BGIOSGA006962
| Gene Name |
BGIOSGA006962 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:002-143-A05, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006962, complete gene. |
| LocusTag |
OS02G0193800 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA006962-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA006962-PA |
| Length |
7546 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:6079399..6086944 |
| Sequence Coding Region |
6085968..6086944,6084775..6085092),complement(6084237..6084573,6083711..6084133),complement(6083340..6083632 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:6079399..6086944 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:6079399..6086944 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCTCGCCGGCGGGGGCAATCGGCGGCGCGTCGCCGTCGGGGCGGGTGCTGGGCCCTGCGCTGGACCGGATCATCAAGAACGCGGCGTGGCGGAAGCACTCGGGCCTCGTGGCGGCCGCCAAGGCGGCGCTCGACCTGCTCTCCTCGTCGGCGTACGCGTCGGCGTCGGCGCCGTCGCTGCTGCTCGGGTTGCCGGCGGCCGCCGCGGACGCGTGCATCCACGCGCTCCTTCTCGCGCTCGAGTCGGCGTCCCCCAAGGTCGCCGACCCGGCGCTCGACTGCGTCGCCAAGCTGCTCTACCACCGCCTCCTCGTCGGTGATCTCGGCGGTGGCGGCGGCGACGACGACTCCCTGTCCTCCAAGCTGCTCGCCGCCGTGCTCTCCTGCGGCGCTCTCGCTGACGATGCCATGGAGCTCTCCACCCTCCGCGTCCTCGTGGCCGCCGCGCGGTGCCCCTCCGTCGCCATCCGCGGGGAAGGGCTCGGCCAGATGCTCAAGACCTGCTACAACATATACCTCAGTAGCAGCAGCGGCGCCAACCAGCTCTGCGCTAAGCTGGCGCTGGCGCAGGTGCTGGTGATCGTGTTCGCGCGCGTGGAGGTGGACTCCATGGATGTGCGCGTGCGCACGGTGTCGATCACCGACATGATGGACATGTCTGACCGCAACCTGAATGACTCCAGCATTGTCCATGCGGCGCAGAGCTTCATAAACGAGACGATGGAGGGAAGCGATGTCCCTGAGCCGGGGTCCCCGGTTGAGCCGGCCGAGACGGATGGGAAGGAGGATGTTGTCATGAGCAAGATCAGGGAGGATGGGTTGACACTGTTCAAGAACCTGTGCAAGCTGTCCATGAAGTTCTCGACGCCGGATAATCCTGAAGATCAGGTCCTGCTGCGCGGGAAGGTGTTGTCTCTTGAGTTGCTCAAGATGGTTATCGACAATGCTGGGGCATTCTGGAGAACGAATGAAAAGTACCTTGGAGCAATCAAGCAGTATCTTTGTTTGTCCTTGTTGAAGAACAGTGCCTTGTCAGCAATGAGTATTTACCAACTGTTATGCTCCATATTTTTGGGTTTGCTGTCAAGATTTAGATCTGGGCTGAAAGAGGAAATTGGAATATTTTTTCCCATGCTTGTTCTGAGGGTTCTTGAGAATGTCCATCAACCTAGCTTTCTGCAGAAAATGACTGTTCTAAACCTTTTGGAGAAGATCTGTAAAGACTCCCAGGTTATTATTGATGTCTTTGTGAACTATGATTGTGATGTTGATGCACCAAATATCTTTGAAAGGATTGTCAATGGGCTTTTAAAGACTGCTCTAGGGGTTCCTCCTGGATCTGCAACAACATTAACCCCTGCACAAGACCAGACATTTCGGATTGAGTCAGTCAAGTGTCTTGCAACCATAATAAAATCAATGGGTTCATGGATGGACCAACAGCTGAAAATTGGTGAATTTTCACCCAAACCTTCTGAAATATCTTTAAATTCGATAGACATTCCTAACATCCTTGTTGGAGAAGATGGGGGTGCTGTTGATTATGAACTGCAAACAGACTCTGGTAACCCAGACCTATCTGACGCTTCCTCACTTGAGCAGCGTCGTACTTATAAAATAGAACTTCAGAAAGGAATTTCCTTGTTTAACAGGAAGCCTTCCAAGGGTATTGATTTTCTCATTAAAAGCAAGAAAATAGGTCATTCCCCAGAAGATGTTGCTTCTTTCTTGAGAGATACTGCTGGTTTAAACGCAACAATGATCGGGGACTATTTGGGTGAAAGAGATGAATTCCCTATCAAAGTAATGCATGCATATGCAGATGCACTGAACTTCGAAGGTATGGACTTTGGTGAAGCCATTAGGTATTACTTGCGAGGTTTCAGGTTGCCTGGAGAAGCGCAAAAAATTGATCGAATCATGGAAAAGTTTGCTGAACGATACTGCAAATGCAATCCAAATTCTTTTACCAGTGCAGATACTGCATATGTTCTTGCTTATTCTGTAATTATGCTCAATACCGATGCTCATAATACGATGGTCAAAGATAAGATGTCGAAGTCTGATTTCATTCGCAATAACCGAGGAATTGATGATGGGAAGGATTTGCCTGAACATTATCTGAGTACATTGTATGATCAAATTGTCAAAAATGAGATAAAAATGAGTGCTGATTCGTCAGTTCCACAAAGCAAGCAGCCTAGTAGTGTAATTAAGCTCTTAGGCTTGGATAACATTATCAACCTTGTCAACTGGAAACAGGCTGAAGACAAGGCACTTGGAGCAAACGACTTACTCATTAAGAACATACAGGAGAAATTCAAAGCAAAGAGTGGGAAATCAGAATCTATATTTCATGTTATTACTGATTCTACCATTTTAAGATTCATGATGGAGACACAGCGAGATGCCTTTGTGACATCTGTTGCCAAATTCACTTACCTCCATTGTGCTGCGGACATGAAACAAAAGAATGTGGATGCTGTGAAGGCTATAATATCCATCGCAATTGAAGATGGTGACTATTTGCAGGATTCCTGGGAGCATGTACTAACATGTCTTTCACGGTTTGAGCATCTACATCTCCTTGGAGAGGGGGCACCTACTGATGCTTCATTTTTGACAGTGCCTCTGGTTGAGTCAGAAGATAAAACACAGAAGTCAAGTAGCACTACAGCTTCGAAGCGAACTAATGCTCTTCAGAATCCAGCTGTAATGGCTGCCGTCAGAGGGGGTTCTTACGACAGCACAACAGCTAAAAATAATGCCTCACCATTGGTTACTCCTGAACAGATAAATAGCTTCATATCAAACATAAATTTGTTAGACCAGATTGGCATTTTTGAATTAAATCATATATTTGCTCATAGCCAGAGATTAAATAGTGATGCCATTGTTGCTTTTGTGAAAGCTCTTTGTAAAGTTTCGATGACAGAGTTGCACTCACCTACAGAACCTCGCATCTTCTGCCTAACAAAGATTGTGGAGATTGCGCATTACAATATGAACCGCATACGTCTGGTGTGGTCTCATATTTGGAAAGTTTTATCAGACTTCTTTGTGTCTGTGGGATCGTCAGAAAATCTCTCAGTTGCAATATTTGTTATGGACTCTTTGAGGCAACTAGCGATGAAGTTTCTGGAAAGAGAGGAACTGGCAAATTACAATTTTCAGAATGAATTCCTGCGACCTTTTGCAGTTGTTATGCAGAAGAGCAATGCTTCGGAAGTACGGGAACTTGTCGTTCGTTGCATCTCCCAAATGGTTTTGAGTCGTGTTAACAATATAAAATCCGGATGGAAAAGTGTTTTTATGGTTTTTACTGCTGCTGCTGCTGATGATCGAAAAAGTATTGTGCTGTTGGCATTTGAAACCATGGAAAAGATTGTTCGGGACTATTTTCCATACATAACTGAGACTGAAACCACAACATTTACTGATTGTGTTAAATGTCTTATTACATTCACGAGCAGTAAATTTAGCAGTGATGCCAGTCTTAATGCTATTGCATTTCTTCGGTTCTGTGCTGTTAAACTTGCCGAGGAAGGATTTGTTTGTCATGAAAAGGATACAGATCACCAGTCAAATAACTTAGATGTTTCTGATGGGAATGCCACTCTGCACAAGGACGATCATGTTTATTTCTGGGTTCCTCTGCTTGCCGGTCTAGCTAGGTTGACAACTGACACAAGACCAACAATCAGAAAAGGTGCAGTAGAGGTACTCTTTGACATTTTGAAGGATCATGGGCACCTCTTCTCGCAGTCCTTTTGGAGAAATATCTTTGAATCTGTTGTTTATCCTCTATTTAGCACTGGTAGCTCTACACCAAATGAGCACATTAATCTAACTGAGGATGACTCTTGGAATTCTGAAACTAAAACAGTAGCAGTCAAGTGTTTAGTGGATTTGTACATTACCTTTTTTGATGAGATGCGGACAGAACTTTCTAGAGTTACTTCTGTTGTCACAAACTTTATCAGAAGTCCTTATAAACAGTCTGCTAGCACAGGTTTATCTGTTTTTCAGCGTTTAACAGAAGGACTTGAAAGCAGACTCTCCAAGGAGGAATGGAAAGAGATCTTGTTATGTTTTAAAGACTCAGCAATGCAAACATTTGTCGTGTTTGACAAGATAGTTAGGATGATGCAAGATATAGAAATTCCAGATAGAAATGAATCTTATCCTGAAGTTGAACGATATTCAGATAATGACATATACAATGATGATGAAGAGGAAGCTAATATGGAAACAACATCATACGCTATTATTAAATTGAAGAATCATATGGCGCAGCAGCTCTTAGTTGTTCAGGGCATAGTTAAATTGTATGAGACACACAGGTGGTCTTTTTATGCTGAGCATATGGGAATAATTTTAGAGACACTATCAGCCATTGCGTCACATGCAAGTGAAGTGAGCTCCGAATCTACCTTGCTCATGAAATTCCATAAAGCATGTTCCCTTTTGGAGGTGTCTGAGCCAGCAGTCATTCATTTCGAGAATGAGTCTTACCAGAGCTATCTCAAACTTCTGCAAGCTTTGGTTCATGACCACCCATCAATCTCAGAAGATATGAAAATTGAGTCACATATTATGCTTGTTTCTGAGAAAATACTACGGAAGTATCTCAAATGTGCAGGGCGTGAACGATCTAACGATTCATCTGGTAGAGATCCAGCATTACGCTGGAAACTGCCTTTGGGCACTGCTAAGAAGGAGGAACTGTCTGCTAGAACTTCATTGGTCCTTCATGTGATGCAGTTATTGGGTGGCCTAGAGAGGGACTGCTTTAGGAGAAACCTGCCCCTGTTTTTCCCCTTATTAACTAACCTCATTCGCTGTGAGCATAGCTCTGGAGAAGTTCAGCTTGCACTGTATGATATATTCCAGTCATCGATAGGCCCTATAATATCAACATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
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| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..977#1853..2170#2372..2708#2812..3234#3313..3605#3683..3734#3864..3956#4319..4821#4932..5253#5649..5997#6099..6748#6938..7546#ATGGCCTCGCCGGCGGGGGCAATCGGCGGCGCGTCGCCGTCGGGGCGGGTGCTGGGCCCTGCGCTGGACCGGATCATCAAGAACGCGGCGTGGCGGAAGCACTCGGGCCTCGTGGCGGCCGCCAAGGCGGCGCTCGACCTGCTCTCCTCGTCGGCGTACGCGTCGGCGTCGGCGCCGTCGCTGCTGCTCGGGTTGCCGGCGGCCGCCGCGGACGCGTGCATCCACGCGCTCCTTCTCGCGCTCGAGTCGGCGTCCCCCAAGGTCGCCGACCCGGCGCTCGACTGCGTCGCCAAGCTGCTCTACCACCGCCTCCTCGTCGGTGATCTCGGCGGTGGCGGCGGCGACGACGACTCCCTGTCCTCCAAGCTGCTCGCCGCCGTGCTCTCCTGCGGCGCTCTCGCTGACGATGCCATGGAGCTCTCCACCCTCCGCGTCCTCGTGGCCGCCGCGCGGTGCCCCTCCGTCGCCATCCGCGGGGAAGGGCTCGGCCAGATGCTCAAGACCTGCTACAACATATACCTCAGTAGCAGCAGCGGCGCCAACCAGCTCTGCGCTAAGCTGGCGCTGGCGCAGGTGCTGGTGATCGTGTTCGCGCGCGTGGAGGTGGACTCCATGGATGTGCGCGTGCGCACGGTGTCGATCACCGACATGATGGACATGTCTGACCGCAACCTGAATGACTCCAGCATTGTCCATGCGGCGCAGAGCTTCATAAACGAGACGATGGAGGGAAGCGATGTCCCTGAGCCGGGGTCCCCGGTTGAGCCGGCCGAGACGGATGGGAAGGAGGATGTTGTCATGAGCAAGATCAGGGAGGATGGGTTGACACTGTTCAAGAACCTGTGCAAGCTGTCCATGAAGTTCTCGACGCCGGATAATCCTGAAGATCAGGTCCTGCTGCGCGGGAAGGTGTTGTCTCTTGAGTTGCTCAAGATGGTTATCGACAATGCTGGGGCATTCTGGAGAACGAATGAAAAGTATGATATGATACTCATTATTGTCTTACTTCTGTGCATTTTAACAGCTCAACTTGCTGTGTTGCCTATCTATATAAATATTGTTGTTGCAGTGATTTAGAAGAATGCAGATGGCTTAAATGACTAAGGGAAGGAAGGCATAAAATGTTCAGTATAGTAATTGATATGGAGGCTTCATGTTTGCCTAGTAGTAACTCAGAAATTATGGATACACATTTTTCTGATACTAATACATTGTTTTCACAATCCAGGCACGCTTTACTATTATCTGCTTGGATGTGTCAACATTTTGGCTATATATTTTTAATGTATTATGATGGATGAAAATTTTTCTAGGGAAAAAAGTGCAGAGTTTAATCTATGGTGGTAGATACATGTTTACGTGACCTACTATTCTGTATTTGAATTGCCATTGGTTCTTTTAAAATGTTTCAAATGATGTCCTGATGATAATCTGCATTTGTATGTTGTTCTCTTAATTTGTTTAAGTCTCTTCACTAACTAAAAAAAGAAAATAATTAATGAGCTAACAATACACTGGAAAGGGAATAAAAACATGAAGTGTTGATTTATGAGCTCCAGATGTAACATGATGGCCAGGAGAGGGCACAAGCATCACGATATTTTATTTATAACATTAGGAGTGACTGAACTTTATTCCGTTCTTTTTTTCCTTCAAAATATGCTCATCCATCTAATTTGCTATGCTGAAAAATATGATTATTGTTCACCAAGCTTCCTGCAAGTATACGGTTACAATTTAAAACCTTTTATGTTTAGGGTATTCCATAAAGAGCATTCTGTTTACTCTGACTCCAATGGGTAATAAAACTCTTATACTGAAGTGTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTCAATGCAGGTACCTTGGAGCAATCAAGCAGTATCTTTGTTTGTCCTTGTTGAAGAACAGTGCCTTGTCAGCAATGAGTATTTACCAACTGTTATGCTCCATATTTTTGGGTTTGCTGTCAAGATTTAGATCTGGGCTGAAAGAGGAAATTGGAATATTTTTTCCCATGCTTGTTCTGAGGGTTCTTGAGAATGTCCATCAACCTAGCTTTCTGCAGAAAATGACTGTTCTAAACCTTTTGGAGAAGATCTGTAAAGACTCCCAGGTTATTATTGATGTCTTTGTGAACTATGATTGTGATGTTGATGCACCAAATATCTTTGAAAGGTATGTAGTTTTGTTCTTGATGAATGGCAACCTTAAGTTTTGTTGTCACAGATTATTAGCAGCAGGTATGCATCTATTTAGTGGCCTGTAAGTGCTGCATGAGAATCGATGCATTGAACTGATTACAGTTCTGCAAAAATTAAGTTCACTCTCTCTTCATCATAGTTAAAACAACCCTTTAATTCCAACAGATCTTTGCAGGATTGTCAATGGGCTTTTAAAGACTGCTCTAGGGGTTCCTCCTGGATCTGCAACAACATTAACCCCTGCACAAGACCAGACATTTCGGATTGAGTCAGTCAAGTGTCTTGCAACCATAATAAAATCAATGGGTTCATGGATGGACCAACAGCTGAAAATTGGTGAATTTTCACCCAAACCTTCTGAAATATCTTTAAATTCGATAGACATTCCTAACATCCTTGTTGGAGAAGATGGGGGTGCTGTTGATTATGAACTGCAAACAGACTCTGGTAACCCAGACCTATCTGACGCTTCCTCACTTGAGCAGCGTCGTACTTATAAAATAGAACTTCAGGTATGTTAATATTTGCATGCTTTCTATTTAAATCAACTCCAATGTTAGACATTTTATAAAGGGTTAACATTTGGTTTACTGAACTGCAAAATTCCTTCTGCAGAAAGGAATTTCCTTGTTTAACAGGAAGCCTTCCAAGGGTATTGATTTTCTCATTAAAAGCAAGAAAATAGGTCATTCCCCAGAAGATGTTGCTTCTTTCTTGAGAGATACTGCTGGTTTAAACGCAACAATGATCGGGGACTATTTGGGTGAAAGAGATGAATTCCCTATCAAAGTAATGCATGCATATGCAGATGCACTGAACTTCGAAGGTATGGACTTTGGTGAAGCCATTAGGTATTACTTGCGAGGTTTCAGGTTGCCTGGAGAAGCGCAAAAAATTGATCGAATCATGGAAAAGTTTGCTGAACGATACTGCAAATGCAATCCAAATTCTTTTACCAGTGCAGATACTGCATATGTTCTTGCTTATTCTGTAATTATGCTCAATACCGATGCTCATAATACGATGGTCAAAGATAAGGTTAGCTATATCACTGATCCCCTCTGTTATATGTCAATAACAGAAGTTTTGATCATTAAATGGATTTTCGTTACGCAGATGTCGAAGTCTGATTTCATTCGCAATAACCGAGGAATTGATGATGGGAAGGATTTGCCTGAACATTATCTGAGTACATTGTATGATCAAATTGTCAAAAATGAGATAAAAATGAGTGCTGATTCGTCAGTTCCACAAAGCAAGCAGCCTAGTAGTGTAATTAAGCTCTTAGGCTTGGATAACATTATCAACCTTGTCAACTGGAAACAGGCTGAAGACAAGGCACTTGGAGCAAACGACTTACTCATTAAGAACATACAGGAGAAATTCAAAGCAAAGAGTGGGAAATCAGAGTAAGAGAGAGTTACTCATAGACAAATAACTTGCGTCAGCTAACACTTTATAATAATTAAAGCTCTTGTATTCGCAGATCTATATTTCATGTTATTACTGATTCTACCATTTTAAGATTCATGATGGAGGTTTGTTGGGCCCCTATGATGGCTGCATTCAGTGTGACACTTGACCAAAGTGATGATAAGGCTGCCACATCACAGTGTTTGCAAGGATTCAGATCTGCAGTGCATGTAACCGCTGTAATGTGTATGCAGACACAGCGAGATGCCTTTGTGACATCTGTTGCCAAATTCACTTACCTCCATTGTGCTGCGGACATGAAACAAAAGAATGTGGATGCTGTGAAGGTAGGAACTTAGAAAAGCCAAACTTGGTTCTCTTTTGTTTTCTTGAAATAAAAAATGATTCTCATGATTTAAATGCAAATGCACACATACTATTGCATTTTCCTATTGATATTATGTAGACAAAATTCCCAAGCTTATATGGTCCCTTGGTCTATTTATGGTGAGGACACTTAGATGGCTTCACAGTACATTAGAGCTTGAACTATTCAAAGCATTTACACTTGTACTGGATTAAAATACTTGATTCTATTTTTTGTCAAAACCATATCGACTAATATATATATCTATATTTGTTAGACATAGTCCTATTCGTCAATATTAGAACAAGTAATGATGTGTGTTTTCTTAATGTCTTTTTACAGGCTATAATATCCATCGCAATTGAAGATGGTGACTATTTGCAGGATTCCTGGGAGCATGTACTAACATGTCTTTCACGGTTTGAGCATCTACATCTCCTTGGAGAGGGGGCACCTACTGATGCTTCATTTTTGACAGTGCCTCTGGTTGAGTCAGAAGATAAAACACAGAAGTCAAGTAGCACTACAGCTTCGAAGCGAACTAATGCTCTTCAGAATCCAGCTGTAATGGCTGCCGTCAGAGGGGGTTCTTACGACAGCACAACAGCTAAAAATAATGCCTCACCATTGGTTACTCCTGAACAGATAAATAGCTTCATATCAAACATAAATTTGTTAGACCAGATTGGCATTTTTGAATTAAATCATATATTTGCTCATAGCCAGAGATTAAATAGTGATGCCATTGTTGCTTTTGTGAAAGCTCTTTGTAAAGTTTCGATGACAGAGTTGCACTCACCTACAGAACCTCGCATCTTCTGCCTAACAAAGATTGTGGAGATTGCGTAAGTCTTTAGCAAAATCTAGTCCAAGAACATAGTT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| External Link(s) |
