Os12g0501700
| Gene Name |
Os12g0501700 |
|---|---|
| Description |
Transcription factor, MADS-box domain containing protein |
| Version |
NM_001073355.1 GI:115488671 GeneID:4352275 |
| Length |
9213 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0501700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:19250801..19260013 |
| Sequence Coding Region |
19251097..19251208,19251313..19251425,19251569..19251607,19253841..19253940,19254702..19254766 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:19250801..19260013 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:19250801..19260013 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggggagggggaaggtgcaggtgcggcggatcgagaacgaggtgagccggcaggtgaccttctccaagcggcggccggggctgctcaagaaggcccacgagatcgccgtcctctgcgacgtcgacgtcgccgccatcgtcttctccgccaagggcaacctcttccactacgcctcctcccacaccactatggagcgaatccttgagaagtatgacagacatgagttattatctgaaggaaataatgtgattgaagagttccctgagctggagggaagcatgagctatgaccacatcaagctgaggggcaggattgaagctctaaaaaagagccaaaggaatcttatggggcaggaacttgactcgctgacactgcaagatatccagcagcttgagaaccagatagacacttctctgaataacataagatcaagaaaggaaaagttgctgatggagaaaaacactattctggagaagaaaattactgaactggagacactgcatacatgcatcagggcgtcacccactaaagctgctgctcctcctgcctgcaatactgctgatgcatttgttcccaacctcaacatctgctgcggcgattccggcgagccggaaaccgtgacggcgccacttggctggaccagcagcaacaatggcttgccatggtggatgctccagtcatcatcgaacggcaagagctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGRGKVQVRRIENEVSRQVTFSKRRPGLLKKAHEIAVLCDVDVA AIVFSAKGNLFHYASSHTTMERILEKYDRHELLSEGNNVIEEFPELEGSMSYDHIKLR GRIEALKKSQRNLMGQELDSLTLQDIQQLENQIDTSLNNIRSRKEKLLMEKNTILEKK ITELETLHTCIRASPTKAAAPPACNTADAFVPNLNICCGDSGEPETVTAPLGWTSSNN GLPWWMLQSSSNGKS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8806..8917#8589..8701#8407..8445#6074..6173#5248..5312#5019..5103#1..188#atggggagggggaaggtgcaggtgcggcggatcgagaacgaggtgagccggcaggtgaccttctccaagcggcggccggggctgctcaagaaggcccacgagatcgccgtcctctgcgacgtcgacgtcgccgccatcgtcttctccgccaagggcaacctcttccactacgcctcctcccacaccacgtacgtcactatcactactcctgctgcattttccatacaatacgtacaaaataacaaaagcagtagatatatatagttagctcaattaatatgatggattatttcagaaacatttaacttctctctctctctctctctctctcttccctggcatgcatcgtccatgtatcaaattaaaagatgatcaagaatgcaatgtgaaaaatatataacaacccgtgtacacctgtgagtttacaaatacaagcatttcaagcgttcataatttatccatccataaatataagtgttacaggatatactacttattctatcgtctatcacccttctttcaaacttcctccggatgcatgcatatcgatccctcattcaacaagggatattttagtcgctaaacaaattataaatacctatattaattcatcgatagagggggagttagcaagtactccctctgtcccacaatgctggtcgtccaaggaatgtagagaaaataattgctctggatgaaacttaccaggatgccccaaaacattagttgcagtagtcattttaacacaagtacaccagccacataatggtgccatacacctaatttgaatgctttggcacctagaaatttgacaggagcactagatggtgctagggatgaaaacggagcggatacggacggataatgctcataccatattcgttttcatattttttaccggatacgaaaacgaatacggatagctcgaatacggaaacaaatacggattatctcgaatacgaataagaatcgaatatgatcggacacgaatacggaaacaaatttttctcggaacacgaaaaccaactcaacttctaatggaaacaaatatcaacatatataattagctcattttatataaaatgaggtataatttataaatattttttaaaatttaaataatattaatagtatggactagtgttaagagataaactactattaaaatctataaacgtatattgaaggtcatagagttagaaagaaatggggtatgtctcatgggtcctgcggatatccgaatagcactgttcaccggatatccgaattattatccgtatccgacagaaaccttggtaccatatttgtattcgtatccgggagaaaatatccgtattcgtatccgtatccgaactatccgagaattatctgatccgaaaggtatccgtatccatttttgtccggagcggacggaaactatccgctccgttttcatccctagatggtgccacttttctgcgccattattactgccgatgggcgagtacaacgtcaaccattctaggatatttgttagccagtaaaacgatctcctttgtgggagggaggaagtagacattgtacacttcatagggcctgtttggagaactatctcagggatatttttttgctaaagattatcccaccaaaatagccctcttgctgtttggatccaagggctatttagctattattgtaccatcccaatcatttgtctccactaaaagtatacaacagccggatcttctatagctaatccaatacaggcacatacaagcatacacaattccttacaagcacaaactcataatttgtctcaaatgtataagcaagtccgtaaaataattgcacgccaaccgcggcccccacgtccgcggtcgcggccacagttggttgccatggcgcgttgccgacggcgacccattgcccctgatgaggagctgcctcgcccagggctgccgccgacgatgcccgatgacgacccaccatttccaccgtgtccagcacggtcacctgccgcgccgaagttgagccggcgggagcgcggtgcaccacgagacggcccggcgggcgcgtggtgcaccacgagacggcccggcgccctctcgaccagcccttactcccagagagcgtggtgcgcggatgggagggagaccggagcctcggccatggccagctccttcctcgccgccaccctggaggaaggcactgtactcgtggaggtgagggaactcctggcccgacgacgcctgggtgttgaggtccagcgtgtccacgccggtgcggggaacggatccgtgggaagggccggacgccgacggctgcgagggccaaatgttgccggcggcggacgaaatgggatcttgggagaagaaatcgaagccgttggggtccatctccgcgcggattcggtgcacagcgatgcgtcgacgacggatctgatggccggcaacgcgggtggggtgagttgccagtgtggatgcctctcggtggatctgaaggaaggggcagcgcgattcgagggagagggcggcgcgggtgaagggccgggcggcggcgtgggtggggggagggggaggagaagctagggccgggcggcggcgcgggtgtggggagggggaggcgaagctgggccgggcggcggcgagggttctagagagtgagcgggggcgacagcgagcgggggcgaaatgcgatgggttttgccgcaacgggatcggcacaagtgggggaaagtgggaatcggtggggcccacagcaaaatagccccaattagcacccggtgggggtgataattttttggggtgggctatttgcaaatagccctaaaatagccctcctgtttggatccccttgagctattttggggttaaaaggggtgggctaaaaaatatccctaggatccaaacaccgccatagaacgatattatgcatagagattctccttactatcttgtaccaccggtaagtacacggcaataatttgctgagccagctttatttcctcttatgggaactgttatacctgcccaggggtactatttttggtagatgcatgtcggccccattcttctcttgtcctagtatatgcagtattaccttagtcctattgcatatactacattcgtcctattttaagtgcatctatagtttttcgtgcctaacttcgattgttgtcttatttagaaaaaaaaattaaaaatataagtcacacataagatacttatcatgttttatcatcttataacaataaaaatactaattataaaaaaaatttaaataagacggacgattaaaattggacacgaaaactcatgggctacactaaaacgagacggatagagtagtattaatagagtagtattaggaacagccttttgacttgtctacggcaatgcacaaatagtaatcaatataatctaatcatatcttttattgataggaacaattgtttgcacagtactgatatatgtatattttttttcatgttatttcagatcatatacatgaaactcataatcaaccttctattctgttgatttatataattaataatttgaatctgtagacaatccagatcatgctatatggagtataacattattaattgcctctttgtaaataaccattatcagaactatatattcatcttcaaactttgatcactactcgttctttaaaagacaaatacttaaaaatgtattatcaaagtgtgccgcattaatcgtgaaatagttttcgtttatcatagtctaaccatttgcaagatattagatgcatcctcttgttttctctcaatccctccaactcaactcaaattgtactcagtgatgccattccttttacacaattaattgcatgatgttacacttacacaccattgtttacgccctaacgaaactaatgtgtagtgcacgtaaaacgaagcgattcattagcgcataattaattaagtatttagttttttttaaaagggattaatatgattttttttaaaacaactttggtgtagaaattttttttaaaaatgtactgtttaatagtttaggaagcgtgcgcgcggaaaacaagaagaaggaagttaggaaccgaagtaacaaacacaaccttagggcactcccaaccctccacctagtatgatgtctatggcattaactacattgccatgtaggacttttagcttatgtggcactatattaattaagagagagggagtgaagagaggaagaaactgggtctcatgcaagacacagcttcaacacgagaacctatgcactagacactatcaagttttgcattgggagagaatagtgtcttcataatagatgaaaaataaatatgattggtagagaagagatatgatgtatttattaatggtctattattttaagaaaccatggattatatagtgtagtgtgatttcttattgacatggcaccatagacactgcttatggacaatatggattgggactgtctttaatccaatcaaaccaaggccaccccgtgaatgttcactgcatacgcatagcactattcacatgagacagacccatggctgggcctaccaaccgtcacatattgatctggaaggacatgcactattcagcgcgtgtgagatgcccaatcaaagaaataactgaaattgatgtagataatttgtttacttaaacaccgtgggaacgctggaaagttaggggtgccacgtcagatgttacttttgtaaaaaagcccccgcagttctgttaattatgcattggtccccgctgataatttatagtataaattagctaggtttggctatcgttgagcattggccgaaattctattctattaactaaacaaattagctaggtgacttgaagtgaagtgagtgtactcaccatccaattatagttaattagggtctgtttattttgttgccactttcgattcattaatattcatgtgtgagggcgggaatattgtgaacattttaagttagttttttttattagaggaagtatatcctaataattgattctcatattttattgatagtatggagcgaatccttgagaagtatgacagacatgagttattatctgaaggaaataatgtgattgaagagttccctgagctggaggtgtgtacgtaggaaggggaaatgttcatcataacatttgtacattcatcctgtataaatatgcactacattatatatcactatatctgttcaatgtataggtagtaaacaatttttagtttacatcttctgtgttctgcgcagggaagcatgagctatgaccacatcaagctgaggggcaggattgaagctctaaaaaagagccaaaggtaacaaaaaatctagacaaaactaatagctcttcaatttttcccttttctgtatttaacaaatcaactggcctttccaatgtagtatgccgtgttagtttcaatatacagaaaataggaacagtatctgtggatacccaaaatatgctacatatttctgtaaacttttattggtttattaataagtattaattaatcaagaagagggatatttaaaaaaaattaaaccctgcaacatactcttctgggaaatgatcaatcttttttacctggtgggaaaggatgatcatattatttttagctcgattatttgtcgacacatatactttattgaacattgttgatcagctcagcatgctgaatatatatggccttgaatcaatgcattagtctgaaaaaaaataggtgcaaagcatctttctttaataaaaatgtaagtgcaaagtatcttcatcttcttgaatcttggtactagctagacagtggattctttattgatggctcaagtttgtcactgtcaatacaaccggtaaaatattacaatcaataaaaccttttttttaaattaaaaatgtcatatatgtccatctagtttgatcttatatatggatttggctcaaaagctgtctgggaatcagtggacaaatgctaaaacgcagacacctattcttgtcaaatgtatatctcctttgtacttgtgatgccctagttgttggcaggatagggacctcatgctctcatacttgtcatccatggctcaggaatcttatggggcaggaacttgactcgctgacactgcaagatatccagcagcttgagaaccagatagacacttctctgaataacataagatcaagaaaggtacaaacacacacacactgaacttatagaactacaaaaatatgtttacttgagatgatcatattgtgtggtgttgctaatggtttttaatttgtaactaggaaggtaacccgcgcgaggcatgtgttgtacactaagtttgagatatttataagagcaaaatattgaacggagaacatctagcacaatttctccataaattgttttcatcggcattaattgcttttataattttataacctattagttttatattgtatcatatttaaataatatctattagaaattatttataatcttctttatcatttgaaattaagagacttattttttttaagaaaacatgttaacgaaagtaaaaatatggtgtttttgaaattacatatctatggaccatagttcattaaaggattaattaggtggaagatgaagctccactaaacttttgggtttatatagtctaatatggttgatgtagtttgagaggcaatccatatatgaacatttcatgtagggtgggtgagaggctccatgcagcctaacatgaatacgataacgacgaaatataattgcgcagtaatattttaaaaatattatgtaccatgaataaattcttttttttaggtaagatagatttaacgattataactaatagtttaccggtttaaaaggcacatgagtattgcagaatgtagcttaaaaattatggttgttttaatattcaatgttattgcgaagtgagcgcacctcaactggttaggtttcttgtggtggaacttgcccactcggattcaagtcctagatttgatatgggtgttggcatttacgactaattattctttcagtggtaggtgacgtatccatcgacagcgagacgacatggtaacttcttcaatcttaaaatatgtcggctcagtctttcggaggtactaaaggggtagggtgcgtagacgctgtgtttctaagagatttccaatattattaattgtttccgctaaaatctatttatttttttcttaaaaatgtatggattagtttttgtcaacaattagtgaacaatagctagtccgtagaatatatatctgatccaaagtaatgaatttttttaataatatagttaacttggttctttagttttaaattttatagtaaataatctaatttatctcctacttatgctacattcgatctcattggttgagcttatgtagggcacacaaaacgatataggccattaacgcatgattaattaagtattaaatattacaaacgtgaaaatagtttttttttttaaaaaaatgtatagaatgtatttgcacaacatgcgcagattagtagtttaaatgaggcataatttttagacaatacattatttatttctgtttttgacaatatgtcctgagtaatttattactcattatttcatcttgaacaatcaagatacgtttttttgatattttatattatattatagatctacttttggctgtgcaagtttgtaaagtaatatatttttcttatactaccaccttcactaaatatatgacgttggtcatcaatatataaaaaacaataaaaaaaatacaaaggaagtacaaagagcgttcttttctttcggtagtttcactaaatatggccgtcataagaaaatacagagaagtgcaaatccacctttaaaaaaagcgatgttttttttaatttccagtagtacgtacgtatacagttttttttttctgtatattatttcttcttttctaggccgtggttgttaatccgtatgtacgtatgccttctcagctttttctagtcaatttttttatggaaagtattgctcggtaaattaggaggggtagattactatttataacagatctaatccaatggtgtaaactaatgggtccaccaacttaaatgaaaatcgagggctagattttttttcttttttattagaatttctaagttttttctattttattattgcgccatgtggcagcttgagagcgtttttagagcaccatgtggcagtatgagagcgtttgtaggaagtttaatggacttttagtatataataatagaagatagatagatagatagatgttttagaacaatctcttgctcaagtcgatcgccgagctccgacagaaggcaaatgctaaaaaccttttgattcttaaacttgtaggtgaaatggttataaatcttcttaatgttagtcttttttgtctctctccaggaaaagttgctgatggagaaaaacactattctggagaaggtattctgttaattttactgatggaatgagaaagcatatcctaattattttcagttaccactgcatgattcatgtagctgtactcagctcaactgaactgaatcactaattttgtgttaatttgtccatgaaaaaaaaaaaagaaaattactgaactggagacactgcatacatgcatcagggcgtcacccactaaagctgctgctcctcctgcctgcaatactgctgatgcatttgttcccaacctcaacatctggtgagccacaccatccaactgccaccatgcaatgcttgccatgttgtttcttcagattcacctcaactgaaactctgatacctggccttcaaatcaaaccgcagctgcggcgattccggcgagccggaaaccgtgacggcgccacttggctggaccagcagcaacaatggcttgccatggtggatgctccagtcatcatcgaacggcaagagctagaagatgttcagatgaaatggtccctgcagccattgcatggttgctgaataatgtcgtcccagatggttaggcaagcaacctagctagaactttcagttagtgagcggtagtagtatctcccccttcttaatccctactatactccgtagattaattctaagcatccttttgtttccattatctacgctgctggtttgatgaaattcctgtgttgtattcagctgcattgggatcattgctcagcctttggtcatgtctctcactggaatcaatgtgtcatgtctgtcttgcaatca</dnaseqindica> |
| External Link(s) |