BGIOSGA013898
| Gene Name |
BGIOSGA013898 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013898, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0042I09.24 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA013898-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA013898-PA |
| Length |
6220 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:39552633..39558852 |
| Sequence Coding Region |
39552633..39552790,39553527..39553671,39553932..39554051,39554210..39554344,39554428..39554489 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:39552633..39558852 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGCGGCGAACGGGGCGGGGGGCGGAGGAGGGGTGCCGCGGCCGACGAACCCGATGGTGACGCCGCTGCTCACCGACCTCTACCAGTTCACCATGGCCTACGCCTACTGGAAGGCCGGCAAGCACCTCGACCGCGCCGTCTTTGATCTTTACTTCCGGAAAAATCCCTTTGGTGGTGAATTCACCATCTTCGGTGGCCTTGAGGAGTGTATAAGATTCATTGCTAACTTCAAGTTAACAGATACGGAAATAACATTCCTGCGATCTGCCATGCCTACATGCGAGGACGGCTTCTTTGAGTACCTTAGTTCAATTGACTGCTCAGATGTTGAGGTTTATGCCATCCCTGAGGGTTCTGTTGTATTCCCTAAAGTTCCACTGATGATAATTGAAGGACCTGTTGCGGTTATTCAACTTCTTGAAACACCATTTTTAAGTCTGGTCAACTATGCATCCTTGGTTACTACAAACGCGGCAAGACACAGACTTGTAGCAGGGAAGTCAAAGAATTTACTTGAATTTGGACTTAGAAGGGCCCAGGGGCCTGATGGAGGAATCAGTGCATCAAGATATTGTTATATGGGAGGATTTGATGCAACAAGCAATGTTGCAGCAGGATGGTTATTTGGGATACCAATACGTGGGACTCATTCTCATGCATTCGTGAGCTCTTTCATGGGTCTTGATGACATCATTGACAGGACACTCGCTAGTTCTGATGGTTCAAACAAATGCGAAGACTTTGTCTCTCTGGTGCAGAATTGGCTTGCCAGGATTAAGGATGCTGGTTCATTGCGTGGTACCTTTCGTGAAACAAATCTAAGTGAGTTGGCTGCATTCACGTCATATGCGCTGGCATTTCCAAATTCCTTCCTGGCTTTGGTGGACACATATGATGTCATGAGAAGTGGAGTGCCAAACTTCTGTGCTGTTGCTTTAGCCCTCAATGATATGGGGTATAAGGCGGCTGGAATTAGATTAGACTCTGGTGACTTAGCATACTTATCCGTTGAAACTCGTAAGTTCTTCCGTGCAATTGAAGAAGAATTTGGGTTTATTGGCTTTGGAAAAATGAATATCACAGCGAGCAATGACCTAAATGAGGAAACAATTGATGCCTTGAACAAGCAGGGTCACGAGGTAGATGCATTTGGCATTGGTACCTACCTTGTTACATGCTATGCACAAGCAGCGCTTGGTTGTGTGTTCAAATTAGTTGAGATTAACAAACAACCTCGCATTAAACTGTCTGAAGATGTGACAAAGGTATCCATACCATGTAAAAAACGATGCTACAGGTTGTTTGGAAAAGAAGGTTATCCTTTGGTTGACATAATGACTGGAGAAGATGAGCCAGCCCCAAAGGTTGGTGAGAGGCTCCTGTGTCGGCATCCTTTCAATGAATCAAAGAGGGCATATGTTGTTCCACAGCATGTTGAGGAGTTATTGAAGTGCTACTGGCCTGGAACTACATCCGAACCACGGGAAGAGCTACCATCCATCAACGAAATAAGGAGTCGGTGCATGGGCTATCTGGACCGTATGAGGCCAGACCACATGAGGAGGCTGAATCCAACACCGTACAAGGTTAGCGTGAGTGCTAAGCTGTACGATTTCATCCACTTCTTGTGGCTCAACGAAGCTCCGGTAGGCGAACTGCAATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAAAAAAANGAGGGGGVPRPTNPMVTPLLTDLYQFTMAYAYWKAGKHLDRAVFDLYFRKNPFGGEFTIFGGLEECIRFIANFKLTDTEITFLRSAMPTCEDGFFEYLSSIDCSDVEVYAIPEGSVVFPKVPLMIIEGPVAVIQLLETPFLSLVNYASLVTTNAARHRLVAGKSKNLLEFGLRRAQGPDGGISASRYCYMGGFDATSNVAAGWLFGIPIRGTHSHAFVSSFMGLDDIIDRTLASSDGSNKCEDFVSLVQNWLARIKDAGSLRGTFRETNLSELAAFTSYALAFPNSFLALVDTYDVMRSGVPNFCAVALALNDMGYKAAGIRLDSGDLAYLSVETRKFFRAIEEEFGFIGFGKMNITASNDLNEETIDALNKQGHEVDAFGIGTYLVTCYAQAALGCVFKLVEINKQPRIKLSEDVTKVSIPCKKRCYRLFGKEGYPLVDIMTGEDEPAPKVGERLLCRHPFNESKRAYVVPQHVEELLKCYWPGTTSEPREELPSINEIRSRCMGYLDRMRPDHMRRLNPTPYKVSVSAKLYDFIHFLWLNEAPVGELQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..158#895..1039#1300..1419#1578..1712#1796..1857#2076..2151#2532..2633#2786..2902#3108..3166#3747..3921#4565..4699#4792..4890#5080..5188#5918..6030#6143..6220#ATGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGCGGCGAACGGGGCGGGGGGCGGAGGAGGGGTGCCGCGGCCGACGAACCCGATGGTGACGCCGCTGCTCACCGACCTCTACCAGTTCACCATGGCCTACGCCTACTGGAAGGCCGGCAAGCACCTCGACCGCGCCGTGTCAGGATCCCTCATTCCCTTCCCCTCCTCGATCCCCTCTCCATGAATCCATCCTTTTTTTTAGACGCGTGTTTCCGCTGCTATCCGATCCGTCGTGCTCGTCAGCTCTTAAGCTCATGCGACGGGGTGGTGATTTAGGGACAGTGGAGGAGGAGAGGGACGATCGGTTTTGGTGAATGCTCGGATATGGCGTGGAAGAGGCCCAATTGGTTATTGGTCCTGAGTTTTCGATCTGTGTTATGTGAATTCATGTGCGGTGCGGATTCGAGATTTCCAACTAGCTTTTTTCTCAATTTGATGATCCACTTAACTGTAACCACGGGTATTTCGATTCGAGATTTTTCTGTATGCAGATGTTGTTTGAACAACATGTATGTAAAGTGGTAGATATATGTCATCATAGCTGATGTAATAAAGTGAACATAGTGTCCTTTTTAACCTTGTTTAAGAACTCATATAGAACACTATCACCTGTCATGTACTGTGACGTGTGAACAGATAGAGGAGAAATTGAGAAATCCATGTGCATTAAAAAGTCAACCACCATAAGGTTTTGCAAAGGTTATAACTAATCTAATTATCCAATACGGAGTATGAGATTGTATGTCACCACATCACTTCTTCAGTTTGTCAATCTTCAGATTGAATATATCAAATACAATACTCTTGTACCCGCTGATATATTGTCTTGAAAGAAATACCTGCTAATATTTACTGTCACCTTTAATATTTTCAGCTTTGATCTTTACTTCCGGAAAAATCCCTTTGGTGGTGAATTCACCATCTTCGGTGGCCTTGAGGAGTGTATAAGATTCATTGCTAACTTCAAGTTAACAGATACGGAAATAACATTCCTGCGATCTGCCATGCCTACATGCGAGGTAGGAATTCCAAACTTGTAGAGAAAATTGATGTGACATTCTGCATTCTATAAATCTTATGCTCATCAAATTCATGCATGAATGGGCAAATCATTTTGAGTGTTCATACAACTGAAGGGAAGAGGGGGTCCATCCTCCCAAGTGCTCAGGAGCAGACGAAATACACAAAATGTTATAGTTGTCACTAACATGTTTGGTGTTTTGGTAATTCTATTAATATCTTTTGGCAGCTTTTAATGAATATTTATTTATTCTGATAGGACGGCTTCTTTGAGTACCTTAGTTCAATTGACTGCTCAGATGTTGAGGTTTATGCCATCCCTGAGGGTTCTGTTGTATTCCCTAAAGTTCCACTGATGATAATTGAAGGACCTGTTGCGGTAAGTATCAGGAGTGAGTTAGCAGCTAGAATCCATAGCAGTAGTTGTCACAGATTGACTTGTCCAACATATGTCTCTATCCAGCACTCCTAAACGTTGATGTCACAGATTGATCTTTTTTCCTTCAAAAAAATGTCTTGAATTTTCTTTTGTCCTAGGTTATTCAACTTCTTGAAACACCATTTTTAAGTCTGGTCAACTATGCATCCTTGGTTACTACAAACGCGGCAAGACACAGACTTGTAGCAGGGAAGTCAAAGAATTTACTTGAATTTGGACTTAGAAGGGCCCAGGTGAGTCTTACTTTTGACCTTTTGTCTTGCTATGTTTGTCATCCATTAACCTTCACATGAACTTATAGCCACACATCTATCAGGGGCCTGATGGAGGAATCAGTGCATCAAGATATTGTTATATGGGAGGATTTGATGCAACAAGGTCTGGTTTACAAAATGAACAAATCTCTCTGGCTATACAGTTCTGTGTGTCCTGATATCTATCTGGCCGTCATCAGTTTTTTCTTTTGTAGATATTAAATATTCTTACACAATATATTTATCCTTGGACGACTTTGACGTGAAAGCTGAAATCCTACAATGCTTATACAAAAAAGCTTACTGCAATAATACTCTGACACGCTTTTACAACATGAGCAGCAATGTTGCAGCAGGATGGTTATTTGGGATACCAATACGTGGGACTCATTCTCATGCATTCGTGAGCTCTTTCATGGTTAGTGGTAATATTTCTGATACTCGGGAGTTATTTGGATTTTTGCTTTGCACCAATTTAGAAGTATCATTCATGAGGAAGGATGTTTACATCCAGATAGACACTTAGTCAGGTCAAAAATCAAAACCTTCTGGTCAGCAATGTTTTGACTGCCTAGATGAACATATTTCACTTACCAAAACAGATGGCCATCCCTTCTCATTGATATTCAAATGCCCTAGTGTTAGAGGCAGCCAGGTATCAAGTTCATAGTCGTGACTAATGAAATGTTTTACATCATGAGCCATTGAGCCTTGCATCTATATCATTACTTGTTCTTGCCAAGAAATTGGACATATTTTGTAACAGTATTTTTTCTCTAATATATTATATGTCTGTAGGGTCTTGATGACATCATTGACAGGACACTCGCTAGTTCTGATGGTTCAAACAAATGCGAAGACTTTGTCTCTCTGGTGCAGAATTGGCTTGCCAGGATTAAGGTGTACAGATGAACATTGTCTTGCTTAACAAGTGGAGATGATATCTTCTGTAATTTTTAGTTATACAATTTACTATACGTTGTAGAACTTCTAGTTAGTAACACCATATGTTGAACTATCACAACTAAAGATCGTCATTATGATATTCTCAGGATGCTGGTTCATTGCGTGGTACCTTTCGTGAAACAAATCTAAGTGAGTTGGCTGCATTCACGTCATATGCGCTGGCATTTCCAAATTCCTTCCTGGCTTTGGTGGACACATATGATGTATGTCAATCTTTCTCTGCAGTTGTATATTGAAACTTTCAATGGCGTGGCCAAATTTCCAATTGTTTAATGATTGCTTTACTGTATCTGCCTAGGCTGTAAACCTTGTGCATGCTCAAAATGATGTGTGACCTTGACAGAACTAATGTGACAAATCGATTTCTATCAGAACGCAGCTGATATTTAAATATGTGTGGTTTGCTAGGTCATGAGAAGTGGAGTGCCAAACTTCTGTGCTGTTGCTTTAGCCCTCAATGATATGGGGTAATTTAGCCTCAACTCTTCTCGGTAATACTTGTGTTTGCACAACTTGCTTCTATTACATGGGAAGTTATAGCCAATGAATAACACAACTAAAAAAGGAGGGTTCTCACTCTGGGTGTCACCTTGCTATTAAATTCTACTACGTAGTTTCCTTCACTGTTGTCAAAAAAAAGGGTTTGCATGGGTGAATGTGTACACTTTCAATATATTTCTTTTACTCCAATGGTTCGTTGGTGCCTAAGTAGTTACTCTTAGGACTCATTTATTAGTACCAATGATGTGATATAGTGTACAAAGTAGTTCAAACAAGCATCTTGAGCACAATCTCCCAAAACATCACATGGTTAGTCAGCTCCCTGTTTTAGAAATTGTTTTCCTTAATGACATTTTTTTTATATACTGTACAAATATAGATTCTGTGTATTGCTGGAGGCGCATGTCGAATGCTAGTTGCTTTGATGTTTTAACAAATGAACCTACGAATGGATGGATTTTCTTGTTATGCTGTTGCTTTTCCTGTCATGATTAAAAGGGAAAGGTAATGTCTCGCTTTTATTGACTCTGAAAATTTTCATTTCAGGTATAAGGCGGCTGGAATTAGATTAGACTCTGGTGACTTAGCATACTTATCCGTTGAAACTCGTAAGTTCTTCCGTGCAATTGAAGAAGAATTTGGGTTTATTGGCTTTGGAAAAATGAATATCACAGCGAGCAATGACCTAAATGAGGAAACAATTGATGCCTTGAACAAGCAGGTATGCTGTACTTCAGAGTAGCTGTGAAGAATTGGTTTGTGATGCCATACCATCCAGTCTTTCAATCTAACTGTGTTCTGAAGTTACTCCCTCCATCCTACAATATAAGGGATTTTGCCCCTTCTAGTTGTCCCACAATATAAGGGATTTTGATGTACTACTTGTCACATCCATCAACTCCAATTCAAATTTTTACCTATTTTAACCCTCAACTACCCACTCACCTATAATCAAATATCATTTAATAGGGGCATTCTAGTATTTTCTTGATATCCTTAAACTTACCCAAAAGGGAATAATCCCTTATATTATGGGATGGAGGGAGTAACTGATATATTCTGATTTGCACAACGATTTATGTCGATATTAACTACAGATTGGACCCAGCTATCCTGGCTGGTCCTGCTAACTATATATAATATAAAAAATTGCTTAAAAATACTTCTTATCAGCTAGGGTGATGGTGTCATGGTGGCATTGAAATCTGCTACTGACTACTGTAAACCCTTTGTTTCTTGGTATTTATTGACAACAGAGTTGCAGAAACAGTCTCAAAAGCCTGTGTTGGATATTCGCATGCTCAGTGTATCCCTTTTATAACCTTGCTATGATGTGGGACGTGATTATTGATAATTTTATGTAGGGTCACGAGGTAGATGCATTTGGCATTGGTACCTACCTTGTTACATGCTATGCACAAGCAGCGCTTGGTTGTGTGTTCAAATTAGTTGAGATTAACAAACAACCTCGCATTAAACTGTCTGAAGATGTGACAAAGGTATATATGCCTTCACTGAGCAAAAGTACTTCTACCTGTTCATGAGACTATGATGCATCAGAAAGACCTAAAACTGCAGTTCTGTGCTCCAGGTATCCATACCATGTAAAAAACGATGCTACAGGTT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