BGIOSGA007394
| Gene Name |
BGIOSGA007394 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA007394, complete gene. |
| LocusTag |
RNBS42 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA007394-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA007394-PA |
| Length |
4558 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:1001306..1005863 |
| Sequence Coding Region |
1001306..1003680,1003764..1005474,1005804..1005863 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:1001306..1005863 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCTGCCTCTTGAGATTAAACATGATATTTCTAAGAGGATCAATGAAATAGTGAATTGTTTACGCACTAGGTGCAAGCCTGTGCAAGGAGTTCTTCAGCTGGAGATTTTACGCCAAATTGCAATGCCAAAGCACAGTCAGAGTGAGCCCAGAAAGCTTCGTCAGACGACTTCTCTTGCAATTGAACACAAGGTTTATGGGCGGGACACAGAGAGGGACAACATAATAGAGTTGTTAACAAAGGTGAAATCATGTGATCTAGGTGTTCTACCATTAGTTGGTGTTGGTGGTGTTGGGAAAACTACACTTGCCAGATTTGTATACCATGATCAAAGAATTAAAGACCATTTTGATTTGAGAATGTGGGTTTGTGTATCCGATAATTTCAATGAAAAGAACCTAACACATGAAATGTTAGAGCTCGTGTGTAAAGATAGACAAGGTTACAAAAATATAATCAGTTTTGATGTGCTGCAAAACACCCTTTGGGAGGAAATTAGAGGCAAAAGGTTTCTGCTCATATTGGACGATATGTGGGAAGATGGGGACAGGAGCGGATGGGACAAGCTGTTAGCTCCATTGAAATGTAATGAAGTAAGCGGCTGCATGGTTTTAGCAACAACTCGAAGGGCATCAGTTGCAAGAATGATAGGAACAATGAGTAAGGTTGAAGTGAATGGTTTGGATGAAACAGTGTTTTGGTTGCTCTTCAAGGAATGGGCATTTCTTGGTAATGAGAAGCTGGAGTGCAATCCAACTTTGCAATCCATTGGGAAACACATTGCTAAAGCATTAAAGGGCAACCCACTGGCTGCCCGTAGTGTTGGTGCACTTTTGAATAGGAGTGTTAGCTTTGACCACTGGAGGAAAGTTCAGCACAAATGGAAATTTCTTCTAAAACAGGATGATGATATTTTAGCCATCTTGAAGTTCAGTTATGAATTTCTACCGGTCCACCTGCAGCACTGTTTCTCTTACTGCTCTCTGTTCCCAAAGGATCATAAATTTAATGGGAAAAAATTAGTTCGTGCTTGGATATCGCAAAATTTTGTGAAGTGCGAATGCCGTGCTGAGAGACTTGAGGAAACAGGGAAGCAATATTTGGATAATTTAGTTGATTGGGGCTTCTTTGAAGAGGTTGAGTCACACTATGTTATGCATGACCTAATGCATGACTTGGCAGAAGAAGTTTCATCAGATGAGTGTGCTACTGTAGATGGATTGGAATCCAAGAAAATTTCACCAGGTCTTCAGCATTTATCAATAATAACTACTGCTTATGATAGAGAAGAACCTTGCAATTTTCCTAGGGAGAAGTTTGAGAACATACTACAGAGTATCGGGTCTTTGCCAAAGTTGAGAACATTAATGTTCTTCGGTGAAAATAGTATAATGTTATTAAGGTCCTTAAATACTATATGCAAGGAGTCAAAAAGGTTACGGTTACTAAAGATTTATGTGACAGCTGCTGACATCAGCTCTACACACAATTTGTTCAAGCCAAATCATCTTCGCTATCTTGAATTTATTGTTGTTCCCACCAATAATATGTTTGGAAGTCGAGGCATTGTAAATACCTCTATTCCTCAAGCTTTGACAAAATTTTATCACCTCCAAGTGTTGGATGTTAGCAGTAAAGGAAATCTTGCAGTTCCTACTGGTATAAACAATCTCATTAATTTACGGCATCTTATCGCTCATGAGAAAGTGCACTCAACAATTGCTGGCCTTGGTAACTTGACCTCTCTTCAGGAACTAATCTTCAAGGTTCAAGATGCTGACAATTTTAATATAGGACAACTTCGAGCCTTGAATGAGCTCGTAATACTTGGAATTTCTCAACTCGAAAATGTGAAAACTAAACAAGAGGCCAGCAGTGCAAGAATGATAGACAAAGAGCATCTTGAAGAGTTGTCGTTGTTGTGGAACGATAACAGCATGAACCCTGAACCTACTGCAGAAAAATCAAGAGATGATGTGATTGAGGGTCTCGAGCCGCTTCAAAACCTCAAGCATCTACAATTGATTCGGTACAGTGGTGCTACATCCCCAACTTGGCTTGCTAGCAGGGTTACCTCACTGCAAGTACTTCATCTAGAGAACTGCAGACAATGGCAAATTGTTCAATCTCTTGAAATGCTTCCACTGCTTAGAAAGCTAAAATTGATTAGGATGTGGAACTTGATGGAAGTCTCAATTCCTTCTTGTTTGGAAGAGTTGGATTTAGTTAATGTGCCAAAATTGGAAAAATGTGTTGGCACTTACGGGCTAGATTTGACTTCTGGTCTGAGGGTATTGATAGTGAAGGATTGCCCTATACTAAACGAGTTCACGTTTTTCCACAAGGACTATTTTCATGCCGAGCAGAAGTCATGTACAATTGCAGAAGTTTCCTACACTTACTTTGTTAAATTATGTTACAGAGCATGGAAGATCCTTCCACTGGAAGAAATGCAAGCACTCAAGAAGCTGGAGTTGATGGATGTGCCTGTTGTTGAAGAATTGTCAGTTCCTTCTCTGGAGAAGTTGGTGTTGATTCAAATCCCAAGGCTGCAAAGTTGCAGAGGGATAACAACTGCTCCATCTCCACATTTTTCGACTTCCCAAGGAGATCAAAGGGAATTGGTATGTGGTCTCCGGGAACTCACTATCAATGATTGCCCCAGTTTTTTAGTGCAGTTTCCTATCCCGCCTTCTTCTCTGATTTCGTTCTTATCCATCAAGGGCCTTTCATCATTTCCAACAATGGTGATAAATCGGAGAGTGCTCACAATCGAATCTAATGAGTTGAGTGAGCTCGATGGCAGGATCTTACCATTCCATAATCTGAAGGGCATAACATGGGTAAACCTACGGCGTTGTCCAAACTTGACCCGCATTTCGATAGACGGTTTCAGCCAACCACATGTCATGTCAAAGCCTGTTCATGATAACAGTATACCTATTACGAGTTACCCTGTCCTCCCATCTGTCAATTCTCTCAGCATTCAGTCGTGTGGCATAGCTGGTGGATGGCTAACTCTAATGCTTCCTCATTTGCAGTCTCTTGAGAACTTGGAGTTACGAGACTGCCCACAGATAAAACTTTTATCAACAAGTCAATGTACAAAAATAGAAGCACCGAACAGTTTGGCTTCAGCAGAGACAACCTCTGCCAGGGACAAATACCTTTTGCAAATTCCATATAATCTCCTCCGTTCTCTAAAGTGGTTAATTATTTGGGCATGCCGAGACCTGGAATTTTCTGGAGTCAATGAAGGATTTGGAGGATTCACCTCTCTTGTGGAGCTACAAATTAGGGATTGCCCCAGGCTGGTCCCATCATTGGTGAGTGAAACCAAGGATAATTGGTTACTCCCAACATCATTTCAATATCTCACTATCAGTCCTCTCCCGGCAAACATGCAGCTCTTCGCCCCTGAGGGCCTAACTTGCCTCAGAGTGTTAAGCGTATTTTGCAGCCAATATTTGAAGTCTGTGCAGCTGAGATCCTGTACAGCATTGGAGTGTCTGCAGTTATTGGAGTGTCAACAGCTGAGTGTTTTGGAGGGCCTCCAACACCTTAGCTCCCTTGTAAGTTTGGACATCGAGATGAATCATGAACTGTCAATGGCATGGGATCACAAACTGCAGGAGCAAGAACAAGGCAGCAATCAGGTTGGACTATTTCCCCTGTCACTTGTACATCTTGGTATCACAAATCTTGAAGGCAGTGTCCATTCTCGCTTTCTGTGCCTCCCTTCTATTACGAAATTAGACTTGTGGAATAGTCCAGATTTGAAGTCTCTACAGTTAGGATACTGCACAGCGCTGGTAGATTTGGCAATTGACAGCTGCAAGTCGCTTGCATCAATCGAGGGTTTCCAGTCCATTAGAAACCTTAGGTCCTTGAGAGTAGGTGACTCCCCCAGCGTATACCCATGTCTGCAGCTTATGTCGCAGCAGCAAGGGGCATCTGACATCTTTTCTCAACTGGAAACTCTAACGGTTGATGATGCCTCTGTCCTTTCCGTGCCCCTTTGCAAACATCTCACGTCTCTACGAGTCTTAGGATTACACCGGGATGGATATAGTGGCAAGTCTATGACATTCATTCAGGAATTCAGCTACTCTGTACAGAAACTACAGATACAATCACGACCATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLPLEIKHDISKRINEIVNCLRTRCKPVQGVLQLEILRQIAMPKHSQSEPRKLRQTTSLAIEHKVYGRDTERDNIIELLTKVKSCDLGVLPLVGVGGVGKTTLARFVYHDQRIKDHFDLRMWVCVSDNFNEKNLTHEMLELVCKDRQGYKNIISFDVLQNTLWEEIRGKRFLLILDDMWEDGDRSGWDKLLAPLKCNEVSGCMVLATTRRASVARMIGTMSKVEVNGLDETVFWLLFKEWAFLGNEKLECNPTLQSIGKHIAKALKGNPLAARSVGALLNRSVSFDHWRKVQHKWKFLLKQDDDILAILKFSYEFLPVHLQHCFSYCSLFPKDHKFNGKKLVRAWISQNFVKCECRAERLEETGKQYLDNLVDWGFFEEVESHYVMHDLMHDLAEEVSSDECATVDGLESKKISPGLQHLSIITTAYDREEPCNFPREKFENILQSIGSLPKLRTLMFFGENSIMLLRSLNTICKESKRLRLLKIYVTAADISSTHNLFKPNHLRYLEFIVVPTNNMFGSRGIVNTSIPQALTKFYHLQVLDVSSKGNLAVPTGINNLINLRHLIAHEKVHSTIAGLGNLTSLQELIFKVQDADNFNIGQLRALNELVILGISQLENVKTKQEASSARMIDKEHLEELSLLWNDNSMNPEPTAEKSRDDVIEGLEPLQNLKHLQLIRYSGATSPTWLASRVTSLQVLHLENCRQWQIVQSLEMLPLLRKLKLIRMWNLMEVSIPSCLEELDLVNVPKLEKCVGTYGLDLTSGLRVLIVKDCPILNEFTFFHKDYFHAEQKSCTIAEVSYTYFVKLCYRAWKILPLEEMQALKKLELMDVPVVEELSVPSLEKLVLIQIPRLQSCRGITTAPSPHFSTSQGDQRELVCGLRELTINDCPSFLVQFPIPPSSLISFLSIKGLSSFPTMVINRRVLTIESNELSELDGRILPFHNLKGITWVNLRRCPNLTRISIDGFSQPHVMSKPVHDNSIPITSYPVLPSVNSLSIQSCGIAGGWLTLMLPHLQSLENLELRDCPQIKLLSTSQCTKIEAPNSLASAETTSARDKYLLQIPYNLLRSLKWLIIWACRDLEFSGVNEGFGGFTSLVELQIRDCPRLVPSLVSETKDNWLLPTSFQYLTISPLPANMQLFAPEGLTCLRVLSVFCSQYLKSVQLRSCTALECLQLLECQQLSVLEGLQHLSSLVSLDIEMNHELSMAWDHKLQEQEQGSNQVGLFPLSLVHLGITNLEGSVHSRFLCLPSITKLDLWNSPDLKSLQLGYCTALVDLAIDSCKSLASIEGFQSIRNLRSLRVGDSPSVYPCLQLMSQQQGASDIFSQLETLTVDDASVLSVPLCKHLTSLRVLGLHRDGYSGKSMTFIQEFSYSVQKLQIQSRP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..2375#2459..4169#4499..4558#ATGCTGCCTCTTGAGATTAAACATGATATTTCTAAGAGGATCAATGAAATAGTGAATTGTTTACGCACTAGGTGCAAGCCTGTGCAAGGAGTTCTTCAGCTGGAGATTTTACGCCAAATTGCAATGCCAAAGCACAGTCAGAGTGAGCCCAGAAAGCTTCGTCAGACGACTTCTCTTGCAATTGAACACAAGGTTTATGGGCGGGACACAGAGAGGGACAACATAATAGAGTTGTTAACAAAGGTGAAATCATGTGATCTAGGTGTTCTACCATTAGTTGGTGTTGGTGGTGTTGGGAAAACTACACTTGCCAGATTTGTATACCATGATCAAAGAATTAAAGACCATTTTGATTTGAGAATGTGGGTTTGTGTATCCGATAATTTCAATGAAAAGAACCTAACACATGAAATGTTAGAGCTCGTGTGTAAAGATAGACAAGGTTACAAAAATATAATCAGTTTTGATGTGCTGCAAAACACCCTTTGGGAGGAAATTAGAGGCAAAAGGTTTCTGCTCATATTGGACGATATGTGGGAAGATGGGGACAGGAGCGGATGGGACAAGCTGTTAGCTCCATTGAAATGTAATGAAGTAAGCGGCTGCATGGTTTTAGCAACAACTCGAAGGGCATCAGTTGCAAGAATGATAGGAACAATGAGTAAGGTTGAAGTGAATGGTTTGGATGAAACAGTGTTTTGGTTGCTCTTCAAGGAATGGGCATTTCTTGGTAATGAGAAGCTGGAGTGCAATCCAACTTTGCAATCCATTGGGAAACACATTGCTAAAGCATTAAAGGGCAACCCACTGGCTGCCCGTAGTGTTGGTGCACTTTTGAATAGGAGTGTTAGCTTTGACCACTGGAGGAAAGTTCAGCACAAATGGAAATTTCTTCTAAAACAGGATGATGATATTTTAGCCATCTTGAAGTTCAGTTATGAATTTCTACCGGTCCACCTGCAGCACTGTTTCTCTTACTGCTCTCTGTTCCCAAAGGATCATAAATTTAATGGGAAAAAATTAGTTCGTGCTTGGATATCGCAAAATTTTGTGAAGTGCGAATGCCGTGCTGAGAGACTTGAGGAAACAGGGAAGCAATATTTGGATAATTTAGTTGATTGGGGCTTCTTTGAAGAGGTTGAGTCACACTATGTTATGCATGACCTAATGCATGACTTGGCAGAAGAAGTTTCATCAGATGAGTGTGCTACTGTAGATGGATTGGAATCCAAGAAAATTTCACCAGGTCTTCAGCATTTATCAATAATAACTACTGCTTATGATAGAGAAGAACCTTGCAATTTTCCTAGGGAGAAGTTTGAGAACATACTACAGAGTATCGGGTCTTTGCCAAAGTTGAGAACATTAATGTTCTTCGGTGAAAATAGTATAATGTTATTAAGGTCCTTAAATACTATATGCAAGGAGTCAAAAAGGTTACGGTTACTAAAGATTTATGTGACAGCTGCTGACATCAGCTCTACACACAATTTGTTCAAGCCAAATCATCTTCGCTATCTTGAATTTATTGTTGTTCCCACCAATAATATGTTTGGAAGTCGAGGCATTGTAAATACCTCTATTCCTCAAGCTTTGACAAAATTTTATCACCTCCAAGTGTTGGATGTTAGCAGTAAAGGAAATCTTGCAGTTCCTACTGGTATAAACAATCTCATTAATTTACGGCATCTTATCGCTCATGAGAAAGTGCACTCAACAATTGCTGGCCTTGGTAACTTGACCTCTCTTCAGGAACTAATCTTCAAGGTTCAAGATGCTGACAATTTTAATATAGGACAACTTCGAGCCTTGAATGAGCTCGTAATACTTGGAATTTCTCAACTCGAAAATGTGAAAACTAAACAAGAGGCCAGCAGTGCAAGAATGATAGACAAAGAGCATCTTGAAGAGTTGTCGTTGTTGTGGAACGATAACAGCATGAACCCTGAACCTACTGCAGAAAAATCAAGAGATGATGTGATTGAGGGTCTCGAGCCGCTTCAAAACCTCAAGCATCTACAATTGATTCGGTACAGTGGTGCTACATCCCCAACTTGGCTTGCTAGCAGGGTTACCTCACTGCAAGTACTTCATCTAGAGAACTGCAGACAATGGCAAATTGTTCAATCTCTTGAAATGCTTCCACTGCTTAGAAAGCTAAAATTGATTAGGATGTGGAACTTGATGGAAGTCTCAATTCCTTCTTGTTTGGAAGAGTTGGATTTAGTTAATGTGCCAAAATTGGAAAAATGTGTTGGCACTTACGGGCTAGATTTGACTTCTGGTCTGAGGGTATTGATAGTGAAGGATTGCCCTATACTAAACGAGTTCACGTTTTTCCACAAGGACTATTTTCATGCCGAGCAGAAGTCATGGTTTCCATCTCTCAATAAACTCATCGTCAGTCGTTGTCATCGTATAATGTAGTTTTCTCTTCTTCTTGATCTTGCTTGTTCAGTACAATTGCAGAAGTTTCCTACACTTACTTTGTTAAATTATGTTACAGAGCATGGAAGATCCTTCCACTGGAAGAAATGCAAGCACTCAAGAAGCTGGAGTTGATGGATGTGCCTGTTGTTGAAGAATTGTCAGTTCCTTCTCTGGAGAAGTTGGTGTTGATTCAAATCCCAAGGCTGCAAAGTTGCAGAGGGATAACAACTGCTCCATCTCCACATTTTTCGACTTCCCAAGGAGATCAAAGGGAATTGGTATGTGGTCTCCGGGAACTCACTATCAATGATTGCCCCAGTTTTTTAGTGCAGTTTCCTATCCCGCCTTCTTCTCTGATTTCGTTCTTATCCATCAAGGGCCTTTCATCATTTCCAACAATGGTGATAAATCGGAGAGTGCTCACAATCGAATCTAATGAGTTGAGTGAGCTCGATGGCAGGATCTTACCATTCCATAATCTGAAGGGCATAACATGGGTAAACCTACGGCGTTGTCCAAACTTGACCCGCATTTCGATAGACGGTTTCAGCCAACCACATGTCATGTCAAAGCCTGTTCATGATAACAGTATACCTATTACGAGTTACCCTGTCCTCCCATCTGTCAATTCTCTCAGCATTCAGTCGTGTGGCATAGCTGGTGGATGGCTAACTCTAATGCTTCCTCATTTGCAGTCTCTTGAGAACTTGGAGTTACGAGACTGCCCACAGATAAAACTTTTATCAACAAGTCAATGTACAAAAATAGAAGCACCGAACAGTTTGGCTTCAGCAGAGACAACCTCTGCCAGGGACAAATACCTTTTGCAAATTCCATATAATCTCCTCCGTTCTCTAAAGTGGTTAATTATTTGGGCATGCCGAGACCTGGAATTTTCTGGAGTCAATGAAGGATTTGGAGGATTCACCTCTCTTGTGGAGCTACAAATTAGGGATTGCCCCAGGCTGGTCCCATCATTGGTGAGTGAAACCAAGGATAATTGGTTACTCCCAACATCATTTCAATATCTCACTATCAGTCCTCTCCCGGCAAACATGCAGCTCTTCGCCCCTGAGGGCCTAACTTGCCTCAGAGTGTTAAGCGTATTTTGCAGCCAATATTTGAAGTCTGTGCAGCTGAGATCCTGTACAGCATTGGAGTGTCTGCAGTTATTGGAGTGTCAACAGCTGAGTGTTTTGGAGGGCCTCCAACACCTTAGCTCCCTTGTAAGTTTGGACATCGAGATGAATCATGAACTGTCAATGGCATGGGATCACAAACTGCAGGAGCAAGAACAAGGCAGCAATCAGGTTGGACTATTTCCCCTGTCACTTGTACATCTTGGTATCACAAATCTTGAAGGCAGTGTCCATTCTCGCTTTCTGTGCCTCCCTTCTATTACGAAATTAGACTTGTGGAATAGTCCAGATTTGAAGTCTCTACAGTTAGGATACTGCACAGCGCTGGTAGATTTGGCAATTGACAGCTGCAAGTCGCTTGCATCAATCGAGGGTTTCCAGTCCATTAGAAACCTTAGGTCCTTGAGAGTAGGTGACTCCCCCAGCGTATACCCATGTCTGCAGCTTATGTCGCAGCAGCAAGGGGCATCTGACATCTTTTCTCAACTGGAAACTCTAACGGTTGATGATGCCTCTGTCCTTTCCGTGCCCCTTTGCAAACATCTCACGTCTCTACGAGTCTTAGGATTACACCGGGATGGATATAGTGGCAAGTCTATGGTTAGTCTGACAGAGGAACAAGAGCGAGCCCTCCAGCTTCTCACCTCACTACGACAACTTAATTTTTACAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATTTGCTCCGGTCCAACTAAAAGTATCTCGAGGTATCGGTACCTCACGATACCAAATCGTTTCCGATCGTTGGATCTAACAATGCATATCCAGCCCAGCTAGATCCAACGATCGAAAACGATTTGGTATCGTGAGGTACCAGTACCTCGAGATACTTTTTGTTGGACCCGAACAAATCTCCTCTAAATATGTTTGGGAAAATTCAGACATTCATTCAGGAATTCAGCTACTCTGTACAGAAACTACAGATACAATCACGACCATGA</dnaseqindica> |
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