BGIOSGA008088
| Gene Name |
BGIOSGA008088 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA008088, complete gene. |
| LocusTag |
P0688H12.36 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA008088-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA008088-PA |
| Length |
5660 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:13949571..13955230 |
| Sequence Coding Region |
13949571..13949573,13949767..13949829,13949936..13950015,13951291..13951399,13954371..13954530 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:13949571..13955230 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGTCGCTCGCCGCGGCAAGGGCGGATAACTTCTACTACCCGCCGGAATGGAGCCCAAAGAAGGGTGGGCTCAACAAGTTCCATGGACAACATGCTCTCAGGGAACGGGCGAGGAAGCTGGACCAGGGCATCCTGATTATAAGATTCGAGATGCCATTCAATATTTGGTGTGGTGGGTGCAACTCCATGATAGCAAAGGGAGTGAGGTTTAACGCTGAGAAGAAACAAGTTGGGAATTATTACTCTACCAAGATATGGAGCTTCACCATGAAATCACCATGCTGCAAACAAGAAATAGTTATACAAACAGACCCAAAGAATACTGAGTACGTCATAATTAGTGGAGCTCAACGAAAGACTGAAGATTATGATGTGGAGGATGCAGAGACACTACTGCTACCTGCAGATGAAGAAAGAGACAAGCTTGCGGATCCTATGTATAAGCTTGAACACCAGGAAGAGGATCTTAAAAAGAAGAAAGAAGCTGAACCAGTTTTAGTTCGCCTTCAACGACTCTCCGATAGCCGGCATTCTGATGACTACGCTCTTAACAGAGCCCTTCGTGATCGTCTTAGGAGCCAAAAGAAGAGAGTTGCTGAAGAGAAAAGATCAGCTAGAAAGATGGGACTTGGAGTACGGCTTTTACCACCCTCTGCAGAAGATGCCACTGCAGCGGCTTCTGTGAAGTTTGCATCAAAATTTGAGAAGAGCAGAAGGGACAAAAGAGCAGCAATTAAGGCTGCTTCCATCTTCCCGGAGTCATCAAGCTCAACTTCAAAGAACAAGCTGGATCTTGCACTGAAGAGGCGAAATATAAAAGCTGGTGCTGCCTCAGCGCTGATGGCGAGCAGGGTGAAGCCGTCGTCATGGCAGAGCGCCGGTTCTGGAAGCTCAAGGACTCAGATGCCGATCATGGCAACACGTAAGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSLAAARADNFYYPPEWSPKKGGLNKFHGQHALRERARKLDQGILIIRFEMPFNIWCGGCNSMIAKGVRFNAEKKQVGNYYSTKIWSFTMKSPCCKQEIVIQTDPKNTEYVIISGAQRKTEDYDVEDAETLLLPADEERDKLADPMYKLEHQEEDLKKKKEAEPVLVRLQRLSDSRHSDDYALNRALRDRLRSQKKRVAEEKRSARKMGLGVRLLPPSAEDATAAASVKFASKFEKSRRDKRAAIKAASIFPESSSSTSKNKLDLALKRRNIKAGAASALMASRVKPSSWQSAGSGSSRTQMPIMATRK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..3#197..259#366..445#1721..1829#4801..4960#5052..5215#5307..5660#ATGGTACGTGGGAGATCTAACCCTAAAGGCCGCTCTCGATTCGATCTCTCCCCATCCCCAAATCGTGCGGGGCTCGCCTCCAGGGCTTTTCTTCTGCTGGCGAGTCCAGTTTGGGGCTCTGGTTGCTGACACGATCCTTTGTTTTCTTTCCCTGCGATTCGATTGATTGACGGATTTATGACGTTTCTCCTTGCAGTCGTCGCTCGCCGCGGCAAGGGCGGATAACTTCTACTACCCGCCGGAATGGAGCCCAAAGAAGGTACGCGTCTCTTCCTCGGTGAATCGTATAGCGTTTTCATTTGGTTTTGATGCGTTGTGGTTGCTGATGCATGTGGGTGTTTTTCTTCTTTCTTGGAACAAATTAGGGTGGGCTCAACAAGTTCCATGGACAACATGCTCTCAGGGAACGGGCGAGGAAGCTGGACCAGGGCATCCTGATTATAAGGTTTGGTTGTCGAAAAATGCTTTTTCTTTGCTCTACACAGTGAAAACCAGTTAGAGAGAACTGCTATCTTAACTCATCGATATGGCTGTGTATTTTGTACGAGTTTAGGGATATGTTAAAATGGACAAAGGATATGGATTAACAATACAGGAACGATTTTGGATGTTGTCTAAATAAACAAGCGGACATAGGAGGAAAATGTTATTGATCCTAGTAAATGGGAATTTTGGACATTGGCCATTTAGATTTTTATGGATCATGGTAACGTAGAATGCCTAACAGTTAACCAGAGAATAGATGATTGGATATTTTAGCCTTTGCCATTGTTGTGGTTAGCTATTTTATTTATTTCCTTTTGCTTTAGCGATTCTGAAATATTGGATTTGCAATTGCAAAAATAGTTTAATTGATTTGATGATTGTTTGCAAGTATTTTTGGCATCTGCATGAACAACCGGACAATATTATTGTATTGAATGGATGATTAATTATGATGTTGTGAACGATTAATCATAAACTTGCAGAGAATATTTCATCAACATCTATGCATATATCAAGCACCAACAATCGCTAATAAAATACTTATCCATAAAAACAGTTGTTTGTGAGGTTTGTTTTTCTAAGCATCATTAAAATTGTACCATAGTTGTTACTATTCATGATATATTTGCTAAACTTGATTACTGGCAAATGAAGAAGGTCCATTACTACATTATAATTTGCAAAAGTGTTAATAAAGTATGATAAGTCCCCTCAGACAAATGAGATGATAATTGATTTGAGTTTACAACCTTTAACATAGAAATGATACTATGGTGTCGACATGATTATTCCATGTGTTCATACCTTTATATTTGATGGCTTGATGCTACAACTATCTATTACTGCCTCTGCCACCATTATGTAAGTAACCATGGTGAAGATAGATGCATCTGTAGATACCATTGTTCTGTCTTCCAGTTACCGCTTAGTTTTGTCATAGTCAGCTAATAATGTTTAGATTAGGAAACAACTACTTTCTGAATCTATATTATCTGACAGAATGCATTTTCATTACTAGTCTAACAAATTGATGGCAAGTAATTTTGTGTACATTGGTCACTTGATGCTAGCTAGGTGATGTATGTAGTCGAGAACAATGTTTAGCTCTACAGATCTAGAAGATAAAAGATACATACCAATGTTGATGTCCTCTTAATGTTTATCTACATATAATTTATCTTCTCAAGTGTATGTTCAAGTTTTGACTCTCTTAATTTGTTTATCTGATGTGCAGATTCGAGATGCCATTCAATATTTGGTGTGGTGGGTGCAACTCCATGATAGCAAAGGGAGTGAGGTTTAACGCTGAGAAGAAACAAGTTGGGAATTATTACTCTACCAAGGTATGTCCTGGATTGGACTAAAGTTCGTCTGAAGTCGAATTCCTTTGCAGCTTTGTTTTGGGAGTATTGTGCTGTAGCTATCCTTGTTAGTTTCAGTGGCGGACCTTCTCTTGTGGCAAGGGATGGCGCCAGCCATACCTATGTCATGCCCAAAGTAGGTAGGGTATTCAAGCATATGACCATCTCAGCCTTGATTTCAGATGCTAATTATATGATTAGTTGGTTGTATTTCATTTGGTACAAGCTTATTCGTTTAGTTAACTGGAGGTAAAGACCTATAGTGGGACTGTCTTGTGTCTGCACAAATGAATGAATAGTCTAGCTAACCACAAAATGTTAATCGGTAAAAATCGAATGCTAAAAAATAGATATGTAACTTAAGTGAATGTCTACTTATAAATAAACACACCTAAAAAACAGGGAAACACTCGTAGAAATGTAGTTTAGTCATAAAAGTTACACAACAAATTTAAGGCTTCAGTTGTAAAAACTGCATGACAAATTTAGGATTATAATCATCGTTAATGGCATATATTCTAATAAGTGCGAACATATTATAGTTTGTGTATAATAAAATGTTACATCATTTTTAAAATACCATGCACTTCGTTCTTGTGTGATGATCCGCCATAGCTAAATTTTAGTGCTGGGTCCGCCACTGGTTAGTTTCAGCTTTAGTTTTGGTCCCATGGATAGATGAGAAAACTGTAGGTGCATAAACTGGTGTGCTTTATCCATTCAACTCTATTTTTCATCAACTCATCTCCTGCATGGCATAGCAAGACATAAGCTACCATAGTATCCATTGATAAGGCACTACTGTATTTTATTTATCCATTTTATTGTGAGTTTTTTTGTTTCTTTTTAAAAAAATGATGGGTCCACATCTGCCTTTTGAATGGCCTATCCTCTCCTATGACTACAGTAGAAAACACAAGATTTGCTGTGACTTAGGACCAGGGTTCACCAAACCGCTTTGGGTGGGGTTACCGTCACCCCATGGTAAGGCGGTTATCATGGTAACCATGCGGTTATCATGAAAACCGTGTGGTTACCGCGAGGTTTACCGTGGTTTCAAAAATTGAGAAGGTTACTGCACATGATAACCGCACGGTTTTGTAAACCCTACTTAGGACTCCATTGGTTCATCATCTGAAACAGAATAGGTGATCAGTCAGCACCCACTCTATCACCAATAGAAGTATATTGCCATGTTGTGTATTGACTAATGGATTGTAGTCAGCAACTCAGCATACTGGGTAGTGGTCTTACTGCTGGCCTAGCCTTATAAGCAGAGTCATGTTCTTTTCTTGGATATACTAGCATAGAGTGTATCATATTTATTCGTGTTACTTCAAGTAAATCCTTGAACTTTGGAGCTATTTAAATATATGATGTTTTTTCTTATGCCTTGAAATTTGGACTCGACTCCTGAGTATCACTTGTTTGGTGGTTTTGTATCAAAATTGAATTAATTGTTTTTCACCTTTAATTAAAATGCTACTCAATCCAGCATAAATTTCATGAGTTATAGAGGTCAGCTTTCCATCATATTCCCTCCGGTTCCATAATTCTTGATGTTTCGGACAAGGTTGAGGACAAAGAATTAGAACTTTGACAATCAATAACTTTTAAAATATTCAGTTTGAAGACGCTAGAACACAATGTATAGATTAGTCTTAAAAATACTTTAATAAAATTAAATATTTACTTGTCTTGTGTATAATATTATAATAGAAAATCATAGTCAAAGACATGTTTTGGAGACTGCGGCGTTGTCCAAAACGTCAAAAAATATTGAACCGGAGGGAGTAAGAAACTAAACAGAGTTCTTACCAGAAGTTGGTGTACACAACTGGGTAAACATTTTTCTCGAAGAGATCAAATGGTGGTGATTTGAAATGGAGTCGTGCTAGGTAAATGAGAGCACCATGTGGGGGAGGAATGGATCTGTAATAGCTAACAAAAGAAAGATCATGGCAGGAGTATGTCGTCTAGGAAGTTTGCTTATTCATTACATGCCTTCATTATGAGATCAAATGCCTTCCAATAGAAGGAGAAATTTAGCAAACATTAGCTAGGGTACTATATCGAACTAACTTATTCTAACTCCCACAAAACTCCTACCTAATAGATGCATAACTTACATCCTTTACATGGCCCAACGCCCCAACCAAAATCCTGCAATGCCTTTTATGCTATTAGCTTGCTGCTGGCAAGCTGCTGCCTGCCTATGGCTACCTACCAGTGTTAAACTTGCTGTCCGGGACCACATCCAAAATGTCTGGGATATGATAATGTTGGGAACAGGATAGCGCTTGTCCATTGTTGCATGTGAGAACTGTGTACGGTATTGTACAGCAACTATTCAGCCTCATGCTTTCAACTGTCCAGACTGAATATATTTTTTATCCTTGGAGATTGTTATTTTAGCCCAGGACTTTTCGCTCCTTCACGAAATATTAGTATAATAAAGTTAATCTGACAATAATACTAGCCATGCTTTTTGGCAACCTGAAAGACCTTAAGAACGTAAAATTTTATTTTAGTTTTCTTGCCTTTTTTGGTTACATGTATGGAACCTATGTAATGATATACTTTTGGTTTATCATATTCATGAGCCTTGGTATTCTTTTTAAAGTTTATTTTATCAACTTAGTTGATCATAACAAGTATATTTTGTGTTATTGACAGTACAAGTTGAATATATCCCATAACTTCTGCTTTTTAAATCGCCCTTGCATTGAATGTGTTCATTGTTGTTGTCTCACCCTAATTACTAGAAAAAAGAACTGCGTGCAGCTTGTGCGCTTTAACCATACTATGTCAGTCGTGCTTTTCAACTCCAAAATACTTGATGACATTATTTTTATTGAGGTACTTCCATTCAGGGAACGAGCTTCTATTGCATAATTGTGTGAGCTGACATTATATGGTGCTAACTTTGTTTTGCCAATGATTCTTGTGTCAGATATGGAGCTTCACCATGAAATCACCATGCTGCAAACAAGAAATAGTTATACAAACAGACCCAAAGAATACTGAGTACGTCATAATTAGTGGAGCTCAACGAAAGACTGAAGATTATGA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