Os12g0538300

From RiceWiki
Revision as of 10:32, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os12g0538300| Description = Dor1-like protein family protein| Version = NM_001073472.1 GI:115488905 GeneID:4352423| Length = 6397 bp| Definitio...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os12g0538300

Description

Dor1-like protein family protein

Version

NM_001073472.1 GI:115488905 GeneID:4352423

Length

6397 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os12g0538300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 12

Location

Chromosome 12:21625666..21632062

Sequence Coding Region

21625700..21625867,21625960..21626112,21628675..21628823,21629023..21629100,21629178..21629271
,21629494..21629568,21629915..21630211,21630296..21630363,21630450..21630504
,21630711..21630849,21631013..21631197,21631322..21631693

Expression

GEO Profiles:Os12g0538300

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008405:21625666..21632062 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008405:21625666..21632062 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggacgtcctcgacgccggccaccgcgccacgccggagccctcctcctcctcctcctccgccgccgccgccgacatgtccggcgcctccgtcctcccgctcgccggcgccgcctaccagccctacgtctccgagctcctctccttctccatcgagcgcctccacaaggagccggagctgctgcgggtggacgcggagcgggtgcggcggcagatgcaggaggtggcggtggagaactacggggccttcatcgccgcatccgaggcgctctccttcgtccgcgcgcagctcgaggggttcgacaggcacctcgaggcactgatagaggagataccgaatttaacatctggctgcaccgagtttgttgagtcagcacagcaaattttagaagagaggaagctcaatcagacattactagccaatcacagcacactgcttgatctgcttgaaatcccacaactgatggacacatgtatacgaaatgggaactatgatgaggcacttgacctggaagcctttgttagtaaaatatcaaagttgcaccctgatttacctgttatccaaggcttagctgttgaagtcaagaagacaatacagtcattaatttctcagcttctccagaagcttcgatcaaatattcagttgcctgaatgcctccgtattgttgcacatttgcgccgcattggagtgttcagtgaatcagaattgcgtttacagttcttgagatgcagggaagcttggctttctgggattcttgatgacctggaccaaaggaatgtatatgggtatctaacaggcatggtgggttaccacagaacacatctatttgatgttgtcaatcaatatcgagcaatattcaacaatgataagtccggaagtgatgagaactacgatggtggattgcttttcagctgggcaatgcaccaaataagtaatcatcttaccactcttcaagttatgttgccaaatataacggaaggtggctctctctccaacattcgtgaacagtgcatgtattgtgcaatgggccttggcttggttggactggatttccgtggcttacttccaccaatttttgaaaaagctgtgttaaatttgttttcaaagaacatgggtacagcagtcgagaattttcaggttgttctggattcacatcgttgggttccaatgccatctgttggctttgtagcgaatggagttgtggatgagacttctgatgatgtgacgccgccttctgttttaatggagcatccacctcttgcagtctttgtcaatggtgtttcagcggcaatgaatgagctaagaccgtgcgcaccattgagcttgaaaaatgtacttgccgaggaggtggtgaagggattacaagccgtttctgactccctagtcagatacaatgccatgcggatgctgcgtggaaatgagtcctctcttttcctttcactttgccaggcatttattgaggtcgcatatccttactgctctgcatgttttggccgatgctaccccaatggagcaatattgatcacagagcgacgaagcacattcgacgcagtcagccagctgctgactgtacctgcaaggtccaacagctcagggatcagcatcgaacggaggcaatcaggcagcattgagagaaaacagtctggagccattgaacgtaagcaatcggaaggcatcgaaagaaagcagtcgatcgacgagagcgcggggacaacagccaccgacaatgggaccccagctaacggaccacctccagtggcgaacgatgattctgggacctcctcagcaccagctcagcctgatgggcaaaccactgcagcagcaagtacgtag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDVLDAGHRATPEPSSSSSSAAAADMSGASVLPLAGAAYQPYVS ELLSFSIERLHKEPELLRVDAERVRRQMQEVAVENYGAFIAASEALSFVRAQLEGFDR HLEALIEEIPNLTSGCTEFVESAQQILEERKLNQTLLANHSTLLDLLEIPQLMDTCIR NGNYDEALDLEAFVSKISKLHPDLPVIQGLAVEVKKTIQSLISQLLQKLRSNIQLPEC LRIVAHLRRIGVFSESELRLQFLRCREAWLSGILDDLDQRNVYGYLTGMVGYHRTHLF DVVNQYRAIFNNDKSGSDENYDGGLLFSWAMHQISNHLTTLQVMLPNITEGGSLSNIR EQCMYCAMGLGLVGLDFRGLLPPIFEKAVLNLFSKNMGTAVENFQVVLDSHRWVPMPS VGFVANGVVDETSDDVTPPSVLMEHPPLAVFVNGVSAAMNELRPCAPLSLKNVLAEEV VKGLQAVSDSLVRYNAMRMLRGNESSLFLSLCQAFIEVAYPYCSACFGRCYPNGAILI TERRSTFDAVSQLLTVPARSNSSGISIERRQSGSIERKQSGAIERKQSEGIERKQSID ESAGTTATDNGTPANGPPPVANDDSGTSSAPAQPDGQTTAAAST</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>35..202#295..447#3010..3158#3358..3435#3513..3606#3829..3903#4250..4546#4631..4698#4785..4839#5046..5184#5348..5532#5657..6028#actactctctctctccagatctcgccccaccgccatggacgtcctcgacgccggccaccgcgccacgccggagccctcctcctcctcctcctccgccgccgccgccgacatgtccggcgcctccgtcctcccgctcgccggcgccgcctaccagccctacgtctccgagctcctctccttctccatcgagcgcctccacaaggtagttcccgcccccgcccccgctgctgctgctgctgcttcctcttctcgatggcgatggtgatctgatgggttgtggtggtgggtgcgcaggagccggagctgctgcgggtggacgcggagcgggtgcggcggcagatgcaggaggtggcggtggagaactacggggccttcatcgccgcatccgaggcgctctccttcgtccgcgcgcagctcgaggggttcgacaggcacctcgaggcactggtaatgcggctggatccctttttgtcccgtagtacgagaaattacggttgctctgtgatttgggacgagtagatcccccactttctctgttgtgtggcaatgtgaggtggagtgatcggattgatggttctgcttcaggtggaaatgggatgtcgagtgatccaaatctgttgcctgatgctgtagactgaagtaactagatccagactttgatgttcgtgaaatttaatgcttagatttgcttctgtgttttcatctgcaatattatagcctggccctggttgatttttcatcttattagttttgagtcagtgaagacttctcttcttgctcaggccatttcagtttggtggccactgagaattgcatgggcttggtaatgcctgtaattgattgctgtgggctgtaccatgtaggaactttcactaatactagccaatggtgtcacgcgttcgcgtgaccatgacctccatctctattatggaattaatatcttactatgctatttgtatcaataatagaaataagtgtctagggaacatagtttgaaggaagtcaatctacaatttcttaatttatgatgaccatgttatgatgacaataaataattaaggttaaatttcatagaacttcaattatttggtgtatcactttactacaactttagaaatgatgagctaaatcaatctgctacgaactggtagttttgacaaataattgtggttttctaaaatatactcaatgattaacctttactatgctcaacttgtaaaatttattggaaatcttatattcatatatcaaaccaaaattatcttaagtcttagaaatattgaaaaacttagatttaatttcattttaacacacacaattctaggtaacttaatatttacaatgttttgaacgactcagttgatcaaataactaaacacatttggatttttttagacaaaatagatttggaatttgtgacaaattaaatacattgaatctgtcctcatgcgagagcctcgcacattcaatgttccaagccaatgcatatttgtctgcatagtaccacataatatatccgtcgtaatatatgcatttgtaccatcgttcacgctactactttgtctcgtcaatataagtagcttgtgacgtaaatcgctagccgtgataatacatgagagagtttggttttatgacgtcctataggctagagacataggtagtaggaggaatgtatgttgtattttttttaactcacttcttttttccccttttctttttaccatggcgaggaggatctggcaacctacaagaccagggacaagtaatttttttagcattttcttttgattttgtttgactcttaattggtattgtccctagctctctcgatatgggttgcttggagatcaatcaggcttcagcttgaacactccagaaggttctcatggaagttgattagttgactatgagtctacaactgtctatggatccaacggttgatatttcctcttttggtgtatccaacggtccccatttaattattacgtggctcaatgagagagcttgaaagttagtactttcactactttagatgggatagtgtgtaatttcgatcccgtcctacctattcgtgtgtaaaaagatcacagcatacctcaggatgccatggcactagcttctcttctatagggacagccaaactgctaattgttgcaggtatgctggtgacattagtttcataggatgaaatagacatggatatttgctcatggattcaatcattcaaaaggttcacagcggagttcttgttctcacatctagggcagatcagattgttgttgtttagatgtctcatcttatgcagattttatgatggataagccacagcactatcaattaatgggggttttaatggcaacttctataaaatatctggtgctctatatttctgttggggtgcagttgactggaaattttaagttagtattgttgtaaacttataataccacaggatgatctgatcacttttagtagaacatagatctttcttactgccgtcctagaagcttgttccagatgcccaaaatgttcagagtgttgtcgtcaccttgagcactttctgcactgccattgttatttgcgttgatgagagatttctaggtacatgtaaagattgtgcaaaatgacttggatttgaggtaccactttatggcaatgtattgttatcactgattgcttgtttattagtcagcttttaaagtcaaataattaggtaaatgtttttcttttttctgtcaatggatgttggtgtgctctcttctgtgctcgtgcaagttaagacattttctgacttctgaaagttgcatatcccgatttttttcatgtggattattttagacttttagttatactatagaccaacaatgcaaccttttctcttcttcatgcttttttttttaaaaaaaattgtctagtgagatgcatttttatgcaatttaggttttctcagcagtatggcatgtaatatttgacccttttttgtgcactttgtacatttatttattacagatagaggagataccgaatttaacatctggctgcaccgagtttgttgagtcagcacagcaaattttagaagagaggaagctcaatcagacattactagccaatcacagcacactgcttgatctgcttgaaatcccacaactgatggacacgtatgtgccatttttttttataatttcttaaagaccttcagtcatcttgtgttgtttgatgttgttgatatgctgtttagttctcgattcttctctaatttctgtatgctacagatccattttgttcagtaaaacatggtttgatttgtacaattgacgaatcatgaagaattacatttaacaatctacatgctcacagatgtatacgaaatgggaactatgatgaggcacttgacctggaagcctttgttagtaaaatatcaaagttgcaccctgagtaagtcatttgacataatctttattatggcctttgtaatttgcaattaatttaactgtatgccttttcgattgaagtttacctgttatccaaggcttagctgttgaagtcaagaagacaatacagtcattaatttctcagcttctccagaagcttcgatcaaatattcaggtgattatgttggtgcactaacaatctgtcattggttaaaccattatcgtatttttcatttgctccatctgttctatgcaagttgaacattgtaaagattgtatcctgtatataaccgagttctttgttgtgcaactaatttcatttcttttccaaatttacttggttttgtctcctcttagcacatctatgtctaactcctggtcatttgactgtctacagttgcctgaatgcctccgtattgttgcacatttgcgccgcattggagtgttcagtgaatcagaattgcgtttacaggtattctgaacttctgatgtaatctggattttttttttgcggggaataatctgaatagaattatacgtcagtataatgcttttacatttaattttgaatttatgagtaattcatttgttaccctaaacccttacttcaaagcggtggtccagagtatataaactactaatggaggaattttaattgtaataatgacatttcatttagttcaaagtgttggtccagattactacaaactactattggaggaattttaattgataataatgatatttcactgagtcaaattcattggatgatacatatcgagtatttttctctctcctaattctgatatagtttctagttcttgagatgcagggaagcttggctttctgggattcttgatgacctggaccaaaggaatgtatatgggtatctaacaggcatggtgggttaccacagaacacatctatttgatgttgtcaatcaatatcgagcaatattcaacaatgataagtccggaagtgatgagaactacgatggtggattgcttttcagctgggcaatgcaccaaataagtaatcatcttaccactcttcaagttatgttgccaaatataacggaaggtggctctctctccaacattcgtgaacagtgcatggtaagcttctgctagtgagtaacaggagtttgattgggatcatttgattcatcataaatttgcatcacttgtttcatcttgcagtattgtgcaatgggccttggcttggttggactggatttccgtggcttacttccaccaatttttgaaaagtaattagcattttcttgtaaattttattagagtattcacgctgcaaacagaacctattcttattgatgatgttatctgcatgcagagctgtgttaaatttgttttcaaagaacatgggtacagcagtcgagaattttcaggtaatgcaaaatgtgcacaatcgttatcgatgtggatgtgctatttacttcttatctagataatagaatgaatttaggttacaggcttcatggtagatggtactattttacttagtgttttcagctgtagtccacattttcaaatgtctatactttcttcctcaaacattattttaatttcaccattttaccttctatcatgttaggttgttctggattcacatcgttgggttccaatgccatctgttggctttgtagcgaatggagttgtggatgagacttctgatgatgtgacgccgccttctgttttaatggagcatccacctcttgcagtctttgtcaatggtaagttttgttgatctctctctccctctcattcccctgcacatggtaattctacacttaaatgaaatattgaatttatacaccatcatgttgaatctaatggtcatgtgttgtgatggctgtataaaagttgatatgtcatttgttttaactttctgtgcaggtgtttcagcggcaatgaatgagctaagaccgtgcgcaccattgagcttgaaaaatgtacttgccgaggaggtggtgaagggattacaagccgtttctgactccctagtcagatacaatgccatgcggatgctgcgtggaaatgagtcctctcttttcctttcactttgccaggcatttattgaggtaaggggcctctggaaaaaggagtatttttgtccaattcctcaaacaaataatattccaaattatgaccaggtggtgtttctatacacctagagaaggattacatattaatttatcctcgcaggtcgcatatccttactgctctgcatgttttggccgatgctaccccaatggagcaatattgatcacagagcgacgaagcacattcgacgcagtcagccagctgctgactgtacctgcaaggtccaacagctcagggatcagcatcgaacggaggcaatcaggcagcattgagagaaaacagtctggagccattgaacgtaagcaatcggaaggcatcgaaagaaagcagtcgatcgacgagagcgcggggacaacagccaccgacaatgggaccccagctaacggaccacctccagtggcgaacgatgattctgggacctcctcagcaccagctcagcctgatgggcaaaccactgcagcagcaagtacgtagctttgactttgttaatgcctttgatggaacctgtcgaagttttttggtcatggccttgggttatcgtcagccaacaagtgtctctactgcaagattatgcctgacgagagttcagtttcggttttctcatggtcttacaatgtatacaagcatctcataccaagatctcggatcttaatttgtacaatacagccattaatttttttagctggtcatcattagtccatacctagatgttgtagagtgaaagattgtttcagggtgacaataagccgataatgtgaagtgagcgtgctacgttgttaactgcagagtactgcgcctctatgttttcttcttttccattaaattactgttcattatttctcg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os12g0538300, RefSeq:Os12g0538300