Os12g0489100
| Gene Name |
Os12g0489100 |
|---|---|
| Description |
Similar to Ubiquitin-specific protease 12 |
| Version |
NM_001073325.1 GI:115488611 GeneID:4352242 |
| Length |
7727 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0489100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:18479396..18487122 |
| Sequence Coding Region |
18479577..18479606,18479870..18479963,18480119..18480269,18480373..18480530,18482529..18482794 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:18479396..18487122 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:18479396..18487122 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgactatgatgactcctccccccatcgagcagcagcagcaggaggacgaggagatgctcgtgccgcaccaggagctccccgccgccgccgctgtcgtcgccgacgccgtgcagccgatggaagttgtggcgcagacagagcctgccaacgcggcagagagccagccgccggaggacccgcagacgtcgcggttcacgtggacgatcgagaacttcaccaggatcaacgggaagaagcactactcggagccgtttgttgttggaggattcaaatggcgtgtgctgattttccctaaggggaacaatgtggaccatttctctatgtatttggatgtcgcggactcggtgaatctcccttatggatggaaccggtatgctcagttcagcttggctgttgtgaaccagatccatccgaagtataccattcggaaagatactcaacatcaatttaatgcacgtgagagtgactggggtttcacatcttttatgcctttgagtgatctgtatgacccaagtaggggctaccttgttaatgacaccgttgttgtggaagctgaggttgctgttcgcagaatggttgattactggacttatgactcgaaaaaggaaacaggatatgttggtctaaagaatcaaggagctacctgttatatgaactctcttctacaaacactgtaccatataccatatttcaggaaggctgtatatcatatgccaactactgagaatgacatgccatctgggagtattcctttagccctgcagagccttttttacaagctccaatacagcgacaatagcgtagctacaaaggagttgaccaaatcttttggatgggacacttatgattctttcatgcagcatgatgttcaagagcttaacagagttctttgtgagaaacttgaagacaaaatgaaggaaactgttgtggaaggaacaattgaacaattatttgaaggccaccacataaactatatcgagtgcattaatgttgattataaatctaacagaaaagaatccttttatgatctacagcttgatgtcaaaggttgtagtgatgtttatgcatcatttgataaatatgtcgaagtggagcgtctagagggtgataacaaatatcatgcagagcagtatggcttacaggatgcaaagaagggagtactcttccttgatttccctcctgttttgcaacttcaactgaagcgttttgaatatgattacatgcgagatacaatggtcaagattaatgaccggtatgagttcccacttcaacttgatcttgacagagatgatgggaaatatcttgctcctgatgcagatagaagcattagaaacctttacactcttcacagtgttcttgttcatagcggaggagtacatggcggtcactactatgctttcatacggcctacgctatcagaccagtggtataaatttgatgatgaacgagtaacaaaagaagataccaaaaaagcccttgaagagcagtatgggggtgaagaagagttgcctcaaataaaccctggtttcaataacaccccatttaaattcacaaagtattcgaatgcctacatgcttgtctatattcgtgagagcgacaaggataaaataatgtgtaatgttgatgaaaaggacatcgctgagcatttgcgg</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTMMTPPPIEQQQQEDEEMLVPHQELPAAAAVVADAVQPMEVVA QTEPANAAESQPPEDPQTSRFTWTIENFTRINGKKHYSEPFVVGGFKWRVLIFPKGNN VDHFSMYLDVADSVNLPYGWNRYAQFSLAVVNQIHPKYTIRKDTQHQFNARESDWGFT SFMPLSDLYDPSRGYLVNDTVVVEAEVAVRRMVDYWTYDSKKETGYVGLKNQGATCYM NSLLQTLYHIPYFRKAVYHMPTTENDMPSGSIPLALQSLFYKLQYSDNSVATKELTKS FGWDTYDSFMQHDVQELNRVLCEKLEDKMKETVVEGTIEQLFEGHHINYIECINVDYK SNRKESFYDLQLDVKGCSDVYASFDKYVEVERLEGDNKYHAEQYGLQDAKKGVLFLDF PPVLQLQLKRFEYDYMRDTMVKINDRYEFPLQLDLDRDDGKYLAPDADRSIRNLYTLH SVLVHSGGVHGGHYYAFIRPTLSDQWYKFDDERVTKEDTKKALEEQYGGEEELPQINP GFNNTPFKFTKYSNAYMLVYIRESDKDKIMCNVDEKDIAEHLR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>182..211#475..568#724..874#978..1135#3134..3399#3479..3697#3763..3871#3942..4057#4389..4487#5901..6010#6447..6521#7382..7460#7581..7727#aatttccccctcccccttcccttccctctccgcatcagcaacccacccccacccctcgccgccgccgccgccgccgcagtcgcggctcccgctccccaaccgaggaatccgctgccaccgccgccgctgcgggcgcccgcgcgcgcgacgtcccgctgcctacgacgtcgcccacggctccatgactatgatgactcctccccccatcgaggtacgcgcttctcctctcctccccctccactctcctctcctctccccccccccccccccacgcactcgcgagcgcgagaggcccgatctcccgcggcagtgttgggttggctccgaggaatccgcgtgccgcgacgggtgttgcgcgatcggggtggggtgggggcgggcgactttggggctagggtttacgcgcggtggccggatctgagtgagtgacatgacatcccccctctctcactacgcgctctctctctcgcgcagcagcagcagcaggaggacgaggagatgctcgtgccgcaccaggagctccccgccgccgccgctgtcgtcgccgacgccgtgcagccgatggaaggtgagactgaccgcgagttcacacagtcctcgcacgcgtgtgctgtgttttattagggtgggttgtgtgggtttaggcgtttttgagatttttatttgctgatctagtacgtgtgtggttgttgttgttgttgttgttgttgtttgtgctgctagttgtggcgcagacagagcctgccaacgcggcagagagccagccgccggaggacccgcagacgtcgcggttcacgtggacgatcgagaacttcaccaggatcaacgggaagaagcactactcggagccgtttgttgttggaggattcaaatggtaacatatctcgcggtcgcggttcctagtggaaatgcggttaccttgggacttgcttgaagcgcggagggttttgatatagatgttctgcctttgcgtgtaggcgtgtgctgattttccctaaggggaacaatgtggaccatttctctatgtatttggatgtcgcggactcggtgaatctcccttatggatggaaccggtatgctcagttcagcttggctgttgtgaaccagatccatccgaagtataccattcggaaaggtattattaccttctttcatttaatgttgtattttccatgtcgtaagaatgctactagtcaatgtatcatggatcgaggtggaacatgcggtgttgtactgatcatttttaaagaatgggacccacaagtcagatgtaactttcactgaggtgattgtcagcaactgtcaatgttctatttcaatggtctgtgtgtatgtttttaagatgctatgtatttactgctggatgtagtttgttggcagtggtaattaatgatgacgtggcacataactagtttctaaacataacaagtcaaaagttgacctagatgcatgagatgtaccataaggcgagatgcggaagtctactagcaaagactttttgtttatcatttcacaatgacaactaagctacaaataaccataaggcatccccttttattttattcctgagataatttaattcttttacatcaggatgcctatattgttaacacatgtaacatgtgcgagtatcatgacttccttttggagtttagttgtacttttaatggacagtttttacttcctaggtaaatattttttttgtatctttttattatttacttatttgaatctgatgtttgccatctgtctgtctctgttggtcttgcacttctggcaattaatggacctagcatctcaactatcgagtgtgcttgttagttcctgcagttgggtgttagtctatggttcaacgttcatggagtttataattattagtgtcaactgttagttggactgtttattgctatgttaatagtgttgctggttttgttgtttttctataccgaacaattcttagtaggattttggctgagtgagactttgttatgatgtttacacatcataattttatatggatttgaatattttcatatgtttcatacattttgttccattatgagtaaataacacctgatagttttgcctttaattttctgttcagttactattgtttcttcagtttgagctgttaagtcttaatcatgtactatttaggagtgttgagaagtttttgtatggcactagaaagttactttagctgaaatgccaatgcaatatgtgcactccttgaacaccactacttctcaaaaacttaacttatttgccatgtctgtcaatgctagactgttaaacccaaaattcctatcagatatttacccatcttactctatatctcctcccttcatcctatattggtgcattgctatcttatctgcctttggctgttgagcaattccagcatcttcaccatttcctcctccagttggctagaacactatgagggacatgaacttgatagcctgggacgccattcccacaaatcacccctgttccttctgtgtcaacttcttgtttctatataagctcatccttttaattcccttcatcacaatggcatgcgagttccaatttccatgttccaacttctgtttcctctctccttttccattacattagttattataggcctgtgcgttgcaactgtattttttttattcagtatagtggaaggatttggatagggtgggctgtttggttttttataccgtagtttttttttttttttttttgaggaatcagtctttaagggtgaacggtttttatgggagggaagaggttttaggaggaagtgggggagggggaaggaggacgactccctcttttaagtagtagaaatgtacatgaggggaaaatggtctcatgaaagccccttcgtgcggttgcaccctaacttacaaaaactgatgagtattggccaacaggtttagttttttaagaacagtagtggaatagaagggagcattcattctgcaagatcattgcagagatttgagaacttcctactgatgacatgcttcctcaatgataaaatggatattgagaacttctaattttttctatacgtggaaataatgaaagccttttgtattagcagcgattgacttgcacatgttgcttacatgtttggcagatactcaacatcaatttaatgcacgtgagagtgactggggtttcacatcttttatgcctttgagtgatctgtatgacccaagtaggggctaccttgttaatgacaccgttgttgtggaagctgaggttgctgttcgcagaatggttgattactggacttatgactcgaaaaaggaaacaggatatgttggtctaaagaatcaaggagctacctgttatatgaactctcttctacaaacactgtaccatataccatatttcaggaaggtctgagatcattactttttcctagtctacatgatttgttaagtacctgaacttaagactaattgaaatttcatcttaggctgtatatcatatgccaactactgagaatgacatgccatctgggagtattcctttagccctgcagagccttttttacaagctccaatacagcgacaatagcgtagctacaaaggagttgaccaaatcttttggatgggacacttatgattctttcatgcagcatgatgttcaagagcttaacagagttctttgtgagaaacttgaagacaaaatgaaggtgaatattataacaaacattttattatatgtctacgatttgttattaactttgcgttgacccaggaaactgttgtggaaggaacaattgaacaattatttgaaggccaccacataaactatatcgagtgcattaatgttgattataaatctaacagaaaagaatccttttatggtaagctttttcacattgaacattcagtatcatttttaatttagtgcttactcatgttataacattgcagatctacagcttgatgtcaaaggttgtagtgatgtttatgcatcatttgataaatatgtcgaagtggagcgtctagagggtgataacaaatatcatgcagagcagtatggcttacaggtactgacaaatcctgcactccgaagttgaatattttgatgtagtgaacttcttagcaggtttttttgggagtacatgatacatgtggagtaaatttaggttattacctctttttttttttgtttagtaaaataataactctgtaatgttggtgtgtacttgcatacagtttattcattgaggagcgatttcctttaatgtagacataaaattaaaagatgttaatcatctgattttccaagttaatgaatggcaatatagcatacatgccatgattatattttcttaccttgatactgcattggcacttgatattctgtaatcttttcaggatgcaaagaagggagtactcttccttgatttccctcctgttttgcaacttcaactgaagcgttttgaatatgattacatgcgagatacaatggtcaaggttggaactgtggcacccttacctttaaattctgaagtgtctatatttcctttacatctgtctgtaattatattgttgtcttgtttcaagtagattcctcaaaatactgttattttcttctgcaatgataaacatattgccatttcaggtttagcattgacctagttattgtttttagagtgaagtacatgggcggtcccgaaacttgtgccagtgtgtcatctaggtccccgaactcctaaaatgcatttttaggtccctgaacttgtcatgtgtgtcatataggtccaaatgggttctaacctgctccatagcgctgacgtggcaatgccacggtgacacctacgtgtcagtggaatccacatggcaagcatatataaaaaataaaattgaaaaccatattttctcctcttagatagacagaaaaaaagataaaaattctaaggtagagaggagaaaatatgtttttctaattatatttttttctatgttactgacacgtgggtccgactaatacataggcgctaccatggcatgccacatcagcgcatggaagaggttggagcttgtttggacctatatgacacccaaaacaagttcgaggacccgaaaatgcattttgagagtttagggacctaaatgacacaccagcacaagtttagggactgcttgcgcacttcactcttgtttttatgaaggcatcaaacatgctttcataggtttaatcatttgacgctgtgttttctgaacttctcccataacatataagctggtagcgatttttttcctactggcattactacttacaaactaactaaaacaacattgaagaattagcaaaaaaaactcaaaaaattgaatgggggttatatcggactgtcatctgatgataagctcttgacaacaatgatcacatccactactagctccttgaaattatcaactgtcattttcgcagtggtgcgcatgtttcacatttttaggtactaaccagtttggcactaataagatcaaatctttattttgcaaccgaatcaaaacaaacttcatgttctatcttggctacaactaaaactggttttctgggtgggtttttcacaaatcaggcagttctcaccttttgggagaaagcatgctagggtggtaagggataaacacttgttaccacgttttggctttgctttagaactatactcatcagtaagcagatagttatgacggttttttttaggtcagtaccatattttcttcacctcgttacttttttgctaggagcagtctatgtttgaacacttctttttgcactttgaagcaattaagtaattaacgtgatatctatcctcttatttctcatataataattatggaaagttcagcaacaaatcgttgattgattaacgtccaattctgcagattaatgaccggtatgagttcccacttcaacttgatcttgacagagatgatgggaaatatcttgctcctgatgcagatagaagcattagaaacctttacactcttcacaggtgtgattttatcttttttttagtaaattttgtgattttatcttttttttttttgtaaattttatcagttatgtgaatacttttatattagtcacagcagtcatgaacaaaaaaagtcatatacgaggaattcaaaccaatatagcacttgcatatagcgctttggtttctgaaataatcgagccaccatgttttttgctgatttgatatttattattgcatatatcatgtattaggcaagatcttgaaaggagactgtttgataatttgtatttgtgacttgtgagcactgccatatcatatagatgaacctgaaatggagaaagctatgcgaatttgaaaaaatatattcactagtacatttgtttctatgacacgtctcagctaaacgtcaactgtattttcttggtgctaatgttgctgtgcttttgctcagtgttcttgttcatagcggaggagtacatggcggtcactactatgctttcatacggcctacgctatcagaccagtggtgtgtaaaaatttatacctcttgtattgtacctcaatactttctttgagttaaagatattctgggtatattttgttttggtcatgctaccattcacagccatttggtggtagagtaactaaattagcagggtctagggcctggcattcttgtgctcataacatgtactccctctgccccaaaatatagcaacttctagatttcaaaatttgttccagaatatagcaacttctccacccacttcctcatctcaaccaaattacaaatctctctcgtttaatttgtccacctacttccttgtttcaaccaaatcacaaccatcccccatttaagtccacctacttgcttaatcactgtgcggaactccagaaattcttgtatttttgggacagagggagttgctggttgttggcactgaactcacaacgttttcctcatggatgccaggcatggaattaaactgggatatagtctttatactacttaaaaagaactatagttaaattacgcctgttcactactacccatcctagcttcatcaatcatccgagttcagtatcttcaatctgtaatcctcaattgtatgtctgccagcatatattgcacgatagaattaagtttgctaagtagcctgcttgcacatcgacaattgaccatctgcagcaccaatccattgtcttagagtttctgaccataatgtgtcctgtctgatagctaccccctccctcgtccctaaaagagtgtcgaggttcctagctataaagacactcttttagggacagaggcagtatatatctaggtaaacaattctgaacatgccacaatttatgtattcgtttggctgcatgctgtcatttcaggtataaatttgatgatgaacgagtaacaaaagaagataccaaaaaagcccttgaagagcagtatgggggtgaagaagaggtcgtttttactattaataactgttcattaagtgcaattcactgatttagtggttgcagcaatttccctcatcttgtatttatgtcatcatcttatttgtttctcttttggatggaacagttgcctcaaataaaccctggtttcaataacaccccatttaaattcacaaagtattcgaatgcctacatgcttgtctatattcgtgagagcgacaaggataaaataatgtgtaatgttgatgaaaaggacatcgctgagcatttgcgg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
