Os12g0509400
| Gene Name |
Os12g0509400 |
|---|---|
| Description |
Similar to Polyprotein |
| Version |
NM_001073388.1 GI:115488737 GeneID:4352313 |
| Length |
10626 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0509400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:19757068..19767693 |
| Sequence Coding Region |
19760699..19761076 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:19757068..19767693 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:19757068..19767693 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>agattgtggaagggtgggagtttcaaatgtctaatgaattcagttctgcagctttatcttattaagttcactattgtgttcttggatgacgtcttggtattacagtctttcaaggcacatgtgaaaaacttggagcatgtcctgaccacactgtggcaacatcaactctgtgttagacgcaagaaatgtagttttgcacagagaagactggagtaccttggtcatgttcttaagaaaaggtggccactaatatgcacaagacataagcaatgttgccctggctacaagatagaattgatatggagttgtgtggttgctagggctaatgggggcactgtcagctcttttgtttgtcaggcattattgaatcatctctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>RLWKGGSFKCLMNSVLQLYLIKFTIVFLDDVLVLQSFKAHVKNL EHVLTTLWQHQLCVRRKKCSFAQRRLEYLGHVLKKRWPLICTRHKQCCPGYKIELIWS CVVARANGGTVSSFVCQALLNHL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3632..4009#gggctttccagaaggcacgggtccaaccgattacggggcacgcgcggcggcggcggcggagtgaccggcgcgacgccgcaggcctgcaatgtgggcattcctgatctccccgccgctccgggatgcccccccccctccgtcgccggtgccgttgagcgtgcttgccccgcggtgagattgtttggttcggccgcggctagggttcgggtaggtggctgctcgccttgcttgccttccaaaaattgtttggttccatgagtcgtggcgtattgggtgctccagtgtaggaagcagggttacactccccccgtatcgtatccttggccatcttgctggatttgtttggtacctgaggatctagctacaagtgccattttaaatttgggaattctgacgtttagcttcataaataggtgtttaattttggagacctgtatatgttttttctgcttcggacccaagttgcctagtgcattgtatagtttagtgggtttcttgtcattttaaatgagcaaactaatcttaattttctctgtggcaacgtggaagtgtggatattttgtattctgcaagtgaataggaggtgcctgtagaaacttgtagactgatcttgcatgattttcacagcatcaagtcttaacatggagtatggcttgtcctgctgttagtgagatgggtaccatctattacagaatcatacacttgtatacatggagaatttgttttttctcgttaatggagcaactctcgatatttatgcgattctttttatatcagcagtttgataaatcactggctagcatatgcactgtacagaattggctgttatggacttatggtgacatattacatataaacatgacatgcattgggtggaaaacaaaatgtgcagtgagatttgtctgattttatattttgtgttttctcaccttttctgaagatttttatgagtagcttagtctgataagctttatctgtttctgggatataacattgttgaagtattagtgtgcaatagagcctgtacaaatagagttaacttattctccttgagttttatggctcatgacttcatgccctctggtgtaaattgtttgtgattttggagccaactgccaacatataggttatcctcctattctgtccatgatgatggctacttaggaacagtacaagtatagttccttaagtacttgcaactgccttatatgctagtaaagtagtaataatcatttttcacttcaataagtaaacactcattctggtaagctacttatgatgagttaggtgatgggaacatgtgtgaactcgagctgcatctttggtgtgactgatttttgttcttgtttagtgtcctttttggatgcctattatagtttcattctattgtcatattttcctgccattttatgtacactgaaaggaaaactttcacttcatctgatgaacctggtttggatggaattctctgtgttcttttgaagcacaagtttctatatatatctgttctatcttttattttcttacattcttcttttcctgcatcatgtgttttatgtatgttttatatttgattttcttgttatttccattcctagatcaaatgttttaagacgaaagtgaaacaagtgtaacacagactgaagtaataatcggaaggtatttttacctgggcttagcatgattattcttgaattgttttgttttccttgtcccatgagcattattgcagcatatttatcaaaagaataagaagtcaatctgagaattacaaccatataaatttctagcctgttttttagtcacatactgtgctgaaagatggcttgactgtttaccagaggaaagttacactttatgttgaaatattctccaactgattttttttttttagtttttcataggttgtttggcttggcatttttcttttgctctttggtggatcccaaataaatggctttttgtgaggtgagtcctacccgttgtcatgctttcgtaacatcacatttgatttttccttcttcagataacaatttcatgtgtgttaatacttatagttagggatgaaaacggagcggatacggacggataatgctcataccatattcgttttcatattttttgccggatacggaaacgaatacggatagctcgaatacggaaacaaatacggactatctcgaatacgaataagaatcgaatatgatcggacacgaatacggaaacaattttttctcggaacacgaaaaccaattcaacttctaatagaaacaaatatcaacatatataattagctcattttatataaaatatagtataatttataaatatttttaaaattttaaataatattaataatgtggactagtgttaagagatgaactactattaaaatctaaaaaggtatattgaaggtcatagagttataaagaaatgggatatgtcttgtggcttctgcggatatccgaattattatctgtatccgacggaaatcctaataccatattcgtattcgtatccgagagaaaatatccgtatccgaactatccgagaattatccgatccgaaaggtatccgtattcgtttttatccggagcggacggaaactatctgctccgttttcatccctacttatagttgacctctttattaattggattgtaacatcaatgctgactaccaagtttattagtgttcagtttcaagaatcacttgctgtgtttattactgcttgtaccgctccattgcagcaagcgtttggaaaaccatagccctgctggtgagatgtgattttcatggtaagagccatgcgttatgataatggatgctttttttttactagctagtcaacttgagatgagcctcatgacagaatgattggtaaagaagtggttgttgtatgttgacatccggttcaatcagtagctctatttttttgttgattactagctatacacttttcttgaaaaaagaaagtactgtgcgtgcatgcaggtcaatttagtcttgtattgttgactccacctgttgttgatttcttttaagttggatttttcttggagccataaataattcagatactcacaattgctaacaactgtttcctgatggaaaataaaatcgaaagtacaatggcatttgaaaattgtgatttcaatagctcatcactaagtatttatacccatgcaagtttgagttatttgtgcctgcatttattacagaattaggtttgccttgtacaaataaatggattacagtggtggttgaatatctcaacactaaatattagaaatgcatgacttacagaactggctttggcagtatgtaagattccaacaacgagagttgggaatgaaagaaggaagtgaccctgccaactactacaagattttgaagatctcttgaaagagcctaagaaattaccactgaaataaaatatgattatgccattccttgtggtcctggcactgcacctgtaaattctaatccttaccagcattgataactgcacaaagacaacattgaggaaatggcgcaccatatgttttttcctcaaaactgcaacacatgcttgctaactgtgttattgaactgggtgcaagccctttcaagttacctttagtcttagtgaagattgtggaagggtgggagtttcaaatgtctaatgaattcagttctgcagctttatcttattaagttcactattgtgttcttggatgacgtcttggtattacagtctttcaaggcacatgtgaaaaacttggagcatgtcctgaccacactgtggcaacatcaactctgtgttagacgcaagaaatgtagttttgcacagagaagactggagtaccttggtcatgttcttaagaaaaggtggccactaatatgcacaagacataagcaatgttgccctggctacaagatagaattgatatggagttgtgtggttgctagggctaatgggggcactgtcagctcttttgtttgtcaggcattattgaatcatctctgagccacaagctaatctcctcaaaggaaggtgttacattgagagtttggaacagagaagtagcttcagattttcaatgattgaaggacaatccagatttcataaggcttttgaagtcaatggaaacttgagatgatggtagaggttccattcacatgcaaagtgagcacctgatagcttacctggccaagtctctcaattcaatgcatcaaaagttgtctaagagagaatttctggcattgatcatggtcgtatactgctggagaccatacctacagaaagtggaatttgtaatcaggacctgcagccatgttatttataagaccatcagtttctgtatgacatgcccgcaaaacgcaatgacaaaacctaatgaattgcagttcatgatccagtgcaagaaggtcaagagaaaggaatgcagatcaatgccttggcttgtacttcctcatcacttacagtccaagctgtctcagaatgccaacagagtttgtcttcaggaggtaatcagttctgaacaattgtcctttgttttcttcaggaagatgttaaaactggtacataagtaacgatgaggactaacacatctacaaccctttcaagctaccaatgggtaggtcaggtaacttgtctcatcagtccatatcttaagacttaatctaatcacttatggttgcttttgctcttttgatagagtctcaattaggcatgacaggttttgccataaatcttgttgctaatattactgttgttttaacattctggtggcatttacaagtttctgttcttcctatgttaactcatcaattaattcctaataacgctcatggtttcattctattatggaaagaactggtttgctggtcatcctgttaattttctaacaattgattaacagttcagtgacaatttataatataacataacattataggatgtttcatgggtctcctgttcagtgtttgcttgttaaattgagctttgagattctgtctaaggttaacatcttctgaatagattagctataattgttgatcaagtcatttctgaatattgaactgcctttatgaaaaacggatttatcgtgaagagtgttttcatcgtccatgagacccctcgtaaaccaattttgaaagacttgtgacaaaataagatggccttttcaatatcaagtcaaattgaaaggcttctctgatatttggtgttattggattatgaaggttgttggggaggtcggttagtcataaggttggaccttatttcaaaactttccatggtctgagacagggggattcctgtctccccttttatttgacatcactccagacaccctagctttattgattaatagagctaaggaataaattttgtttagagggatgatccctcaattaattgaatatggcttatctattttgcaacatgaacatgacactgttttgattatgcaggatgatttgggaggagcgagaaacctgaaattattatgtctctttgatgaaatatctgggttgaaattcaattttcataagatttagacgttttgtttctgaagttctgttgagaagcaagataggtataattggaattttacttgtctctagatgctttgactatgagatatttaggcattgaaaggcgtataagataaggtagagggagagctgggccattgacaggtgttttgaaataagatatggagtgactagggtaagggttcgaaagctgggtggggtataggggcacacactctaatagaagctctgaggcttagagctaacttcaggtagtcatttcttcactcacaatagagtagatgggtccctttatatatagggaggactgacttgatatcctagttactagtctctaaaactatagaaccaatacaatctctatctctaatttgctaacgaacctcatctcttttcctaactatagctctttcaacgcctcatggaccaaatggaaaaagctgatgatgaggtaaaaggcgacctatccttttcgtttcgataaagaatgatagctttcagcctgatccagatgtgtcactaaactaggcgtttttaattgtgaatttgtgtgggtgatgcggattttagtacagcaaggtaggctgttgacctgttgtaaaggcatttcctgctgaatgcttgtttgactatcacccctttatgcgtgctttctttctataaattgccagtgggatcatgggaattagggacaaactggtctgtttagaaaagaagattgttatcacaggcagagcaaagaaaacatcatttagtgaatggcatttgttgtgtttgccgaaggactggggttttatgtgttcttgttttggacattatgaacactaatttattagggaaatggtttttggatcattttactggtaaagggttgtcgcaaagtctactccataagaaatacaagtgatcacttgcttggcatctgggtttgcaagttcgatggggaatgaaaagtatagtaacagtgcagcgttgtgatccatatggacatgaagaaatgatgcttgtgttcagagcaaactgttagttgatccaatataactaatgatgactttaagctactggattaagttctgagattttttgctggcaaagaaaggagatctataggcactgagaggagtccagcttattgagacggtggcaatgaaggtactattaaggaaaaaaaaaaggcctccaggatgatgcctgatgatagaggaactccaggctgcaagtgggttatcgttccctgatcccagaatctaatgcaaagttgcaaatatagctctactttatgctcatcttggtgcggaagagagctgagtttgattcccatgtctttgttttctttctgctatttggaactgttctggtggtttttattaaatagaaattgggagggagttcatcttgtcattctctgcacaatcagttccacctgacttgatatcaggatatatcttgggattcctcatgctaagaactctattgaaattgtttgtttctagaagtttttaacactttactgtatttgtatcattctgagaatcagcagatgctgagttggttatcgaaactgtcagattagtttctgaagtctcgcggtaagctaaatcatttgtttctataagtttttctacactagttcatttgtgaggcttgtttcagcctttgtcctaacatagtcctttgggtcagtctattatatttcagatgaaataattttaggtaatgtgggttatttttctaaaaaaaaagtttacagttttttattgctggtttctgctgtgtaagaatttgcaaagctggttgacggtcacttttatcagattctagtttacgcttaaccaaatgttcatttaacattgatctgctgaagcaaaaagaagttattatgaacctggtaaatgcttttagtgtcattagaaaaacagtttgattatccccctggcaggatacatgtaggttacaaaatttaactgattttcactttgcataaagctctcctttggtgtagctctgggaaacatgtcattggagaattttacatggttatggtggtgcatctctatgttacaattcttacctgttcatgcaatctaggttgtggtaagcacaggacttcatggcttcaaattgttcgtactgtaattagtgagcaatgctaaagttgattggctgtctctcggcctttctgaactgaagatgaacagttcttatatgctatttccttttacagatgagacatatctatggactaaaaggaagggcatattgatgtttttgcagagaacagcagcttaggcatcaatcctcactacatccattcccgtggttgcgtcttttatcgtggacatcacaggttgcaccatttcttaagaagaatgatacttttgtagcagcactaaagaaggtttgtatgcttgctatcaattactccctccgtcctaaaatataagaacctaggaccgggtgagacatttcctagtacaaggaatcatctggtcctaggttcttatattttgggacggagggagtactcagctagttcacctggttcattgttctcttgcaagccataacattccatgtcctattacaggaactgtctgaacacattgctgatgtgcatgttcaaaacgattttctcgatggcatgttcactttctgtggtgctacaatggcacctgcacctctaaatgtatgtaaggtctgcgtgtaagctgtatcatatgttcacgtttgggtaccatcatccactctcagaacgggatgatctaaaaagcttactatggagaacatatcccagttttgtggttgcttattttataggggcaattgcgcttttgaccctgttttaaaacctaactaccaatttgaccctatttttttaagtttgcttatttgaccctcctttttaaaaacgaaagttaggtctgaccctattccgtgaaaacagtataacagtgttaacttttagcaaaaatgccatttatgccctttatggagtgtacggtggaatcaaaataccctctgcactggcctcgacgaggtatcagccgcgcctccaagatgagatgggtcaggccccgtttggcaagataaatgtgtactgagggtattttagtcattttgaactagatgaaatgaaaccctaacggtgtagcaaaaatagggtcagacggcaacttcgattttgaaaattagggtcaaataaacaaactcaaaaaagtagggtcaaattgatagttagccttcgaaacagggtcaaataagtaattgtccctattttatattatattgttctaatgaattcccttgctaattgcttactactgaaaaagaatttaagttcaaagataatttaagttgcttctgtagcatatcaccacattgaaaataccttattcattctttgacttatcaattcacagtttgcaagtgttagttttgatctgccgttccttccggtgcttggctcctatctaattaggattttcggtttcctagtagtcactaaatggttatggatcatttcatgtcttcgaatacagactgaagcccttttttcccctacagttgagaacatctgttttttattttgttcttttcagagagctcccataaatgtgtaaatgatgggatacacgattgtgccacaggtaatccaacaactaattgccatccaataagaagttaggcagtatgcacactctcataataccatgtattaattttattaatcagtatcctacacatatcaaagagaacaaacggtacagtcataaacttggattttcaaactttcaccccaaaacctgggattaatgaaatttttatgcccttttctgtatcaagtcatgaaattgaaaggcttctctgcattttatgtgattggattatgaaggttagcggatgtcaggttggagagaaagctaatgtaatgtagaccttatttcaaaactttcaaaggtttgatatggggggatcccctgtctgcctttttatttggtattgctgcacatgccctagcttcattgattgatagagctaaggaacaattttagttaaagggattatcccttaattaattgaaaatagctttattattttgcaatagaattctgaaattcactttatctctttgagcaaatagcaggatttaaaaccaattttggtaagactttgctgttttgtttcagaaatgctgttgagaagcacgacaagtataatcagatttttacttgttatctagatgcttcgcctttgggatatttgggcgttcctattcatgcaatgatcagaagtcctgattagaaaggtgtagtgtaggctgctgtcaatcaggatacaggaagaggcgtgtgaggctaaatgcttgtttgagtagcatttgctcatacatgctttctttctataaattaccagtgggagttagggaatagattgatatgtttagaaaaaaaaaagattgctattgcaagcagagtaaaaaaaaaacaattggacccgggggatttaggtgttctggatatggatatcaaacaatgcttcgcagggaaatggttatagaatcattttaatgataaagtgctgtggcaacgtctactgtataagaaatacaagtgatcaattgtttcaatgtctgggttcacaagtttgatgggggaatgaaaaggatagtaatggtgcagccttgtgatccatatatggacatttggaaatgatacttgttttctgggcaaactgttaaccgaccatccagttcatgactttgatatactgggttaagttctggttattgttgcaggcaaaggaaagagattgagaggttttgagaaggggcccagttcatcgagattgtggcaatggtggtactccaagccaaaaaaagaaaaaaaatattggaggcctcaggtccgaagaattgaaggatgtcagaatgtgagaagtgtgaagcagataagggttttttcttctttttttttttcttttggtgtgtaatctgatgaggatggtgcctgatgatagagtagttcaagctttgcaagtgggttgtattttcctgttcccagaatctaatagaaactgaactctaat</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
