8230..8309#8739..8805#ATGTGCTCAGCAAGTCCGACGTCCTCTCCTGGATCACCGACCGCACGTCAGTCGGTCTATAGTTCGCATCGCCTGCTTTTAATTTGGTTAGTCTCTAATGGCGTTGTTGTTGTTGCTGATTCGGTTCTTCGTCTCCTCCTCCTCCCTCCAGGAAGCGGCGGCGGCGGCTCGAGGGAGAGCGCGTTCCTGGAGGCCGTGGCGGAGGGGAACGTCCGCCGCCTGAAGAGTGAGTGCTCCTCCCTCCTCGTCTCACCGCCCTCCGACGCCGCGGCGGGTTTGATTTCTTCTCGTCGGGATTCGAGGAGGTTGCTCGTCGGCCTGCTAGCTTGTCCGTGTGCGTGCGAGCGAGTCTCTTGTTGCTTGCATTCGTGGCTGTTTCGATCGGTCTGTCTACGTTTTTTTTTCCTTCCGCGCATGTCACTTCCAGGGGCGGAGCCAGTATTTTGAGGCACCGGGGTCACACTAGCTAGTCTAAGGCTCTAAGCTAACGTCATGTTTAATTAGGCTCTAATTCTAAGATCATTTTTTTAATCTACAAACCTTTAGAGCCAAAAGATTTTGGAACTAAATTAATTGTGGATTGAGATAATTTCGGTGAGATATCATTATCTTAGACTAAACATAAAGTGTTAAATCACTTTAGTTAGCTATTTAGACATAAAACTCCCAAGTTTGGCAATAATTTATGAGCTAAAACTATATAATAATTGACAAACTACGCCTAATTATTTTGGGCACAAAAACAGGTCCCCAGAGTTGTTTATTAACTAAAAGGCCTAATGCGTAGTGTAGTTGATTAACAGAATTACTAGCCTAATTGCATGTATAAACACACCACATAGAAATAGCTAATTTGTTAAGTGATGAAATATGCTAATGGGCTAGCTGTGCGGTGGTGGTGGGCTGACGACACCATAACAAAGATGTTGGAAGATGCGATCAGCAGTTCTGAGCGTTTAGTCTATGAGCTAGCTGTTGCAGTTGAGCGGGCCGGGGTCAACAAGCATCAGCTTATGGGGTCACTTCTCACATACTAAGGAACACACTGGTTGGTCCGATATCATCAGTGTCATCTGACCCCGGTGATATAACGTAGTTCTGCCCCTGGTCACTTCCCAGGTTGCGCCAAGCCGCTAATTAATGAATTAAGATCCTGCGGTAATCTGCTTATTGTATTGCTTGCATCAAGGTTGGATTTCGCTATGCTTTACAAGCTGGAAGTGCTTCACACCTTCAGCTTGGGATGTTTTCATGCTCTACAATTGTGCTTGGCGAGCTATGGTTTTGTGATTTGATGTTACTTTCCAATTATGACCCAGACATGGTAGTTTAGAATTGAATTTTTGTTGCACAATCTTTCACCATATCATGATTATCATTTTCTTCCATGAAACAGAAATGGTGAATAGAATGGATGAGAAGGACAGGGCAAAGCTTACTGATATGCATATAGATGGCATTGGGTTAATGCAAGTGGCAGCAAACCTGGGAAAAATTGAGGTCATCAGGTACTTTGTGGAGGAGCTTGGCTTTGACGTCAATGCTGGTTGCCTCTGTGGTGGTGCGCGCATTTCTTCCAGTGATTAATTGCATTTATTTTTTTTGGATTGTTTTATTAGTTTATTCAAGAAATTATGTCAAGCAAGCTGTTGCGTGACACAATATTTAGTTCATACAATGCTACTTCCTCCGTTTCACAATGTAAGTCATTATAGCATTTCCCATATTCATATTAATGTTAATGAATCTAGATGGATATATATGTCTAGATTCGTGAACATCAATATGAATGTGGGAAATGTTAAAATGACTTACATTGTGAAATGGAGAGAGTACATTCTTTTATGTTTGATTGTGACATGTTATAAATAGTAGCAGCATAAGAAAGTTGGGCTGCTTTAGTTAGCAATCTGCTGTGATTGATAAAAAAAATGTATTTCGGATTTGAGGTCATTTCTGAACTTGTACGCTACTTTCTGGATTTCATTCCATATATAGCATAAGGTACCTTACAGGATTGATATATAGCATCCCATAATTCAGTGAGAAGCAAGCTGGGACATATAGCCTTTCCTAAAATGCAAACCAATGCATGCATGCACTCCGTGCAATGTGCCATTTTGTGGCCATCCTATGGTGAGATGGTCTTTTAGAAGGGACTATCTACACGCCATTTGACAAATTTTTTATTCAAAATCACCTGGATTTTTAAACCTCTCGATTATCAACTCCTAGCTTACATTAGAGCAATACAAAGAAGAAACTCATTAACAAGATTTAAAAGAATAAGTAGTTTCATTATAAAATACAATATGATTATATTTTGTTTGAAAAATTAGAATACAAAAAGTTACATAGAAATCTAAAAAGTTAAAGCGTATTAAAAGTAGTGTAAGAGTATTATATTTACATTGTAACTTAAGACTATGGTTTCTCTTTGTCAACATTGCCTTCATCTCTCTCCCCTGTTAAAGTTGAGTTGTCATCCAATCATATTATTGGGTAGTGGAAAAAGTAAAGGCTGCATGCAAAACATTTGCCACCTATGCCCTGCACCTGGGGAACGAGTGAACAAGAAAACTTGGTTGTGTCTGCTGCCTGGGGATGATGAGGCAAAAAAAAGGGACATATCTCGAGGTATATCGAACTTTTAAAAAATGACTAATTTTATGCTAAAATTCTGTCGAAGGATTTATAGCAAACCTGATTTCAGAAATTGTATTATTTACCATGCTACTAGGATTTCAGCTTGACCACTAAAATCTTTTGGATGAGAGCCAAGTTGTTGGTAACCTCACAAGGTACTTGTCTTCATTGTTGTTGTCAGGTGCTACAGCTTTGGGTTGTGCCGCATTGTTTGGAGAAGTTGATACTGTGAGATATCTTCTTGACTGTGGGGCTGATCCTAATAAGATAGATGAGACAGGTCATGTTGCTCTTCATTGTGCTGTGAAAAATGGTCTTTCTCTTCATGCCTACTACTCGGTTTTCTTTTCTCATTTCGTGACTACGGATGTCTTGCTGAACATGAACTGATGGATTTACCGCAAAATTTAACCATCAAATGAAGAACCATTTTGGGTTTAATTATGAAAAAAAAAATTTAGTAATCCATTTTTGTGACTGCTCTCTCGGGGTAGTTTCTACACATTGGATTATAACACTCTCCTATATTCTTTTTTGCTTGACTAGTTTGTTTGCTGTACTCTCCTATACTCTCATACATTGGATTAACACTCTCCTATTATTTGAAGTAAACCTGTCTAAAATATTATCCTCATTATTCTTTGCAAAGTTCTGTTAGCTATAACTTTTTACTGTTTATTCAACTCTTCCCCACAAACGATCATTTTCCTGTTGTCCTGTGTAGTACTATAAAAACAAGCAGTTAAGTATTTAGCTAAGCACCTCACCAAGAGGCCTACAACTCCTGTCATTTTTAGCTTTGGCAAGAAGTTAGTTGGATCTTTTTAGCACATATCCTACTTTTACCTAATTATGTAGTGTGCTAATAATGCTTGTTCTTTGTTATGACAGTACCATGTTGGTTGTTCATTTTATTTAGGGCATGAAGAAGTAGCACATCTCTTGTTATCTAGTGGATCCAGGGTTGATATAGCTGTTGCTCACGGGACACCACTACATATTGCTGTTTCCTTTGGGAAGACTGGGGTTGTCAAGATTTTATTGGATCACCATTCAGATGTAATAACTATATTTCACGTTTTTTTCATTTGCATTATTCTTGTTGCTCGATACAATCTGAATGATTTTTGTGCTTGTGTTCATTCAGTATTTCATGCCTTCATAGTTTATTACTGGCTCTTAACATATTTTGTGCTGATAAATCAAATAAATCATTCATATATTGTTTTAGTCGCGTAAGATGAATTTGCAGAAATATATATATGGCTGTTAAAGCTTGTTCTATTTTTGCATTCTGCAGTAATGTTCCTGCTGAGTTATCTCACTTGTGTAGGGAATGATTTTATTTTCTATATTAAATTTGTAGCCAAACAACACTTCAGGAGTTTGGGGTACCCCTATACTTACGGCTCTTCATTCTACTAAACATGGATTGGATGAATCTGATTCTTTGGGATGTGTAAAGCTGCTTGTCAAGGTCTGGTATCTGCTTCACCTTTGTTTCTTTATTAGTCGGGAATCTATTAGTTACTATTATTATCAATAGTGCTTGTATTCATCTCTTAAGGACTGTAGGCCTGAATATATGCATGTACATGTAGGAAAATAAGGAAATTCCTCAGGGAAAATACGGAACATAGTATATGTTTATCTAACAACCATATGGATTTCTGTACGAAGCATCTCTATATTGCGCATATTAATTGCACAGGCTGGTCCTGATGTGAATTATGCTAGTCCAGGCTGGTGCTGATGTGAACTATGCTTGTCCAAACACTCCCTTGGTGGTGGCCACGACAGAGGGTTTAACTGATTGTATGAAGTACTTGCTTCAGGTTCACGCAGATCCTAACATCCCAGATAAACAGGTGTGTGCCTTTTATTCCCTGTTATTCTCTTTAAAGTTGCTGTCTTCTCAGTGCATGATATAATATAATTGATTTTGAGTACTAAATCATTCTATCAGCTATTCAATTTTTTTTCTATCAGCTATTCACATGCATACGCTTGTTCATCAATATGTGCACAAGTGCACACCATGTATGATTCAACCTGAATAACCTGTTCTTATCCAGTTAACCTTTTATTATTGCCTTTCAAATTTAAGTCAATTAATACTTCAAGCAAGTTAACGTGTCTCTTCATGAGAGTATTCAGGTGGAAACCACCTCCACAAGGTTCTTATTTTATAATCATGCTCGCGATTGTAATTTATTTTTGTAAGTTTATCGTATAGGTTATCTTTCTTCTTTTATTTTGTAGAGCGGACGCACACCAATAGAAATCGCTGCAAGCTTACGAAGAAGAAATCATGTGGAGATTCTATTTCCTTTCACTTCCCCTGTTAGAGCAGTAACAAATTGGACAGTTGAAGGAATTATTACTCACGGGAAATCAAGATTCTCAATGCCCAAGGTTAGGCTTGAACTAAAAGTTGTCAAACCGTTCTATGGTTTTTTACCTTGATGGTTTAAACTACATGTATATTCTAGTTTGCCGAAAGTGATTCTCGCTCTCTCTTATTCACTTGCACTTTCTTAGTTCCAAATCCCAAAGATAAATGGTTCAGCTGATAGTTCTTGCCATGATCATTTTCCCCATTATATGTGAGCTTTCATCATTCAAATTTTAGTCTTGGATTGGAAGTTTGCAACAGTACCAAACTAATCTATATTTAATTGTCAGTTAATGTTATTGTAGTTTATAAAAGAATTGCATGGTTTCTGCTTAGAAAAATAAGATATGGTAAGAGAACTGTTCTGTATGAAATAGTAAGAATCTGCCACTTAAATGTTTACATAATAGAGTTGTGCCTTGCAAAGTCCTCTTTTCCTCTAGGGCTTGTTTTTGTAGATGAGAATTAGACAATCCCTTTGGATTATTGAGGTTTTTTTTTAAGTTCCCTGGTAATGAAAACGTGCTCTGGAGTCTGGATACCTATCAAGTGAAACTTCTGAATCTTTCAGTGCCACCAATATCTTTTTAAATATTGTAGATTGGGCATATGGAAATGTTATGTGTAGCGCCAACAAGCCCCCATCTATCTATTTGCACAAGCAAAAGTATCATTGGGGATTTTTGTTCAATTTACCTTTCTATCCAAAAAGGCCCCAACTATCTAAACAAGCCCTTATGTGCTTTTCTCCTTTGTGCAATCACTGCTGGGGAACCCATCTTTAGTCCTGGTTTGCAACCCCCTTTAATCCCGGGTATGCAACCAGGACGCCCAATCCGTGACTAAAGATGCCCATCTTTAGTCCCGGTTGAAATAACCGGGACTAAAGATGGATCTTTAGTCCTGGTTGGTAACATCAACTAGGACTAAAGTTCTTTTTTTTCATTGTTTTTCGCAGTTTGCATATTGATTTAGAGCCAAACCCACCAACATCACAAATTCACATATCGAATGAACATATTCAAAATTTCAAATTGACATCACAAAATCACATCACAGATCAAATTGACATCACAAAATCACAGATCGAATGAACATCACAGATCATATTGACATCACAAATTTACAGACGGAATGTACATCACAGATCAAATTGACACCACAAATTCACAAAAACATCTAAACAGTAAGAACATCACAGATCAGATCGCCTGCCGCCTGCCTCCTCCCCTCAGCTGCCACCGGCCGCCGGCTGCCTCTTTCCCTCCTGCCGGATCTGGCGGAGGGGAGGGCGTGGCCGCTGCCCTTCGCTACCACGTGCGCCGCCGCCGCCCGCCTCTTCTCCTTTCGCCTCCTCTTGTGTCGCCGCCTCCTCGTGCGCCACTCACTGGCTTCCTCGCTCATGCCGCCTGCTCACCGGCTTCCTCGCTCTGCAGCCCGCTCCCCGGCGAGATGGATGGATGGATGTGGGTGGTCGGATAGAAGAGAGAGAGAAATGATTTCATATATACAGCTTGAGGGAAGAGAGAGGAGAGAGGAGGAAAGGGAGGAGGAAAAGATGAGGACGGAGTTTGTGAGGAGGAGGAAAGGATACTTTTGTCCTGGTTGGTGTTACCAACCGGGACTATAGATAGTGGGGGGCCTGACACTTTTTGAACCAGGACTAAAAATGATCTTTAGTCCCGGTTGGTGTGAAGGGTCGTTGGGCTTTTGAACCAGGGTTAAAGATTTTTAGTCTCGGTTCCTATTTGAACCAGGACTAATGTGATTTTTGCAATCCCTGGAAAGATCACTTCTCCAGTAGTGAATTGTGCATGCTTGTGTTGCTGTTCCCATGAGGATGCAACTCGCCAGCCAGTTATTAGCATCTGGAGAAGGCTCCATTTTTAGAGTATTATCTATGAAAAAGAAAATGTTGGTATTGCATTTTCAACTTGCACATACATATTGACAAAATATGTTTATGCGCTTATTTCAACTAATGAGCTCAATTTTTCTTCTGAGACATCATTTTTTACATGTGTATTGTGCACATATTTTTCTGTCTTTATGTGAAGTAAACCATATAAGTTGCATATTCTGTAGTTTGTCAGGCTAACTTTATGTTTCAGATTAAGGATGAGCCATGTAGCAAGGTCAATGACAGAAAGATTGAACTAAAATCACTGGGAGGAAAAGCAGTTAAGAGAAAGGACTACCTTGGTGCATCAAGGATATACTCTGAGGTATATGCTTTGCATCTTGTTCTATTTTAATGTTGTATTTGGTGCTATCGTGTGTGTCATTGTTTTCAGTCTTCGTTGTGCTAATAAGGAGCAAAATACATTTTAAGATAAGGGGGATAATATTATGCCAAACTATGTTTTCTGCTTGTTTTATGGCTTATTACTATAGTTTCCAGTTTGCTAAATTATATGGCTATTTTCCTACATCTAATTGTGTCGTGGACACTAGACACTTTAGAAATTTGTGTGCCTAAACAAATTGACCAGTCGGCAGTTTTCAACTTCAAATATTTACCAAATTACTAACCTTTGTATTGTGCAAACTATGCGGTGTTGGATAAAATCTAGGGTAAAATCTATGATATGTTCTAGATGTGCTGAAGTTGTTTTGTTAGAAAAAGGAGGAATACATGGGAGGGGTCACGCATCTTTGATTTTATGGACTGGGACTTCAACCATCATAGTCATTTTATGAATAACCTATGAAGAGAAGAAAAAGGAGAAACTAGACTAAAGGATCTACATAAATAGTACTCCATATTTCCTTTTCTGGGTGCTACAATGTTAGGCAGGTTTTATGTGGACAGTTGAACACTACTAGCTACGGACTCATGATGTGATATCTGTAACTAAATTTTCTCTACTGTTTCATTCTGTTATTGGGCACGTACTCCATTATGCACCTTTATCTTCAATTTGATGCAGGCACTTGAGCTAGATTATTTTGATGCAACCTTGTATTCAAACAGAAGCCTTTGCTATCTACGAATTGGAGAAGTGCAAAAGGCTTTTCTTGACACAGAAATGTGTATAAAACTGCGACCTGAGTGGGTGAAAGGCCACTACCGGGAAGGAGCTGCTTTGATGTTGCTAAAGGTCAGAAAAAATGTTGCAGTGTGCTAGTCACATGTTGCCCTTTACGTCAGCTTGATATCAATCATCTGCCCAATTTTCTGTCCACAGGAGCACAAGAAAGCATTCGAGGTGTTCTTGAATGCACTGAAACTGGATCCTACGAATGCCGACATTGAGAAAGTGTTGTGGTAATGCTTCTATATGTCATGTCTTATGTCATATACAGATTTTGTCTATGGAGTCAGGACGACAAATCATTTCCATCTTCATGTAGGCAGTGCCGGTTATTCTTTTGTATACATATTGGTGGCTGCTTTGCATGTGCGAAGTTATTGATAAAGCTTTACTACCCGGAATAGTTTAGCTACAATGCATTGTTTGGTTCATAATAATAAATGGTAAATTATCCAGCTTCATGATAAAAAAAATATCCAGCCACTGACGTGTTATATTGGTATATGAGGCTTATGTATTTCATTATCTAAAAAAAATGAGGCTTATTTATTTGGCATTAGGTTTGTTCGGTGAATCAGGCAGTATGCATATTTCCTCTACCAACGTTTTAGCTAGCCACTGGGCTTTTCGGCTTCCTTACCAATTGGTTTTAACTTGCGCAGGGAAGCATTGGAGGCGATGAAAAAGGATGATGCTGCTGAAGAGAAAACCTTAAAGTCGGTAGATTAG</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA013333