BGIOSGA006852
| Gene Name |
BGIOSGA006852 |
|---|---|
| Description |
Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006852, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_006296 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA006852-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA006852-PA |
| Length |
7175 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:7879747..7886921 |
| Sequence Coding Region |
7886774..7886921,7884922..7885025),complement(7884747..7884842,7883883..7884002),complement(7883308..7883514 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:7879747..7886921 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACCCCTTCTCCAAGTCCCCCGACGACGACGACCTCCGCCCCGAGGCGGAGGCGGCGAGGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCAGCCGCGGGAGTGGCGGTTCGCGCAGGTCTTCGGGGAGCGCGCGGCGGGGGAGGACGTGCAGGAAGTTGACATCATCTCTGCAATTGAGTTTGACAAATCCGGTGACCATCTTGCCACTGGAGATAGAGGTGGTCGTGTAGTTTTATTTGAAAGGACTGACTCCAGGGATAGCGCCAGTCGGAGTGAACTTGAGAGACAAGATTACCCGATTGCCAGGCATCCTGAATTCCGTTACAAGACTGAATTTCAGAGTCATGAACCTGAGTTCGACTACCTAAAAAGTTTGGAAATAGAGGAGAAGATTAACAAGATCAAGTGGTGCCAAACAGCCAACAACGCCCTCTTTCTCTTATCTACAAATGATAAAACAATCAAGTATTGGAAGGTGCAAGAGAGGAAAGTAAAACGAATTTCAGTGATGAATTTGAATACCTCTCAAAGTTCAGGCAATGGCACAACTTCTAGTTCAAGCAGCAGTAGTTCTAGAGCGATTCTTCCAAATGGTGGATGCTCAGAGAAGTTATACAACTTCCCAAACAACGACCTATTATTTCCTCCTGGAGGATGCACATCATTGCGTCTGCCTGTGGTAGTCACTGGCCAAGATTTGAACCTTGTACCAAGATGCCGGCGTGTATATTCACATGCTCATGATTACCATATTAATTCCATTTCAAATAATAGTGACGGGGAGACATACATATCAGCAGATGATCTGCGAATAAATCTTTGGAACCTGGAAATTAGCAACCAAAGCTTTAATATTGTTGATGTGAAGCCTGCAAACATGGAGGACCTAACTGAGGTGATCACATGCGCGGAGTTCCACCCAACTCATTGTAATACATTAGCCTATAGTAGCTCGAAGGGCTCTATCAGGCTTATTGATCTGCGGCAATCAGCACTATGTGACAACCATGCTAAGTTATTTGAGGAGCATGAGGCACCTGGATCGAGATCCTTTTTTACAGAGATAATTGCATCGGTTTCAGATATAAAATTTGCAAGGGATGGAAGGCACATTCTTAGTCGTGATTATATGACTCTCAAGTTATGGGATATAAACATGGATTCAGGCCCAGTTGCAACTTTCCAAGTTCATGAATATTTAAGACCTAAGCTCTGTGATCTATATGAAAATGATTCAATATTTGACAAATTTGAATGTTGTCTGAGTGGGGATGGACTTCGTGTTGCAACTGGCTCTTACAGCAATTTATTTCGTGTTTTTGGTTGTACTCCTGGAAGTGCGGAGGCAACCACCTTGGAAGCAAGCAGAAATCCTATGAGGCGCCAGGTTGCTAATCCAACAAGGCCTGCACGGACCCTGACCTCATTGACCCGTGCCGTGAGGAGAGGTGGGGAAAATCCGGGAGTTGATGCTAATGGAAATTCTTACGATCTTTCAACAAAGTTGCTCCATCTTGCATGGCACCCAACTGAGAATTCCATCGCGTGTGCTGCTGCAAATAGCTTGTACATGTACTATGCATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDPFSKSPDDDDLRPEAEAARRPQPQPQPREWRFAQVFGERAAGEDVQEVDIISAIEFDKSGDHLATGDRGGRVVLFERTDSRDSASRSELERQDYPIARHPEFRYKTEFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIKWCQTANNALFLLSTNDKTIKYWKVQERKVKRISVMNLNTSQSSGNGTTSSSSSSSSRAILPNGGCSEKLYNFPNNDLLFPPGGCTSLRLPVVVTGQDLNLVPRCRRVYSHAHDYHINSISNNSDGETYISADDLRINLWNLEISNQSFNIVDVKPANMEDLTEVITCAEFHPTHCNTLAYSSSKGSIRLIDLRQSALCDNHAKLFEEHEAPGSRSFFTEIIASVSDIKFARDGRHILSRDYMTLKLWDINMDSGPVATFQVHEYLRPKLCDLYENDSIFDKFECCLSGDGLRVATGSYSNLFRVFGCTPGSAEATTLEASRNPMRRQVANPTRPARTLTSLTRAVRRGGENPGVDANGNSYDLSTKLLHLAWHPTENSIACAAANSLYMYYA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..148#1897..2000#2080..2175#2920..3039#3408..3614#3806..3897#4163..4281#5087..5210#5367..5490#6047..6115#6203..6294#6394..6471#6861..6928#7039..7175#ATGGACCCCTTCTCCAAGTCCCCCGACGACGACGACCTCCGCCCCGAGGCGGAGGCGGCGAGGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCAGCCGCGGGAGTGGCGGTTCGCGCAGGTCTTCGGGGAGCGCGCGGCGGGGGAGGACGTGCAGGAAGGTGAGAACGCGCCGACCCGCCCCCTTCCGCTGCTCGCCGCGTGCGTCGCGTGGCTCGTGAGATCTGCCTCGGTCCGGGGCGGGATGTGGGAGGGTTTCGACGCGGGGTGGCCGCGCATTCCTCCGTGTAGGGGGATTCGGATTCGAAGGGGGCGTGTGGCGGGGTGGCGAATCGAGGGGATTTCGCTGGTGATTTTGAGGTTGTTCGTTGCGTAGGGTGGAGCCGTTCGTGATCTATAGGACACGGGTTCACTGGTTAAATAAATAAATGGCTTTACCAAACTATATGCCAGGTGCGGGAATGGATCACTTCCCTGCGCTGTAGGCTTTGCTCGCTAAGACTTTGTAGCTGGTAGGTAGTTAGTGTTTGTAGGTGAACCGAGATGTTTTTGTTTGCCATTAGAGTGGGTTTGTAAGGATATGAGGAGGAAAGTGGGGGTTGGTGGATCTCCTGGACATAATGCCTCGTGCTTTACATCATGGCACTTTAGTGGGGAGTGTTGAAAGTCTGAATCTTTGTGCGATGATGTGTGGTGATTGTGTATTGCTCAAGTTTTTCTTATTCCTAGTGTCCTAGTATGATTTTGCTACAAATATATATTTATGAGCTTTGGCATGCGAAGTGGGATCACATAATTGAAAGTGATCCGCGGAGCTCCTGGGGGTAATGTTTGCGTTCTAAATGTTCTTTTAATGTGCTTATATGAGGGCTCATAAGCATGTTTCTTGTTTTCTTTCTCTACTTTCAATGTGCCATCTTCTGTTAGGCATGTGTGGATTATGTGATATATTGCTTCTTAGTTGATTTTCAATTTGTCCTGGTTCTGTGGTTAGATGTGTTGGTTTCATAACAGTTTCTCAATGAGTAGTGAGATAATTCTTATTATCTCTTCCCCTGTAACAGATTTACATATGAACTGCCTGTGTTTTGCATGCTTGTTTTTGGCCTTTGACTTGCTTACATTAGCAGCACATCTTTTTCTTGTTTCAACCATAGTGGTCCATGATTAGCTTTCCTTCAGGAATTCAGGATCTTCTACTTGTCTTCAGTTTGTAGTGTTATTCAATACACAAAATGCATTGGTACATAAGTATGATGGTGCAGTTTAGGGGAGGCAAAGTGTTACCTCTACTTATATGAATGCAGTAGCATAAAGCTGAAAATGCCTGCAAATTATATCCCTATTGGATCCAGTTCTTCTACCTGTCGCATATTTAACATGATTTCAGCACCTACTAATATTGTGCTACTCCCTCTGTCCACATTATAAGTTGTTTTGGCCTCTCCATCCCTCGTCTAGATTCACTAACATCCGTACGAATTTAGGCACATATATGAAGCACATGCATGGATCTATTCAAAACCCAAAATGTCTTATAATGTGAAACAGAGGAAGTAGCATCCTTTTTCTAAACAGAAAATGCACTCCACTGCTGCCAATCAATGATTGCACATAGTCGACAAAACTAAACAAGCAAGCTCAAATTTATCCAAACAGCAGTGATGTTTCTTATCTCTTTTTATCTTTTTTAGAGATTGCCATAGTCCTCACAAACCTTTTTAAATACTTTGTCCCAGTTTAATTAACATAAAATTGTCCGTTCTTCTCTTCAATTCAAATGTACTGATGTTTGTGGTTTTATTCATTTTGCCCGAAAGTTATGTCAAATGACTTGAGCATTGCTTTTTTCACAAGGTGGTTTTGATATCATGATATGCATCTTAATTACATGTGTTTCTTGTTTCAGTTGACATCATCTCTGCAATTGAGTTTGACAAATCCGGTGACCATCTTGCCACTGGAGATAGAGGTGGTCGTGTAGTTTTATTTGAAAGGACTGACTCCAGGGATGTAAGTACCACACACTATCTAAGTTATGTAGGTTTCTTGTTTAAATCTCTTGTTCTCATAGAAGTCAATTTATATGCAGAGCGCCAGTCGGAGTGAACTTGAGAGACAAGATTACCCGATTGCCAGGCATCCTGAATTCCGTTACAAGACTGAATTTCAGAGTCATGAACCTGAGGTATGTGAAACTTAAAATGGTTTTAATTATAGTGTCTCCCCTGGTCCATGAATCAGAGTGACATATATATCTGCCACAGTTGGACTGTATAATTTTGATAAGAATTTAAAAGTAACAAAAATATCTGATCTGAATATATGTTTTTGCCCATGTTAGATTTCTTGAAAACCTCGAGTCAAGTCAGGCACTTAAACTTGAGAGTTTATAATAAAATTTCAAGTTGGAGGAAATCACATTATATTTTGAAACATAAGCATAGGAAATTGTCAATTCTGACAGTACATACAATGGTAGGTAACAAACATACAATGGTAGGTAAAAAACATCCAGTTAGGTGTAACGTGGTAGTACCCTTCATCCATGAATATGTGCTGTTTGTAGATCCAACCTTATAAAAACAACATGATAGCGATCTTAATACATTATTGCTAAAAGTGTTTTCATGATGTTATAGCATTTTTAACTCATGCTAATATATTAATTAACAAGAAATTGATTGCCAAAGTTGTACAATGGAGACAGTATCAGAGTCTATAGCAACAGGATTGTCAAGCTTGTGCACCAATGACTGTATCAAGTCTGTAAGTGCACATAGGGGTATTAGTTATAGCAAAATTTTTCCTTTGCTTTGGTTGCAGGCTTCCAGGATTATCTTACCAAGCCATATGCACTGCATGTTAGATTGTTATTAACTATCCTGGAATTTCTCAATTTGTTTTTCTGATTTATATGTAATCCATGTAGTTCGACTACCTAAAAAGTTTGGAAATAGAGGAGAAGATTAACAAGATCAAGTGGTGCCAAACAGCCAACAACGCCCTCTTTCTCTTATCTACAAATGATAAAACAATCAAGTATTGGAAGGTACAGTTGTGTCACGAAGCTTCCATGTTCATTTCGTTTCTTATGGGTATGATCACTTGCCTACATCGGTACTAGAAGTTTGCATCCGATATTTTAGTTTGCATAATGTTTTTGCCCCATGAGGCCATGAGTTATATTTACAATAAACTTATTTCAGAGTTTCTCCTGGTATGGACAGGATATTTCTTCACAGGCTGGTTCTATCAAGGAACACATGCTTTTCGTTCTTTGATCTTTACAGATACAAATGAACCATACAATCGCTTCACAGTTTTAATTATTTGCATGCTATCTCTTTCTTTCTTTGTTTAGCTCTTATTACTTAAGCTATGTAGTATCAATACATTACAGTTTTACTATCTGTACAGGTGCAAGAGAGGAAAGTAAAACGAATTTCAGTGATGAATTTGAATACCTCTCAAAGTTCAGGCAATGGCACAACTTCTAGTTCAAGCAGCAGTAGTTCTAGAGCGATTCTTCCAAATGGTGGATGCTCAGAGAAGTTATACAACTTCCCAAACAACGACCTATTATTTCCTCCTGGAGGATGCACATCATTGCGTCTGCCTGTGGTAGTTGTACTTAACCCACTTTATTCATTATCTCATCTGTAATCGTGTTGTTCTGTACAGCACCAAATCTGGTGTTCACATGTAAAATAAGTCTCCTTTTGGCATGAATACTTATAGATAGATTTTCTTCTTATGGCAAACTGCACATATGATTACAATATATGAGTATTTATTTTCATTTACTATGTATGCAGGTCACTGGCCAAGATTTGAACCTTGTACCAAGATGCCGGCGTGTATATTCACATGCTCATGATTACCATATTAATTCCATTTCAAATAATAGGTTAGCTACCTTCCTGATATTATGGATATCTGATCAGGCTTGTAATTTTGTAATTTTGATTCTTGTTCTGTTGTTTTATTGGCTCCAAACTATTACACATTTATCTACTTTTTTCATCTGTTTATGCGTGTATCTGTGTTTCTTTACTGATTTGTGCCTTATTTCCTGTGTGAGTTCTCTGAACCTATAATACTACCTGCTTCTGTATATTTTCAAATCATGAGCATGAAGCTAATACCATGTTCTCATATTGTTTTACACCCAGTGACGGGGAGACATACATATCAGCAGATGATCTGCGAATAAATCTTTGGAACCTGGAAATTAGCAACCAAAGCTTTAATATTGTTGATGTGAAGCCTGCAAACATGGAGGACCTAACTGGTAAATTTTCCAGTGTGAGATAAGCTAGGCATGCTGTGGATTTGCCATTTGGCTTCCAGTTAGTTTTAAATGTTAAACACACGAATGCTATCTAATTGGTCACTCGGTCCAATAACAAGATGTTCCATATATTATTAGTGGAGTAAGACGCGTGGCAAAGTAACTGGAGTCCTTTTACCATGCAATTATTGGTATCCTACAACTACAAGTGTTAAATGTATGCAGGGTACTAGTTCTCTTGATATCCCTAATTACTAATTGCATTTCCCATGTGAATAACCTATTGTTGGAATGGCAACATGCATATCACTATGTATTAATTTGAAGTTTTCTCCCTATTTGGGTGGTCTGAAAATTGTCCATGCTCAACTATGGTTAAAGGTTAGATTGGGTGGGAAAGCAAATTCTTGAGGAATCATCTGTCTGCATCTATATGTTGGTATACTTGCTAGCGTCTCCTTGCGAATGTATACACTTTGTAGCTCAGTTTTGACAATCGATATCTGGCAGCTTTCATACAATACTGCAAAATAACGAATTAGAGTAGCCGTTTTT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