BGIOSGA006952
| Gene Name |
BGIOSGA006952 |
|---|---|
| Description |
BGIOSGA006952 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006952, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA006952-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA006952-PA |
| Length |
6579 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:6244800..6251378 |
| Sequence Coding Region |
6250875..6251378,6250683..6250776),complement(6250093..6250175,6249525..6249622),complement(6249341..6249410 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:6244800..6251378 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGACGCACCGAGACGTGCGCTTCGTCTCCTCCGGTGTGAAGCTCCCCTGCGCCGACGCGGCTCCGGCGCCAGCGCCAGCGCCGACGCTGCTCTCCGCGGCGCTCCCGTTCGCGCGCATCGGCCGCGCCATCGATGGCGTGGTGCGCCACGTGGCCAGGTCGCTGCCCAGGCTACCCGTGGCGAGGGCCGAGACGGGGGCGGGGGCGGCGGCGGCGCCCATCGCGCTGCCGCGGAGGCAGAAGGACGGCGGAGGGGGTGGAGGGGGAGAGGAGCGGGTGCTGATCAGCGAGGTGGCGGTGAGGGGGAAGGACGGGGAGCCCCTGGAGCGGCCCGAGCTGGAGGCGGCCGCGGCGGCGGCGCTCCGGGCGTGCCGCCCCAACGCGGCGCTCACGGTGCGGGAGGTGCAGGAGGACGTGCACCGCGTCGTCGAGAGCGGCCTCTTCCGCTCCTGCATGCCCGTCGCCGTCGACACCCGTGACGGCATTCGTCTCGTCTTTGAGGTGGAGCCGAACCAGGACTTCCATGGGTTGGTCTGTGAGGGTGCCAACATGCTGCCATCTAAGTTCCTAGAGGACGCATTTCATGATCGCCATGGGAAAATAATCAATATAAGACATTTGGATCAAGTGATCAAGTCTGTTAATGGATGGTATCAGGAACGTGGTCTAACTGGCTTGGTTTCATATGCTGAGATTCTTTCTGGAGGAATTCTGAGGCTACAAGTTTCTGAAGCTGAGGTTAATAATATCAATATTCGCTTTCTGGATAGAAGAACTGGTGAACCAACTGTTGGGAAGACGCAACCAGAGACAATACTCCGTCACCTTACCACCAAGAAGGGTCAGGCTTACAATAGAGCACAAGTGAAAAGGGATGTTGAAACAATCCTTACTATGGGAATCATGGAGGATGTTACTATAATTCCACAGCCAGTTGGAGATTCTAATAAAGTTGATCTTGTCATGAATCTTGTTGAACGACCTTCGGGTGGTTTTTCTGCTGGTGGTGGCATTTCAAGTGGGATAACAAATGGACCACTTTCTGGGCTTATTGGCAGTTTTGCATATTCTCATCGAAATGTTTTTGGGAGGAACAAGAAGCTGAATCTCTCACTGGAGAGGGGGCAAATAGATTCTATATTTCGATTAAACTATACTGATCCTTGGATTGATGGTGACAATAAGAGGACCTCCAGAACTATCATGGTTCAGAACTCTAGGACTCCCGGAACACTTATCCATGGCGGGGACCATCCTGACCATGGGCCCATTACAATTGGACGAGTTACTGCTGGCATTGAATACAGTCGACCATTCAGACCTAAATGGAGTGGCACACTTGGATTAATATTTCAGCATGCTGGTGCTCGTGATGACAAAGGCAATCCTATCATCAGAGATTTCTATAACAGCCAATTAACTGCCAGCGGAAATGCTTATGATGATACACTACTAGCTAAGCTTGAAAGTGTCTACACAGACTCTGGAGATCGTAGCTCAACAATGTTCGTTTTCAACATTGAGCAAGGTCTTCCTATTCTTCCTGAGTGGCTCAGTTTTAACAGAGTGACAGCGCGTTTGAGGCAGGGCTATGAAATTGGCCCTGCTCGACTTCTTCTAAGTGCTTCTGGAGGTCATGTAGAGGGAAACTTTTCGCCTCATGAAGCATTTGCAATTGGTGGGACAAATAGTGTAAGAGGATATGAAGAAGGTGCTGTTGGTTCTGGCCGCTCATATGCTGTTGGTAGTGGAGAAGTCTCTTGCCGCATGTTTGGGCCATTGGAAGGTGTGGTGTTTGGTGACTATGGTAGTGATCTTAGTTCTGGTCCCAAAGTTCCTGGTGACCCAGCCGGAGCTCGTGGGAAGCCAGGAAGTGGTTACGGTTACGGTGTTGGCATCCGTGTGGACTCCCCACTGGGACCTTTGCGTCTTGAGTATGCTTTCAATGATAAACAAGCAAGGCGATTTCATTTTGGGGTTGGCTACAGAAATTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGTHRDVRFVSSGVKLPCADAAPAPAPAPTLLSAALPFARIGRAIDGVVRHVARSLPRLPVARAETGAGAAAAPIALPRRQKDGGGGGGGEERVLISEVAVRGKDGEPLERPELEAAAAAALRACRPNAALTVREVQEDVHRVVESGLFRSCMPVAVDTRDGIRLVFEVEPNQDFHGLVCEGANMLPSKFLEDAFHDRHGKIINIRHLDQVIKSVNGWYQERGLTGLVSYAEILSGGILRLQVSEAEVNNINIRFLDRRTGEPTVGKTQPETILRHLTTKKGQAYNRAQVKRDVETILTMGIMEDVTIIPQPVGDSNKVDLVMNLVERPSGGFSAGGGISSGITNGPLSGLIGSFAYSHRNVFGRNKKLNLSLERGQIDSIFRLNYTDPWIDGDNKRTSRTIMVQNSRTPGTLIHGGDHPDHGPITIGRVTAGIEYSRPFRPKWSGTLGLIFQHAGARDDKGNPIIRDFYNSQLTASGNAYDDTLLAKLESVYTDSGDRSSTMFVFNIEQGLPILPEWLSFNRVTARLRQGYEIGPARLLLSASGGHVEGNFSPHEAFAIGGTNSVRGYEEGAVGSGRSYAVGSGEVSCRMFGPLEGVVFGDYGSDLSSGPKVPGDPAGARGKPGSGYGYGVGIRVDSPLGPLRLEYAFNDKQARRFHFGVGYRN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..504#603..696#1204..1286#1757..1854#1969..2038#2620..2713#2802..2883#3087..3122#3436..3589#3684..3827#4797..4867#4997..5075#5160..5275#5410..5557#6047..6116#6425..6579#ATGGGGACGCACCGAGACGTGCGCTTCGTCTCCTCCGGTGTGAAGCTCCCCTGCGCCGACGCGGCTCCGGCGCCAGCGCCAGCGCCGACGCTGCTCTCCGCGGCGCTCCCGTTCGCGCGCATCGGCCGCGCCATCGATGGCGTGGTGCGCCACGTGGCCAGGTCGCTGCCCAGGCTACCCGTGGCGAGGGCCGAGACGGGGGCGGGGGCGGCGGCGGCGCCCATCGCGCTGCCGCGGAGGCAGAAGGACGGCGGAGGGGGTGGAGGGGGAGAGGAGCGGGTGCTGATCAGCGAGGTGGCGGTGAGGGGGAAGGACGGGGAGCCCCTGGAGCGGCCCGAGCTGGAGGCGGCCGCGGCGGCGGCGCTCCGGGCGTGCCGCCCCAACGCGGCGCTCACGGTGCGGGAGGTGCAGGAGGACGTGCACCGCGTCGTCGAGAGCGGCCTCTTCCGCTCCTGCATGCCCGTCGCCGTCGACACCCGTGACGGCATTCGTCTCGTCTTTGAGGTCAGGATTATTATTATTATTATTATTTGCTCGTTCCCCATTTTCTCTTCGTCAGCTAACCTTGGAACTGATTATTGCACATTTTGGGCTTGGTTTAGGTGGAGCCGAACCAGGACTTCCATGGGTTGGTCTGTGAGGGTGCCAACATGCTGCCATCTAAGTTCCTAGAGGACGCATTTCATGATCGCCATGGTAAGAACTTGTCCACCTTCATTCTCGGTAGCCTGCTGTGGTGGATGAAGTGAAATGTGGTATAGATTATCATAATTGAGGATATGTGCCTGTCAGGGTAAAAAGCTACATTTGTTTCATTTACTCATACATCATATCAAAAGCTTTAAGCAATGCAAATCGTTGTTCTCCTATTGTAAAATCTGGGTAAAGAGCCATCAAAGTATAGCGGTGGTCAGTATCCTATATCTTTGACATAGCGTATGCATTTGTCTAGAATGAGTTTGGGTATTGAATTCCAGAACTCCACTGGATTAAAATGTGCTGCTTTGCAGCTCTTATTGTTGGTTCATTTTGACCCTATAGACAAAAATGCTTTTCTACATCCTACGAAATCTCATAGTTGTACCATTTCTCTATGGAGAAAGAATGCGCAATTCATTTCCTCTTTGTAATCCTAATGTACCTTTTCTAGCTTGTCGCATTTTCTTTTGAGACCTACTTGAGTTTTCATATTACACTATGCAGGGAAAATAATCAATATAAGACATTTGGATCAAGTGATCAAGTCTGTTAATGGATGGTATCAGGAACGTGGTCTAACTGGCTTGGTAAGTGGCAAATCAGTGAATATAAAACTCATCTTCTACTTTTGTATGCTATTTGGTTCTATATCACATTTTGTTTAAGAGGTTTGAGCATTGCTGTAATCAGGCTTCTGGTGCCCATTTGATTTACAGTACATTCTTTGTAACTACAAACTTTTAGATGCATACAACAACAGCAGTCGATTTGTTGCTATCCAGATTGTCTAACCTGCACTATTTGCATATATATTGCTGATGTCAAATAGGTGGGCATATACCATGGTAATCCTCTGTTATTTGTTAAATTCTTAGTCCTAACAGGATTAGAAATATGATGTGTGGTTAATGCTGAAGTTAGCAACCTATCGATAAGTTGAGCTCTGGCATTCATTATTGTAGGGCAAAACACATCAGACTTTTACAGTTTTAACAAGAAAAACAAGGTATTTTGTTTACTACTGATAAATCAATAAAGCCCCTTGATTTGGTATCAGGTTTCATATGCTGAGATTCTTTCTGGAGGAATTCTGAGGCTACAAGTTTCTGAAGCTGAGGTTAATAATATCAATATTCGCTTTCTGGATAGAAGAACGTGAGAACCATAGCCTGATTTATTGAGATTCGCTTCACTTGTTACTGTTTTATTTCTATGCGATATTCTGATCTTTCTTATCTTCCACCTCTTTCTATTTCTCTCCATCACCAGTGGTGAACCAACTGTTGGGAAGACGCAACCAGAGACAATACTCCGTCACCTTACCACCAAGAAGGGTCAGGTCAGATCATTGAAATCACTTTGCTCCATTTGTGTTTACCTACTTTAGGAACACTATTCCACTACAATGATATTTACAAATTTCACATCAGTTGTGTTCTCAATGTAGAAGTTTTCTTGTGATATGATTTTAAGAACTAGTTCCATTTATCTACTTTAAAAGCACTATGTCACTGTTGATGATATTCACAAATATTCATATCAGTTATATCTAGAACATACGAGTTTTCATGAGATATGACTTCAAGAACCATTTCCATTTCATACTGAACTGTGCACTAGGCATTGAAGCATTGCTTTGGTGTGCTTCTGAAATTGCAATGCAAATGCCATAATTACAAAACTTAATTTTTATACCGATGTTAGAGTGTACTCATTAAATTCTTTGAACATTTATGTATAATATTTGCCTATACATATAATTTTGCACAAATTCTGTATTCTGCAAAAAAAAGGAAAGAAAGAAAGAAAGGGGTAGTCACGCAATCTGAAGCAGAAGTATTTTGCTAATGAAAATACAGACTAATTCTCTGATAAGAGTGATACTGTATTATCTGTCTAAACTTGTGATGATGAAAATAGGCTTACAATAGAGCACAAGTGAAAAGGGATGTTGAAACAATCCTTACTATGGGAATCATGGAGGATGTTACTATAATTCCACAGCCAGTTGGAGGTAATGTTAATTTGTTAGTTCAGTCTGTTTCGGAAAGCTGGTATTTGCACTTATTAGCACATGTTTTCTTACTTATGATCTTCTGCAGATTCTAATAAAGTTGATCTTGTCATGAATCTTGTTGAACGACCTTCGGGTGGTTTTTCTGCTGGTGGTGGCATTTCAAGTGGGTGAGTACAAGGCTTGCTGAGCGAACTTAATTGAATGAAATATCAAATCTTTGCTTTCATAAAAATAATTTCCTTATCCATAAGGTTCTGATAATGTTAAACTTACTGTACCTCAAAGACCATATGCAAAATATATGCAAATTTGCATCCAAATGTTGTTTTAACATCTATTTTATCATGATGGCATGCTGTGTTTTCTGCAGGATAACAAATGGACCACTTTCTGGGCTTATTGGCAGGTTGGTAGATTCTTCCACTCTTTTTATTTTTATGCCTTCGGCTATTCTGATTTTGTTTATCATACTGTTCTTACCACATGCCAATATGATCTTGTTTCTGCTGGAAGACCAGAATATAGCTGTTTTTTCTATGCAACAATGTTGGGATTGTTGTTTGTTAGAAACCAGACTTCTTAAACTTCTAGGAAGCATCCTGGATTATCAGCTGTGAAGAATTAGATATTGCTTCAAATGTATCAGTTAATATCCTTACAGAAGTTGTCCTCAAACTGGAGTTGCACATCTAATTCTTGTCTCGCACTGGAATAAACAGTTTTGCATATTCTCATCGAAATGTTTTTGGGAGGAACAAGAAGCTGAATCTCTCACTGGAGAGGGGGCAAATAGATTCTATATTTCGATTAAACTATACTGATCCTTGGATTGATGGTGACAATAAGAGGACCTCCAGAACTATCATGGTTCAGGTAATTATGATTAAGACAATTCCGTCTTCAACGCTCCATAGTTACTTATGGCTGACAATCATCGTTATGTTCTTATAATTATTTTCTTTGCCAGAACTCTAGGACTCCCGGAACACTTATCCATGGCGGGGACCATCCTGACCATGGGCCCATTACAATTGGACGAGTTACTGCTGGCATTGAATACAGTCGACCATTCAGACCTAAATGGAGTGGCACACTTGGATTAATATTTCAGGTACAACTAGTGAATGAAGTCGCATGTTCACGCGACTATAACCTTCCTATCTATTAACCGTTATTGTAATTAACAATAATTTTTCCACCATTCAGTTAAATCAATAATTAGATGTTAATTTCTTTTCTATATATTGTTTTGATTGCTGCTGACTGATTTACAGTGTTATATGTAGAATATCTTTTCCCTCTTCTAAAATTATTTAATTGGTCATCTAGTCTAAGGACCGTTTGGGTTGATTTGCCAAGCCAAGCCAGCCCTAGACCTGTTTGGGAGGCCAACATGAGATTACAATGAGAGGCAATGAGTGGCTCAAACTCTTCCTTCTCTGTGTATTTTACCACTTCTAGAAGATTCCTCGTTTCAATGGCTAGGATTTTTCCTTGCTATTTTGTCATTTTGTGAATCCAACGGCCATTTTTTGACAGATGATGTGGCTAATTCTGGTTGCTTTTTGAGTTTTACTTTTCACATAGAATAGATTTGCCATAGTAATCAAGTAGCCCTTTCTCCGTACTTATTGGCCATGAGAGAAGACCCAGACTAGACAATCTTGTGACATTAATACTACCTTAGGTTAAAGGATAAAAAAGGATACTCTACCCCCGTTCTTAAATATAGATGACGTCGTCAAACCTCAATATCTTAAATCATTAATATATGCTAAAATATTATGATTTATTAATTATAAAAATAGCACCAATAGATTTATCGTGAAAATTCCTTTCATGCAGTTATGTTTTTAATATTGTTTGTAAATACATAATTAGAAGAAGTAATAATGGTACATGTCCATATCTAAAGCATCAAGCAAAAAAGAAGAGATGTAGTACATGAGCACAGTTTGTACCGCCAGTAATGGTGTAACCGTGTAAGAAGCAAGTGAAACTAAGTTTGTTGATTTGGTTCCTGCTATAAATCTGTCCCTTTGGGGACCTTCATTCTACTGATTACTGACACTCTATGCAGCATGCTGGTGCTCGTGATGA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