BGIOSGA013889
| Gene Name |
BGIOSGA013889 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013889, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0096I06.12 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA013889-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA013889-PA |
| Length |
5198 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:39476734..39481931 |
| Sequence Coding Region |
39476734..39476819,39476903..39477000,39477127..39477265,39477360..39477388,39477504..39477600 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:39476734..39481931 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGACGCCGCAGCTGCAGCCGAAGCAGATGCACTGGGCGAGGGCCGACTCCTCCGACTTCGGAGGCCAAATCCCCGCCCCTCGGAGCGGGCACACGGCGGTGAGCATCGGCAAGTCCAAGGTGGTCGTCTTCGGCGGATTCGCCGACAAGCGCTTCCTCTCCGACATCGCCGTCTACGACGTTGAGAATAGGATTTGGTACACACCTGAATGCAATGGGAGTGGCTCGGATGGACAGGCAGGCCCCAGTCCAAGGGCCTTTCACGTAGCTATCGTCATTGACTGCAACATGTTCATCTTTGGCGGCCGATCAGGCGGCAAGAGATTAGGTGACTTTTGGATGCTCGATACTGACATATGGCAATGGTCAGAGTTAACCGGCTTTGGTGATCTACCATCACCTCGAGAGTTTGCTGCTGCTTCAGCCATAGGAAACAGAAAAATTGTTATGTATGGCGGTTGGGATGGCAAAAAATGGTTGTCGGATGTATACATCATGGACACAATGTCACTTGAGTGGACAGAATTATCAGTTACTGGATCAGTGCCACCTCCAAGATGCGGACATTCTGCCACAATGATCGAGAAGAGGTTGCTTGTATTTGGTGGCAGGGGTGGAGCTGGGCCCATAATGGGTGATTTATGGGCTTTAAAGGGTGTCACTGAAGAAGATAACGAGACACCAGGTTGGACACAATTGAAGCTCCCAGGACAATCTCCATCTCCACGATGTGGTCACTCAGTAACATCTGGTGGACCTTATCTCTTGCTGTTTGGAGGACATGGAACTGGTGGTTGGCTAAGTAGGTATGATGTGTACTACAATGAATGTATTATTTTAGACAGGGTCTCTGTTCAATGGAAGCTCTTAGCAACAAGTAATGAGCCACCCCCTCCTCGAGCATATCATTCTATGACTTGCATAGGGTCTCGATTTCTTTTATTTGGTGGCTTTGATGGGAAAAATACATTCGGGGATCTATGGTGGCTTGTTCCTGAAGGTGATCCTATTGCGAAACGAGACTTGGTTCCTAATGTTGATTCAGACAGCAAACCTAGTAATGTGACTGGTGGTGCTCAACATTCCGCATCACAGGAATCACAAGCTGGGGAATCTCCAATGATTGACTTGGCAAAACGATTGGGCATTTCACTTTCTTTAGAAGCTTCAGCAAGTTTTGTTGACGAGATCAATGATAAAGAACTAATTGAATTATCATCTATGCTTTTTGGTGAATCACCCCCTACCGGTGACCAGCATGCATGCATTCAGGCACTTCGTGATCATTGGACAAGTATTCCAGCCAACTCAATACAGCTCCAGGAGCTAGGCCCTTTACTGAGGGATTATCAACGCCTCATTCTTCGCCGCTATTTGGAAAATTCATTCACGTCTTTCTATGAGAAGGAAGTTCACCGCTTCTTCCATTTGAAAAATGCTTCCGAGTTACGGATGGATGACATCCCCATCTTGTTGATGGAGTATGGAAAGCTGCTTTCCACCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTPQLQPKQMHWARADSSDFGGQIPAPRSGHTAVSIGKSKVVVFGGFADKRFLSDIAVYDVENRIWYTPECNGSGSDGQAGPSPRAFHVAIVIDCNMFIFGGRSGGKRLGDFWMLDTDIWQWSELTGFGDLPSPREFAAASAIGNRKIVMYGGWDGKKWLSDVYIMDTMSLEWTELSVTGSVPPPRCGHSATMIEKRLLVFGGRGGAGPIMGDLWALKGVTEEDNETPGWTQLKLPGQSPSPRCGHSVTSGGPYLLLFGGHGTGGWLSRYDVYYNECIILDRVSVQWKLLATSNEPPPPRAYHSMTCIGSRFLLFGGFDGKNTFGDLWWLVPEGDPIAKRDLVPNVDSDSKPSNVTGGAQHSASQESQAGESPMIDLAKRLGISLSLEASASFVDEINDKELIELSSMLFGESPPTGDQHACIQALRDHWTSIPANSIQLQELGPLLRDYQRLILRRYLENSFTSFYEKEVHRFFHLKNASELRMDDIPILLMEYGKLLST</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..86#170..267#394..532#627..655#771..867#958..1013#1124..1231#1353..1409#1909..2000#2639..2723#3658..3810#3950..4044#4187..4363#4451..4554#4960..5029#5139..5198#ATGACGCCGCAGCTGCAGCCGAAGCAGATGCACTGGGCGAGGGCCGACTCCTCCGACTTCGGAGGCCAAATCCCCGCCCCTCGGAGGTAATCCTCTCGATCCAATCCACCTCAAATCCCCGCCGCCGCTGCCGCCACCTGAAACCATGTGAATTTTCGTGCCTCTGCAGCGGGCACACGGCGGTGAGCATCGGCAAGTCCAAGGTGGTCGTCTTCGGCGGATTCGCCGACAAGCGCTTCCTCTCCGACATCGCCGTCTACGACGTTGGTAATAAGCCCCACCGCTTGCTTCGCCTGATTGCAAGTGCCACGATTCAGACGATTGATTCTGTTTAGATAAGAGCGCTGAACCTTATTAGCTGTGTGAACTTCCGGATGCAACTCGTGTTTGCAGAGAATAGGATTTGGTACACACCTGAATGCAATGGGAGTGGCTCGGATGGACAGGCAGGCCCCAGTCCAAGGGCCTTTCACGTAGCTATCGTCATTGACTGCAACATGTTCATCTTTGGCGGCCGATCAGGCGGCAAGAGGTCTGCGATTCATACGGCTATTTGCTGGGATTTGAAAAGCACCCTATAAAGAATTGCCTTATTTGTTGTTTATAACATGATGTTCATTGCGCAGATTAGGTGACTTTTGGATGCTCGATACTGGTAAACTTCTATACTTTCTCAAGCATTTTAAGACCCCTTCCTTAATTTGTTTGGGCGTATAGTGGAGGTTCCCGTGATTACTAATAACCGTCATGTTGCCTCTTTCATATTCCAGACATATGGCAATGGTCAGAGTTAACCGGCTTTGGTGATCTACCATCACCTCGAGAGTTTGCTGCTGCTTCAGCCATAGGAAACAGAAAAATTGTTATGTAAGCATTCCATCTAATGCAAGTTTCCCTTTCATTTCTGGGTACCATCGCTTATGAGTTATGAAGAACATTTGGTTCATCCTGATTCAGGTATGGCGGTTGGGATGGCAAAAAATGGTTGTCGGATGTATACATCATGGACACAAGTAAGTTAACTTCCTGTTCTTATTCAATCAGGGTTGAGTATTTAATTTATTTTGTTCAGGATGGCAATAAAAAAATCAATCAATTAATAACTACACTCTCTATTGGACAGTGTCACTTGAGTGGACAGAATTATCAGTTACTGGATCAGTGCCACCTCCAAGATGCGGACATTCTGCCACAATGATCGAGAAGAGGTTGCTTGTATTTGGTGGCAGGGGTAACTTACATTTCTTGACTTGACTTGTATTTGCTGATGATTTTTAATTATTAATGAATCAATGCATAACTTTTGGCCATCAACATATATTTCTGATTATTTCATATATTTTTTTCAATAGGTGGAGCTGGGCCCATAATGGGTGATTTATGGGCTTTAAAGGGTGTCACTGAAGAAGGTACATCTTCCTAGTTGCTTGTAAATCTACTTATATTGAGAGGGAAGGAGGGTGGGATACTAACTGCTATTTAAAACTGGAAAACTCAACTATTTGCCTGGGAGGGAGGGGGAGAAGAAGAGGAGTGGCCGAATGGGGAGGTCTCAGGCCATCCTAACTGCTATTTACAACATCTGACACACAATAGTTGGTGGTTTAACCATTTGCCTCTCAATAGAAGCTTACTGTAGTTGATAATATGCCACTTAATAGATGTGCACACTCCATGTATTGCCCACTTTGACCAAATATTTTTGCATGTTTCTCCTGTTGCAATGGTGAGCCCACATTTATTTTTGTTTTAATAAACTTGCCTTTCTTAGTTGATGTTAGCTATTGTTAATTGGAAATGAAAAACCTGGTTATTGCCGACTACTGAGTGTGCTTACATTCTTATTCCTTCAATGAGATTACACAATTTTTTGATTGCCAGCACCTGATGTTTATTTTATTTTGGAAGATAACGAGACACCAGGTTGGACACAATTGAAGCTCCCAGGACAATCTCCATCTCCACGATGTGGTCACTCAGTAACATCTGGTGGACCTTATGTATGCAATTTGGTGTCCTTATATTTGCTTTCATACCATTTCTCTTTCTAGTTGCTTCGTATTTAATTGCTGATATCTCAATTGAGTATTACGTACTGCAAGTTCTCTCAGTTGATCGTTCTGTTATACTAGAATAGGTATCAGAAACTATTGCCCAGGAGTAGAAATGGAATGCTGGTTCACATTTAATACTTGTTGACACAGTACAAACAGCAAACTAGGGATGCTCAGTGTTTTGCCATCACACTATTCAATGTTGATGTTAAGTTTTCTGCTACAATGAATATAATGGTTTTTCAGTATATGACATACTGTAGTTGGTCATACCAAAATTTTTATTTTTTCAAAGCCCGCCTGTCTTATTCTTTACTTGGAGACTCCACAAAGTAATGCTTTTGTTCATACCAGGTAGCTTTGCAAATTTACGCTATCCATCAGTTCTATAGTCACAAAGTAATTCTTTTGTTCTTTACTGGGTAGCTTTAGCAAACTTACGCTATCCATCAGTTCTAGAGCTTATGTAATTGGAAGATGGGTTTCTTCTCCTGGAACTATCCATCAGTTCTAGACATTTTGTTGTCCAAACTTTTAATTCATTGCGCAATAGCATTACTAACAACCATATATCTTTTGGTTAGCTCTTGCTGTTTGGAGGACATGGAACTGGTGGTTGGCTAAGTAGGTATGATGTGTACTACAATGAATGTATTATTTTAGACAGGGGTAAGCACCAGCAAATTTTCTGATTTTTTTTTCATGTTGTTGTGAGCATGCATTGGGATCATTGATATGGAATTAGCATTACATTTTTCTTGATGTCAACACATGCACTTATTTTGACTGTCTTGTTGACACCCATCAGTTACATGGGCAAAATCCCTTATATCATGGGACGGGGGTAGTAGATGGTTTTCATAATCACAAAAGAGTGCAATCAGTGCATGCTGGTAACTAAAAAATAAGATGTGATTCCACAGTGATACAAAATCTACTTCTCATACTAAGACAGAGTAGCTTTGACAAAACATTCTTTGCAATATAACTGCAAACAAATCCCAACATTGATCAAGAAAACTGGAAAAGTAAGCGGGTTAATATGGTACTCTTGATCGTTACTACCCGAACAAGCATTAGGGAAGACAGCTAGCAGGTGGTTGGGGTATCGAGTTATCCTACTACTACCATGGTACTCAACCACATGCTTCATAGCCAGCTTGGGACTTGACACCCATAAGAGTAATTCTGTAACCTCAACAACTTACAGCAGCAATTATTATAGATACACTAACAGAAAGCATATGTGCTCTCCTCCTTAAGTCATGGCTACCTTACATGTCCTGCACTCTTTGAGGCATTCAGCGCACACATCATATGTCTGCTCTGCACCGCTGTGTGAAATTGTGATCACATGCATCCACTTCCCTGATCTTCATGTTCTAGAGTCCAGACAATCCCAAATATCATGTCTTACAGAGCATTCTGTTGCTTATGACCAGCGGATAGAACTTATATCTGTTAGGTTGTTAGCATACCACTTGGCCATCTAATTTAGTTTTGTACTTTTCTTCCATTTTTTTCTTCTCTTGTAGCAACCAGCAGTACTTATAGTTTTTCATCATCACCAACTATATTTGCTGACTAAAATTTGGCATCTCAGTCTCTGTTCAATGGAAGCTCTTAGCAACAAGTAATGAGCCACCCCCTCCTCGAGCATATCATTCTATGACTTGCATAGGGTCTCGATTTCTTTTATTTGGTGGCTTTGATGGGAAAAATACATTCGGGGATCTATGGTGGCTTGTTCCTGAAGGTATGGTCACTGTTCAACTGAAGAAGATTCTTTATTGATATAATGGAGTGCAGTTTTTATTCTTACAGCTTTACTCCATAATGCTTGATGGGAAAATATTTTTCTTCTTTCTGAAAACTCTACCTGATCGAATGCTCAGGTGATCCTATTGCGAAACGAGACTTGGTTCCTAATGTTGATTCAGACAGCAAACCTAGTAATGTGACTGGTGGTGCTCAACATTCCGCATCACAGGTATGTATTTTTGCGTGCTTGTGTGAGTAACGATTGACCTGTGGTTCAGAAGGTTTCCTGGAGAGTAAAAGTGAGAAACCAATCTGGAAACTTGAGATGATGATAAAAAAGGTATAGTTACTAAAAGATGCACTTATCGCAGGAATCACAAGCTGGGGAATCTCCAATGATTGACTTGGCAAAACGATTGGGCATTTCACTTTCTTTAGAAGCTTCAGCAAGTTTTGTTGACGAGATCAATGATAAAGAACTAATTGAATTATCATCTATGCTTTTTGGTGAATCACCCCCTACCGGTGACCAGCATGCATGCATTCAGGTGCTCATGTCTCAGCTATTCTGTAACCAGATCCAGTCGCATTGGTCTATGAAGAAATGTGATGTTTTTTTTTTGTGCATGGTACAGGCACTTCGTGATCATTGGACAAGTATTCCAGCCAACTCAATACAGCTCCAGGAGCTAGGCCCTTTACTGAGGGATTATCAACGCCTCATTCTTCGCCGCTATTTGTACGGTTCCCATTCTTGCGTTTTCCCTCTACTGTCTTTATTTACACTTTCTTAACCATCTGCGTTTATGTACATCATCCCTCTTCCAGAAAATGAATTATTATGTTTTGTCATGGTGATAAATCCGAGATGCTAGCATAATTTGTTTTGTTTTGCACAAGTAATAGTCACAAGCTGTACATTTGTACCCTTTATTGCCAATCTGTTATGCTCAGCGGTAACACATGAGCATGCATAGTAACCTGATGGCCATTATCAGGCTTAGAGTTT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