BGIOSGA006757
| Gene Name |
BGIOSGA006757 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J023078M02, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006757, complete gene. |
| LocusTag |
OS02G0255000 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA006757-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA006757-PA |
| Length |
7372 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:9717942..9725313 |
| Sequence Coding Region |
9725285..9725313,9724518..9725049),complement(9723445..9723657,9721672..9721952),complement(9721475..9721586 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:9717942..9725313 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTTTCCGAGAGGACAAATATGTGAGATTTCATGACTGGAGATCAGAACATTCTGTTGGTTCCGAAAAGACAGTTTTAGAAGGAAGGCATAATGTGTTTGACTCGCTAATGGATAGAACTGTAGGAGCCTTTTCATTCCTAGGGAATTCCTCACATCCTGAAACCCTCAACAAACCAGCTTCTGAGGAAAAGAAGTCCAAAACAAGAGTTCTTGATCCTCAAGGGCCATTCTTGCAGAGATGGAACAAGATATTTGTTATATCATGCCTTATTGCAGTTTCTGTGGACCCGTTATTCTTCTATATTCCAGTGATTGATGGTGACAATATCTGCTTATATCTGGACAAAAAGTTGGAAATCATAGCAAGTGTCCTGCGATTTTTTACAGATATATTCTATTTACTCCATATAATTTTTCAGTTCAGGACAGGCTTTATTGCTCCTTCCTCTAGAGTGTTTGGTCGAGGTGTCTTGGTTGAGGACACCTTTGCAATAGCAAAGCGGTATCTATCAACATATTTTCTGATTGATTTCTTAGCTGTTCTGCCCCTTCCTCAGGTGCTCGTATTGGTAGTTCTACCCCGTCTGCAAGGCTCCTCAGTTATGACGGCAAAAAATATATTAATGGTTATAGTTATTTGTCAATATGTACCTCGGTTGATTCGAATAATACCATTGTACCTTCAAATCACCAGATCGGCTGGTATAATTACAGAGACAGCATGGGCTGGTGCTGCATTTAACCTTTTAATTTATATGCTTGCTAGTCATGTCCTTGGAGCTCTTTGGTACCTTCTTTCCATTCAACGAGAAGACACCTGTTGGAAAGATGCATGTAGTAGACATGATGGCTGTGATTCGGGATCTTTATTTTGTGGGAGTAATGCAGCTAGAAATAACAGTTTCTTACAAGATTTTTGCCCGACAAATGGAACTGACAATGCAGATCCAACTTTCGGAATTTATCTTCCAGCTCTTCAAAATGTTTCACAATCAACGAGTTTCTTTGAAAAATTGTTTTATTGCTTTTGGTGGGGTCTGCAAAATCTAAGTTCTCTTGGTCAAAATCTTAAGACAAGCACGTATACATGGGAGAATCTATTTGCTGTTTTCGTCTCGACATCAGGTCTAGTTTTGTTTGCACTCCTTATCGGTAATGTGCAGACCTATCTACAATCTGCCTCTGTGCGTATAGAAGAAATGAGAGTGAAACGGCGTGACACAGAGCAATGGATGGCACATCGATTACTTCCTGATAACCTCAAGGAGCGAATACTGCGTCATGAACAATATAGGTGGCAAGAAACAAGAGGGGTTGATGAAGAGGGCCTTCTTTCAAATCTTCCTAAGAATCTTAGGAGAGAGATAAAGAGGCATCTTTGCCTGTCGCTTCTCATGAGGGTTCCAATGTTTGAAAACATGGATGAGAAGCTCTTGGATGCCATGTGTGATCGTCTAAAGCCCATGCTGTACACAGAAGGCAGCTGCATCATTCGCGAAGGAGACCCAGTGAATGAAATGCTCTTCATCATGAGAGGAAATCTTGAGAGTATGACGACAAATGGTGGACAGACTGGCTTTTTCAACTCCAATATTATCAAAGGTGGAGATTTTTGTGGTGAAGAGCTTCTCACATGGGCACTTGACCCTACTTCAGCTTCAAACCTTCCCAGCTCAACCAGGACTGTGAAAACGCTGTCTGAAGTCGAAGCTTTTGCTTTGAGGGCTGATGACTTGAAGTTTGTAGCCACCCAATTCAGGAGACTCCACAGCAAACAACTCCAGCATACATTTAGATTCTATTCACAGCAATGGAGAACCTGGGCAGCTTGTTTTATACAGGCAGCTTGGCATAGATACTGCAGAAAGAAACTGGAGGATACTTTGTTTGAGAAGGAGAAGAGGTTGCAAGCGGCAATTGTCAGTGATGGTTCAAGTTCGCTCAGTCTTGGTGCGGCGCTATATGCTTCACGTTTTGCTGGTAATATGATGCGGATCTTACGGAGAAATGCCACTCGAAAGGCCCGTTTGCAGGAAAGAGTGCCTGCAAGGTTATTACAGAAGCCTGCAGAACCGAACTTTTTCGCTGAAGATCAGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAFREDKYVRFHDWRSEHSVGSEKTVLEGRHNVFDSLMDRTVGAFSFLGNSSHPETLNKPASEEKKSKTRVLDPQGPFLQRWNKIFVISCLIAVSVDPLFFYIPVIDGDNICLYLDKKLEIIASVLRFFTDIFYLLHIIFQFRTGFIAPSSRVFGRGVLVEDTFAIAKRYLSTYFLIDFLAVLPLPQVLVLVVLPRLQGSSVMTAKNILMVIVICQYVPRLIRIIPLYLQITRSAGIITETAWAGAAFNLLIYMLASHVLGALWYLLSIQREDTCWKDACSRHDGCDSGSLFCGSNAARNNSFLQDFCPTNGTDNADPTFGIYLPALQNVSQSTSFFEKLFYCFWWGLQNLSSLGQNLKTSTYTWENLFAVFVSTSGLVLFALLIGNVQTYLQSASVRIEEMRVKRRDTEQWMAHRLLPDNLKERILRHEQYRWQETRGVDEEGLLSNLPKNLRREIKRHLCLSLLMRVPMFENMDEKLLDAMCDRLKPMLYTEGSCIIREGDPVNEMLFIMRGNLESMTTNGGQTGFFNSNIIKGGDFCGEELLTWALDPTSASNLPSSTRTVKTLSEVEAFALRADDLKFVATQFRRLHSKQLQHTFRFYSQQWRTWAACFIQAAWHRYCRKKLEDTLFEKEKRLQAAIVSDGSSSLSLGAALYASRFAGNMMRILRRNATRKARLQERVPARLLQKPAEPNFFAEDQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..29#265..796#1657..1869#3362..3642#3728..3839#4250..4486#6674..7372#ATGGCTTTCCGAGAGGACAAATATGTGAGGTCAGCTTCTGTGCACTCCTTGTACCAACATCCAAGAGTGTGTTGGTGTCTGAAACAAAATTTTTATTTCGTTCAGATTTCATGAAGGCCTACTCCACATGACTAACAATTTGGTTCATTTTATGGCTTACAGAAATTTCTTATTCTACTACACTGAAAAAATGTTGCAATATAAATAGCTGCCATGCACATTATTCCGAGGAGTACTTTGACCTGCTATTTTTTTTATGTGCAGATTTCATGACTGGAGATCAGAACATTCTGTTGGTTCCGAAAAGACAGTTTTAGAAGGAAGGCATAATGTGTTTGACTCGCTAATGGATAGAACTGTAGGAGCCTTTTCATTCCTAGGGAATTCCTCACATCCTGAAACCCTCAACAAACCAGCTTCTGAGGAAAAGAAGTCCAAAACAAGAGTTCTTGATCCTCAAGGGCCATTCTTGCAGAGATGGAACAAGATATTTGTTATATCATGCCTTATTGCAGTTTCTGTGGACCCGTTATTCTTCTATATTCCAGTGATTGATGGTGACAATATCTGCTTATATCTGGACAAAAAGTTGGAAATCATAGCAAGTGTCCTGCGATTTTTTACAGATATATTCTATTTACTCCATATAATTTTTCAGTTCAGGACAGGCTTTATTGCTCCTTCCTCTAGAGTGTTTGGTCGAGGTGTCTTGGTTGAGGACACCTTTGCAATAGCAAAGCGGTATCTATCAACATATTTTCTGATTGATTTCTTAGCTGTTCTGCCCCTTCCTCAGGTACATCTGCAATTTACTTCATTAATCTTTTAGATCTGAGCACTTAAAACAATGAGCTACTTATAAGTCTGGTGTTTGTTAGGGTCATAAAGGTTCTTTGCATAGTATATTAATATGCATTCACTTTTGTACTACTTTACTCATGTACGATTTTAAGGAACGCAATAGTAATCAGTTAAATGTAGCTGTTAGATATACTGGACACTTCAAAAAAACTTTGAAGAACTATTGTCTTGGCTCTGGTGTACCCTACCCCCTCCTGTCACAAACCTTTGGACTTACATATTCAGACTGGACATTTGAAGATAATGTGTATAGATTTTTCTTGAGAAATACTTCCATATATTTCAAATTTACCAGGTCTTAAATATAATACAATAGAAATTAGTTATGGTCAAAGTTCAATTTTAAGGTATCATGTCAATGTGCAAAACGACATGTATTTATGATTGATCTGCAGCTACTGATCGTGAAATTACACCATGGTTTGATGAACTTCCATGCTTTCTAGTGGCCAAATTGGATAGAGCTGTTGTATCATAGGTGGGGGATTCAATTGAATGGATAATACAAACCAGAAGATAATAAAATATAGGCACTGAAGATATGTTTGGTTTTTATTATGCATGAAACATATACATGTTTGACTCAATCATGCATGCAATAAGTTTTTAGACAAGTAAGGATGGGAACAAATTGGGAATATGCATTCTATGAATTATTTTGTTCCTTTTTCATGTGCGGGTTGTTTTGAGTTGCAAAGGTAGAACAAACATTCAAGTGTTATGTGGTTGACTTGATGTATCATTCCTAAGGATCTCTTTTGTTTAAGTTGTAACAATATTTATTTTTGTTATCAGGTGCTCGTATTGGTAGTTCTACCCCGTCTGCAAGGCTCCTCAGTTATGACGGCAAAAAATATATTAATGGTTATAGTTATTTGTCAATATGTACCTCGGTTGATTCGAATAATACCATTGTACCTTCAAATCACCAGATCGGCTGGTATAATTACAGAGACAGCATGGGCTGGTGCTGCATTTAACCTTTTAATTTATATGCTTGCTAGTCATGTAAGTCTTCTACATCACAAATTACATGGCATGCTAATTTGGGCCATTTTATATCTTCTGCCTAATTTTCATTCTTGGTGATAATTCAGTGAATATTGTTTGACAATAGTTCTTTGCTTGTGGTCGTGAAACATTCTACCTGAATGAACTTTAGTATTTAGTTTTTGGGACATAGATCTACAAAGATTAAAAAAAATGTCATATGGGGATTCTTTTTTTCTCATAGATGCGTGTCCATGAAGAATTTATGCTTGTTAGCTTCAGCTTTGTCACATCATTGAAATAAAGATCAACATGTTTAATGTAGATTTTTCAGCACAATAGTACCATAGTAATATCCACTATCCAGTATCAACCATGTTTTTAGTTTAACAATCTGCTCTATATTGTCTGAGGCAACTATATATCGTATTTCGTAGTAGAAACAATAAAATGTGTTGTCACAGTGAGGCATGCCATACATACAATATCTGGCTATCTGTATATGTGGATGAGCTGATCATATCTTGGACATATCCTCTTAGCAATCAATGGAACTGTTTGCTGAATTGGATGCCCAGAGTCTGAGTTGGATTCTACACCCATGTCCGATCCCGAGTAGTATTTCTCATGTCGAATCAGACATATGAATCCGAGTTGGGTTTGACGCATGTTGGCTTTGTGGTAACACTGTGTTTAGCTTAAGTTAGCCTAAGTTTAGGGCCACTTTGTTACTGCATGGGGTTGATACATGAAATTGTATCAAATGATATTATGATGCTTCAGGGTCTATAGCACGAGTGCAGGCCCATTTTAATTCTTCTGGATAAGCGACAGCCAAAAACCAAGTTGCGATGTGCATGTACAGCCTGCCCCGCACTGGGGTTAGAACTTGCAGCCTGTCCCCTGGGTTTATAGAGGGCATCCAACATTACCCTTTCTGCATGGGCAAGTATATTGGACACCATGTTGATGTCTGAAGAACTGATTGTCTCTGTTATGGGCCAGGGTTCATAGGGATAAACACTGCCAGGAGGATAGCGGGGCAGCGATGGCTGCTAGGGGTGAGAGAGGACTTAGGTTGAGGGAGACTGATTCTGAATTCATTGCTGATCCAAACGATGTTACATCCATCCTTACATAGATGGAAGGAAGGGCCCAGTCTAATCCTATCCAACAGACTCTAACCAACCAATACCATATCATGTAGGCGTGTACGAGGCGGCGATATCATTCTCTTGACAGGTGGGCTGCCCTGGGGCCTTGACCTCTCAGCCCAATCCCCATGACAGTCACTTAATTGCTCCATTATAACTTTCAGAAAAAACAAGGCATATCCAAAATGTCTGCAAAAGCATCTGGTACCTGTAGATATACTGCAATAAAATAAAATAAAATAAAAGATGCATGCCTGTGATACGCCATTCAGTTCTTCATAAGAGGCTAGTCAGTTTGCACATATTTTGTTATTCATGGTCAAGATATTACTAACTGATGCTTTAAATGCTTGCAGGTCCTTGGAGCTCTTTGGTACCTTCTTTCCATTCAACGAGAAGACACCTGTTGGAAAGATGCATGTAGTAGACATGATGGCTGTGATTCGGGATCTTTATTTTGTGGGAGTAATGCAGCTAGAAATAACAGTTTCTTACAAGATTTTTGCCCGACAAATGGAACTGACAATGCAGATCCAACTTTCGGAATTTATCTTCCAGCTCTTCAAAATGTTTCACAATCAACGAGTTTCTTTGAAAAATTGTTTTATTGCTTTTGGTGGGGTCTGCAAAATCTAAGGTCTGTAGAAATAACCTTCGTTTTATTTTCCCTTGAAGAACACATACTTCAATATTGTTTCTATATAGTTTTTTATTTGTTGCAGTTCTCTTGGTCAAAATCTTAAGACAAGCACGTATACATGGGAGAATCTATTTGCTGTTTTCGTCTCGACATCAGGTCTAGTTTTGTTTGCACTCCTTATCGGTAATGTGCAGGTATGGAATATATCAACTGTCATATTTTTATTATGATCATAATTGGATTAAGTAGTTAATATTTTTTATATATGCAACTTGTGTGGAGTATCTTTTTTAATGAAAATAGTACACTGTAGATGTGTTTCTCTGACATGCATGTTCTCTTTATCTATTCTCTGGCATGCATATTGTCTTTTCAATAGAAGCCACAATTAACGAGTTATATAGCCAATTCATATTCTCTTTATGTATCATTTTTTCTCCTTAAAAATTAAAGGGTTAAACAGCTCCTTTTTTGCAATGCTATTTACTTATATTACATGTAATGAAAACAACTCTGTTGTTTAAGGTGTAATCGGGATGACAATTAAATGTGTAAGCGGCTCGATTTCTTCCTTTCGTAATTTTCTATTGCATGTATTTTGTAGACCTATCTACAATCTGCCTCTGTGCGTATAGAAGAAATGAGAGTGAAACGGCGTGACACAGAGCAATGGATGGCACATCGATTACTTCCTGATAACCTCAAGGAGCGAATACTGCGTCATGAACAATATAGGTGGCAAGAAACAAGAGGGGTTGATGAAGAGGGCCTTCTTTCAAATCTTCCTAAGAATCTTAGGAGAGAGATAAAGAGGCATCTTTGCCTGTCGCTTCTCATGAGGGTATTTTCTCATACCTTTGCATAATTTGCTACTATGTTTTGAGAGAATCCTGATTCTTGTCCCATCTGGGTGTATATGAAAAGGGTTATTCTTGAGACTCGCACAATCTTTCATACCTTCATCTTGAGACAACATGCATCTTCCATGATCAACACTAAGCCCAACTGCATGTCATGCCAAATCATATGTTGAGGATTGATTTCTTGCCTTCTATTTCCCAAGGACCATTAGTTAGATTGTTACATAAAAACAATTTGCATGTGGTTTGTAAATTCCAAGTTTCTTGCTTATTTTGAATAGTTGCATCTGTACTGGTTTTGTCAGATGTTAGTTCTGGACTTTCTGGTTTTGTGTCAGACCTTTCCTCTTCTGGGTCATAGTGTAAGTCTGGCAGTTCCTGAAGTCTAATCAGTAATCTGGTTTAGTATAG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