BGIOSGA006636
| Gene Name |
BGIOSGA006636 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006636, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0010K08.34-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA006636-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA006636-PA |
| Length |
4799 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:12504433..12509231 |
| Sequence Coding Region |
12508417..12509231,12505195..12507157,12504830..12505027,12504433..12504675 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:12504433..12509231 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:12504433..12509231 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCAGTTGTAGCAGGGGCGATGACTGCCCTCATTGCCAAGTTGACTACCCTGCTGATGGACCAATACAAGCTGCAGAACAGTGCGAGGGGCGACATCATATTTATTAAAGCCGAGCTTGAGAGCATTCAGGCTGCCCTTGAGAAGTTGTTTGAGGTGCAGGTAACTGATCGCCAGGTTAAGATTTGGGAGAGGGATGTGAGAGAGCAGTCGTACGACATGGAGGATATCATCGACAATTTCATGGTTCATGTCGAAACCCATTTGCTAGCCAAGCCACATGAACTCAAAGGATTCATGAAGGGAAGTTTGAGCTTGTTGAGAAGAGCAATGGTTCGCTATCGTGTTGCTACCGACATCAAACGTATCAGGAGGCTTGTCAATGAGACGAGTGCACGCCGTGATAGGTATAAGGTTGGTACTATTGTTGCTGCTGCCAAGACTGAGACCGCAATTGATCCCCGTTTAATTGGTATCTATGGAGAGGCTACTAAACTTATTGGCATAAGTGGACCTAAGGAAGAATTGACCAAGCTGCTGATGGATTCCAAGGGCAACTCAAAGAATAAACTGAAAGTGATCTCCATCGTTGGAGTTGGTGGTTTAGGCAAGACAACTCTTGCTAATGTCATTTATCAACAGCTTAGAGGACAATTCGAGTGTCATGCTTTTGTTTCAGTATCCTTAAAGCCTGATCTAAAGAAGGTCCTGAGCAGCATACTCCGTCAATTCAGTGAACAAGGTTATGCTTGGACAGAAACATGGTGTGCTCAGGAAATCATCAACAAAATCAGAGATGAAATTAAGGAAAAGAGGTACTTGATTGTAATTGATGATATATGGGAGAAATCAGCATGGGAATGCATCGAGTGTGCTTTAATAGAAAATGACCGTGGAAGCAGAATAATCACAACAAGCAGAGTGCTTGATGCTGCCACGCCATGCTCTTCTGAGGTTGATCATACCGTTTACAAGCTGCAGCCACTTTCTAGTGATAACTCAAAGAAATTGTTCTACAAAAGGATATTCTACTGTGAAGATGGTTGTCCATTGGAACTGAAGGATATATCTGAAAAAACTTTAAGAAAGTGTGAGGGAGTCCCATTAGCCATAATCACCATAGGCAGTTTATTGGCCATGAGACCACAAAATTTATACCAATGGGATAGGGTACACAATTTAATTGGTTCTGGACTTGAGAAAAGCCATCATGTGGAGAATATGCGGCACATATTGTCTATTAGTTATTATGATTTGCCAGCCCATTTAAGAGCTTGCTTCCTATATCTAAGTATATATCCAGAGGATTACAATATACAGAAAGATCAACTGATACGCAGATGGATTTCTGAAGGGTTTATACTTGGAGAAGATATGGATACTTTGCATGAAGGAGGTAAATACTTCAATGAGCTAATAAACAGAAGCATGATTCAACCAGCATACATCGACAGTCATGGAAGGGTGCATGCTTGTCGTGTTCATGATATGGTGCTTGATCTTATCACATCATTGTCAAATGAAACAAATTTTGTGACATCATTAGGTGGTCAGCAGCCCACATATCATCCAAACAGGGCTCGCCGGTTATGCCTTCAAAACAGCATATATGACCATACGATACGACAGGAGAAAATGAAGTGGCCCCGCGTGAGGTCACTAATCGTATTCCCTCATGCTACCAACTTGTTGCCATCCCTTTCGAGATTCCGTATTTTGCGCGTACTGGATTTAGAAGGTTGTCAAGACTTGAAGAATCACCAAATTGAGGGTATCAGTGATTTGTTTCATTTGAGGTCTCTAGTACTGAAGGATACAAATATTGGTAGTCTCCCCAAAAAGATTGGCAACCTAAGTTGTTTACATACACTGGACATAAGGCACACTATCATAACTGAACTTCCATCAACAGTCGTTCATCTAAGAAGACTGGTGCGCCTACTAATTGATGCATCGGTGAAGTTACCTGATGGAATTGGGAAAATGGAATGCTTACAGGAAATATCACTGGTTGGTATTAGCAAGTCTCCAAACTTTTTGAAGGAGCTAGGGAGTTTGACAGAACTAAGAATACTCCAGATTTCAGAGAGTACTGGTGCGTGGCATGATAGTTATGAGAATACTTTGATTGATTCTTTGTGCAACCTGCACAAAATCTGTGACCTGTACATCCATGGCTGTAAACTGTCCACAGAGTTCATATCAAATATAAGATGCTCTCCGCGATATCTCCGATATCTTTCATGTGGCCAATTATCCATATTGCCAAGGTGGATCAATTCATCCTTATTGTCCCTCTCCACCATAGATTTGATACTTAATGTACTCCGACAGGATGATCTTCATAGTCTTGGTGCCTTACAATCTCTATGTTGTCTCCGTCTTAATGTGTTCAAAATTGAACCAGAAAGGTTGGTTGTTGGCACTGAGCATGCAAAGTTCCACTGGCTAGCTGAGTTTTCGTTTACCACTAATGCCATGGGGCTTATATTTAGCCAATATTCTATGCCAAGGCTTGAAAACCTTGAGCTAGCTTTTAATGTTCGAGAGACAAAGTATTTTGATATTGGCTTGGAGCACCTGTCCTCTCTTAAGGATGTCACTGCAAGAATTGATTGCAGGGATTCCAGTATTTTTGAGGTGCAAAATGCAGATGCTGCCATTCGGAGGATTGCATATATGAACTCCAACCAACCTAAGGTTCATGTGATCAGGCATTATGAACACATGTTAATGGATGAGGTGAAGATCCAGAAGGAAACGGAGGAGGAAAAGGAGATATTGGAAAATAGGATTGGTCCATGGGGTGGAAATGGTGGGGTCACTTGTGACATCAAGGTTGCACCCAAACGCTTGGAAAGCATTACTATTTGTAGCGGCATAATCATCGATGCACTTGCATTTTCTTACTTGGACAAAGATGGAGAGCGACACACGACTAGTTTATGGGGTGGTCTTGGTGGTAGTGTTCAACTGATTGATCTTGATGAAAGAGAGTTTCTTATGGAGGTTATTGGAACTGTGGGTCCATTCAATGTGTTATCTGAGGCTATAACATCACTTACACTTGTGACCAATGTACGTAGCTATGGGCCTTTTGGACAACCACAGGGTACTCCTTTCCGTACTCCACGGAAGAAAAACAGTTGTATCGTGGGATTCTTTGGGCGTTCAGGAACATATCTTGATGCAGTTGGGGTCTATTTTCACCCTATGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAVVAGAMTALIAKLTTLLMDQYKLQNSARGDIIFIKAELESIQAALEKLFEVQVTDRQVKIWERDVREQSYDMEDIIDNFMVHVETHLLAKPHELKGFMKGSLSLLRRAMVRYRVATDIKRIRRLVNETSARRDRYKVGTIVAAAKTETAIDPRLIGIYGEATKLIGISGPKEELTKLLMDSKGNSKNKLKVISIVGVGGLGKTTLANVIYQQLRGQFECHAFVSVSLKPDLKKVLSSILRQFSEQGYAWTETWCAQEIINKIRDEIKEKRYLIVIDDIWEKSAWECIECALIENDRGSRIITTSRVLDAATPCSSEVDHTVYKLQPLSSDNSKKLFYKRIFYCEDGCPLELKDISEKTLRKCEGVPLAIITIGSLLAMRPQNLYQWDRVHNLIGSGLEKSHHVENMRHILSISYYDLPAHLRACFLYLSIYPEDYNIQKDQLIRRWISEGFILGEDMDTLHEGGKYFNELINRSMIQPAYIDSHGRVHACRVHDMVLDLITSLSNETNFVTSLGGQQPTYHPNRARRLCLQNSIYDHTIRQEKMKWPRVRSLIVFPHATNLLPSLSRFRILRVLDLEGCQDLKNHQIEGISDLFHLRSLVLKDTNIGSLPKKIGNLSCLHTLDIRHTIITELPSTVVHLRRLVRLLIDASVKLPDGIGKMECLQEISLVGISKSPNFLKELGSLTELRILQISESTGAWHDSYENTLIDSLCNLHKICDLYIHGCKLSTEFISNIRCSPRYLRYLSCGQLSILPRWINSSLLSLSTIDLILNVLRQDDLHSLGALQSLCCLRLNVFKIEPERLVVGTEHAKFHWLAEFSFTTNAMGLIFSQYSMPRLENLELAFNVRETKYFDIGLEHLSSLKDVTARIDCRDSSIFEVQNADAAIRRIAYMNSNQPKVHVIRHYEHMLMDEVKIQKETEEEKEILENRIGPWGGNGGVTCDIKVAPKRLESITICSGIIIDALAFSYLDKDGERHTTSLWGGLGGSVQLIDLDEREFLMEVIGTVGPFNVLSEAITSLTLVTNVRSYGPFGQPQGTPFRTPRKKNSCIVGFFGRSGTYLDAVGVYFHPM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..815#2075..4037#4205..4402#4557..4799#ATGGCAGTTGTAGCAGGGGCGATGACTGCCCTCATTGCCAAGTTGACTACCCTGCTGATGGACCAATACAAGCTGCAGAACAGTGCGAGGGGCGACATCATATTTATTAAAGCCGAGCTTGAGAGCATTCAGGCTGCCCTTGAGAAGTTGTTTGAGGTGCAGGTAACTGATCGCCAGGTTAAGATTTGGGAGAGGGATGTGAGAGAGCAGTCGTACGACATGGAGGATATCATCGACAATTTCATGGTTCATGTCGAAACCCATTTGCTAGCCAAGCCACATGAACTCAAAGGATTCATGAAGGGAAGTTTGAGCTTGTTGAGAAGAGCAATGGTTCGCTATCGTGTTGCTACCGACATCAAACGTATCAGGAGGCTTGTCAATGAGACGAGTGCACGCCGTGATAGGTATAAGGTTGGTACTATTGTTGCTGCTGCCAAGACTGAGACCGCAATTGATCCCCGTTTAATTGGTATCTATGGAGAGGCTACTAAACTTATTGGCATAAGTGGACCTAAGGAAGAATTGACCAAGCTGCTGATGGATTCCAAGGGCAACTCAAAGAATAAACTGAAAGTGATCTCCATCGTTGGAGTTGGTGGTTTAGGCAAGACAACTCTTGCTAATGTCATTTATCAACAGCTTAGAGGACAATTCGAGTGTCATGCTTTTGTTTCAGTATCCTTAAAGCCTGATCTAAAGAAGGTCCTGAGCAGCATACTCCGTCAATTCAGTGAACAAGGTTATGCTTGGACAGAAACATGGTGTGCTCAGGAAATCATCAACAAAATCAGAGATGAAATTAAGGAAAAGAGGTATAACTAACCAAATACATGCTTAAGATCATTGGGAACATATCCTGTGTACACAAGCCATCACGTGTACACACTGTACACCAACTAACAAATGTCACCAAAAAATCTAGAAAATTTCATACATGTACTTTCAATAGTATTACACCTACAAGTACAAATTCATTATATTTTAGCCGTAACCAAAAAAATGTGACAGTTTTAAGGTTATAATTCTGTCAGAATTTTGTTTCTTGTTGTTGCTCTCTGTAGAATGAATTTGAAGATGGGACTTTACACGTAAATGTAATACTATTAAAAGTACACATATGAATTTTCTTAGATTTTTCTGGTGATATTTGTTAGTTGTTATGTACACGTGAGTGCTTGTGTACATAAGATATGCTCCCAGGATCATCCCATGCTATGTGTAAGCATTTTAGCTTGAAGTACAGCTAGAATTTGGAGCTAGTAGGGATAGTAAAATACATGCACAGACTGCTAGGTGAATTAACAATGAAATTAATCCTTTTATCTAATAAACCAAGTTCAATGGGCTGGGAAAGTAATATTCTAGCTTAGGGTGCTAGGTGTGATAACAACGGGAAGTTCAAGGGGCTATGAAAGAGAAATGTGAATTCAGGGTGTTCGATAAGACAGGCAAAAGCTTAGAGGTCTAAAATACAGTTCTTTTCTTTCGGAAAACTAAAACCAAGATAGCAAAATTACTAGTTTGATCAATTTGGATTCAGGCAACTTCTATTCTTTGAACTTCTCACAAAACTGCAACCCTGTCATATCCTAGGAAATTTTTGCATGTTGGTCCAAATATTATTGACTCTACTCTGTTTGATACCATTAGGCTGCTAATGGGCCGCATCAGCATCAAATTGGCTGCAAGTTTTTATTTATTTATTTAGAAGTCATTCCCTATCTTCGAAAAAGCAAATACATGCTACATAAGTTCAGGAAGTAGTAGCCAGACCTAAAGGTTAGGTAAATAAAATGTTCACATCTAACATGATTGAAACTGAGTTCATGAAACCCTATACTTGTGGGACTGAACTCATGAGACTGAACATGTAGGGAAACTATAGCTTCTGGAGATCCTGTCTTTCCTCTCCCTCACCTTCTGTCCAATGCCAGTACTCGTGGTTCTCAGAGCAGAGCCTTTTGTGCTGTTGAATACTTCATCTGTTACTTGCCTTTGAAAGGATCCAATTAATTGGTTTTCAGTTTCAATTTAACTCATGTCTTGTGCTAATGTTATCACAAAACCACAGGTACTTGATTGTAATTGATGATATATGGGAGAAATCAGCATGGGAATGCATCGAGTGTGCTTTAATAGAAAATGACCGTGGAAGCAGAATAATCACAACAAGCAGAGTGCTTGATGCTGCCACGCCATGCTCTTCTGAGGTTGATCATACCGTTTACAAGCTGCAGCCACTTTCTAGTGATAACTCAAAGAAATTGTTCTACAAAAGGATATTCTACTGTGAAGATGGTTGTCCATTGGAACTGAAGGATATATCTGAAAAAACTTTAAGAAAGTGTGAGGGAGTCCCATTAGCCATAATCACCATAGGCAGTTTATTGGCCATGAGACCACAAAATTTATACCAATGGGATAGGGTACACAATTTAATTGGTTCTGGACTTGAGAAAAGCCATCATGTGGAGAATATGCGGCACATATTGTCTATTAGTTATTATGATTTGCCAGCCCATTTAAGAGCTTGCTTCCTATATCTAAGTATATATCCAGAGGATTACAATATACAGAAAGATCAACTGATACGCAGATGGATTTCTGAAGGGTTTATACTTGGAGAAGATATGGATACTTTGCATGAAGGAGGTAAATACTTCAATGAGCTAATAAACAGAAGCATGATTCAACCAGCATACATCGACAGTCATGGAAGGGTGCATGCTTGTCGTGTTCATGATATGGTGCTTGATCTTATCACATCATTGTCAAATGAAACAAATTTTGTGACATCATTAGGTGGTCAGCAGCCCACATATCATCCAAACAGGGCTCGCCGGTTATGCCTTCAAAACAGCATATATGACCATACGATACGACAGGAGAAAATGAAGTGGCCCCGCGTGAGGTCACTAATCGTATTCCCTCATGCTACCAACTTGTTGCCATCCCTTTCGAGATTCCGTATTTTGCGCGTACTGGATTTAGAAGGTTGTCAAGACTTGAAGAATCACCAAATTGAGGGTATCAGTGATTTGTTTCATTTGAGGTCTCTAGTACTGAAGGATACAAATATTGGTAGTCTCCCCAAAAAGATTGGCAACCTAAGTTGTTTACATACACTGGACATAAGGCACACTATCATAACTGAACTTCCATCAACAGTCGTTCATCTAAGAAGACTGGTGCGCCTACTAATTGATGCATCGGTGAAGTTACCTGATGGAATTGGGAAAATGGAATGCTTACAGGAAATATCACTGGTTGGTATTAGCAAGTCTCCAAACTTTTTGAAGGAGCTAGGGAGTTTGACAGAACTAAGAATACTCCAGATTTCAGAGAGTACTGGTGCGTGGCATGATAGTTATGAGAATACTTTGATTGATTCTTTGTGCAACCTGCACAAAATCTGTGACCTGTACATCCATGGCTGTAAACTGTCCACAGAGTTCATATCAAATATAAGATGCTCTCCGCGATATCTCCGATATCTTTCATGTGGCCAATTATCCATATTGCCAAGGTGGATCAATTCATCCTTATTGTCCCTCTCCACCATAGATTTGATACTTAATGTACTCCGACAGGATGATCTTCATAGTCTTGGTGCCTTACAATCTCTATGTTGTCTCCGTCTTAATGTGTTCAAAATTGAACCAGAAAGGTTGGTTGTTGGCACTGAGCATGCAAAGTTCCACTGGCTAGCTGAGTTTTCGTTTACCACTAATGCCATGGGGCTTATATTTAGCCAATATTCTATGCCAAGGCTTGAAAACCTTGAGCTAGCTTTTAATGTTCGAGAGACAAAGTATTTTGATATTGGCTTGGAGCACCTGTCCTCTCTTAAGGATGTCACTGCAAGAATTGATTGCAGGGATTCCAGTATTTTTGAGGTGCAAAATGCAGATGCTGCCATTCGGAGGATTGCATATATGAACTCCAACCAACCTAAGGTTCATGTGATCAGGCATTATGAACACATGTTAATGGATGAGGTGAAGATCCAGAAGGAAACGGAGGAGGAAAAGGAGGTACTTTCTAAATGACTAATTAATGGAAGGCGTAGTAACTTGTAATACATGAAGTTTACATATAAATTTCTGAATCATAGGGTCACTTTTTAAATTCATCGAAACAAAACTGCAAAACTTTGTTTTTCTTTTTTCTTTTTTATTATATCTTGATGTCTTCTTTGCAGATATTGGAAAATAGGATTGGTCCATGGGGTGGAAATGGTGGGGTCACTTGTGACATCAAGGTTGCACCCAAACGCTTGGAAAGCATTACTATTTGTAGCGGCATAATCATCGATGCACTTGCATTTTCTTACTTGGACAAAGATGGAGAGCGACACACGACTAGTTTATGGGGTGGTCTTGGTGGTAGTGTTCAACTGGTGAGTTGATCATTATTATTTTTTATTTTCTTTGCAAAACAAATATGGCATTTATTTCTTTCTTCCTGGATCGAATCCAGTAAAATGAGCAACACAAATACAACTCAATTACATTGCAAGAATTCAGAGGTAATGGACCTTAATTTCCTCGCAGATTGATCTTGATGAAAGAGAGTTTCTTATGGAGGTTATTGGAACTGTGGGTCCATTCAATGTGTTATCTGAGGCTATAACATCACTTACACTTGTGACCAATGTACGTAGCTATGGGCCTTTTGGACAACCACAGGGTACTCCTTTCCGTACTCCACGGAAGAAAAACAGTTGTATCGTGGGATTCTTTGGGCGTTCAGGAACATATCTTGATGCAGTTGGGGTCTATTTTCACCCTATGTAG</dnaseqindica> |
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