BGIOSGA007025

From RiceWiki
Revision as of 02:49, 28 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA007025| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA007025, complete gene.| tag = P0544B0...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA007025

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA007025, complete gene.

LocusTag

P0544B02.10

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA007025-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA007025-PA

Length

6914

Source

Oryza sativa Indica Group 

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:5065659..5072572

Sequence Coding Region

5072519..5072572,5072168..5072391),complement(5071273..5071526,5070176..5070395),complement(5069514..5069635
,5068836..5069092),complement(5067998..5068105,5066926..5067132),complement(5066654..5066764
,5065990..5066163),complement(5065659..5065814

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:5065659..5072572 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:5065659..5072572 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCTGCTCCTCCTCTCTCGTCGTGGCCATGGGCAAGCCTCGGCTCGTACAAGTATGTGTTGTACGGGGCGGTGGTGTGGAAGGTGGCGGAGGAGTGGAGGCAGCAAGGGGCGGCGCCGGTGGGGTCGTGGTGGCTCCACCTGCTGCTGCTGTTCGCCGCCCGCGGGCTCACCTACCAGTTCTGGTTCTCCTACGGCAACATGCTCTTCTTCACCCGCCGCCGCCGCGTCGTCCCCGACTCCGTCGACTTCCGCCAGGTCGACGCCGAATGGGACTGGGATAACTTTCTGCTGCTGCAGACGCTGATAGGGGCAACGTTGGTGGGGAGCCCGGCGGTGGCGCGGCAGCAGCTGCTGCTCCCAAGCCTGAAGCAAGCGTGGGACCCACGCGGGTGGGCCATCGCGCTGCTGCTGCATGTGTTGGTCGCTGAGCCGCTCTTTTACTGGGCCCACCGGGCCCTGCACCGGGCCCCACTCTTCAGCCGCTACCACGCCGCTCACCACCACGCCTCGGTCACCACACCCTTGACAGCTGGATTTGGGACGCCACTGGAGAGCCTCCTGCTGACGGTGGTGATAGGGGTCCCACTCGCAGGGGCCTTTCTGATGGGGGTAGGGTCCGTGGGCCTGGTCTATGGACACGTCCTTTTGTTTGACTTCTTGAGGTCCATGGGCTACAGTAACGTGGAGGTGATATCCCCTAGGGTCTTCCAGGCTGTTCCTCTTCTCAGATACCTCATCTACACCCCTACGTACCTGAGCCTGCACCACAGGGAGAAGGACTCAAACTTCTGCCTGTTCATGCCTATTTTTGATCTCCTGGGGGGCACCCTCAACCACAAGTCATGGGAGCTGCAAAAGGAGGTCTACTTAGGCAAGAACGATCAGGCGCCGGACTTCGTGTTCCTGGCACACGTGGTGGACATCATGGCGTCGATGCACGTGCCGTTCGTGCTCCGGTCGTGCAGCTCGACGCCGTTCGCCAACCACTTCGTCCTCCTCCCGTTTTGGCCGGTCGCCTTCGGCTTCATGCTGCTCATGTGGTGCTGCTCCAAGAACTTCCTCGTCAGCTCCTACCGCCTCCGCGGGAACCTCCACCAGATGTGGACTGTCCCCCGATATGGGTTTCAGTACTTCATACCGGCGGCGAAGAAAGGCATCAACGAGCAGATCGAGCTGGCCATCCTGCGTGCAGATCGGATGGGCGTCAAGGTGCTCAGCCTCGCCGCTCTCAATAAGAACGAGGCCCTGAATGGAGGTGGCACGCTGTTCGTGAACAAGCACCCGGAGCTGAGGGTGAGGGTGGTGCACGGCAACACCCTGACGGCGGCCGTGATCCTCAACGAGATCCCCAGCAACGTCAAGGACGTCTTCCTCACCGGCGCCACCTCCAAGCTCGGCAGAGCCATCGCCCTCTACCTCTGCAGAAAAAAGATCAGAGTCCTGATGTTGACATTGTCGTCGGAGAGGTTTCTGAAGATTCAGAGGGAAGCACCGGCAGAGTTCCAGCAGTACCTCGTGCAGGTCACGAAGTACCAGCCTGCACAAAACTGCAAGACGTGGCTGGTGGGGAAGTGGCTGTCGCCGAGGGAGCAGAGGTGGGCGCCGGCGGGGACACACTTCCACCAGTTCGTGGTGCCGCCGATCATCGGGTTCCGGCGAGACTGCACCTACGGCAAGCTCGCCGCCATGAGGCTCCCCAAGGACGTCCAGGGCCTCGGCTACTGCGAGTACACGATGGAACGCGGGGTGGTGCACGCGTGCCACGCCGGCGGCGTGGTGCACTTCCTGGAAGGGTGGGAGCACCACGAGGTGGGCGCCATCGACGTCGACCGGATCGACGTCGTCTGGAAGGCGGCGCTCAAGCACGGCCTCACGCCGGCGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAAPPLSSWPWASLGSYKYVLYGAVVWKVAEEWRQQGAAPVGSWWLHLLLLFAARGLTYQFWFSYGNMLFFTRRRRVVPDSVDFRQVDAEWDWDNFLLLQTLIGATLVGSPAVARQQLLLPSLKQAWDPRGWAIALLLHVLVAEPLFYWAHRALHRAPLFSRYHAAHHHASVTTPLTAGFGTPLESLLLTVVIGVPLAGAFLMGVGSVGLVYGHVLLFDFLRSMGYSNVEVISPRVFQAVPLLRYLIYTPTYLSLHHREKDSNFCLFMPIFDLLGGTLNHKSWELQKEVYLGKNDQAPDFVFLAHVVDIMASMHVPFVLRSCSSTPFANHFVLLPFWPVAFGFMLLMWCCSKNFLVSSYRLRGNLHQMWTVPRYGFQYFIPAAKKGINEQIELAILRADRMGVKVLSLAALNKNEALNGGGTLFVNKHPELRVRVVHGNTLTAAVILNEIPSNVKDVFLTGATSKLGRAIALYLCRKKIRVLMLTLSSERFLKIQREAPAEFQQYLVQVTKYQPAQNCKTWLVGKWLSPREQRWAPAGTHFHQFVVPPIIGFRRDCTYGKLAAMRLPKDVQGLGYCEYTMERGVVHACHAGGVVHFLEGWEHHEVGAIDVDRIDVVWKAALKHGLTPA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..54#182..405#1047..1300#2178..2397#2938..3059#3481..3737#4468..4575#5441..5647#5809..5919#6410..6583#6759..6914#ATGGCTGCTCCTCCTCTCTCGTCGTGGCCATGGGCAAGCCTCGGCTCGTACAAGGCATGCATATAATCTCTCTCTTAAGTCGTCAATTAATCTCTCTTTGTTAGTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTACCTTATTAAGCTAATTAACGTGTGCGTGGTTAATTAATGGGAGATGGGTGCAGTATGTGTTGTACGGGGCGGTGGTGTGGAAGGTGGCGGAGGAGTGGAGGCAGCAAGGGGCGGCGCCGGTGGGGTCGTGGTGGCTCCACCTGCTGCTGCTGTTCGCCGCCCGCGGGCTCACCTACCAGTTCTGGTTCTCCTACGGCAACATGCTCTTCTTCACCCGCCGCCGCCGCGTCGTCCCCGACTCCGTCGACTTCCGCCAGGTCGACGCCGAATGGGACTGGTACGCCCTTCGCCGTCTCTCTCTCTATCTATCTCATTCTCCTCCGCCGTAGCTAGCTAGTCGCCGGCCGGTCGCCGACGGCGTGCATTTGTGTCCTATTCATTTTTAGATTGATTTTTTTGAGAGGGAGAAAATATGGCTTTGCATCCAATGCAAGCAGTGGTCACCAAGCCCAGAGACAGTACTGTACCATCCAGTCATCCACTGTTAGATCAGATCCCAGCTTCAGCCTTCAGAAGAGTTCAGACAGACAGACGCCATGGCTGCTCTCTTATCTAGAATCATCGTAATTACTACTCATATATGTCACCATTTTTACTGCTTAAACCAGCACCAGCAGTAAAATTAAGAATGAATCTGTTTTATGTAGTCCTCCCTCCCTCAATTCTAAAATAAGTTTAGTTTTATACTATCCTTATCCAACGTTTGACCGTTCGTCTTATTTAATTTTTTAATTATTTTTATTTATTAGATGATAAAACATGAATTTTATATGTGACTAATTATTTTATAAAATTTTTAAATAATACGAACGGTTAAATGTTAGAAACGGATATCCACGGCAACACTTATATTTTAGAACGGAGGTAGCAATATGTGTTTTTCTTTTTTTGATGGGATTATTTTGCATATATATGCAGGGATAACTTTCTGCTGCTGCAGACGCTGATAGGGGCAACGTTGGTGGGGAGCCCGGCGGTGGCGCGGCAGCAGCTGCTGCTCCCAAGCCTGAAGCAAGCGTGGGACCCACGCGGGTGGGCCATCGCGCTGCTGCTGCATGTGTTGGTCGCTGAGCCGCTCTTTTACTGGGCCCACCGGGCCCTGCACCGGGCCCCACTCTTCAGCCGCTACCACGCCGCTCACCACCACGCCTCGGTCACCACACCCTTGACAGGTACTCTACACCTGTACTCATCATGTCTTGTACTCCATACCATACTCACCCAACAAAGTTTAGGAGTATAAAAAGGGAGTGTATTTATTCCTATCTATGAACTGTTTGGTGTACCAAATTTGTTTTGAAAATTCTCGTTGGAACTGTGAACCAGTTTATGTATGATGTTTTGTTGTCTTAATGAGTTGCAGCAGATATTTTGAAACTTAATGTTGGTTTTGGGATAGATTTTGAAGTGTTTTATTTGTCGTAGTTTGTTTTTTCTAGCATTGACTTTTAAACAATAAACAATAAAAATATAAAATTTTATGCATAGATTATTCTTTTTTCTGCTTCATTCATACTCCCTCCGTATTTTAATGTGTGACGCCGTTGACTTTTCGACTAACGTTTGAACATTCATTTTATTCAAAATTTTCATGCAAATATGAAAATATTTATATCATGCTTAAATAACATTTGATGATGAATCTAGTCACAATAAAATAAATGAAAATTGCATAAATTTTTTTTTAATAAGACGAATGGTCAAACGTTGGATAAAAAGTCAACTGCGTCATACATTAAAATATGGAGCTAGTATTTCTACATTGATTAACCCATCAGAGTGGTACAATTTATGCAGATTAAATTAATCGAGACTAGCCTGAAATTTTAATTTTAAAACGTAATTATGAAGTTGATTTTAAGTTTTTTTAATCGTGATCCATATTTTAGCAAGATTTTTTTATATATATTTTAGCATTGTAGATATAAATATTTTATCTATAATTTATTTTTAATTATACGTCTCATACGGTTATACGGTTATAGCGTTGTAGGAGTACAATTTTGACTGGCTGATGATAAGCTTTTCCTGTGTTACGTTGGTCTGCAGCTGGATTTGGGACGCCACTGGAGAGCCTCCTGCTGACGGTGGTGATAGGGGTCCCACTCGCAGGGGCCTTTCTGATGGGGGTAGGGTCCGTGGGCCTGGTCTATGGACACGTCCTTTTGTTTGACTTCTTGAGGTCCATGGGCTACAGTAACGTGGAGGTGATATCCCCTAGGGTCTTCCAGGCTGTTCCTCTTCTCAGATACCTCATCTACACCCCTACGTGAGTGCAAAAATAAAATAATAGTATAATGTATTTGTTTTCTGATAAATACTTCTCTATTCATAACTTTTGGTAAATTGGATTGAAAATTATTTTAGTTGACCACCGATATCTTGTAAATCGTTTGATTCAATTAATGGGAATTATATGCTTATATTTTTTAATAGCTACCAGTTTATTTTTAAAATAGGAGTGATCGGACTAAAACAATGCAAGGTCAAAATTATCATATATTGTAAAATGGAGAAAATAAGTAAATTATTTTTGTCTAAGACAGTTAGTTAAATAAATAAATAACTACTTTATAAGGTTGAGATACAAGTAGTACTAATTATGCTGCACTTCATTGTATGGACTGTGCTGCTATCTGCTTAATTGCATCTGTCATTTGGTCACTATCCTAGTGTTGTTAGCTGTACTGCTAATTGGTTGTTAGAGAAAAGTTGATTAATTAGTCGGTGTTGTATGAAGAGGTGATACAAGTAATTAAAATCGATTTGATTGTTCTAATGCGTTATGCATATGGATTTAATTGCGCAGGTACCTGAGCCTGCACCACAGGGAGAAGGACTCAAACTTCTGCCTGTTCATGCCTATTTTTGATCTCCTGGGGGGCACCCTCAACCACAAGTCATGGGAGCTGCAAAAGGAGGTCTACTTAGGTAGGGTGCACGCCTAATTAGTGCATTTTATTATGCCTTTTGCTTCAAGAAACAAGAATTATATTCAGTCAGTGTGCTACAAGACCCATAAGAAACATTAACATTTGGAATTGATTCCTGCAAAATTCCCAAGCCCCAAAAATCTTGAAGACTTTTTACAATTAAAACAAAGAGATTTGGAGGGAGAGACATTGCTCCAGACATTAACATTTAGAATTAATTCATGCAAAATTCCCAAGCCCCAAAAATCTTGAATATTTTTACAATAAAAAAACTTTTTTAAAGAAGAAATTATGAGCGTGCGGGGATTGAACACATGACCTCAAGGGTTGAAATCACACATCTATTATCATTTCACTATCGAGAGCTTGACGGTTTTATAATAATATTATTTCGCGAAAAATGGCAATTGTTGATGTAGGCAAGAACGATCAGGCGCCGGACTTCGTGTTCCTGGCACACGTGGTGGACATCATGGCGTCGATGCACGTGCCGTTCGTGCTCCGGTCGTGCAGCTCGACGCCGTTCGCCAACCACTTCGTCCTCCTCCCGTTTTGGCCGGTCGCCTTCGGCTTCATGCTGCTCATGTGGTGCTGCTCCAAGAACTTCCTCGTCAGCTCCTACCGCCTCCGCGGGAACCTCCACCAGATGTGGACTGTCCCCCGATATGGGTTTCAGGTATAATCACAATAACCCCCCCCCCCCCCCCCCTATATCTTGTAGGGCTAACTTAATTCCAGAAATAATTTAAAATTGTATCATATCTCATGTCGGTATAACATGAGACAATATTTTAGAATTAGTATGTGATCCCACCGTAAATTTTTCACCCCGTCACATCGAACGTCTAAAGACATGCATGAAGTATTAAATATATGCTTAAAAAAATAACTAATTGCATAAATTACGACTAATTTGCAAGACAGATCATTTAAGCCTAATTGCTCAATGATTTGATAATGTGGTGCTACAGTAAATATGTGCTAATGACAGATTAATTAGGCTTAATAAATTCGTCTCGTAGTTTACTGACGGATTCTGTAATTATTTTTTTTATTAGTGCCCGAACACCCCATACGACACACTATATAATACCCGATGTGACACGCCAAAACTTTACACCCCTGAATTTAAACACCCTCGTACTGACTGTATCGAGAGGACAACTGAGATATCATGGATGGATCATAGGTTGTCCATCAATTAATTGGTAGAGGTGTTGTGGTACCATACTATTCAATGGCACCTCTCTCGCAAGTACTTGTACAGTACAGTAGTGACAACAGTGGTTAATGTGTGGCTTTAACTTTGCAGTCCCTATAGAAAACTGCATGTGATTCGGTTTTGTGTAGGCCATCTGAACTTGTGAATTGATTCTGACATTGGCGCCATGTATGCAAATGCACAGTACTTCATACCGGCGGCGAAGAAAGGCATCAACGAGCAGATCGAGCTGGCCATCCTGCGTGCAGATCGGATGGGCGTCAAGGTGCTCAGCCTCGCCGCTCTCAATAAGGTCAGTTGTTTTACAAAAGATCGATTATTATCACGAATTATTTATTTATTTATTTATTCAAGTCACCAAGAATACATTTTTTAAATATTTATTTATTAAAACATTTAATTTATGTATATAATCATATAGATAATATAATAATAGTCCAATAATTTATGTATATTTAATATTTGCTACCTGTACATGTCTTGTCTCTTCCATGCCTCAACTTTTTTTTCCTTTTCCTTTATCACTTTCTTGCAATGACACAGACACATACATGTCTCTTTCTTTGATCATAATGTGCCGTGTTATGCATATAGTTGAGCAGTATTGGATATACAGCATGTATAATAAGATACTTGTCCATTAACTAGTACAGTATCACTGCTGATGATTCAGTAGGGGTGTTCTGTTTTTCCTCATCTTTCTTCAACTTTCTCCCTGTCATTTTCAAAAGAAAAAAAAGGAAAAAAAAAGAGAGTATGTGATGTTCATGTCAGTCTCTTTGCTGTTCATGTGTCGCCCATACAGTTGGGCAGCATTGGTTATCTAGCACAGACTACCGGAACCAATTCATCATCATTTATGATGGGCATGTGAAATCCTTAACTGATTCGACGTTGAAATGGCGGCGAAGATGGAAATGCGACCGTGACGCGTGTAATCGGAGTAGATGCTGTGGCTAGCTCATAACTAAAAAATCTGCGTTAATTGTTCAGACAGTTAAAAAGTTCAGGAATTTCATCTGATCAGCACTGTAAACAGAATCTTTAGGCTAGCAATCTAGCATTACTCAAAAATCAAAATGCAGTGAAACGATCTGATCTTAACTGAAACTCTTTGAATTTTCTTATGTTTTGGTTTGGTTTCTTGTTTCTGTCAGAACGAGGCCCTGAATGGAGGTGGCACGCTGTTCGTGAACAAGCACCCGGAGCTGAGGGTGAGGGTGGTGCACGGCAACACCCTGACGGCGGCCGTGATCCTCAACGAGATCCCCAGCAACGTCAAGGACGTCTTCCTCACCGGCGCCACCTCCAAGCTCGGCAGAGCCATCGCCCTCTACCTCTGCAGAAAAAAGATCAGAGTCCTGGTTCGTGCTCTGCTGCCTGTCTGAACTCTGAACTGAACCCCAAAAAAGGAGAAAAAAAACTCTGTGTTAATTCACAGCATGATTAGATGAGTATGTTAAACAAGAGGATGATTGCAAGACTGGGATTGATGGTTCTGTGTGCTAATCTTTTTTGGTTTTAGATGTTGACATTGTCGTCGGAGAGGTTTCTGAAGATTCAGAGGGAAGCACCGGCAGAGTTCCAGCAGTACCTCGTGCAGGTCACGAAGTACCAGCCTGCACAAAACTGCAAGGTAATTCACTCGCTGGAATTTCAATAAGACTTTCAGTAATTCAAGGCTGTGTCCATGATGTGATTGTCCACATTTTCTTTCATCAGGTTTTATCCACCAACCAGTTAACCTATAAAACATAGACTTTTGTCAGAGTCATATTGTCCCGCTGACCAATTAACCCAGAAAAAGTTACATTTTTTTTGTCTCAGTTGTATGCACCGACCAGATCACCAAAAGTTTAGTTTAGTGTTTATTTTGGGTCTAGCTATATTTATGGCGCCAAGTTGTATGTACTAGCTAGTTCGACGGAAAAGCTGAGGGTAATTTTACCATCTAAGAAGGTACCCGAAATTTACCGTATTTTCTGATGTAAAATTTAGTACTTCCGAATACTAGGTATCTCAAGATACTAAATTTTTTTAATGTAAGATTTAAGTATCCCGGGTTACTTTTTCAAATACCGTAAAATTTATCAGAAGCTAAAGTTAGATGGATGGCGTTGTTGCAGACGTGGCTGGTGGGGAAGTGGCTGTCGCCGAGGGAGCAGAGGTGGGCGCCGGCGGGGACACACTTCCACCAGTTCGTGGTGCCGCCGATCATCGGGTTCCGGCGAGACTGCACCTACGGCAAGCTCGCCGCCATGAGGCTCCCCAAGGACGTCCAGGGCCTCGGCTACTGCGAGGTACTTCCTCCGTTTCATATTACAAGTCACTTTAAACTTTTTTTATAACAAAACTCTTTTTATATTCAACTAAATTTATAGAAAAATTATGTCCATTATTATTATTATTATATTCTTCTTCTCCGAGTTCGCTGACATGGTCGGCCGGCGATCGCCGGGAAACATATGTGTGCAGTACACGATGGAACGCGGGGTGGTGCACGCGTGCCACGCCGGCGGCGTGGTGCACTTCCTGGAAGGGTGGGAGCACCACGAGGTGGGCGCCATCGACGTCGACCGGATCGACGTCGTCTGGAAGGCGGCGCTCAAGCACGGCCTCACGCCGGCGTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA007025

Retrieved from "https://ngdc.cncb.ac.cn/ricewiki/index.php?title=BGIOSGA007025&oldid=60577"